PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES : PYTHON 2 DU 11

UNIVERSITE PARIS DIDEROT- PARIS 7 UFR SCIENCES DU VIVANT
PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES : PYTHON 2
DU 11 AU 13 MAI 2015 DUREE 3 JOURS / 18 HEURES 1350 €
PUBLIC : Ingénieurs, chercheurs et techniciens des laboratoires de recherche académique et des industries
pharmaceutiques.
OBJECTIFS : Approfondir les connaissances acquises dans le module « programmation PYTHON 1 ». Les
participants vont pouvoir approfondir la notion de programmation objet dans un contexte d’analyse
bioinformatique.
LIEU : Plate-forme RPBS associée à l’Unité MTi, bâtiment Lamarck A, 39 rue Hélène Brion, 75013 Paris
Partie théorique 3 h par jour
• Programmation objet en PYTHON : classes et héritage
• Scripting, wrap de programmes externes
• Interface PYTHON/C/R ou le module BIOPYTHON
Partie pratique 3 h par jour
Applications directes de la partie théorique avec comme finalité :
• Conception d’une classe minimale pour l’analyse de fichiers de séquence au format
FASTA
• Interface avec un programme externe comme CLUSTALW
• Extension d’une classe pour parser les structures au format PDB
Des modifications mineures peuvent être apportées sous la responsabilité de l’encadrement pédagogique
Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 9 maximum
ENCADREMENT : Dr Pierre TUFFERY
[email protected]
DOCUMENTS : Version imprimée et PDF sur clé USB des illustrations de cours
ÉVALUATION : Attestation d’assiduité délivrée par l’Université.
INSCRIPTION : 01 57 27 82 34 - [email protected]
SITE DE L’UNIVERSITE : www.univ-paris-diderot.fr/formations/cursus
professionnels/formations qualifiantes