Usages vétérinaires des antibiotiques, résistance bactérienne et

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Usages vétérinaires des antibiotiques, résistance
bactérienne et conséquences pour la santé humaine
Janvier 2006

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Coordination
Mme Corinne Danan (Afssa – DERNS)
Secrétariat administratif (Afssa – DERNS)
Mme Aurore Petit

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Composition du Groupe de travail
- Président
M. Didier GUILLEMOT (Institut Pasteur - Paris)
- Membres du comité d'experts spécialisé Microbiologie :
Mme Anne BRISABOIS
M. Hubert BRUGERE
M. Roland LECLERCQ
M. Francis MEGRAUD
- Membres du comité d'experts spécialisé Alimentation animale :
M. Jean François GUILLOT
- Membres du comité d'experts spécialisé Santé animale :
Mme Arlette LAVAL
M. Yves MILLEMANN
M. Pascal SANDERS
- Autres experts :
Mme Anne BOUCHARDON (Afssa - Ploufragan)
Mme Elisabeth CHASLUS-DANCLA (INRA – Nouzilly)
Mme Claire CHAUVIN (Afssa - Ploufragan)
M. Pierre COLIN (Afssa – Brest)
M. Henri DABERNAT (Centre Hospitalier Universitaire Purpan - Toulouse)
Mme Isabelle KEMPF (Afssa - Ploufragan)
Mme Danièle MEUNIER (Afssa - Lyon)
M. Gérard MOULIN (Agence Nationale du Médicament Vétérinaire)
Mme Isabelle PELLANNE (Afssaps)
M. Benoît SCHLEMMER (Hôpital Saint-Louis – Paris ; Président du Comité
national de suivi du Plan pour préserver l'efficacité des antibiotiques)
M. Pierre-Louis TOUTAIN (Ecole Nationale Vétérinaire - Toulouse)
- Agence française de sécurité sanitaire des aliments
Mme Hélène Aubry-Damon (Derns-UERB)
Mme Corinne Danan (Derns-UERB)
Mme Muriel Eliaszewicz (Derns)
Répartition des contributions
- Section I. Usage des antibiotiques chez l’animal
C. Chauvin (coordinateur), P. Colin (coordinateur), J.F. Guillot, A. Laval, Y. Millemann, G.
Moulin, I. Pellanne
- Section II. Impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance chez l’animal
(incluant la surveillance de la résistance bactérienne chez l’animal
A. Brisabois, I. Kempf, D. Meunier, Y. Millemann, P. Sanders (coordinateur), P.L. Toutain
- Section III. Diffusion de la résistance à l'Homme et conséquences pour la santé
publique
A. Bouchardon, A. Brisabois, E. Chaslus-Dancla (coordinateur), P. Colin, H. Dabernat,
D. Guillemot (coordinateur), R. Leclercq, F. Mégraud, B. Schlemmer, P.L. Toutain

