Instituts thématiques Inserm Institut national de la santé et de la recherche médicale INSERM US012 CNRS UMS 3367 Aix Marseille Université Frederic FIORE, PhD [email protected] Éthique Bien être animal Archivage Distribution Mutagénèse Services à la recherche et l’industrie Validation de cibles Évaluation des risques R&D Phénotypage Zootechnie Éducation Formation 1 2 Module de KO/KI Trangénèse Cryopréservation Archivage Décontamination par transfert d’embryons 3 Module de stabulation EOPS (10 000 cages) 4 5 Exploration fonctionnelle du système immunitaire de la souris en conditions A3/L3 Exploration fonctionnelle du système immunitaire de la souris Cytométrie et tri multiparamétrique KO-KI Booster Plate-forme IBISA d’exploration des fonctions du système immunitaire de la souris CIMTECH Anticorps monoclonaux CIML Implémentation en continue des panels d’anticorps Zone Laboratoire banalisé Zone Laverie Zone Animalerie EOPS Zone Bureaux - Stockage Zone Animalerie A3/L3 Zone Laboratoire banalisé Zone Animalerie A3/L3 Zone Animalerie EOPS Zone Laverie Zone Bureaux - Stockage Certification Iso 2001 de ce périmètre décembre 2012 ~ 6-9 mois ~ 6-9 mois 1 mois Etude Projet + Stratégie 3-5 mois Bio-mol 3 mois Biologie cellulaire 2w Microinjection 7w Chimères matures 5+2 w Transmission + Géno-typage F1 4w F1 matures 4w Contrôles sanitaires 1w Livraison Knock-out Knock-out conditionnel Knock-in d’une mutation ponctuelle d’une étiquette Tag à des fins d’analyses biochimiques Tag de protéines fluorescentes Du récepteur humain à la toxine diphtérique Knock-in entraînant la constitution d’un allèle complexe et multi-analytique Combinatoire entre : protéines fluorescentes + récepteur humain à la toxine diphtérique Tag à des fins d’analyses biochimiques + protéines fluorescentes + récepteur humain à la toxine diphtérique (à venir) Start R415 1 2 R415A Start 2 1 N 3 Stop 3 Stop Stop R415X Start 2 1 N 3 Stop Start Stop 1 Start Stop 1 2 3 2 3 Stop Start TdT IRES2 3’UTR 3’UTR Stop 1 2 EGFP TEAL TEAL YPET YPET eYFP eYFP Neptune (à venir) Neptune (à venir) N N + N TdT EGFP N N 3 Stop N N 3’UTR Sart Stop 1 2 3’UTR 3 Start Stop Stop 1 2 3 IRES2 hDTR 3’UTR + DT-A N + N Mort cellulaire Stop 1 2 3’UTR 3 Start Stop Stop 1 2 3 FP IRES2 Linker 2A hDTR 3’UTR C N + + N + DT-A Suivi cellulaire Mort cellulaire Start Stop 1 2 3 Start 1 Stop Stop 2 Purification des complexes N P1 P2 P3 3’UTR 3 Tag 3’UTR Tag de très haute affinité qui permet l’analyse de l’intéractome protéique en condition stœchiométrique via la spectrométrie de masse Start Stop 1 2 Start 1 Stop 2 3 Purification des complexes N P1 P2 P3 3’UTR 3 Stop Tag IRES2 FP 3’UTR Suivi de l’expression par émission de fluorescence + signalosome en condition stœchiométrique via spectrométrie de masse Stop 1 2 Start 1 3’UTR 3 Stop 2 3 Tag IRES2 Stop FP Linker 2A hDTR 3’UTR + DT-A N P1 P2 P3 Mort cellulaire Plus de 103 projets pris en charge depuis 2008 ~ 6-9 mois ~ 6-9 mois 1 mois Etude Projet + Stratégie 3-5 mois Bio-mol 2w 3 mois Biologie cellulaire Microinjection 7w Chimères matures 5+2 w Transmission + Géno-typage F1 4w F1 matures 4w Contrôles sanitaires 1w Livraison Module KOKI : [email protected] Module Immunophenotypage [email protected] Module « Cryo-préservation, Cohortes, Intégration PHENOMIN» [email protected] Module confiné BSL3 [email protected] Spécialisation en Cytométrie multi-paramétrique et Développement de la Cytométrie de masse CYTO Bilan hématologique complet Immunophenotypage exhaustif- analyse multiparamétrique Réponse immunitaire – standard et inflammatoire L'activité génique par l'expression d'un gène rapporteur Tri des différents populations des cellules immunitaires Cytometrie de masse R&D Réponse immunitaire –conditions infectieuse (BSL3) Virus, bactérie Tri des cellules infectées Bio-imaging –ex vivo, in vivo Imagerie 3D à haute résolution de tissus vivants Imagerie dynamique en temps réel de cellules vivantes normales ou infectées Microdissection- sélection d’une population ou d’une région cellulaire d’intérêt R&D BSL3 PHENOMIN French nationale infrastructure for phenogenomics CELPHEDIA French national technological network for integrative and syntetic biology INFRAFRONTIER European infrastructure for phenotyping, archiving and distribution of mouse models INTERNATIONAL MOUSE PHENOTYPING CONSORTIUM 6 countries, 15 research institutes Boissonnas, A., Scholer-Dahirel, A., Simon-Blancal, V., Pace, L., Valet, F. Kissenpfennig, A., Sparwasser, T., Malissen, B., Fetler, L. and Amigorena, S., Foxp3+ T cells induce perforin-dependent dendritic cell death in tumor-draining lymph nodes. Immunity. 32: 266278. Prinz, I., Sansoni, A., Kissenpfennig, A., Ardouin, L., Malissen, M., and Malissen, B. (2006). Visualization of the earliest steps of gammadelta T cell development in the adult thymus. Nat Immunol 7, 995-1003. Guilliams, M., Crozat, K., Henri, S., Tamoutounour, S., Grenot, P., Devilard, E., de Bovis, B., Alexopoulou, L., Dalod, M. and Malissen, B., Skin-draining lymph nodes contain dermis-derived CD103(-) dendritic cells that constitutively produce retinoic acid and induce Foxp3(+) regulatory T cells. Blood. 115: 19581968. Kissenpfennig, A., and Malissen, B. (2006). Langerhans cells--revisiting the paradigm using genetically engineered mice. Trends Immunol 27, 132-139. Henri, S., Poulin, L. F., Tamoutounour, S., Ardouin, L., Guilliams, M., de Bovis, B., Devilard, E., Viret, C., Azukizawa, H., Kissenpfennig, A. and Malissen, B., CD207+ CD103+ dermal dendritic cells cross-present keratinocyte-derived antigens irrespective of the presence of Langerhans cells. J Exp Med. 207: 189206. Komatsu, N., Mariotti-Ferrandiz, M.E., Wang, Y., Malissen, B., Waldmann, H., and Hori, S. (2009). Heterogeneity of natural Foxp3+ T cells: a committed regulatory T-cell lineage and an uncommitted minor population retaining plasticity. Proc Natl Acad Sci U S A 106, 1903-1908. Près de 50 publications réalisées par les utilisateurs de la plate-fome IBISA « KI/KO booster » (l'embryon de CIPHE) Partenariats, collaborations et soutiens Instituts thématiques Inserm Institut national de la santé et de la recherche médicale Dr Bernard Malissen –Directeur du CIPHE [email protected] Dr Ana Zarubica – Directrice des opérations du CIPHE, COO [email protected] Dr Frederic Fiore - Responsable du module KO/KI « Création de lignées de souris génétiquement modifiées » [email protected] Dr Marie Malissen – Responsable des modules « Immunophenotypage » « Cryo-préservation, Cohortes, Intégration PHENOMIN » [email protected] Dr Jean-Pierre Gorvel – Responsable du module « Infectiologie BSL3 » [email protected]