« LA BACTERIO A LA MASSE... »
Principe
Dépôt des colonies sur la cible (+/-
après extraction préalable) Mesure des rapports
masse-sur-charge (m/z)
des molécules ionisées Interprétation du profil obtenu par comparaison à une banque
de données
Applications
Outil d’identification microbienne en remplacement des techniques phénotypiques
Outil d’épidémiologie permettant la comparaison des spectres en cas de suspicion d’épidémie
Intérêts
Fiabilité : large gamme d’identification bactérienne (> automates disponibles)
Rapidité : délai de réponse compétitif
Le laboratoire de Microbiologie a acquis récemment un appareil de spectrométrie de
masse de type MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time Of
Flight). Ce spectromètre de masse est depuis utilisé en pratique quotidienne pour
l’identification phénotypique des bactéries isolées à partir des différents produits
pathologiques.
Cette technique d’identification est basée sur la caractérisation des protéines
(protéines ribosomales et protéines de membrane) : après désorption et ionisation
d’un mélange échantillon - matrice sous l’action de champs magnétiques, le spectre
de masse obtenu est comparé à une banque de données de spectres.
La spectrométrie de masse permet l’identification rapide et fiable de la plupart des
bactéries d’intérêt médical. Il reste cependant à améliorer la banque de spectres
actuelle afin d’élargir l’application de cette méthode à un plus grand nombre
d’espèces bactériennes.
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E.coli
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