Master - Mention Microbiologie, Biologie Végétale et

Master - Mention Microbiologie, Biologie
Végétale et Biotechnologies
) Architecture de la formation
1ère année 2ème année
Autres formations
de master
1ère année
Spécialité R Microbiologie
Master MBVB 1ère année
Spécialité R Biol. Végétale
Spécialité R BIOtechnologies
pour le DEVeloppement durable (BIODEV)
Spécialité P BIOtechnologies
VEgétale et Microbienne (BIOVEM)
Spécialité P Enseignement et
Formation en Biotechnologies (EFB)
Habilitation partagée par les Universités d’Aix-Marseille 1, 2 et 3.
Enseignements sur le campus universitaire de Luminy à l’exception de certains
UE de la spécialité « EFB ».
) Responsables
Mention et M1 : Chantal Tardif
M2 Spécialité R Microbiologie : Frédéric Barras
M2 Spécialité R Biologie Végétale : Christophe Robaglia
M2 Spécialité R BIODEV : Jean-Luc Tholozan
M2 Spécialité P BIOVEM : Christophe Robaglia
M2 Spécialité P EFB : Chantal Tardif/Matthieu Nouailler
) Objectifs
De la 1ère année :
 Donner aux étudiants une formation de haut niveau,
pluridisciplinaire, avec un parcours « Microbiologie » ou « Biologie
Végétale » ou « mixte » (Microbiologie et Biologie Végétale) ou «
Enseignement et Formation en Biotechnologies». La formation «
mixte » peut offrir aux étudiants indécis la possibilité de choix de
spécialité (Microbiologie ou Biologie Végétale) à l’entrée en M2.
Les étudiants souhaitant intégrer le M2 EFB doivent
impérativement suivre le parcours « Enseignement et Formation
en Biotechnologies ».
 Permettre aux étudiants de se construire un parcours
personnalisé permettant de préparer leur intégration dans de
nombreuses formations de 5ème année universitaire (Master 2ème
année recherche ou professionnel, y compris le M2 «
Enseignement et Formation en Biotechnologies, écoles
d’ingénieurs, etc...).
De la 2ème année :
 Parfaire leur formation dans la spécialité de M2 choisie pour
permettre leur insertion professionnelle.
 Préparer les étudiants qui le souhaitent aux études doctorales.
Et plus particulièrement pour les différentes spécialités …
 Les spécialités recherche Microbiologie et Biologie
Végétale donnent aux étudiants une formation de très haut niveau
dans les domaines de la microbiologie moléculaire, de la biologie
végétale et/ou des biotechnologies, à partir des compétences
mobilisées au sein de l’important réseau de laboratoires
d’excellence de l’aire marseillaise. Les stages sont réalisés dans
ces laboratoires.
 La spécialité BIODEV s’appuie sur les laboratoires de
l’INRA et de l’IRD de Marseille (campus de Luminy) et de 7 centres
de recherche de pays à économie émergente (Mexique, Brésil,
Chine, Maroc, Tunisie, Vietnam, Madagascar), pour dispenser un
enseignement international multi-sites par « enseignement à
distance » en français et en anglais. Le but de cette spécialité est
de donner aux étudiants une formation de haut niveau en
Biotechnologie microbienne et de favoriser le transfert des
connaissances vers les pays en transition. Elle est majoritairement
destinée à des étudiants des universités étrangères.
 La spécialité professionnelle BIOVEM s’appuie sur un
réseau d’entreprises partenaires appartenant aux domaines de
l’énergie (pétrochimie), de la bioproduction (pharmacie,
agroalimentaire) et de la production de semences, localisés
autour des campus des Universités d’Aix-Marseille:
- Pôle de compétitivité Capénergie centré autour du CEA
Cadarache, dont des ingénieurs participent activement aux
enseignements.
- Entreprises de biotechnologies du campus de Marseille-
Luminy et du campus de Cadarache (bioproduction de
molécules, diagnostic)
- Tissus des entreprises de biotechnologie des plantes de la
vallée du Rhône, en particulier les entreprises
semencières, en liaison avec le centre INRA de Montfavet
- Petites et moyennes entreprises du secteur de la
microbiologie à Marseille
- La concentration des grandes entreprises du secteur
pétrolier autour de Berre, dont certaines affichent une
politique d’intérêt pour la recherche et le
développement dans le domaine des biocarburants
(Shell, Total).
Des stages dans des entreprises et laboratoires de
biotechnologies étrangers sont possibles.
 La spécialité R et P EFB s’appuie sur les
compétences disciplinaires de l’équipe pédagogique du
master, et sur les compétences professionnelles de l’IUFM et
des professeurs de biotechnologies du lycée Marie Curie pour
préparer les étudiants aux métiers de l’enseignement et de
la formation en biotechnologies et aux épreuves du concours
du CAPET Biotechnologies –option biochimie – génie
biologique.
) Débouchés
Ingénieur dans des petites, moyennes et grandes
entreprises des secteurs de l’agroalimentaire et de
l’énergie, startup en bioproduction et biotechnologies,
laboratoires publics et privés de recherche et
développement, collectivités territoriales, cabinets de
brevets, organismes de certification, distribution
(traçabilitédes produits).
Professeur certifié en biotechnologies (enseignement en
filière pré-BAC technologique et en BTS).
Après une thèse : chercheurs ans les secteurs public et
privé, enseignant-chercheur.
) Recrutement des étudiants
Recrutement en première année MBVB :
Etudiants titulaires d’une licence, parcours « Biochimie » ou
« Biologie cellulaire » ou « Physiologie ». L’inscription des
étudiants titulaires d’une licence de Biologie dans un autre
parcours est soumise à l’approbation de la commission de
pilotage pédagogique.
