Sciences de la biodiversité

Diplôme : Licence
Sciences de la biod
Sciences de la Vie
La formation :
Résumé
La Biologie
des Organismes et des Populations est un champ très large englobant des disciplines scientifiques diverses reliées
entre elles par une approche duale : écologie et évolution. Exprimé autrement, l’enseignement proposé s’organise
autour des relations entre l’organisme et son génome (génétique, développement), entre les organismes
(génétique et dynamique des populations), entre les organismes et leur milieu (écologie, écophysiologie,
microbiologie), et autour des changements affectant les organismes au cours du temps en conséquence des ces
relations (évolution, phylogénèse, zoologie, botanique). Les sciences auxiliaires de l’écologie et de l’évolution sont
aussi bien présentes, en particulier les mathématiques et statistiques appliquées à la biologie, ainsi que la biologie
moléculaire.
Parmi les savoir-faire acquis grâce à ce parcours, la capacité d’observer, de manipuler et de comprendre le monde
vivant, de pouvoir lui appliquer une démarche scientifique rigoureuse et d’être capable d’en rendre compte à l’écrit
comme à l’oral, forment une base indispensable à la formation de futures chercheurs, mais aussi de techniciens et
de cadres de l’environnement, de l’administration et de la recherche.
Description
La licence STS mention Biologie, parcours Sciences de la Biodiversité (Ecologie, Evolution, Environnement) se
déroule sur 3 années:
- l'année L1 (semestres 1 et 2) est commune aux 3 mentions de licence du portail "Sciences de la vie et de la
Terre" (Sciences de la Vie, Sciences de la Terre et de l'Univers, Sciences de la Vie et de la Terre). Elle confère une
solide formation scientifique de base. Elle est constituée de 8 UE scientifiques: 3 UE de Biologie, 2 UE de Chimie
Biochimie, 1 UE de Géologie, 1 UE de Mathématiques, 1 UE de Physique, et 2 UE transversales.
- l'année L2 (semestres 3 et 4) comprend 3 UE obligatoires et 3 UE optionnelles de Biologie, permettant de couvrir
les domaines essentiels de la biologie des organismes et d’aborder l’écologie. Les autres UE permettent de
compléter les compétences en biochimie et en mathématiques appliqués à la biologie.
- l'année L3 (semestres 5 et 6) est une année de formation avancée permettant d’acquérir les méthodes et
concepts actuels de l’écologie et de l’évolution. Elle est organisée autour d’un premier semestre à 4 UE
obligatoires, et d’un second avec 2 UE obligatoires et 3 UE à choisir dans une liste diversifiée, dont une UE de
stage (5 semaines), permettant ainsi d’envisager une offre assez large de masters.
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Public concerné :
- Accès en première année (L1) : Baccalauréat ou équivalent.
Des équivalences sont possibles avec des UE de L1 portail "SVT" pour les étudiants, ajournés en PCEM1 et
PCEP1 à Lyon 1, qui auraient obtenu la moyenne dans certaines disciplines
- Accès en deuxième année (L2) : 60 ects validés de L1 portail "SVT", de Lyon 1
- Accès en troisième année (L3) : 120 ects validés de la Licence STS, mention Biologie
Un accès en L2 ou L3 est également possible, sur dossier, après validation par la commission pédagogique de
validation des acquis de formation:
1) pour les étudiants titulaires d'un BTS ou DUT
2) pour les étudiants issus des CPGE (Classes Préparatoires aux Grandes Ecoles)
3) pour les étudiants « reçus collés » de médecine ou pharmacie d'une université française (accès en L2)
4) pour les étudiants issus d'une université française, autre que Lyon 1, ou étrangère
Les passerelles entre parcours de licence Sciences de la Vie
de Lyon 1 sont également possibles.
Un accès en Licence STS mention Biologie peut être envisagé par la Validation des Acquis de l'Expérience
(VAE).
Conditions d'accès :
Niveau de recrutement : BAC 0, BAC +1, BAC +2
Niveau de sortie : BAC +3
voir rubrique "publics concernés"
Responsable de la formation (informations pédagogiques) :
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BERNARD KAUFMANN
Telephone : 0472447953
Email : [email protected]
Contact scolarité (inscription) :
Scolarité de licence STS
Telephone : 04 72 43 29 05
Email : [email protected]
Lieu principal d'enseignement :
●
Villeurbanne - La Doua
Compétences acquises :
Les compétences sont acquises dans les principaux domaines de l’écologie et de l’évolution.
