Aspects épidémiologiques et caractérisation moléculaire des

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DISCIPLINE):)Microbiologie)
ANNÉE%2014%*%2015%SÉRIE%DOCTORAT%N°%
THÈSE)DE)DOCTORAT%
soutenue%le%02/06/2015%
par%
MICROBIOLOGIE
Kuan Abdoulaye TRAORÉ
Aspects épidémiologiques et caractérisation moléculaire des
souches du virus de l’hépatite E (VHE) au Burkina Faso
Directeur de thèse : Pierre ROQUES Chercheur CEA, Fontenay aux Roses
Co-directeur de thèse : Nicolas BARRO Professeur, Université de Ouagadougou
Composition du jury :
Rapporteurs : François SIMON Professeur, PU-PH, Université Paris VII
Stéphane CHEVALIEZ Maitre de Conférence, MCU-PH,
Universi Paris XIII
Examinateurs : Anne-Marie ROQUE AFONSO Professeur, PU-PH, Université Paris Sud XI
Nicole PAVIO Chercheur, HDR, ANSES Maison-Alfort
THÈSE
Présentée par
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Pour obtenir le grade de
Docteur de l’Université de Ouagadougou
Option : Sciences Appliquées
Spécialité : Microbiologie/Immuno-virologie
Soutenue le 02/06/2015 devant le Jury composé de:
Directeur de thèse : Nicola BARRO Professeur, Université de Ouagadougou
Co-directeur de thèse : Pierre ROQUES Chercheur CEA, Fontenay aux Roses
Rapporteurs : Fraois SIMON Professeur, PU-PH, Université Paris VII
Stéphane CHEVALIEZ Maitre de Conférence, MCU-PH, U. Paris XIII
Examinateurs : Anne-Marie ROQUE AFONSO Professeur, PU-PH, Université Paris XI
Nicole PAVIO Chercheur, HDR, ANSES Maison Alfort
Aspects épidémiologiques et caractérisation
moléculaire des souches du virus de
l’hépatite E (VHE) au Burkina Faso
U
NIVERSITE DE
O
UAGADOUGOU
---------------------
École Doctorale
Sciences et Technologies
---------------------
Laboratoire : Centre de Recherche en Sciences
Biologiques Alimentaires et Nutritionnelles
(CRSBAN)
d’ordre…………. /
DEDICACES
A mon père Moussa Traoré (In Memorium),
A ma mère Fatoumata Keïta,
A ma deuxième maman Fanta Zerbo, mon oncle Moussa Konaté et famille,
A tous mes frères, sœurs, cousins et cousines,
A tous ceux qui souffrent d’hépatites dans le monde.
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REMERCIEMENTS
Ce travail a pu être réalisé grâce au soutien d’institutions et aux conseils de
nombreuses personnes ; Il est également le fruit d’une collaboration internationale
entre le Laboratoire de Biologie Moléculaire, d’Épidémiologie et de surveillance de
bactéries et virus transmissibles par les aliments/CRSBAN (Burkina Faso), Le
laboratoire de recherche du Centre Régional de Transfusion Sanguine (CRTS) et les
Laboratoires de virologie du CEA et du INRA/ANSES/ENVA dans le cadre d’une thèse
en cotutelle entre l’Université de Ouagadougou et l’Université Paris Sud XI.
Qu’il nous soit permis de remercier :
Les autorités des Universités Paris Sud XI et de Ouagadougou à qui nous exprimons
toute notre reconnaissance ainsi qu’aux membres du jury.
Le docteur Stéphane CHEVALIEZ et le professeur François SIMON qui ont accepté
d’être les rapporteurs de mon manuscrit de thèse.
Je remercie également le professeur Anne-Marie ROQUE AFONSO d’avoir accepté
d’examiner mon manuscrit.
Le Pr Alfred S. TRAORE, Directeur du Centre de Recherche en Sciences Biologiques
Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN), Responsable Académique des formations
Doctorales en Biochimie et Microbiologie/Biotechnologies, de lUniversité de
Ouagadougou, Président du Réseau Ouest Africaine de Biotechnologie (RA-Biotech).
Toute notre reconnaissance pour nous avoir acceptés dans son Centre et de nous
avoir encouragé à travailler sur ce thème des hépatites qui a un intérêt capital.
Le Pr Nicolas BARRO, Responsable du Laboratoire de Biologie Moléculaire,
d’Épidémiologie et de Surveillance de Bactéries et Virus Transmissibles par les
Aliments/CRSBAN, Directeur de thèse qui malgré ses multiples occupations a suivi
de bout en bout ce travail depuis le DEA. Merci énormément pour le suivi
quotidien, les nombreux conseils et toute l’attention accordée à ce travail.
Sans oublier votre soutien immense sur le plan social, recevez toute notre profonde
gratitude.
Le Dr Roger Le Grand pour son accueil au sein du service d’immuno-virologie/CEA.
Le Dr Pierre ROQUES, chercheur au Commissariat à l’Energie Atomique, Directeur
de thèse, à qui je ne saurai être plus reconnaissant, pour avoir été à l’origine de ce
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projet, pour s’être investi jusqu’au bout dans cette expérience, pour son
dévouement total à ce travail et pour toute sa disponibilité et son soutien
matériel.
Le Dr Nicole PAVIO, chercheur INRA/ANSES/ENVA, pour l’interêt qu’elle a porté à
mon travail, ses précieux conseils et son soutien technique en nous acceptant dans
son laboratoire.
Les partenaires du Centre National de Transfusion Sanguine : Dr Honorine
Dahourou, Directrice du CNTS, Dr Yacouba NEBIE, responsable de la Coordination
Scientifique et de l’Assurance Qualité. Que vous découvrez ici notre considération
et nos sincères remerciements.
Le Major Sanou, du CNTS : merci pour vos conseils, vos encouragements et votre
assistance morale et matérielle pour la réalisation de ce travail ;
Les techniciens du CNTS pour leurs aides multiformes et enseignements reçus lors
de mon stage de formation ;
Tous les enseignants-chercheurs du CRSBAN: Pr Aboubakar S. OUATTARA, Pr Yves
TRAORE, Dr Philippe A. NIKIEMA, Dr Cheik A. T. OUATTARA, Dr André Jules
ILBOUDO, Dr Aly SAVADOGO, Dr Cheikna ZONGO, Dr Marius SOMDA, Dr Assèta
KAGAMBEGA pour l’encadrement pédagogique du travail;
L’ensemble des étudiants du CRSBAN (doctorants et autres) pour l’amitié et tous
les encouragements reçus au cours de notre travail
L’ensemble des personnes du service d’immuno-virologie, qui ont toutes contribué,
de différentes manières, à la conduite de ces travaux.
Toute l’équipe du RA-BIOTECH pour tous les enseignements dont nous avons
bénéficié tout au long de notre formation.
Toute l’équipe du Laboratoire de Biologie Moléculaire, d’Épidémiologie et de
Surveillance de Bactéries et Virus Transmissibles par les Aliments: Les doctorants
Oumar V. TRAORE, Gertrude TCHAMBA, Saïdou KABORE, Larissa WARE, Hadiza
Ibrahim BAWA, MAMADOU, Nafissatou OUEDRAOGO, Serge BAGRE, Bienvenue Jean
OUOBA, Konaté Ali et Bako étudiants pour leur appui technique et leurs conseils.
L’équipe du RABIO-TECH ainsi que tous mes promotionnaires, amis et connaissances
pour toutes les expériences vécues durant le cheminement.
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