Journée thématique Ecologie virale et environnement « Les virus de microorganismes au sein des écosystèmes : rôle et applications » Mardi 21 juin 2016 Campus Jussieu, salle Fourcade (tour 56-55, 4eme étage) – 9h30-17h00 La Fédération de Recherche en Environnement en Ile-de-France organise une journée scientifique dans le domaine de l’écologie virale. Le thème choisi concerne la dynamique et le rôle des virus de microorganismes au sein des écosystèmes, et les possibilités d’utilisation de ces virus pour des applications environnementales ou dans le domaine des écotechnologies. Les virus de microorganismes sont présents dans tous les environnements. Par le biais de la pression de prédation et par les divers mécanismes d’interactions entre virus et cellules (échange de matériel génétique, modification des cellules hôtes, en particulier de leur métabolisme), ils exercent des effets très importants sur la structure, la dynamique et le fonctionnement des écosystèmes, ainsi que sur les cycles biogéochimiques. L’écologie virale constitue une thématique émergente au sein de la FIRE. Cette journée ouverte à tous a pour but de faire découvrir l’écologie virale et également de favoriser les échanges entre les équipes de la Région IdF impliquées ou désirant s’impliquer dans ces thématiques et les orateurs invités. Elle permettra d’aborder les perspectives de développement pour l’écologie virale au sein de la FIRE et. Elle s’articulera autour de conférences invitées relevant de 3 thèmes et autour de temps de discussion : Thème 1 : diversité et impact des virus sur les dynamiques microbiennes Thème 2 : applications environnementales et médicales des virus Thème 3 : caractérisation des particules virales dans l’environnement Nous vous remercions pour votre participation à cette journée. Comité d’organisation Céline Roose-Amsaleg, UMR 7619 METIS, [email protected] Ariane Bize, Irstea, UR-HBAN, [email protected] Journée thématique Ecologie virale et environnement Mardi 21 juin 2016 Présentations en salle Fourcade (tour 56-55, 4eme étage), Campus Jussieu UPMC 9h30-10h00: Accueil, café 10h00-10h15: Présentation de la journée Thème 1 : les virus dans les écosystèmes : diversité et impact sur les dynamiques microbiennes (Médiateur : /Laurent Debarbieux) 10h15-10h45 Michael Dubow, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), équipe Génomique et Biodiversité microbienne des biofilms (Orsay, 91) La biodiversité des phages et leurs hôtes dans les milieux oligotrophes désertiques. 10h45-11h15 Marianne De Paepe, INRA MICALIS, équipe Dynamique des génomes de bactériophages (Jouy-en-Josas, 78) High prophage induction in the mouse gastrointestinal tract 11h15-11h45 Télesphore Sime-Ngando, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement, équipe Virus et Métabolismes microbiens en milieu aquatique (Aubière, 63) Host physiology is decisive for bacteriophage lifestyles: metabolomics evidence from freshwater microcosms 11h45-12h15 Discussion 12h15-14h00: Buffet salle Darcy : tour 46-56 3ème Thème 2 : applications environnementales et médicales des virus (Médiateur Télésphore Sime-Ngando) 14h15-14h45 Christophe Gantzer, Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour l’Environnement, équipe Microbiologie Environnementale (Villers-lès-Nancy, 54) Prévalence et diversité génétique des bactériophages ARN F-spécifiques chez l’homme et l’animal : intérêt pour évaluer le niveau de pollution virale et pour discriminer l’origine de la pollution fécale dans les eaux. 14h45-15h15 Laurent Debarbieux, Institut Pasteur, groupe Interactions Bactériophages Bactéries chez l’Animal (laboratoire de Biologie moléculaire du gène chez les extrêmophiles) Bactériophages, virus guérisseurs ? Thème 3 : caractérisation des particules virales dans l’environnement (détection, énumération, identification) 15h15-15h45 Ariane Bize, Irstea, UR Hydrosystèmes et bioprocédés, équipe Bioprocédés et biotechnologies microbiennes pour la valorisation des déchets K-mer frequencies of viruses infecting hyperthermophilic archaea match with the viral families 15h45-16h15 Martine Boccara, Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure, équipe Génomique des plantes et diatomées Une nouvelle méthode de comptage des virus : applications environnementales et médicales 16h15-17h: Conclusions et perspectives de la journée Quelles perspectives pour la virologie microbienne au sein de la FIRE? Martine Boccara, Josette Garnier et Télesphore Sime-Ngando