4V139 - Master BMC

Intitulé de l’UE : BACTERIOLOGIE MOLECULAIRE ET MEDICALE
Code de l’UE : 4V139
Responsables de l’UE : Guennadi SEZONOV, Professeur
Mel : [email protected]
Wladimir SOUGAKOFF, Maître de Conférences - Praticien
Hospitalier
Mel : [email protected]
Secrétariat : Carine JOSEPH
Tél. : [phone]
Mel : [email protected]
1. Descriptif de l’UE
Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage, autre) : 60 h (48 h CM/TD + 12 h travail person-
nel)
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Mention de master où l’UE est proposée : Mention "Biologie Moléculaire & Cellulaire"
Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 2 du Master
Effectifs prévus : 32
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
Le but de cette unité d'enseignement est de donner aux étudiants les connaissances en bactériologie
moléculaire et médicale qui leur permettront de mieux appréhender les enjeux de la microbiologie
moderne, aussi bien fondamentale (génétique bactérienne, présentation générale des Archaea,
communication inter-cellulaire et différenciation) que médicale (grands pathogènes d’intérêt médi-
cal majeur et résistance aux antibiotiques).
Les thèmes abordés sont : structure et dynamique des génomes bactériens, métagénomique, régula-
tion, éléments génétiques mobiles, interactions hôtes-pathogènes mais également les capacités adap-
tatives des bactéries aux stress environnementaux et à la pression de sélection des antibiotiques.
b) Thèmes abordés
- L’homme et ses flores microbiennes.
- Taxonomie des procaryotes.
- Bactériologie moléculaire :
• Génétique bactérienne.
• Les échanges génétiques naturels. Les facteurs intervenant dans les échanges naturels :
plasmides, phages, éléments mobiles (IS, transposons). Notion de transferts horizontaux.
Ilots de pathogénicité. Structure et dynamique des génomes procaryotes. Etude des commu-
nautés microbiennes par l’approche métagénomique.
• Les Archaea.
• Aspects de la régulation chez les procaryotes : les états de stress (stress oxydatif, "heat
shock", réponse SOS, phase stationnaire) ; la différenciation et la production
d’antibiotiques.
• Communications entre bactéries : quorum sensing ; biofilms.
- Bactériologie médicale :
• La bactériologie médicale, la notion d’infection, le diagnostic bactériologique, les infec-
tions liées aux soins.
• Les relations hôtes bactéries, notion de virulence.

• Microbiologie cellulaire : modèle Listeria monocytogenes ou E. coli uropathogènes ou
tuberculose.
• Mode d’action et mécanismes de résistance aux antibiotiques.
• Eléments génétiques et résistance aux antibiotiques.
c) Organisation pédagogique
- L'enseignement, qui se déroulera sur deux semaines à plein temps, est composé de cours magis-
traux et de travaux de groupe encadrés sous forme d'analyse d'articles.
- Organisation des travaux dirigés par groupe de 16 étudiants : analyse d’articles avec exposés de 30
minutes et 15 minutes de questions par binôme.
d) Pré-requis
Aucun pré-requis n'est exigé pour suivre cette unité d'enseignement.
3. Equipe pédagogique
Animateurs de l'équipe : Guennadi Sezonov et Wladimir Sougakoff.
Cours Magistraux : Guillaume Arlet, Houssein Benabdelhak, Pierre Netter, Guennadi Sezonov et
Wladimir Sougakoff.
Travaux Dirigés : Guillaume Arlet, Houssein Benabdelhak, Pierre Netter, Guennadi Sezonov et
Wladimir Sougakoff.