biologie moléculaire, maldi-tof

Etienne Carbonnelle
Service de Microbiologie
HEGP
Paris
Vendredi 20 juin 2014
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XIX ème journée de Microbiologie Clinique du COL.BVH
Place des nouveaux outils dans le diagnostic des bactériémies :
Biologie moléculaire, MALDI-TOF-MS

Conflit d’intérêt :
• Actionnaire chez ANDROMAS

Diagnostic
Meilleure prise en charge
Antibiothérapie ciblée et adaptée
Limiter la transmission (BMR, MST, …), gérer l’isolement
Durée d’hospitalisation
Suspicion clinique de bactériémie
Techniques idéales
Rapide
Faible coût
Sensible
Spécifique
Universelle
Simple
Identification Résistance aux anti-microbiens

Apport de la biologie moléculaire
2006-2007 : Septifast
Les hémocultures vont elles disparaître ?
Rapidite
Indépendant du traitement antibiotique
Sensible
Intérêt pour la détection des champignons
Multiplex PCR Temps réel
Mussap M,et al., J Chemother. 2007 Oct;19 Suppl 2:31-4.
Ce qui se dit :

Hémoculture
aérobie/anaérobie
résine/charbon
Sang
Sérum
Culture : ATBg et Id
PCR Temps réel spécifique (Coxiella, Bartonella,
Brucella, …)
Multiplex PCR Temps réel
PCR/Electrophorèse
PCR/Séquençage
+/- pré-culture
(quelques heures)
Diagnostic moléculaire des bactériémies
PCR Temps réel spécifique
Multiplex PCR Temps réel
FISH
Puce
PCR/Hybridation
PCR/Séquençage
PCR/ESI-MS