Reconstruction phylogénét. - Fondation Sciences Mathématiques de

Introduction Hypothèses Génétique des pops Reconstruction phylogénét. Div. des espèces
Prédire le Passé :
Évolution, Hasard et Mathématiques
Amaury Lambert
Journée “Mathématiques en Mouvement”, 5 juin 2013

Introduction Hypothèses Génétique des pops Reconstruction phylogénét. Div. des espèces
Plan
1La modélisation probabiliste de l’Évolution
2Le paradigme neutraliste
3Génétique des populations
4La reconstruction phylogénétique
5Les processus de diversification des espèces

Introduction Hypothèses Génétique des pops Reconstruction phylogénét. Div. des espèces
SMILE : un groupe interdisciplinaire au CIRB
•CIRB = Centre Interdisciplinaire de
Recherche en Biologie (Collège de
France)
•SMILE = Stochastic Models for the
Inference of Life Evolution

Introduction Hypothèses Génétique des pops Reconstruction phylogénét. Div. des espèces
Comprendre les grands patrons de la biodiversité
•Pourquoi y a-t-il tant d’espèces sous les
tropiques ?
•Pourquoi y a-t-il si peu d’espèces dans les
océans ?
•Pourquoi y a-t-il des groupes taxonomiques
tellement plus riches que d’autres ?
•Mais surtout : retrouver les processus qui
ont généré ces patrons

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Modélisation probabiliste de l’Évolution (1)
Pour quoi faire?
•Les processus évolutifs ne peuvent pas être
répliqués
•Seul leur résultat est connu
•La modélisation probabiliste aide à
•identifier quelles caractéristiques des données
observées auraient pu survenir par chance et
lesquelles requièrent une explication biologique
•décider si un processus donné en comparaison
avec un autre est responsable des données
observées (sélection de modèle, estimation de
paramètres).