Rapport final thèse CHEVIN A

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Aix Marseille Université I – Université de Provence
Thèse
Pour obtenir le grade de
Docteur de l’Université d’Aix Marseille Université I
Mention : Bioinformatique, biochimie structurale et génomique
Présentée et soutenue publiquement par
Aurore Chevin
Le 10 septembre 2012
Le virus de la paralysie chronique de l’abeille :
contribution à l’étude de la caractérisation de
protéines virales
Jury :
Dr. Decroly Etienne Président du jury
Dr. Tordo Noël Rapporteur
Dr. Le Conte Yves Rapporteur
Dr. Darbon Hervé Directeur de thèse
Dr. Thiéry Richard Co-directeur de thèse
Dr. Chabert Magali Examinateur

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A la mémoire de J-E. Chevin (1954-2009)
Om mani padme hum
(Mantra tibétain)

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Sommaire
Sommaire ................................................................................................................... 5
Remerciements.........................................................................................................10
Liste des figures .......................................................................................................12
Liste des tableaux ....................................................................................................13
Liste des abréviations ..............................................................................................14
Introduction générale ...............................................................................................17
PARTIE 1 : Introduction bibliographique ..................................................................23
Chapitre 1 : La paralysie chronique de l’abeille et son agent étiologique ..............25
I. Syndromes........................................................................................................................................ 27
II. Détection .......................................................................................................................................... 28
III. Transmission .................................................................................................................................. 31
A. Transmission verticale via la reine............................................................................................31
B. Transmission horizontale .......................................................................................................... 32
1. Transmission indirecte.......................................................................................................... 32
a) Par Varroa destructor ................................................................................................... 32
b) Par des fourmis............................................................................................................. 33
2. Transmission par voie trophique .......................................................................................... 34
3. Transmission par contact...................................................................................................... 35
IV. Répartition du virus et de la maladie ........................................................................................... 36
A. Répartition géographique et saisonnière .................................................................................. 36
B. Répartition dans la ruche .......................................................................................................... 38
C. Localisation du virus dans l’abeille............................................................................................ 39
1. Dans l’abeille entière ............................................................................................................39
2. Dans le système nerveux ..................................................................................................... 39
Chapitre 2 : Etude du virus : la particule virale........................................................43
I. Sa morphologie ................................................................................................................................ 45
II. Son génome..................................................................................................................................... 47
III. La position phylogénétique du CBPV.......................................................................................... 49
IV. Les protéines du CBPV ................................................................................................................. 53
A. Protéines non-structurales putatives......................................................................................... 53