1 SOUTENANCE A CRETEIL UNIVERSITE PARIS VAL-DE-MARNE FACULTE DE MEDECINE DE CRETEIL *********************** ANNEE 2006 N° THESE POUR LE DIPLOME D’ETAT DE DOCTEUR EN MEDECINE Discipline : Médecine Générale ----------------Présentée et soutenue publiquement le / / A CRETEIL (PARIS XII) ----------------Par BARANES David Né le 21 Janvier 1977 à Montreuil-sous-bois ----------------TITRE : Résultats à long terme de l’éradication du portage nasal de staphylococcus aureus méthicilino-résistant (SAMR) sur la prévalence des infections graves provoquées par ce germe chez le malade cirrhotique hospitalisé. DIRECTEUR DE THESE : M. CAMPILLO Bernard Signature du Directeur de thèse LE CONSERVATEUR DE LA BIBLIOTHEQUE UNIVERSITAIRE Cachet de la bibliothèque universitaire 2 REMERCIEMENTS 3 M. le docteur Bernard. CAMPILLO Docteur en Hépato gastroentérologie Praticien Hospitalier à la faculté de médecine de Créteil Chef de service du service de rééducation digestive de L’hôpital Albert-Chenevier Qui m’a fait l’honneur d’accepter la direction de cette thèse, et d’avoir su me guider dans ce travail avec rigueur, patience, et bienveillance. Veuillez trouver ici, l’expression de mon plus profond respect, et de ma sincère reconnaissance. A tous les professeurs et enseignants de la faculté de médecine de Créteil, Pour votre disponibilité, et votre savoir que vous avez su partager… A toute l’équipe du service de rééducation digestive de l’hôpital Albert-Chenevier Pour toute votre sympathie, et votre motivation, qui m’ont beaucoup aidé dans la réalisation de cette thèse. A toutes les équipes rencontrées au cours des différents semestres dans le cadre du résidanat : des urgences de Montreuil à PM Adele (maître de stage de Créteil), en passant par les urgences de l’hôpital Trousseau, la médecine interne à Cochin, la rééducation digestive à Albert Chenevier, et enfin la pneumologie à Max Fourestier : MERCI… 4 A mes parents, Les meilleurs parents du monde... Merci pour votre soutien, votre amour, votre générosité, qui nous permettent de réaliser nos rêves. Je vous dédie cette thèse avec ton mon amour A la mémoire de mes grands-pères, Votre étincelle, votre attention, votre force, me guident au quotidien, et resteront à jamais dans mon cœur et ma mémoire. A mes grands-mères, Merci de m’avoir donné toute la tendresse et le bonheur nécessaires à l’aboutissement de mes études. A Yaël, David, Ouri, Yonathan, Aarone, (et...) A Carole, Alex A Noémie (et Yoel), Eva, Anael, et Elie A mes oncles, tantes, cousins, et cousines 5 A mes amis, Mike, Sandra, Steeve, Manu, Belace, Fabien, Michael T, Arié, Madi, Cheli, Johan, Sandrine, Kayout, Julien, Aurélie, Caro…et les autres. A toi… 6 SOMMAIRE 7 REMERCIEMENTS ................................................................................................. 2 SOMMAIRE .......................................................................................................... 6 INTRODUCTION .................................................................................................. 10 PREMIERE PARTIE LES COMPLICATIONS INFECTIEUSES AU COURS DES CIRRHOSES ......................................................................................................................... 13 I Les péritonites spontanées ............................................................................................. 14 II Autres types d’infections ............................................................................................... 18 1) 2) 3) 4) Infections urinaires ............................................................................................................................... 18 Bactériémies .......................................................................................................................................... 18 Pneumopathies ...................................................................................................................................... 18 Autres infections ................................................................................................................................... 18 III Caractères des infections nosocomiales dans la cirrhose........................................ 20 IV Rôle du SARM dans les infections nosocomiales chez le malade cirrhotique ...... 22 DEUXIEME PARTIE ERADICATION DU PORTAGE NASAL DU SARM........................ 24 I Les stratégies d’élimination........................................................................................... 25 II Résultats des stratégies d’élimination dans diverses situations pathologiques ........ 