Protocole pour la réalisation d`un herbier

 L3MA – UMR ECOFOG Protocole pour la réalisation d’un herbier Présentation de la base Aublet2 de l’Herbier de Guyane
Emeline Houël 01/08/2007 PROTOCOLE HERBIER SOMMAIRE INTRODUCTION 1. RECOLTE 2. SECHAGE 3. ETIQUETTES 4. ANNEXES 4.1. La constitution d’un herbier 4.2. Copies d’écran du site de l’Herbier de Cayenne (base Aublet2): Liste des localités, Taxons, Liste des grands types d’habitats en Guyane française 4.3. Liste des familles présentes en Guyane française 4.4. Liste simplifiée des habitats 4.5. Liste partielle des types biologiques 4.6. Liste partielle des phénologies INTRODUCTION A. L’Herbier de Guyane: L'Herbier de Guyane, créé en 1965, est géré par l'IRD dans le cadre de son Unité de Service "BIODIVERSITE VEGETALE TROPICALE : CONNAISSANCE ET VALORISATION" (IRD N°84 BIODIVAL). Il comprend plus de 150.000 spécimens de la flore de la région des Guyanes gérés et exploités par la Base de données AUBLET 2. Il joue un rôle fondamental en tant qu'observatoire de la flore régionale et participe activement aux programmes nationaux et internationaux d'inventaires floristiques et de rédaction de flores tropicales. C'est également un outil incontournable pour la valorisation de la biodiversité végétale, l'aide à la décision et l'expertise. Un fond documentaire important est associé à l'Herbier et à la Base de données. L’Herbier et la base de données sont des outils de base pour la recherche fondamentale, la valorisation et l’aide au développement, l’expertise et la formation. B. La base Aublet 2 La base AUBLET2 réunit les données concernant les spécimens botaniques collectés sur le plateau des Guyanes, surtout en Guyane Française, et déposés à l'Herbier de Guyane (CAY). Elle a pour but de gérer l'Herbier à Cayenne, et de mettre à la disposition des utilisateurs les informations qu'il contient. Elle permet en outre de sélectionner des informations répondant à des requêtes spécifiques. La base de données Aublet a été créée en 1988 par M. Hoff, G. Cremers, C. Feuillet et J.‐J. de Granville et administrée jusqu'en 1997 par G. Cremers et M. Hoff. C. La constitution d’un herbier (d’après R.A.A. OLDEMAN) Voir document en annexe. 1. RECOLTE ‐ Lors de la récolte, se munir d’un carnet de collecte (modèle Herbier CAY ou autre) afin de pouvoir noter sur place : . le récoltant . le numéro de récolte : les numéros d’herbier doivent être séquentiels (pas d’interruption dans la liste) et de préférence dans l’ordre des dates de récolte. . éventuellement genre / espèce / famille ou nom vernaculaire. Les noms seront ensuite systématiquement vérifiés grâces flores (= ouvrages permettant de déterminer les plantes), aux révisions et aux monographies (disponibles à l’Herbier de Cayenne). . la date . la localité (commune et localisation précise, par exemple le PK, le lieu‐dit…) . l’écologie du lieu de récolte : type d’habitat ou milieu . la phénologie (c'est‐à‐dire l’état de l’échantillon prélevé pour l’herbier : stérile, fleurs, fruits…) . le type biologique (herbacée, arbre, arbuste…) . une indication de la taille de la plante vivante : hauteur et/ou diamètre (ou circonférence) Ces données seront reportées sur l’étiquette pour le montage (voir 3.). ‐
