Développement d`un endomicroscope multiphotonique compact et

D´eveloppement d’un endomicroscope multiphotonique
compact et flexible pour l’imagerie in vivo haute
r´esolution de tissus biologiques non marqu´es
Guillaume Ducourthial
To cite this version:
Guillaume Ducourthial. D´eveloppement d’un endomicroscope multiphotonique compact et flex-
ible pour l’imagerie in vivo haute r´esolution de tissus biologiques non marqu´es. Optique / pho-
tonique. Universit´e de Limoges, 2014. Fran¸cais. <NNT : 2014LIMO0004>.<tel-01086081>
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Submitted on 21 Nov 2014
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UNIVERSITE DE LIMOGES
ECOLE DOCTORALE 521
Institut de Recherche XLIM-UMR 7252 – Département Photonique
Thèse
pour obtenir le grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE LIMOGES
Discipline: Electronique des Hautes Fréquences, Photonique et Systèmes
Spécialité : Photonique
Présentée et soutenue par
Guillaume DUCOURTHIAL
le 24/09/2014
Développement d'un endomicroscope multiphotonique compact et
flexible pour l'imagerie in vivo haute résolution de tissus biolo-
giques non marqués
Thèse dirigée par : Frédéric LOURADOUR
JURY :
Rapporteurs
Mme. Marie-Claire SCHANNE-KLEIN Directeur de Recherche CNRS, Laboratoire d’Optique et
de Biosciences, Ecole Polytechnique, Palaiseau.
M. Hervé RIGNEAULT Directeur de Recherche CNRS, Institut Fresnel, Université
Aix-Marseille, Marseille.
Examinateurs
Mme. Geneviève BOURG-HECKLY Maître de Conférences, Laboratoire Jean Perrin, Université
Pierre et Marie Curie, Paris VI.
Mme. Cathie VENTALON Chargée de Recherche CNRS, Institut de Biologie de
l'Ecole Normale Supérieure, Paris.
Mme. Anne DRUILHE Chargée de Recherche INSERM, Laboratoire CRIBL, Uni-
versité de Limoges
M. Alexandre KUDLINSKI Maître de Conférences, Laboratoire de Physique des La-
sers, Atomes et Molécules, Université Lille 1, Lille
M. Rodney O’CONNOR Chercheur titulaire de la Chaire Santé de Biophysique du
Labex SigmaLim, Institut de Recherche XLIM, Limoges.
M. Frédéric LOURADOUR Professeur, Institut XLIM, Université de Limoges
Invitées
Mme. Christine VEVER-BIZET Chargée de Recherche CNRS, Laboratoire Jean Perrin,
Université Pierre et Marie Curie, Paris VI
Mme. Mireille VERDIER Maître de Conférences, Equipe Homéostasies Cellulaires et
Pathologies, Université de Limoges
Thèse de doctorat

i
à mes parents

ii
Remerciements
Trois années sont passées. Qui aurait pu s'imaginer que le temps se serait si vite écoulé ?
Je ne serai jamais arrivé où j’en suis actuellement sans l’aide de plusieurs personnes. Cela aurait
été de plus moins plaisant sans la présence de beaucoup d’autres. Comme elles sont nom-
breuses, je m’excuse par avance si j’en oublie certaines.
Je remercie tout d’abord Marie-Claire Schanne-Klein et Hervé Rigneault qui ont accepté
d’être rapporteurs de ce manuscrit de thèse. J’espère que cette lecture aura été agréable. Je tiens
également à remercier les autres membres de mon jury, Geneviève Bourg-Heckly, Cathie Ven-
talon, Anne Druilhe, Alexandre Kudlinski et Rodney O’Connor, Christine Vever-Bizet, Mi-
reille Verdier, pour l’intérêt porté à ces travaux ainsi que pour leurs différentes contributions.
Je souhaite remercier les directeurs successifs du département photonique de l’institut
de Recherche Xlim au sein duquel ont été réalisés ces travaux, Alain Barthelemy et Vincent
Couderc, pour m’avoir accueilli au sein du département pour la réalisation de cette thèse.
Toute ma reconnaissance à la région Limousin qui m’a financé durant ces trois années
de thèse.
Je tiens à remercier chaleureusement mon directeur de thèse, Frédéric Louradour, qui
m’a donné l’opportunité de travailler à ces côtés sur des sujets qui m’ont passionné. Je te re-
mercie pour ton aide, tes conseils, et nos discussions. Je te remercie également de m’avoir per-
mis de travailler dans de bonnes conditions grâce à tes multiples recherches de financements et
de collaborations. Merci de m’avoir poussé à donner le meilleur de moi-même. Merci d’avoir
compris comment me faire plaisir : « une entrecôte frites ». Et bien sûr, je te remercie d’avoir
supporté mes fautes d’orthographe.
Je remercie aussi Tigran Mansuryan, alias MacTigran qui est la version Arménienne de
MacGiver. J’ai pris beaucoup de plaisir à travailler avec toi sur le projet. Merci de m’avoir fait
rêver au labo avec tes astuces, tes manières de procéder, tes échantillons, nos discussions en
franglais, et tes expressions : « touche pas la table », « c’est le stagiaire » ;-). Et pour rappel, il
y a toujours une solution à chaque problème : « double face ». Merci à Pierre Leclerc pour ta
participation au projet, ta bonne humeur, et nos pauses café. Je te souhaite de prendre mon relai
et de passer comme moi trois fantastiques années, enfin c’est un peu moins drôle lors de la
rédaction, mais on s’y fait ;-). Je souhaite remercier Marc Fabert, et non pour une fois je ne