27 1) 2) 3) 4) La Chirurgie.......................................................................................................................................... 27 L’hémodialyse ....................................................................................................................................... 27 L’infection VIH ..................................................................................................................................... 28 Les unités de long séjour ...................................................................................................................... 28 III Les limites de l’utilisation de la mupirocine ............................................................ 29 IV Mécanismes de son activité........................................................................................ 30 V Emergence de résistance à la mupirocine .................................................................... 31 1) Mécanismes de résistance à la mupirocine ......................................................................................... 31 8 2) 3) 4) 5) Signification clinique des résistances .................................................................................................. 32 Bases génétiques des résistances à la mupirocine............................................................................... 32 Incidences de la résistance à la mupirocine ........................................................................................ 33 Origines de la résistance à la mupirocine ........................................................................................... 33 VI Traitement des staphylocoques résistants à la mupirocine .................................... 35 VII Prévention de la résistance à la mupirocine : .......................................................... 36 TROISIEME PARTIE L’ETUDE .............................................................................. 37 I Buts de l’étude ............................................................................................................... 38 II Malades et méthode........................................................................................................ 39 1) 2) 3) III 1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) Description de l’étude........................................................................................................................... 39 Les trois périodes de l’étude ................................................................................................................ 41 Analyse statistique ................................................................................................................................ 41 Résultats ...................................................................................................................... 43 Caractéristiques des patients ............................................................................................................... 43 Prévalence du portage nasal à l’admission et du portage acquis durant l’hospitalisation............. 43 Durée moyenne d’hospitalisation ....................................................................................................... 44 Efficacité de l’éradication et prévalence de la réaquisition............................................................... 44 Caractéristiques des infections à SARM : .......................................................................................... 45 Facteurs associés à la mortalité : ......................................................................................................... 46 Résistance à la mupirocine : ................................................................................................................ 46 QUATRIEME PARTIE DISCUSSION ....................................................................... 47 I Prévalence du portage.................................................................................................... 48 II Facteurs liés à l’acquisition ........................................................................................... 52 1) 2) III 1) 2) 3) 4) IV V La durée d’hospitalisation.................................................................................................................... 52 Le portage sur d’autres sites et dans les selles : ................................................................................. 52 Effets sur l’incidence des infections à SARM .......................................................... 54 Rôle des infections à SARM dans le pronostic de la cirrhose ........................................................... 