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Se munir soit de grilles, de cordes et de journaux (format France Guyane) pour faire les herbiers sur place, soit d’un sac plastique (avec un peu d’eau au fond, permet de conserver un certain temps la fraîcheur des feuilles), de scotch et de marqueurs (afin de numéroter les rameaux), d’un sécateur / couteau / machette. Faire la description de l’échantillon avant séchage : il faut décrire au moins tout ce qui disparait au séchage (couleur, texture, odeur… pour les feuilles, les fleurs, les fruits…). L'écorce est aussi une caractéristique de l’espèce. Un échantillon doit être représentatif du végétal que l'on veut illustrer. Il faut récolter également un fragment représentatif de rameau ou de la tige, pour montrer de quelle manière sont insérées les feuilles, car l’insertion des feuilles est caractéristique pour une espèce donnée (feuilles opposées, alternes ou en verticille, présence de stipules, d’épine, de gaine, feuilles simples ou composées, etc.). Par exemple dans le cas de plantes à feuilles composées, bien prendre garde à ne pas prendre qu’une seule feuille mais bien un rameau comportant plusieurs feuilles afin de garder visible leur insertion. Sinon on ne voit que l’insertion des folioles… Si la plante est très grande et qu’il est impossible de la mettre en l'état dans l'herbier, on peut préciser la taille de la plante, et quel est le morceau prélevé (exemple : morceau d’inflorescence terminale) ou préciser si c’est une feuille basale ou caulinaire. Les feuilles ‐
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basales n’ont pas toujours la même forme que les feuilles se trouvant sur la tige. De même, les feuilles proches de l'inflorescence peuvent avoir une forme différente de celles qui en sont éloignées. Et c'est évidemment une caractéristique de l'espèce en question. Exemple : Passiflora coccinea Aubl.: coller juste une feuille n'est pas représentatif. Il faut avoir un morceau de tige, sur laquelle sont insérées des feuilles, ainsi que les vrilles qui accrochent la plante sur son support. Pour la plupart des plantes, les faces supérieures et inférieures des feuilles ne sont pas identiques, il faut donc avoir au minimum deux feuilles par plante. Les graines peuvent être mises dans des petits sachets en papier. Lors de la récolte un point GPS pourra également être pris si un GPS est disponible (recommandé) Des photos de la plante sur pied et/ou des échantillons frais pourront être jointes à l’herbier pour être intégrées dans la base de données Aublet2 avec le même numéro de collecte que l’échantillon (numérotation des photos : NOM_RECOLTANT/N°HERBIER/x si plusieurs photos ex : HOUEL2a). 2. SECHAGE Le séchage peut se faire soit à l’Herbier (étuve à 60°C) soit en ambiance climatisée (intérêt : permet de mieux conserver la couleur des plantes). Les échantillons doivent être placés dans des journaux (format France Guyane) pour le séchage, avec une feuille retourner afin de pouvoir observer directement les faces supérieure et inférieure du limbe une fois la planche montée. Les feuilles peuvent être repliées si jamais elles dépassent du format du journal, ce n’est pas gênant. Dans tous les cas, placer entre chaque échantillon des cartons (découpés au format du journal) et presser les échantillons (grilles ou poids) afin d’assurer un séchage des feuilles bien à plat. 3. ETIQUETTES Pour que les échantillons puissent être montés en planches, il est nécessaire de compléter des étiquettes : Ne pas oublier le nom du Coordonnées soit relevées sur le terrain avec le GPS soient complétées à posteriori avec la liste des localités de la base Aublet (chercher la référence la plus proche) : http://www.cayenne.ird.fr/a