Recrutement en 2ème année :
Sur dossier. Un CV détaillé et une lettre du directeur de
la formation d’origine, précisant le rang de l’étudiant et
l’effectif de la formation, sont demandés aux étudiants issus
d’un cursus autre que le M1 MBVB.
Secrétariat pédagogique :
Patricia Violland Tel : [phone]

ECTS
Parcours "Enseignement et Formation en Biotechnologies" Parcours "microbiologie" Parcours "biologie végétale" Parcours "mixte"
S1 Travaux Pratiques 1
Compléments de Biochimie Des bactéries aux plantes Des bactéries aux plantes Des bactéries aux plantes
Stress oxydatif et autres stress cellulaires Stress oxydatif et autres stress cellulaires Stress oxydatif et autres stress cellulaires
3 Anatomie fonctionnelle des procaryotes Anatomie fonctionnelle ou autre unité de spécialité Biologie moléculaire des eucaryotes Unité de spécialité 1 au choix
3 Nutrition et croissance des bactéries Nutrition et croissance ou autre unité de spécialité Biochimie intégrative du végétal Unité de spécialité 2 au choix
3Introduction à la génomique Introduction à la génomique Introduction à la génomique Introduction à la génomique
3 Enzymologie et nutrition Unité libre: anglais, virologie, ... Unité libre: anglais, virologie, ... Unité libre: anglais, virologie, ...
Mécanismes moléculaires de régulation Biologie cellulaire et développement végétal Unité de spécialité 3 au choix
Transport et adressage des macromolécules Transport et adressage des macromolécules Transport et adressage des macromolécules
S2 6Travaux Pratiques 2
Compléments de Biologie Moléculaire
6Biologie humaine et physiopathologie
6 Communiquer en sciences Communiquer en sciences Communiquer en sciences Communiquer en sciences
3Pathogénie bactérienne (unité optionnelle de S2)
3 Transposition didactique, apprentissages et structure du savoir
Stage en laboratoire de recherche ou en entreprise de 1 mois
pendant l'été, avec mémoire, et présentation orale en S3
M2 Professionnel "Enseignement et Formation en
Biotechnologies" M2 Recherche "Microbiologie" ou M2 Recherche
"Biologie Végétale" M2 Recherche "BIODEV M2 Professionnel BIOVEM
Accès aux seuls étudia nts ayant suivi l es UE spéci fiques de M 1 et l e
stage en entreprise d'été, mention AB requise
S3 Travaux Pratiques 3 Anglais
Virologie (UE libre de S1 pour les autres parcours) Droit, Management, Propriété Industrielle et Qualité
Métabolismes
Compléments de Microbiologie
6Recherche bibliographique en biotechnologies, situations
d’enseignement Génétique et physiologie fonctionnelle des champignons filamenteux
6Reinvestissement des connaissances disciplinaires en
biotechnologies 1 Bases théoriques des procédés biotechnologiques
6Reinvestissement des connaissances disciplinaires en
biotechnologies 2 Biodiversité et détoxication microbienne ou Transformations microbiennes: du gène à l'aliment fonctionnel
S4
En gras: UE du tronc commun de la mention MBVB
En rouge: travaux pratiques et unités contenant les stages
Unité professionnelle 3- Agir en fonctionnaire éthique et
responsable
15
Analyse bibliographique et prospective du projet de
recherche
4 UEs optionnelles parmi 6 proposées :
Les thèmes proposés peuvent varier d’une année à l’autre.
Ex d’UEs proposées :
 Sécrétion des facteurs de virulence et relation bactéries-
hôtes
 Régulation globale chez les microorganismes
 Interactions plantes-microorganismes
 Biotechnologie Végétale
Accès à tous les étudiants ayant une mention AB, y compris ceux ayant suivi le parcours "EFB"
6
Stage en laboratoire de recherche pour un total de 30
ECTS
Stage en laboratoire de recherche pour un total de 30
ECTS
6
Conception et organisation de séquences de formation
Master MBVB 2ème année
Stage en entreprise pour un total de 30 ECTS
4 UEs optionnelles sur 6 proposées
 Bioénergies
 Bioproduction
 Bioremédiation
 Bases théoriques des procédés biotechnologiques
 Diagnostic moléculaire
 Amélioration des plantes
15
Structure de la mention : les unités d'enseignement
Initiation à la recherche 2 (stage en laboratoire de
recherche)
6Génétique et physiologie des procaryotes des
environnements extrêmes
6
Unité professionnelle 2 - Les élèves et les politiques éducatives
Analyse bibliographique et prospective du projet de
recherche
6
Initiation à la recherche 2 (stage en laboratoire de
recherche)
Initiation à la recherche 1 Initiation à la recherche 1
Initiation à la recherche 2 (stage en laboratoire de
recherche)
Master MBVB 1ère année
4 UEs choisies parmi 9 UEs proposées: Adaptation des plantes à l'environnement, Biotechnologie microbienne et végétale, Interaction plantes/pathogènes et symbiontes, Les
grands cycles de la matière, Différentiation cellulaire bactérienne, Pathogénie bactérienne, Etude moléculaire de métabolismes, Champignons filamenteux et levures, Sciences et
société
Orientation active dans les parcours à partir du dossier de pré-inscription dans la mention (lettre de motivation, cursus détaillé avec notes, expérience professsionnelle)
Initiation à la recherche 1
Biologie cellulaire
6Unité professionnelle 1 - Le système éducatif et la classe
Sites web :
* http://www.univ-provence.fr/gsite/document.php?pagendx=967&project=ufr_svte
* www.luminy.univ-mrs.fr, (cliquer sur “Enseignement”, puis “liste des formations”, puis “Masters”, puis sur “Microbiologie…”).