54 Diminution de l’incidence des infections............................................................................................. 55 Facteurs liés aux infections chez les patients éradiqués..................................................................... 55 Données de la littérature ...................................................................................................................... 56 Effet sur les résistances : Justification des modifications du protocole ................ 62 Pourquoi ne pas avoir réaliser une étude randomisée ? ............................................. 63 CONCLUSION ..................................................................................................... 64 9 BIBLIOGRAPHIE ................................................................................................. 66 ANNEXES .......................................................................................................... 75 RESUME ............................................................................................................ 85 I Synthèse........................................................................................................................... 86 10 INTRODUCTION 11 Les infections bactériennes sont des complications fréquentes et graves au cours de l’évolution des cirrhoses. Les plus fréquentes sont les péritonites spontanées, les infections urinaires, les pneumopathies, les bactériémies, et les infections dermatologiques. La flore prédominante, pour la plupart de ces infections bactériennes, communautaires acquises, en particulier pour les péritonites spontanées, est classiquement dominée par les entérobactéries, principalement E. Coli. Depuis quelques années cependant, les pratiques et les progrès thérapeutiques en hépatologie ont considérablement évolué tant dans le domaine curatif que préventif, avec la multiplication des hospitalisations et l’allongement des durées de séjour, l’intensification des gestes invasifs et donc de la iatrogénie (ligature des varices oesophagiennes, ponction biopsie hépatique par voie transjugulaire, embolisations artérielles, prélèvements percutanés d’hépatocarcinome), l’extension des indications à la transplantation hépatique, et enfin l’antibioprophylaxie au moyen de la norfloxacine introduite en 1987 afin de réduire le risque d’infection de liquide d’ascite par les entérobactéries. L’écologie bactérienne des infections chez les cirrhotiques s’en est ainsi trouvée profondément modifiée, avec une majoration des risques d’infections nosocomiales, une élévation des résistances des bacilles à Gram négatif aux béta-lactamines dont les céphalosporines de troisième génération, ainsi qu’une augmentation de la prévalence des germes à Gram positif, qui deviennent prédominants. Le Staphylocoque est un des principaux germes responsable d’infections nosocomiales. L’émergence du Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) pose un problème particulier : L’augmentation de l’incidence des infections dues à ce germe est liée à un portage nasal observé chez environ 16% des malades hospitalisés. Le portage augmente de dix fois le risque d’infections à ce germe. Les infections à SARM ont un caractère récidivant dans plusieurs sites, et un moins bon pronostic que les infections à entérobactéries. Les modifications de l’épidémiologie des infections nosocomiales récemment décrites invitent à s’interroger sur l’épidémiologie observée dans chaque centre, à adapter les protocoles d’antibiothérapie probabiliste, à limiter la prescription de norfloxacine à titre prophylactique, favorisant l’émergence d’infections à germes résistants. 12 La prévention des infections chez les malades cirrhotiques nécessite de nouvelles stratégies. L’utilisation de la mupirocine en application nasale s’est avérée d’une efficacité satisfaisante dans l’éradication du portage nasal du SARM, les fosses nasales représentant un des principaux réservoirs de staphylocoques chez les patients cirrhotiques. Par ailleurs, qu’en est il de cette même éradication du portage nasal du SARM sur l’incidence des infections à staphylocoques chez les cirrhotiques ? Nous avons donc mené une étude prospective sur 4 ans, sur une large population de patients hospitalisés dans une unité de rééducation digestive (Hôpital Albert Chenevier à Créteil), et tenté d’observer sur ces quatre dernières années (2000 à 2004), l’incidence des infections à staphylocoques depuis l’instauration de la politique d’éradication du portage nasal du SARM au moyen de la mupirocine. 