ublet2/ puis >Localités > Localités de Guyane française Description de ce qui disparait au séchage et éventuellement des critères botaniques qui permettent la détermination N° herbier Déterminateur : ce peut‐être le collecteur ou toute personne capable de reconnaître la plante, mais seules les déterminations effectuées par des spécialistes peuvent être considérées lors de comparaisons. Duplicate : nombre de parts. Au moins une part pour l’Herbier de Cayenne (acronyme CAY) et éventuellement une part envoyée à l’herbier où se trouve le spécialiste de la famille (demander à l’Herbier) par exemple : Missouri Botanical Garden (MO), Paris (P), New York (NY), Utrecht (U), Washington (US), Kew (K), Berlin (B). La confirmation ou correction de la détermination par le spécialiste sera reportée sur l’étiquette et dans la base Aublet2. Date de récolte
descripteur et bien vérifier l’orthographe du nom. Le plus simple : vérification ou copier/coller depuis http://www.cayenne.ird.fr/aubl
et2/ puis > Taxons : taper le nom et Soumettre. En cliquant sur le nom on accède à Famille / Genre / Espèce / Synonymes et en cliquant sur Specimen aux échantillons classés à CAY (voir copie d’écran en annexe). Possible d’utiliser ces informations comme aide pour remplir les champs type bio / habitat / description. Autre lien pour des vérifications : liste des plantes du plateau des Guyanes sur http://www.mnh.si.edu/biodiver
sity/bdg/planthtml/index.html (depuis la page d’accueil d’Aublet : > Biological Diversity of the Guianas > BDG Publications and Resources > Plant Checklist > Checklist of the Plants of the Guianas) En premier recours voir la liste simplifiée fournie en annexe. La liste intégrale des habitats CORINE‐Biotope (liste « officielle ») est disponible sur le site http://www.cayenne.ird.fr/aubl
et2/ puis > Habitats > Liste des espèces par habitat. On accède à la liste des grands types d’habitats en Guyane française. Cliquer sur l’habitat souhaité puis bouton Soumettre pour accéder à la liste des habitats rattachés au type (habitats détaillés). 4. ANNEXES 4.1. La constitution d’un herbier 4.2. Copies d’écran du site de l’Herbier de Cayenne (base Aublet2): ¤ Liste des localités ¤ Taxons ¤ Liste des grands types d’habitats en Guyane française 4.3. Liste des familles présentes en Guyane française ACANTHACEAE CARYOPHYLLACEAE GENTIANACEAE MONIMIACEAE SABIACEAE ACERACEAE CARYOCARACEAE GESNERIACEAE MORACEAE SANTALACEAE ACORACEAE CASUARINACEAE GINKGOACEAE MORINGACEAE SAPINDACEAE ACTINADIACEAE CECROPIACEAE GLEICHENIACEAE MUSACEAE SAPOTACEAE ADANTIACEAE CELASTRACEAE GNETACEAE MYOPORACEAE SAURURACEAE AGAVACEAE CHENOPODIACEAE GOODENIACEAE MYRICACEAE SAXIFRAGACEAE SCHISANDRACEAE ALANGIACEAE CHLORANTHACEAE HAMMAMELIDACEAE MYRISTICACEAE ALISMATACEAE CHRYSOBALANACEAE HEMONORACEAE MYRSINACEAE SCHIZAEACEAE ALSEUOSMIACEAE CLUSIACEAE HERNANDIACEAE