Compétences « naturalistes »
- savoir identifier les organismes animaux et végétaux
- devenir autonome « sur le terrain » face à des questions d’échantillonnage de faune et de flore
Compétences en Génétique et Biologie Moléculaires
- comprendre et pratiquer les manipulations de base (PCR, électrophorèse, séquençage) nécessaire aux sciences
de l’évolution et de l’écologie
Compétences en Microbiologie
- connaître le fonctionnement et la diversité des bactéries et des virus
- utiliser les techniques et concepts de base de la microbiologie et de l’écologie microbienne (génétique
environnementale, clonage, cultures bactériennes)
Compétences en Biologie des Populations
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- générer et manipuler les jeux de données de génétique et de dynamique des populations en utilisant les
méthodes et les logiciels appropriés
Compétences en Bio-mathématiques
- comprendre les principes des statistiques et de la modélisation mathématique
savoir analyser des données biologiques en utilisant les méthodes et les logiciels adéquats (en particulier logiciel
libre R
savoir formaliser un problème biologique en terme de modèlisation ou d’hypothèse biologique
Compétences en Ecologie
- comprendre les principes de l’allocation des ressources dans un organisme, les relations entre les organismes et
les relations entre les organismes et leur milieu
- pouvoir estimer la biodiversité sur le terrain mais aussi en utilisant les techniques mathématiques adéquates
Compétences en Sciences de l’Evolution
- comprendre les concepts actuels de l’évolution des espèces, à la fois d’un point de vue macro-évolutif (sur le long
terme, à travers l’étude de la phylogénèse) et micro-évolutif (à l’échelle des espèces vivantes, par l’étude de la
génétique des populations)
- mettre en œuvre les méthodes de recontruction phylogénétiques, à partir de données morphologiques (fossiles
ou actuelles) ou moléculaires.
compétences transversales:
- connaître et observer les règles de sécurité
- définir et préciser son projet professionnel
- analyser et interpréter les données expérimentales
- savoir rechercher et traiter la documentation
- organiser un travail en équipe
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- maîtriser les outils de la bureautique
- exposer oralement ses résultats et rédiger un rapport
- communiquer en anglais
Débouchés :
La poursuite d'étude
:
- Master (2 années M1 et M2: 120 crédits; accés sur dossier et/ou entretien) à l'université Lyon1 ou dans une autre
université française ou européenne. A l'université Lyon1, les masters "Biodiversité, Ecologie, Evolution" et "Biologie
Végétale" sont les débouchés "naturels" du parcours Sciences de la Biodiversité. La mention "Sciences de l'Eau"
(Lyon 2) est aussi accessible. Plus généralement les Masters "Ethologie", "BEE", "Biologie Végétale",
"Epidémiologie" sont des débouchés possibles.
- préparation du Concours de Recrutement au Professorat des Ecoles (CRPE), ouvert à tout étudiant titulaire d'un
diplôme de Licence. La meilleure mention pour cette orientation est cependant "Sciences de la Vie et de la Terre",
qui offre des stages d'enseignement.
- entrée sur concours ou sur titre en école d'ingénieur ou en école vétérinaires.
Programme de la formation :
Unités d'enseignement Semestre 1
Biomolécules A (6 cts) [UE Obligatoire]
Géosciences 1 (6 cts) [UE Obligatoire]
Diversité du vivant (6 cts) [UE Obligatoire]
Bases de physique pour les sciences de la vie et de la terre (6 cts) [UE Obligatoire]
Description Semestre 1
Cette première année de Licence Sciences et Technologies (L1) du portail SVT permet d’accéder aux trois
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mentions suivantes : 1)Sciences de la Vie, 2) Sciences de la Vie et de la Terre, 3) Sciences de la Terre. Elle est
constituée de deux semestres, le semestre d’automne et le semestre de printemps. Ces deux semestres vous
apporteront une solide formation scientifique de base et sont composés chacun de cinq UE parmi les 10 UE
suivantes: Biomolécules A, Biomolécules B, De la cellule à l’organisme, Diversité du Vivant, Géosciences 1,
Génétique 1, Mathématiques pour Sciences de la Vie, Bases de physique pour les sciences de la vie et de la terre,
transversales 1 et 2.
Unités d'enseignement Semestre 2
Biomolécules B (6 cts) [UE Obligatoire]
Génétique 1 (6 cts) [UE Obligatoire]
De la Cellule à l'Organisme (6 cts) [UE Obligatoire]
Mathématiques pour les Sciences de la Vie (6 cts) [UE Obligatoire]
Description Semestre 2
Vous pouvez suivre indifféremment lors du semestre d’automne et lors du semestre de printemps, le S1 ou le S2.