13 PREMIERE PARTIE LES COMPLICATIONS INFECTIEUSES AU COURS DES CIRRHOSES 14 I Les péritonites spontanées Les infections bactériennes sont des complications fréquentes et graves chez les malades cirrhotiques, et elles restent une cause fréquente de morbidité et de mortalité dans l’évolution de la maladie. On estime ainsi que les infections représentent environ 25% des causes de mortalité chez les cirrhotiques. Ces complications, connues de longue date, ont bénéficié récemment de progrès thérapeutiques, tant dans le domaine curatif que préventif ; mais des modifications d’ordre épidémiologique sont en train d’apparaître du fait de l’évolution des pratiques médicales. Les infections bactériennes les plus fréquentes sont les infections spontanées du liquide d’ascite ou péritonites spontanées, les infections urinaires, les pneumopathies, les infections dermatologiques, et les bactériémies. (1). Les mécanismes à l’origine d’une augmentation du nombre d’infections bactériennes reposent sur une altération des mécanismes de défense immunitaire. Le mécanisme le plus important semble être une diminution de la clairance du système réticulo endothélial. Il a été également décrit une diminution des capacités de recrutement des polynucléaires neutrophiles, et une diminution des capacités de phagocytose. L’activité des lymphocytes natural killer (NK) et des lymphocytes activated killer (LAK) serait également réduite. La translocation des bactéries intestinales à travers la paroi digestive dont témoigne la colonisation des ganglions mésentériques est une étape favorisant la dissémination des germes. Enfin, l’altération des mécanismes de défenses non spécifiques telle que la diminution du complément sérique, la baisse de l’activité opsonisante et bactéricide du liquide d’ascite, participe au risque accru d’infections. Les PS (péritonites spontanées) sont les plus fréquentes des infections bactériennes. (2). Le risque chez un malade cirrhotique ascitique hospitalisé de contracter une PS (péritonite spontanée) est de l’ordre de 10 à 30%. La flore microbienne est classiquement dominée par les entérobactéries, plus particulièrement E.Coli, responsable d’environ 70% des péritonites spontanées. Il s’agit d’une flore saprophyte du tube digestif qui, suite à une translocation de la paroi intestinale, va coloniser les ganglions mésentériques. Les germes vont diffuser par voie hématogène et ensemencer secondairement le liquide d’ascite. Ce mécanisme explique qu’une bactériémie contemporaine de l’épisode d’une péritonite spontanée soit mise en évidence dans 30 à 50% des cas. 15 Les facteurs de risque indépendants des péritonites spontanée sont l’élévation de la bilirubine plasmatique traduisant le degré d’insuffisance hépatocellulaire, et le taux de protides dans le liquide d’ascite, dont un taux bas, au dessous de 10g/l, traduit une altération des capacités d’opsonisation. Le germe en cause est habituellement unique, et les autres germes retrouvés après les entérobactéries sont les cocci à Gram+, principalement les streptocoques et les entérocoques. Cliniquement, une péritonite spontanée peut se manifester par des signes tels que fièvre ou hypothermie, des douleurs abdominales parfois même d’allure pseudo chirurgicale, des nausées, des vomissements, des troubles du transit, un état de choc. Mais elle peut aussi être latente, et doit être recherchée de principe devant toute aggravation de la cirrhose (encéphalopathie hépatique, insuffisance rénale…) par une ponction d’ascite exploratrice. 10% des cas de péritonites spontanées sont asymptomatiques, et diagnostiqués lors d’une ponction d’ascite systématique. Le diagnostic de péritonite spontanée est souvent fait sur la cytologie du liquide d’ascite réalisable dans l’heure qui suit le prélèvement et affirmé par un taux de polynucléaires neutrophiles supérieur à 250/mm3. L’ascitoculture peut être positive, mais l’examen bactériologique direct est en général négatif. C’est l’ensemencement du liquide d’ascite dans des flacons à hémoculture qui ramène une culture habituellement positive en 48 à 72 heures. Lorsque l’asciculture est négative mais que le taux de polynucléaires neutrophiles est supérieur a 250/mm3, on parle d’ascite stérile riche en polynucléaires neutrophiles, à considérer comme une authentique infection, et à traiter comme telle. Lorsque l’asciculture est positive mais avec un taux de polynucléaires neutrophiles inférieur à 250/mm3, on parle de bactérascite (colonisation du liquide d’ascite par une bactérie en l’absence de toute réaction inflammatoire péritonéale) et l’attitude pratique dépend du contexte clinique. S’il existe des signes cliniques en faveur d’infection, il faut traiter rapidement, car il peut s’agir d’une péritonite spontanée à son début, sinon, il est recommandé de refaire une ponction à 24 heures pour contrôler le nombre de polynucléaires neutrophiles. Cependant, malgré des méthodes de détection de plus en plus sensibles, l’asciculture est négative chez 40% des patients présentant des signes très évocateurs de péritonite spontanée et avec un taux de polynucléaires neutrophiles dans l’ascite très élevé. 