Marion GRUFFAZ La protéine Core du virus de l`hépatite B est le

La prot´eine Core du virus de l’h´epatite B est le
d´eterminant majeur responsable de l’inhibition pr´ecoce
de la r´eponse IFN dans les h´epatocytes
Marion Gruffaz
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Marion Gruffaz. La prot´eine Core du virus de l’h´epatite B est le d´eterminant majeur responsable
de l’inhibition pr´ecoce de la r´eponse IFN dans les h´epatocytes. Virologie. Universit´e Claude
Bernard - Lyon I, 2013. Fran¸cais. <NNT : 2013LYO10090>.<tel-01176008>
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N° d’ordre : 90-2013 Année 2013
THESE
présentée devant
L’UNIVERSITE CLAUDE BERNARD-LYON 1
L’ECOLE DOCTORALE BMIC
pour l’obtention du
DIPLOME DE DOCTORAT EN BIOLOGIE
(Arrêté du 7 août 2006)
Soutenance publique le 4 juin 2013 par
Marion GRUFFAZ
La protéine Core du virus de l’hépatite B est le
déterminant majeur responsable de l’inhibition
précoce de la réponse IFN dans les hépatocytes
Directeur de thèse: Pr. Fabien ZOULIM
Co-encadrant: Dr. David DURANTEL
Composition du Jury:
Pr. Fabien ZOULIM
Dr. David DURANTEL
Pr. Massimo LEVRERO
Dr. Monsef BENKIRANE
Dr. François Loïc COSSET
Dr. Ivan HIRSCH

Préambule Page 2

Préambule Page 3
PREAMBULE
I-COMPOSITION DE L’UCBL
COMPOSANTE ADMINISTRATIVE
Président de l’Université
Vice
-président du Conseil d’Administration
Vice
-président du Conseil des Etudes et de la Vie
Universitaire
Vice
-président du Conseil Scientifique
Secrétaire Général
M. François-Noël GILLY
M. le Professeur Hamda BEN HADID
M. le Professeur Philippe LALLE
M. le Professeur Germain GILLET
M. Alain HELLEU
COMPOSANTE SANTE
Faculté de Médecine Lyon Est – Claude Bernard
Faculté de Médecine e
t de Maïeutique Lyon Sud
UFR d’Odontologie
Institut des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques
Institut des Sciences et Techniques de la Réadaptation
Département de formation et Centre de Recherche en
Biologie Humaine
M. le Professeur J. ETIENNE
M. le Pro
fesseur G. KIRKORIAN
M. le Professeur D. BOURGEOIS
Mme la Professeure C. VINCIGUERRA
M. le Professeur Y. MATILLON
M. le Professeur P. FARGE
COMPOSANTE
SCIENCES ET TECHNOLOGIE
Faculté des Sciences et Technologies
Département Biologie
Département Chim
ie Biochimie
Département GEP
Département Informatique
Département Mathématiques
Département Physique
Département Sciences de la Terre
Observatoire de Lyon
Ecole Supérieure de Chimie Physique Electronique
Institut Universitaire de Technologie de Lyon 1
Inst
itut Universitaire de Formation des Maîtres
Institut de Science Financière et d'Assurances
M. le Professeur F. De MARCHI
M. le Professeur F. FLEURY
Mme le Professeur H. PARROT
M. N. SIAUVE
M. le Professeur S. AKKOUCHE
M. le Professeur A. GOLDMAN
Mme S. FL
ECK
Mme la Professeure I. DANIEL
M. B. GUIDERDONI
M. G. PIGNAULT
M. C. VITON
M. R. BERNARD
Mme la Professeure V. MAUME
-
DESCHAMPS

Préambule Page 4
II-TABLE DES MATIERES
PREAMBULE ..................................................................................................................... ................. 3
I-COMPOSITION DE L’UCBL .......................................................................................................... 3
II-TABLE DES MATIERES ................................................................................................................ 4
III-INDEX DES ILLUSTRATIONS ...................................................................................................... 7
IV-ABBREVATIONS ........................................................................................................................ 8
V-REMERCIEMENTS ............................................................................................................... ....... 9
DONNEES BIBLIOGAPHIQUES ......................................................................................................... 12
I-LE VIRUS DE L’HEPATITE B ........................................................................................................ 13
I.1 Généralités ........................................................................................................................ 13
I.1.1 La découverte du virus ............................................................................................... 13
I.1.2 Classification et famille des Hépadnavirus ................................................................ 14
I.1.2.1 Les orthohépadnavirus ....................................................................................... 14
I.1.2.2 Les avihépadnavirus ............................................................................................ 15
I.1.3 Les données épidémiologiques .................................................................................. 15
I.1.4 Le mode de transmission ........................................................................................... 17
I.2 Structure et organisation génétique ................................................................................. 18
I.2.1 Les particules virales, subvirales et antigéniques ...................................................... 18
I.2.2 Le génome viral .......................................................................................................... 20
I.2.3 Les régions de régulation transcriptionnelle du génome HBV .................................. 21
I.2.4 Les protéines virales .................................................................................................. 25
I.2.4.1 Les protéines d’enveloppe .................................................................................. 25
I.2.4.2 Les protéines Core et PréCore ............................................................................ 27
I.2.4.3 La polymérase ..................................................................................................... 31
I.2.4.4 La protéine X ....................................................................................................... 32
I.2.5 Le cycle de réplication ................................................................................................ 34
I.2.5.1 De l’interaction du virus avec l’hépatocyte à son internalisation dans le
cytoplasme .................................................................................................................... . 34
I.2.5.2 De son transport jusqu’au noyau à la formation de l’ADNccc ........................... 36
I.2.5.3 De la transcription de l’ARNpg à la synthèse de l’ADN RC ................................. 38
I.2.5.4 De la formation des nucléocapsides matures à leur sécrétion ou recyclage ..... 42
I.3 Les modèles d’études du HBV ........................................................................................... 43
I.3.1 Les modèles acellulaires ............................................................................................ 43
I.3.2 Les modèles cellulaires .............................................................................................. 44
I.3.2.1 Les lignées d’hépatome ...................................................................................... 44