Unités d'enseignement Semestre 3
Génétique 2 (6 cts) [UE Obligatoire]
Microbiologie 1 (6 cts) [UE Obligatoire]
Enzymologie et métabolisme (6 cts) [UE Obligatoire]
Biologie et diversité des organismes (6 cts) [UE Obligatoire]
Description Semestre 3
Le semestre 3 se compose de 5 UE obligatoires :
- Génétique 2
- Biologie des Organismes 2
- Microbiologie 1 (ou Biostatistiques et Bioinformatique, en fonction des places disponibles)
- Enzymologie et Métabolisme
- Transversale 3
Unités d'enseignement Semestre 4
Biostatistiques et bioinformatique (6 cts) [UE Obligatoire]
Ecologie générale (6 cts) [UE Optionnelle]
Chimie Organique Fonctionnelle (6 cts) [UE Optionnelle]
Botanique (6 cts) [UE Optionnelle]
Ecologie et informatique (6 cts) [UE Optionnelle]
Agriculture et Agronomie (6 cts) [UE Optionnelle]
Physiologie végétale (6 cts) [UE Optionnelle]
Zoologie (6 cts) [UE Optionnelle]
Description Semestre 4
Le semestre 4 comprend 2 UE obligatoires :
- Transversale 4
- Biostatistiques et Bioinformatique (ou Microbiologie 1 en fonction des places disponibles au S3)
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et de 3 UE au choix parmi les 7 suivantes
- Ecologie générale
- Botanique
- Zoologie
- Agriculture et Agronomie
- Physiologie Végétale
- Ecologie et Informatique
-
Unités d'enseignement Semestre 5
Génétique et dynamique des populations (6 cts) [UE Obligatoire]
Mathématiques appliquées à la biologie (6 cts) [UE Obligatoire]
Biologie et écologie de l'organisme (6 cts) [UE Obligatoire]
Ecologie microbienne (6 cts) [UE Obligatoire]
Description Semestre 5
Vous devrez suivre en L3, les 5 UE obligatoires suivantes :
- Biologie et Ecologie des Organismes
- Ecologie Microbienne
- Génétique et Dynamique des Populations
- Mathématiques Appliquées à la Biologie
- Transversale 5
Unités d'enseignement Semestre 6
Outils moléculaires pour l'écologie et l'évolution (6 cts) [UE Obligatoire]
Evolution (6 cts) [UE Obligatoire]
Ecologie des communautés (6 cts) [UE Optionnelle]
Chimie-véto (6 cts) [UE Optionnelle]
Chimie-véto (6 cts) [UE Optionnelle]
Technique d'identification de la biodiversité (6 cts) [UE Optionnelle]
Conduite de projet (6 cts) [UE Optionnelle]
Ecologie et Gestion des Populations (6 cts) [UE Optionnelle]
Ecophysiologie : vie en milieux extrêmes (6 cts) [UE Optionnelle]
Ecologie végétale (6 cts) [UE Optionnelle]
Description Semestre 6
Le semestre 6 permet une spécialisation du parcours en direction des masters, soit vers les parcours
professionalisants dans les domaines de l'environnement, l'écologie ou la biodiversité, soit vers les parcours de
recherche en évolution et écologie.
Deux UE sont obligatoires :
- Outils Moléculaires pour l'Ecologie et l'Evolution
- Evolution
Trois UE sont à choisir dans la liste suivante :
- Conduite de Projets
- Ecologie des Communautés
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Sciences de la Vie
- Ecophysiologie et Vie en Milieux Extrêmes
- Ecologie Végétale (conseillée pour le Master Biologie Végétale)
- Ecologie et Gestion des Populations
- Techniques d'identification de la biodiversité
-
Evaluation :
Les modalités d'évaluation sont arrêtées annuellement par le Conseil d'Administration, sur proposition du Conseil
des Etudes et de la Vie Universitaire. Pour le parcours Sciences de la Biodiversité, comme pour les autres de la
Licence STS:
- la compensation au sein du semestre pédagogique (30 ECTS) est automatique ;
- la compensation au sein d'une année (60 ECTS) est automatique si les deux semestres sont acquis ou si aucun
n'est ajourné avec une note inférieure à 9/20
- la licence est validée par validation individuelle des 3 années.
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