Sujet de stage de Master Quantification du mouvement et de la

Sujet de stage de Master
Quantification du mouvement et de la déformation cardiaque en imagerie ultrasonore
tridimensionnelle
Unités d’accueil :
Le stage proposé sera codirigé par l’entreprise Philips Healthcare et le laboratoire de
recherche CREATIS (Villeurbanne – Lyon). L’équipe Philips Research lab Paris (Medysis),
basée à Suresnes en banlieue parisienne, se consacre au traitement des images médicales. Elle
regroupe une trentaine d’ingénieurs de recherche, travaillant sur les problématiques les plus
prometteuses du domaine et en collaboration avec des groupes de recherche académiques
(INRIA, CREATIS, EPFL,…). Le laboratoire CREATIS est une unité de recherche en imagerie
médicale regroupant environ 200 personnes dont les domaines de recherche privilégiés sont
au croisement de deux grands axes: l’identification des grandes questions de Santé pouvant
être abordées par l'imagerie et l’identification des verrous théoriques en traitement du signal
et des images, en modélisation et en simulation numérique dédiés à l’imagerie du vivant.
Description du stage :
Les pathologies cardiaques constituent l’une des principales causes de mortalité dans les pays
industrialisés. Le développement d’outils d’aide au diagnostic passe par une compréhension
fine de la physiologie du cœur : mouvement/déformation du muscle, hémodynamique dans
les différentes cavités, activation électrique etc…
Dans ce contexte, plusieurs études cliniques ont montré que la mesure locale de la
déformation du muscle cardiaque constitue un indicateur efficace permettant de caractériser
l’état pathologique d’un cœur en action. Plusieurs modalités d’imagerie permettent d’effectuer
de telles mesures (IRM, IRM marquée, US) parmi lesquelles l’imagerie ultrasonore 3D
constitue l’une des modalités les plus prometteuses. En effet, cette imagerie étant temps réel,
non invasive et peu onéreuse, elle permettrait d’effectuer à bas coût un diagnostic rapide,
efficace et ne nécessitant aucun protocole particulier. Néanmoins, les caractéristiques
intrinsèques de l’imagerie échocardiographique rendent encore difficile la mise en œuvre de
de mesures fiables et précises de déformation cardiaque, nécessitant ainsi le développement
de méthodes dédiées et le déploiement d’outils adapté.
L’objectif de ce stage est de développer une nouvelle méthode d’estimation robuste de
déformation locale du muscle cardiaque adaptée à imagerie ultrasonore 3D. Ce travail
s’appuiera sur une méthode récemment développée au sein de l’équipe mais dédiée à l’IRM
marquée 3D [ref]. Le stage mêlera à la fois des aspects théoriques (extraction d’information de
phase, régularisation dans un repère anatomique) et des aspects techniques (structures de
données, algorithmie).
[ref] : Y. Zhou, O. Bernard, E. Saloux, A. Manrique, P. Allain, S. Makram-Ebeid, and M. De Craene, "3D
Harmonic Phase Tracking with Anatomical Regularization", Medical Image Analysis, 2015.
Profil du stagiaire :
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Formation : troisième année d’école d’ingénieur, spécialisation en traitement du signal
et de l’image.
Connaissances en C++ et en Matlab.
Connaissances solides en analyse numérique.
Notions de traitement d’image et motivation spécifique pour le domaine médical.
Durée : 6 mois.
Date de début : Février 2016.
Contacts : pour postuler, envoyer cv + lettre de motivation + relevé de notes à :
Olivier Bernard, maître de conférences, [email protected]
Mathieu De Craene, ingénieur R&D Philips, [email protected]