Facteurs explicatifs de la répartition spatiale en Afrique

UNIVERSITE DES ANTILLES ET DE LA GUYANE
UFR SCIENCES EXACTES ET NATURELLES
THESE
Pour obtenir le grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DES ANTILLES ET DE LA GUYANE
En
Sciences de la vie
Ecoles Doctorale Pluridisciplinaire de l’Université des Antilles et de la Guyane
Présentée et soutenue publiquement
Le 25 avril 2014
Par
Laure BOURNEZ
Titre
Facteurs explicatifs de la répartition spatiale en Afrique australe de deux
espèces de tiques parapatriques, vectrices de la cowdriose, Amblyomma
variegatum et A. hebraeum, et rôle de la compétition
Devant le jury composé
Rapporteur Dr Marius GILBERT, Université Libre de Bruxelles
Rapporteur Pr Maxime MADDER, Institute of Tropical Medicine, Antwerpen
Examinateur Dr Dominique MARTINEZ, CIRAD Guadeloupe
Directeur de thèse Dr Thierry LEFRANCOIS, CIRAD Montpellier
Co-directeur Dr Abdennebi OMRANE, Université des Antilles et de la Guyane
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REMERCIEMENTS
Je tiens à remercier sincèrement Marius Gilbert et Maxime Madder pour avoir accep d’être les
rapporteurs de cette thèse. Je remercie doublement Dominique Martinez pour avoir accepté de faire
partie du jury de thèse, et pour avoir aidé au lancement de ce projet de thèse.
Je remercie chaleureusement Thierry Lefrançois pour m’avoir donné l’opportunité de cette thèse, pour
son suivi et ses conseils tout le long de la thèse.
Je remercie Jennifer Pradel pour son aide, son soutien, ses conseils toujours pertinents qui m’ont
souvent aidée et confortée dans mes choix.
Je remercie Abdennebi Omrane pour avoir accepté d’être mon co-directeur de thèse, sa gentillesse et
ses conseils mathématiques.
Cette thèse fut pour moi très riche en expériences. J’ai eu l’occasion d’échanger et de travailler avec
de nombreuses personnes, que ce soit en Guadeloupe, au Mozambique et à Montpellier. Je remercie
sincèrement Renaud Lancelot pour son investissement dans ce projet, ses nombreux conseils, et son
aide sur les analyses. Merci à Frédéric Stachurski pour sa patience, et ses réponses très détaillées à mes
très nombreuses et longues questions, et son aide sur la partie expérimentale. Je remercie également
David Pleydell pour son aide essentielle sur le modèle de compétition et pour les discussions générales
en écologie, sur la compétition et la dynamique des populations, qui m’ont aidée à me poser les
bonnes questions. Un grand merci à Jérémy Bouyer qui a su voir comment tourner autrement une
partie de l’analyse et le résultat n’en était que plus surprenant ! Je n’oublie pas Rosalie Aprelon, Ken
Giraud-Gerard, et Loïc Jacquet-Crétides pour leur aide sur la mise en place de ma petite expérience et
pour leurs expertises sur l’élevage de tiques. Je remercie Rupert Pegram pour ses conseils et son
intérêt à mon travail. Je remercie Karine Huber d’avoir pris le temps de discuter un peu avec moi sur
la génétique de populations des tiques. Je remercie également pour son soutien Nathalie Vachiery.
Au Mozambique, je remercie chaleureusement Luis Neves pour son accueil, son aide et ses conseils, et
surtout son enthousiasme sur le projet et son investissement. Je tiens à remercier pleinement Nidia
Cangi pour son accueil dans sa maison, toute son aide que ce soit pour le terrain, les expériences, la
recherche d’informations. Je remercie également Balbina Müller et Erika Cangi pour leur accueil
chaleureux dans leur maison. Un grand merci. Je remercie toutes les personnes qui nous ont aidés sur
le terrain en particulier Gito et Nelo, Vladimiro, Elizabeth Specht pour son accueil, les techniciens ou
vétérinaires des services vétérinaires des districts, et tous les éleveurs. Je remercie également Susanna
pour avoir pris le temps de rechercher les informations dont j’avais besoin. Je remercie toutes les
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personnes du centre biotechnologique de l’université Eduardo Mondlane pour leur accueil chaleureux,
en particulier Iara, Valter et Fernando pour m’avoir accueillie dans leur bureau. Je remercie également
Alain Boulanger pour son aide quand il y en avait besoin.
