Développement d`un endomicroscope multiphotonique

UNIVERSITE DE LIMOGES
ECOLE DOCTORALE 521
Institut de Recherche XLIM-UMR 7252 – Département Photonique
Thèse
pour obtenir le grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE LIMOGES
Discipline: Electronique des Hautes Fréquences, Photonique et Systèmes
Spécialité : Photonique
Présentée et soutenue par
Guillaume DUCOURTHIAL
le 24/09/2014
Développement d'un endomicroscope multiphotonique compact et
flexible pour l'imagerie in vivo haute résolution de tissus biolo-
giques non marqués
Thèse dirigée par : Frédéric LOURADOUR
JURY :
Rapporteurs
Mme. Marie-Claire SCHANNE-KLEIN Directeur de Recherche CNRS, Laboratoire d’Optique et
de Biosciences, Ecole Polytechnique, Palaiseau.
M. Hervé RIGNEAULT Directeur de Recherche CNRS, Institut Fresnel, Université
Aix-Marseille, Marseille.
Examinateurs
Mme. Geneviève BOURG-HECKLY Maître de Conférences, Laboratoire Jean Perrin, Université
Pierre et Marie Curie, Paris VI.
Mme. Cathie VENTALON Chargée de Recherche CNRS, Institut de Biologie de
l'Ecole Normale Supérieure, Paris.
Mme. Anne DRUILHE Chargée de Recherche INSERM, Laboratoire CRIBL, Uni-
versité de Limoges
M. Alexandre KUDLINSKI Maître de Conférences, Laboratoire de Physique des La-
sers, Atomes et Molécules, Université Lille 1, Lille
M. Rodney O’CONNOR Chercheur titulaire de la Chaire Santé de Biophysique du
Labex SigmaLim, Institut de Recherche XLIM, Limoges.
M. Frédéric LOURADOUR Professeur, Institut XLIM, Université de Limoges
Invitées
Mme. Christine VEVER-BIZET Chargée de Recherche CNRS, Laboratoire Jean Perrin,
Université Pierre et Marie Curie, Paris VI
Mme. Mireille VERDIER Maître de Conférences, Equipe Homéostasies Cellulaires et
Pathologies, Université de Limoges
Thèse de doctorat

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à mes parents

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Remerciements
Trois années sont passées. Qui aurait pu s'imaginer que le temps se serait si vite écoulé ?
Je ne serai jamais arrivé où j’en suis actuellement sans l’aide de plusieurs personnes. Cela aurait
été de plus moins plaisant sans la présence de beaucoup d’autres. Comme elles sont nom-
breuses, je m’excuse par avance si j’en oublie certaines.
Je remercie tout d’abord Marie-Claire Schanne-Klein et Hervé Rigneault qui ont accepté
d’être rapporteurs de ce manuscrit de thèse. J’espère que cette lecture aura été agréable. Je tiens
également à remercier les autres membres de mon jury, Geneviève Bourg-Heckly, Cathie Ven-
talon, Anne Druilhe, Alexandre Kudlinski et Rodney O’Connor, Christine Vever-Bizet, Mi-
reille Verdier, pour l’intérêt porté à ces travaux ainsi que pour leurs différentes contributions.
Je souhaite remercier les directeurs successifs du département photonique de l’institut
de Recherche Xlim au sein duquel ont été réalisés ces travaux, Alain Barthelemy et Vincent
Couderc, pour m’avoir accueilli au sein du département pour la réalisation de cette thèse.
Toute ma reconnaissance à la région Limousin qui m’a financé durant ces trois années
de thèse.
Je tiens à remercier chaleureusement mon directeur de thèse, Frédéric Louradour, qui
m’a donné l’opportunité de travailler à ces côtés sur des sujets qui m’ont passionné. Je te re-
mercie pour ton aide, tes conseils, et nos discussions. Je te remercie également de m’avoir per-
mis de travailler dans de bonnes conditions grâce à tes multiples recherches de financements et
de collaborations. Merci de m’avoir poussé à donner le meilleur de moi-même. Merci d’avoir
compris comment me faire plaisir : « une entrecôte frites ». Et bien sûr, je te remercie d’avoir
supporté mes fautes d’orthographe.
Je remercie aussi Tigran Mansuryan, alias MacTigran qui est la version Arménienne de
MacGiver. J’ai pris beaucoup de plaisir à travailler avec toi sur le projet. Merci de m’avoir fait
rêver au labo avec tes astuces, tes manières de procéder, tes échantillons, nos discussions en
franglais, et tes expressions : « touche pas la table », « c’est le stagiaire » ;-). Et pour rappel, il
y a toujours une solution à chaque problème : « double face ». Merci à Pierre Leclerc pour ta
participation au projet, ta bonne humeur, et nos pauses café. Je te souhaite de prendre mon relai
et de passer comme moi trois fantastiques années, enfin c’est un peu moins drôle lors de la
rédaction, mais on s’y fait ;-). Je souhaite remercier Marc Fabert, et non pour une fois je ne

