PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES : PYTHON 2

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PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES:
PYTHON 2
►PUBLIC
Techniciens, ingénieurs et chercheurs des entreprises et des collectivités
dans le domaine des sciences du vivant.
Pré-requis: avoir suivi la formation Python 1 ou en avoir les
compétences.
►COMPETENCES VISEES
Etre à l’aise avec la programmation objet dans un contexte d’analyse
bioinformatique.
►LIEU
Plate-forme RPBS associée à l’Unité MTi, bâtiment Lamarck A, 39 rue
Hélène Brion, Paris 13e
Des modifications mineures peuvent être apportées sous
la responsabilité de l’encadrement pédagogique
Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum
ENCADREMENT
Dr Pierre TUFFERY
DOCUMENTS
PDF sur clé USB des illustrations de cours
ÉVALUATION
Attestation de formation délivrée par
l’Université
INFORMATION et INSCRIPTION
01 57 27 82 34 - fc[email protected]
du 09 au 11 mai 2017
3 jours / 18 heures
1350 € (TVA 0% incluse)
PARTIE THÉORIQUE (3 H PAR JOUR)
►Programmation objet en PYTHON: classes et héritage
►Scripting, wrap de programmes externes
►Interface PYTHON/C/R ou le module BIOPYTHON
PARTIE PRATIQUE (3 H PAR JOUR)
APPLICATIONS DIRECTES DE LA PARTIE THÉORIQUE AVEC COMME FINALITÉ :
►Conception d’une classe minimale pour l’analyse de fichiers de séquence au format FASTA
►Interface avec un programme externe comme CLUSTALW
►Extension d’une classe pour parser les structures au format PDB