MYRTACEAE SCROPHULARIACEAE AMARANTHACEAE COMBRETACEAE HIPPOCASTANACEAE NYCTAGYNACEAE SELAGINELLACEAE AMBORELACEAE COMMELINACEAE HUMIRIACEAE NYMPHAEACEAE SIMAROUBACEAE ANACARDIACEAE COMPOSITAE HYDRANGEACEAE OCHNACEAE SMILACACEAE ANCISTROCLADDACEAE CONNARACEAE HYMENOPHYLLACEAE OLACACEAE SOLANACEAE ANISOPHYLLEACEAE CONVALLARIACEAE HYPERICACEAE ONAGRACEAE SPHENOSTEMONACEAE ANNONACEAE CONVOLVULACEAE HYPOCYDACEAE OPILIACEAE STAPHYLEACEAE APIACEAE CORNACEAE ICACINACEAE ORCHIDACEAE STEMONACEAE APOCYNACEAE CORYNOCARPACEAE IRVINGIACEAE OXILIDACEAE STERCULIACEAE AQUIFOLIACEAE COSTACEAE IXONANTHACEAE PAEONIACEAE STROMATOPTERIDACEAE ARACEAE CRASSULACEAE JUGLANDACEAE PANDACEAE STYRACACEAE ARALIACEAE CTENOLOPHONACEAE LABIATEAE PARACRYPHIACEAE SYMPLOCACEAE ARAUCARIACEAE CUCURBITACEAE LAMIACEAE PASSIFLORACEAE TACCACEAE ARECACEAE CUNONIACEAE LARDIZABALACEAE PENTAPHRAGMATACEAE THEACEAE ARISTOLOCHIACEAE CUPRESSACEAE LAURACEAE PHELLINACEAE THELYPTERIDACEAE ASCLEPIADACEAE CYCADACEAE LECYTHIDACEAE PHOIPTELEACEAE THYMELAEACEAE ASPARAGACEAE CYPERACEAE LEEACEAE PHORMIACEAE THYMELAECEAE ASTELLIACEAE DAPHNIPHYLLACEAE LEGUMINOSAE PHYLESACEAE TILIACEAE ASTERACEAE DAVALLIACEAE LEGUMINOSAE‐FABACEAE PHYTOLACCACEAE TRIGONACEAE AUCUBACEAE DENNSTAEDTIACEAE LEGUMINOSAE‐
CAESALPINIACEAE PIPERACEAE TRIMENIACEAE AVICENNIACEAE DICHAPETALACEAE LEGUMINOSAE‐
MIMOSACEAE PITTOSPORACEAE ULMACEAE BALANOPACEAE DICKSONIACEAE LEGUMINOSAE‐
PAPILIONACEAE PLUMBAGINACEAE URTICACEAE BALANOPHARACEAE DILLENIACEAE LICHEN POACEAE VALERIANACEAE BALSAMINACEAE DIOSCOREACEAE LILIACEAE PODOCARPACEAE VERBENACEAE BETULACEAE DIPTEROCARPACEAE LINACEAE POLEMONIACEAE VIOLACEAE BIGNONIACEAE DRACAENACEAE LOGANIACEAE POLYGACEAE VISCACEAE BIXACEAE DRYPTERIDICACEAE LORANTHACEAE POLYGONACEAE VITACEAE BLECHNACEAE EBENACEAE LYCOPODIACEAE POLYPODIACEAE VITTARIACEAE VOCHYSIACEAE BOMBACACEAE ELAEOCARPACEAE LYGODIACEAE PRIMULACEAE BORAGINACEAE EPACRIDACEAE LYTHRACEAE PROTEACEAE WINTERACEAE BRASSICACEAE ERICACEAE MAGNOLIACEAE QUIINACEAE XANTHOPHYLLACEAE BUDDLEJACACEAE ERIOCAULACEAE MALPIGHIACEAE RANUNCULACEAE XANTHORROHEACEAE BURSERACEAE ERYTHROXYLACEAE MALAVCEAE RAPATACEAE ZINGIBERACEAE CAMPANULACEAE ESCALLONIACEAE MARANTACEAE RHABDODENDRACEAE ZYGOPHYLLACEAE CANNABACEAE EUPHORBIACEAE MARATTIACEAE RHAMNACEAE CAPPARACEAE FAGACEAE MELASTOMATACEAE RHIZOPHORACEAE CAPPARIDACEAE FLACOURTIACEAE MELIACEAE ROSACEAE CAPRIFOLIACEAE FLAGELLARIACEAE MENISPERMACEAE RUBIACEAE CARLEMANNIACEAE GANODERMATACEAE METAXYACEAE RUTACEAE 4.4 Liste simplifiée des habitats de Guyane française Bord de route en végétation ouverte Bords de pistes forestières Bords de route et de pistes Bords de routes forestières Cours et abords des maisons Cultures Défrichement récent Forêt dégradée Forêt exploitée Forêt inondable Forêt primaire Forêt primaire, bas fonds humide Forêt secondaire Forêt sur sable blanc Jardins Layons forestiers Mangrove Plantation d’arbres Plante cultivée Plante cultivée sur brûlis Savane Savane inondée Savanes‐roches Terrains vagues Végétation des bords de mer Végétation secondaire Zone rudérale 4.5 Liste partielle des types biologiques ARBRISSEAU ARBRE ARBUSTE PALMIER HERBACEE TERRESTRE ARBUSTE LIANESCENT LIANE 4.6 Liste partielle des phénologies Stérile Inflorescences Fleurs Infructescences Fruits Boutons floraux