Thèse Cifre Hiérarchisation intégrée des valeurs de conservation

Bureau d’Etudes Hémisphère Sub / Laboratoires LEMAR IUEM & URU 420 Rennes 1
Thèse Cifre
Hiérarchisation intégrée des valeurs de conservation des estrans rocheux du
littoral breton : application méthodologique à la problématique Natura 2000
Le cadre de la thèse
Contexte :
Laboratoire des Sciences de
l’Environnement Marin
CNRS/UBO UMR 6539
Université de Bretagne Occidentale
Institut Universitaire Européen de
la Mer, Technopôle Brest-Iroise
29280 Plouzané
Le LEMAR, UMR 6539 CNRS, est un
laboratoire qui regroupe des
biologistes, des chimistes et des
physiciens pour comprendre et
modéliser les systèmes marins
au sein de la biosphère, définir les
caractéristiques du milieu et des
organismes, et préciser leurs
interactions.
La forte interdisciplinarité mise en
œuvre est indispensable pour aborder
un domaine complexe comme les
interactions entre les diverses
composantes du domaine marin.
Les enjeux de la conservation des estrans rocheux sont
particulièrement forts du fait de la richesse reconnue de leur faune
et flore marine et des fortes pressions anthropiques qui s’exerce sur
ces substrats par la pêche à pied, les pollutions portuaires ou
urbaines ou encore le piétinement.
De nombreux programmes nationaux et internationaux tels que la
Directive Cadre Eau (« EC Water Framework Directive »), Natura
2000 ou encore les Aires Marines Naturelles Protégées, ont mis en
évidence la nécessité d’améliorer les connaissances fondamentales
sur la structure et la dynamique de ces habitats et de développer
des critères d’évaluation de leur qualité écologique. Ces recherches,
basées essentiellement sur l’analyse de la biodiversité de la
macrofaune et de la macroflore des estrans rocheux, doivent
permettre de caractériser les cinétiques de dégradation et/ou de
restauration sous les contraintes naturelles et anthropiques.
Objectifs :
Acquérir des connaissances fondamentales permettant de
caractériser l’état écologique d’un estran rocheux et sa dynamique
dans le temps, mettre au point des outils de diagnostic accessibles
aux gestionnaires d’Aires Marines Protégées
Il s’agira en particulier de :
- Identifier les réponses des peuplements macrofaune/flore des
estrans rocheux soumis à différentes perturbations (pêche à
pied, pollutions portuaires et urbaines, piétinement)
- Déconvoluer les signaux issus de ces perturbations et les
caractériser
- Elaborer des méthodologies d’évaluation de la qualité écologique
des estrans par la recherche d’indicateurs spécifiques à chaque
type de perturbation sur des habitats ciblés
Biodiversité
Gestion des
territoires
Le secteur d’étude
Région Bretagne
Laboratoire URU 420
Bâtiment 25 - Université de Rennes 1
35000 Rennes
Le laboratoire URU 420 anciennement
ERT 52, est un laboratoire de
biodiversité fonctionnelle et de
gestion des territoires. Ses activités
de recherche s'inscrivent dans les
champs de la biodiversité
patrimoniale, de la biodiversité
fonctionnelle et du transfert des
connaissances. Elles concernent
davantage l’environnement terrestre
mais se diversifient depuis peu dans
l’environnement littoral et subtidal.
Le secteur de la Bretagne présente toutes les caractéristiques
nécessaires au développement du projet de recherche du fait de sa
situation entre les façades Atlantique et Manche, de la diversité de
ses paysages (îles, baies abritées, littoraux rocheux) et de la variété
de ses mosaïques d’habitats rocheux (nombreux champs de blocs,
roche en place…).
Les étapes de la thèse
Choix d’estrans soumis à différents types de perturbation

Choix de n estrans par type de perturbation, regroupés dans un
grand secteur biogéographique, présentant un gradient
d’exposition à une perturbation majeure et les mêmes
caractéristiques de faciès entre eux (hydrodynamisme et
architecture)
Définition de composants structuraux
Le bureau d’études HEMISPHERE SUB
Pôle de compétences en milieu marin
Division ECOSUB
6, rue de la mer
22380 Saint-Cast Le Guildo
Créé en 2005, Hémisphère Sub et sa
division ECOSUB souhaite répondre à
une majorité de problématiques
environnementales aux quelles font
face les professionnels de
l’environnement, mais aussi les
collectivités locales, les institutions
régionales et gouvernementales.
Trois domaines d’étude principaux :

Biologie et écologie

Cartographie

Imagerie


Affiner les typologies des habitats existantes - Eunis et Cahier
d’Habitats Côtiers Natura 2000 - en identifiant des sous-habitats
et/ou
microhabitats
rocheux
permettant
d’intégrer
l’hétérogénéité et la complexité architecturale des estrans
rocheux
Mise en place d’une approche stationnelle sur ces composants
qui serviront d’unités de référence et de comparaison intra et
inter estrans
Conception et développement de méthodologies d’évaluation de la
qualité écologique des estrans :




Recherche d’indicateurs spécifiques à chaque type de
perturbation sur des habitats ciblés à partir de :
Descripteurs et paramètres adaptés (Diversité, abondance,
biomasse…)
La richesse et composition spécifique des assemblages
d’espèces
La recherche d’espèces caractéristiques d’un gradient de
dégradation (Application méthode Indval basée sur
Présence/absence des espèces)
La représentativité des fluctuations des groupes fonctionnels
(Indice AMBI)
Les ratios espèces généralistes/ espèces spécialistes
Recherche de bioindicateurs (Macroalgues et Mollusques)
Mise au point d’un Indice de Valeur Patrimoniale
Régionale des espèces basé sur :
L’occurrence des espèces ou la
rareté des espèces
inféodées aux substrats rocheux
La constitution d’une base de données
Conception d’un Indice Global Normalisé de type SMART
Utilisation et valorisation des résultats acquis dans le cadre du
programme REBENT rocheux par le LEMAR

Valorisation en termes de publications scientifiques et d’outils
d’évaluation et de gestion
Les partenaires




Porteur : Bureau d’études Hémisphère Sub, division ECOSUB
Laboratoires :
- LEMAR, IUEM, Plouzané
- URU 420, Rennes 1
Co-Directeurs de thèse :
- Christian Hily, CR CNRS, HDR
- Frédéric Ysnel, MC, HDR
Doctorante : Maud Bernard