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Relecteurs :
Experts des Comités spécialisés placés auprès de l’Afssa
- « Microbiologie » : Mmes Marie-Laure De Buyser et Christine Vernozy-Rozand,
M. Hubert Brugère,
- « Alimentation animale » : MM. Michel Etienne, Hervé Pouliquen et Philippe
Schmidely,
- « Santé animale » : MM. Bertrand Faroult, Alain Milon et Jacques Poirier.
Comité extérieur de lecture
NOM Affiliation
Jacques Acar Hôpital Saint-Joseph, Paris
Jean-Pierre Alno Syndicat National des Groupements Techniques Vétérinaires
Véronique Vaillant Institut de Veille sanitaire
Geneviève Benard Ecole nationale vétérinaire, Toulouse
Claude Danglot Centre de recherche et de contrôle des eaux de Paris
Patrick Dehaumont Agence nationale du médicament vétérinaire
Dominique De Furst,
Jean-Michel Azanowsky
Direction générale de la santé
Vincent Jarlier Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris
François L’hériteau Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales, Paris Nord
Yves Levi Faculté de Pharmacie, Chatenay-Malabry
Philippe Maugendre Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé
Antoine Monteil Société anonyme de gestion des eaux de Paris
Jean-Pierre Orand Direction générale de l’alimentation
Frédérique Touffet Agence française de sécurité sanitaire environnementale
Organismes extérieurs consultés:
Assemblée permanente des chambres d'agriculture, Association des fabricants
d’aliments du bétail, Association française des directeurs et cadres de laboratoires
vétérinaires publics d'analyses, Association française des vétérinaires pour animaux
de compagnie, Association des vétérinaires salariés de l'ouest, Centre de
coopération internationale en recherche agronomique pour le développement, Centre
national de référence des antibiotiques, Centre national de référence des Salmonella,
Chambre Régionale d’Agriculture de Normandie, Conseil de l'ordre des pharmaciens,
Conseil Supérieur de l'Ordre des Vétérinaires Français, Fédération nationale des
syndicats exploitants agricoles, Groupe de défense sanitaire d'Indre-et-Loire, Groupe
français de l’association mondiale des vétérinaires de l’aviculture, Service de
microbiologie de l’hôpital européen Georges-Pompidou, Institut technique de
l'aviculture, Institut de l'élevage, Institut technique du porc, Les entreprises du
médicament, Office national interprofessionnel des viandes de l'élevage et de
l'agriculture, Observatoire national de l’épidémiologie de la résistance bactérienne
aux antibiotiques, Service des maladies infectieuses du centre hospitalier régional
universitaire de Tours, Service des maladies infectieuses et tropicales du centre
hospitalier universitaire de Dijon, Société française de buiatrie, Société française de
microbiologie, Syndicat de l'industrie du médicament vétérinaire et réactif, Syndicat
national des groupements techniques vétérinaires, Syndicat national des producteurs
d'additifs et d'ingrédients de la chaîne alimentaire, Syndicat national des vétérinaires
d’exercice libéral, Union fédérale des consommateurs - Que Choisir, Union des
groupements de producteurs de viande bovine.
Suite à la consultation nationale organisée en novembre 2005 sur le projet de rapport du
groupe de travail, les principaux commentaires ayant appelé une réponse du groupe de
travail, sans modification du rapport, sont rassemblés en annexe 17.

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Sommaire général
Introduction générale 7
Section 1 : Usage des antibiotiques 9
I. Contexte réglementaire et conditions d’utilisation des antibiotiques chez l’animal 10
II. Les antibiotiques concernés 19
III. Les méthodes et outils de suivi des utilisations des antibiotiques 21
IV Les quantités d’antibiotiques utilisées 28
V. Analyse des points critiques 37
VI. Résumé et recommandations 39
VII. Bibliographie 44
Section 2 : Impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance
bactérienne chez l’animal 46
I. Définitions de la résistance bactérienne aux antibiotiques 47
II. Suivi de la résistance aux antibiotiques en filière de production animale 66
III. Analyse de l’impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance
bactérienne chez l’animal 82
IV. Résumé et recommandations 106
V. Bibliographie 115
Section 3 : Diffusion de la résistance à l’homme et conséquences
pour la santé publique 125
I. Y a t-il des conséquences de la résistance bactérienne aux antibiotiques
en termes de Santé Publique ? 126
II. A-t-on la preuve que des gènes de résistance ont été acquis par les bactéries
humaines à partir de bactéries animales ? 128
III. Dispose t-on d’études épidémiologiques démonstratives de la transmission
de bactéries résistantes de l’animal à l’homme ? 148
IV. Faut-il définir, pour l’homme ou pour l’animal, des antibiotiques « critiques » ? 156
V. Résumé et recommandations 157
VI. Bibliographie 160
Conclusion générale 175
Recommandations générales 179
Annexes 186
Abréviations 227
Remerciements 228
Glossaire 229
Liste des annexes 231
Liste des tableaux 232
Liste des figures