Je remercie toutes les personnes du laboratoire CIRAD Duclos pour leur accueil chaleureux, les
nombreuses discussions et rires autour du café ou d’une coupe de champagne.... J’ai passé de très bons
moments avec vous, merci. Je remercie en particulier pour leur soutien et leur compréhension, et pour
tous les bons moments, Aurélie, Willy, Ludovic, Marion, Stéphanie, et surtout Amal, ma co-thésarde.
Je remercie Céline pour sa présence continue, son soutien et son incroyable aide pour la relecture de ce
manuscrit.
Je remercie toutes les autres personnes qui ont rendu cette période plus agréable et ont parfois
supporter mes moments de stress, je pense en particulier à Sylvio et Aurore. A mes amis lointains qui
ont toujours su m’accueillir lors des voyages transitoires et m’ont soutenue malgré la distance : merci
à Charline, Olivia et Fanny. Je remercie également Cathy pour son écoute et son accueil chaleureux à
Montpellier.
Et enfin je remercie mes parents, Marie et Claire pour leur soutien et leur présence infaillible à mes
cotés.
5
TABLE DES MATIERES
RESUME ................................................................................................................................................ 7
LISTE DES FIGURES ....................................................................................................................... 11
LISTE DES TABLEAUX ................................................................................................................... 13
INTRODUCTION .............................................................................................................................. 14
PARTIE I : PRESENTATION GENERALE DU MODELE ET DE LA REGION D’ETUDE ... 21
1. GENERALITES SUR A. VARIEGATUM ET A. HEBRAEUM ............................................................. 23
1.1. Taxonomie et caractéristiques morphologiques ................................................................................... 23
1.2. Aires de distribution d’A. variegatum et A. hebraeum ........................................................................ 24
1.3. Cycle biologique .................................................................................................................................. 26
1.4. Fixation sur l’hôte et processus d’accouplement ................................................................................. 27
1.5. Facteurs climatiques influençant la survie des tiques et maintien de la balance hydrique................... 29
1.6. Mécanismes de régulation des populations de tiques .......................................................................... 31
1.7. Impact des deux espèces sur la santé animale et la santé publique ...................................................... 36
2. PRESENTATION DE LA REGION D’ETUDE L’AFRIQUE AUSTRALE ..................................... 41
2.1. Quelques généralités sur l’élevage des ruminants en Afrique australe ................................................ 41
2.2. Présentation générale du Mozambique ................................................................................................ 44
2.3. Présentation générale du Zimbabwe .................................................................................................... 52
2.4. Synthèse ............................................................................................................................................... 56
PARTIE II : A. VARIEGATUM ET A. HEBRAEUM, DEUX ESPECES POTENTIELLEMENT
COMPETITRICES ............................................................................................................................. 57
1. COMPETITION, COEXISTENCE ET PARAPATRIE ........................................................................ 59
1.1. Compétition interspécifique et intraspécifique .................................................................................... 59
1.2. Compétition exclusive et coexistence des espèces .............................................................................. 60
1.3. Déterminants des distributions parapatriques ...................................................................................... 61
1.4. Synthèse ............................................................................................................................................... 63
2. INTERACTIONS INTERSPECIFIQUES ENTRE A. VARIEGATUM ET A. HEBRAEUM ............. 64
2.1. Degré de chevauchement des niches d’A. variegatum et A. hebraeum................................................ 64
2.2. Compétition et différence des traits d’histoire de vie d’A. variegatum et A. hebraeum ...................... 77
2.3. Potentiels mécanismes de compétition interspécifique entre A. variegatum et A. hebraeum .............. 80
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