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t’oublie pas. Merci pour ton aide, tes précieux conseils, ta bonne humeur et tes blagues (parfois
violentes ^^). Merci aux personnes qui m’ont précédé : Jérôme, Meri…, pour leurs conseils et
astuces et les bons moments. Et merci aux autres personnes avec qui j’ai interagis dans le cadre
de cette thèse : Julien B, Dominique P, Vincent P, Sylvia, Renaud, Donald, Hector, Lluis….
Je tiens aussi à remercier Alain Dexet au talent certain. Merci pour tes pièces sur me-
sures qui ont permis la concrétisation du projet. C’est promis j’arrête avec les pièces de plus en
plus petites. Je remercie également Nathalie Buisson, pour sa sympathie, sa bonne humeur, et
pour avoir toujours répondu présente lorsque j’avais besoin. Tu es géniale ! De manière un peu
plus générale, je remercie les membres du département photonique pour avoir permis d’associer
un cadre sérieux à une bonne ambiance : les repas, les quizz, les cafés, les gâteaux, les bon-
bons…
Je tiens tout particulièrement à remercier l’équipe IRO pour avoir hébergé au calme et
au frais lors d’une partie de la rédaction, le grand clandestin que je suis ;-).
Je souhaite aussi remercier les différentes personnes dont j’ai fait la connaissance au
cours des années que j’ai passées à l’université de Limoges et qui sont devenues dans mon cœur
de vrais amis. Je commence par ordre chronologique avec Romain Baudoin le roi du rangement.
Un grand bravo pour ton bureau en carton (RS tout de même), il est suuuuperrrrrr beau. Je te
remercie pour toutes ces années, et surtout pour les derniers mois, tu m’as permis de me changer
les idées avec le tir à la canette, le vol d’hélicoptère télécommandé (il faut que l’on se fasse un
parcours), ou encore le kart (« rien ne sert de courir il faut partir à point »). Je remercie égale-
ment Pierre Medrel qui prépare entre autres le thon comme un chef. Merci pour ta tourte maison
super légère qui a rendu ta maman malade ;-), tes mojitos basilic, tes discussions incompréhen-
sibles avec Romain, ta culture cinématographique… Merci aussi à ta moitié Émilie Tabaraud,
merci pour tes conseils, …, on se fait une petite randonnée ;-). Merci également à Philippe
Rigaud, pour tous ces bons moments, ses fabuleux gâteaux, et tes expressions « chic chic chic »,
… . Un grand merci à Jean-Thomas Gomes, alias JK (Jean Kebab), toi pour qui gastronomie
rime avec kebab. Je te remercie pour tout : le live, le sport, les cafés, ton soutien, tes conseils…
J’ai toujours pu compter sur toi alors merci. Merci à Sophie Levet, future madame Gomes, pour
son aide, ses conseils, sa joie de vivre, son côté délirante « limonette », son autorisation à jouer
avec mon copain aux jeux vidéo (merci maman ;-)). Je vous souhaite beaucoup de bonheur.
Merci à Farid El Bassri, pour ces bons moments, ces cafés. J’aurai toujours un pied de table
chez moi pour que tu puisses te stabiliser même si c’est pas bien français tout ça ^^. Merci à