GUIDE DES ÉQUIPEMENTS ET DES SERVICES

GUIDE DES ÉQUIPEMENTS ET DES SERVICES
BIOPUCES ET GÉNOTYPAGE
ÉQUIPEMENTS
Équipement Manufacturier Modèle Équipement
Libre-service
Équipement
avec service
GeneTitan, lecteur,
micro-matrices,
automatisé
Affymetrix GeneTitan
Instrument non oui
Lecteur, micro-
matrices
(microarray scanner) Affymetrix
GeneChip Scanner
3000 7G Plus non oui
Bioanalyseur 2100 Agilent G2938C non oui
Robot, type Beckman
BIOMEK FXP, pipetteur
automatique
multicanaux
Beckman
Coulter A31844 non oui
PCR, quantitatif, RT-
PCR, à haut débit Applied Biosystems 7900HT non oui
Nanophotomètre VWR Nanophotometer
Pearl non oui
Lecteur, plaques, UV Biotek
Instruments uQuant non oui
Spectrophotomètre,
tubes UV + visible
Bichron Ultrospec 3100 non oui
SERVICES
La plateforme de biopuces et génotypage offre des services spécialisés et compétitifs en transcriptomique et
génomique.
Sytème GeneTitan®
Automatisation de l’hybridation, du traitement fluidique et du balayage des biopuces en un seul instrument.
Ce système fonctionne avec des biopuces en plaques
• Biopuces d’expression disponibles en plaques de 16, 24 ou 96 échantillons
• Biopuces de génotypage disponibles en plaques de 96 ou 384 échantillons
Applications possibles : expression des gènes (à l’échelle du transcriptome), expression des microARN et
génotypage de SNP (à l’échelle du génome).
Plateformes scientifiques du CRCHUM Responsable technique Responsable scientifique
Biopuces et génotypage Gilles Corbeil Johanne Tremblay, Ph. D.
Téléphone : 514 890-8000 #31416
[e-mail] 29 juillet 2015

Système GeneChip®3000
Ce système comprend un four d’hybridation 645, trois stations fluidiques 450 et un scanner 3000 7G Plus. Ce
système fonctionne avec des biopuces en cartouches.
Applications possibles : expression des gènes et des exons (à l’échelle du transcriptome), épissage alternatif,
expression des microARN, analyse RIP-Chip, analyse ChiP-on-Chip, génotypage de SNP (à l’échelle du
génome), analyse des CNV (à l’échelle du génome).
Bioanalyseur 2100
Instrument qui utilise la microfluidique pour l’analyse de l’ARN.
• Cet instrument fonctionne avec des nanopuces et des picopuces
• Échelle de concentration pour le kit RNA 6000 Nano : 25 à 500 ng/µl d’ARN total et 25 à 250 ng/µl
d’ARNm
• Échelle de concentration pour le kit RNA 6000 Pico : 50 à 5000 pg/µl d’ARN total et 250 à 5000 pg/µl
d’ARNm
Applications possibles : analyse de la qualité de l’ARN total (algorithme RIN), analyse de l’ARNm et distribution
de la taille des ARNc et des ADNc.
Robot Biomek® FXP
Robot de pipetage entièrement automatisé avec deux bras fonctionnant de manière indépendante
Ce robot comprend :
• un bras muni d’une tête à 8 canaux à écartement variable (Span-8)
• un bras muni d’une tête à 96 canaux
• un dispositif statique à effet Peltier
• un dispositif remueur à effet Peltier
• un PCR automatisé (PTC-200)
Applications possibles : préparation de plaque PCR pour le génotypage de colonies de souris et de rats et
préparation d’échantillons pour la plateforme Affymetrix (expression et génotypage).
PCR en temps réel 7900HT Fast
Réactions de PCR en temps réel (qPCR) à haut débit
Caractéristiques de l’appareil :
• Bloc Fast de 96 puits
• Utilise la technologie TaqMan®
• Utilise la technologie SYBR® Green
Applications possibles : expression de gènes, génotypage de SNP et analyse de CNV.
NanoPhotomètreTM Pearl
Spectrophotomètre pour très petits volumes.
Volume d’échantillon requis et intervalle de concentration pour l’ARN :
• Lid5 : 3.5 - 5 µl / 2 - 300 ng/µl
• Lid10 : 1 - 3 µl / 4 - 600 ng/µl
• Lid50 : 0.3 - 2 µl /20 - 3000 ng/µl
Applications possibles : dosage de l’ADN double brin, dosage de l’ADN simple brin, dosage de l’ARN.
Plateformes scientifiques du CRCHUM Responsable technique Responsable scientifique
Biopuces et génotypage Gilles Corbeil Johanne Tremblay, Ph. D.
Téléphone : 514 890-8000 #31416
[e-mail] 29 juillet 2015