L`avis du conseil scientifique est sollicité sur la première inscription

SUJET PROPOSE
POUR UNE PREMIÈRE INSCRIPTION EN DOCTORAT
RENTREE UNIVERSITAIRE 2013 / 2014 – AR DU MINISTERE
Intitulé du laboratoire d’accueil
UMR 1014 Secalim INRA-Oniris
Nom et Prénom du responsable du laboratoire
Professeur Hervé Prévost
Nom et Prénom du responsable de l’équipe
Intitulé français du sujet de thèse proposé :
Mécanismes d’inhibition de Campylobacter jejuni
par la bactérie lactique Lactobacillus salivarius
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé
Mechanisms involved in Campylobacter jejuni
inhibition by Lactobacillus salivarius
Directeur de thèse (encadrement : 40%)
Xavier Dousset (Professeur)
[e-mail]
02.51.78.55.25
Co-directeur (encadrement : 30%)
Co-encadrant (encadrement : 30%)
Hervé PREVOST (Professeur)
Nabila HADDAD (Maitre de Conférences)
Résumé du sujet de thèse proposé
Enjeux économiques :
En Europe, plus de 190 000 cas d’infections à Campylobacter ont été reportés, Campylobacter étant
la première cause de gastro-entérite bactérienne en Europe. Les travaux de recherche montrent à
l’évidence que le portage intestinal de Campylobacter par les volailles constitue un élément clé de la
transmission de ce danger à l’homme. La diminution ou l’éradication du portage intestinal chez le
poulet est un élément stratégique très important pour la maitrise du risque Campylobacter dans cette
filière.

Enjeux scientifiques :
Nous avons récemment (UMR INRA Secalim) isolée une souche de bactérie lactique Lactobacillus
salivarius SMXD51 pour ses propriétés à inhiber la croissance de Campylobacter. Cette souche
présente une capacité d’inhibition de Campylobacter in vitro rare et notamment par la production d’un
peptide anti-microbien (Messaoudi et al. 2011, 2012a). Par ailleurs, des premiers travaux ont aussi
prouvé ses capacités potentiellement probiotiques (Messaoudi et al., 2012b). La connaissance
partielle du génome de cette bactérie a confirmé la présence de gènes en rapport avec cette
potentialité (Kergourlay et al., 2012). Le projet de thèse proposé a pour but de mieux connaitre cette
interaction entre ces deux bactéries dans le but d’utiliser cette souche comme une flore d’exclusion
compétitive de Campylobacter chez la volaille et/ou une flore de bioprotection pour les produits
carnés. Les travaux seront poursuivis selon le plan ci-dessous.
1- Etudes in vitro :
 Etudes d’inhibition in vitro lors de cocultures C. jejuni - L. salivarius SMXD51 (UMR
INRA 1014 SECALIM)
effet des différents ratios et de la température. Observation en microscopie électronique
de Campylobacter en coculture.
 Etude de la virulence et de la colonisation de Campylobacter sur modèle de cellules
intestinales humaines et aviaires, respectivement, en présence de la souche de L. salivarius
SMXD51 (UMR INRA 1014 SECALIM, INRA Nouzilly)
2- Etudes in vivo :
 Etude de la colonisation de Campylobacter dans le modèle poulet en présence de la
souche de L. salivarius SMXD51 dans des isolateurs (UMR INRA 1014 SECALIM et
ANSES Ploufragan).
3- Etude des mécanismes d’interaction L. salivarius et C. jejuni
 Compléter l’assemblage et l’annotation du génome de L. salivarius SMXD51
rechercher des gènes potentiellement impliqués dans l’interaction bactérienne
(production de bactériocines, quorum sensing, production de AI-1, AI-2, AIPs, etc.)
 Comparaison des profils protéiques et ARN par des approches de transcriptomiques et
protéomiques, respectivement, au cours de la coculture
Partenaires : ANSES Ploufragan, INRA Nouzilly
Messaoudi S., Kergourlay G., Dalgalarrondo M., Choiset Y., Ferchichi M., Prévost H., Pilet M.F., Chobert J.M..,
Manai M and Dousset X. 2012a. Purification and characterization of a new bacteriocin active against Campylobacter
produced by Lactobacillus salivarius SMXD51.Food Microbiology, 32:129-134.
Messaoudi S, Madi A, Prévost H, Feuilloley M, Manai M, Dousset X, Connil N. 2012b.In vitro evaluation of the
probiotic potential of Lactobacillus salivarius SMXD5, Anaerobe. 18:584-9.
Kergourlay G, Messaoudi S, Dousset X, Prévost H. 2012. Genome sequence of Lactobacillus salivarius SMXD51, a
potential probiotic strain isolated from chicken cecum, showing anti-campylobacter activity. J Bacteriol. 194:3008-9.
Messaoudi S, Kergourlay G, Rossero A, Ferchichi M, Prévost H, Drider D, Manai M, Dousset X. 2011. Identification
of lactobacilli residing in chicken ceca with antagonism against Campylobacter. Int Microbiol. 14:103-10.