16 Le traitement de la péritonite spontanée repose sur une antibiothérapie à large spectre qui doit être adaptée aux germes les plus souvent rencontrés. Ce traitement curatif est bien codifié et repose essentiellement sur des céphalosporines de 3ème génération à large spectre (céfotaxine ou ceftriaxone) ou sur l’association amoxicilline_acide clavulanique avec une fluoroquinolone pendant 10 à 15 jours. L’efficacité de ce traitement doit être évaluée au bout de 48 heures par une ponction d’ascite exploratrice de contrôle et se juge sur la diminution du nombre de polynucléaires neutrophiles qui doit être d’au moins 25%. En cas d’échec du traitement initial, celui-ci doit être évidemment réévalué, en tenant compte soit des résultats de l’asciculture si elle est positive, soit de façon empirique si elle est négative. La péritonite spontanée est une complication grave, et la mortalité au cours du séjour hospitalier après un épisode est de l’ordre de 25%. Le risque majeur est la récidive ultérieure, de l’ordre de 70%, exposant à un risque cumulé de mortalité élevé. La péritonite spontanée est ainsi un critère dans l’indication de la transplantation hépatique. Le risque élevé de récidive a conduit à proposer des stratégies d’antibioprophylaxie. La norfloxacine est l’antibiotique le plus utilisé à cette fin. Ingérée à la dose de 400mg/j, elle agit essentiellement au niveau de la flore digestive, en détruisant la flore des entérobactéries ; une faible part est absorbée. Plusieurs études ont montré une diminution très significative du nombre d’épisodes de péritonites spontanées à l’aide de cette prophylaxie. Les indications actuellement retenues sont : l’hémorragie digestive récente, un premier épisode de péritonite spontanée. Mais il n’y a pas de consensus quant à la stratégie à adopter en l’absence de tout épisode de péritonite spontanée avec un taux de protides bas dans l’ascite (<10g/l), facteur de risque de survenue de PS. Le problème majeur posé par ce traitement prophylactique de la péritonite spontanée utilisant largement les quinolones, est l’émergence de souches résistantes. En effet, la norfloxacine, quinolone partiellement absorbée après administration orale , utilisée pour une décontamination digestive sélective, élimine les BGN (bacilles à Gram négatif) aérobies de la flore intestinale, mais préserve les autres bactéries aérobies et anaérobies, menant à la sélection de souches de BGN résistantes aux quinolones dans la flore fécale, à la colonisation de cette flore par des germes multi résistants et donc l’émergence de bactéries multi résistantes dans les selles chez environ la moitié des patients sous antibioprophylaxie. 17 Par ailleurs, on constate également une augmentation de la fréquence des infections à entérobactéries résistantes aux quinolones (augmentation de l’incidence des infections du tractus urinaire à entérobactéries résistantes) et à SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline), qui caractérisent les infections nosocomiales. L’administration à long terme de norfloxacine pour l’antibioprophylaxie des péritonites spontanées à entérobactéries est donc largement utilisée aujourd’hui puisqu’il existe un bénéfice en terme de survie ; cependant l’écologie bactérienne s’en est trouvé profondément modifiée, favorisant l’émergence de souches résistantes. 18 II Autres types d’infections 1) Infections urinaires Les infections urinaires sont fréquentes chez les cirrhotiques. Elles sont observées avec une prévalence de 20 à 25% chez les malades hospitalisés. Elles sont plus fréquentes chez les femmes, et sont favorisées par l’insuffisance hépatocellulaire. Elles sont souvent asymptomatiques, et doivent donc être systématiquement recherchées à l’admission avec un examen cytobactériologique des urines. La flore responsable est dominée par les entérobactéries(3). Un trouble de l’évacuation vésicale avec persistance d’un résidu post mictionnel a été incriminé comme facteur de risque d’infection urinaire, mais ce facteur n’a pas été retrouvé dans une étude prospective récente(4). 2) Bactériémies Les bactériémies sont observées avec une prévalence de 5 à 10% chez les malades hospitalisés. Elles peuvent être primitives, ou accompagner une infection localisée telle qu’une péritonite spontanée, une pneumopathie, une infection des voies urinaires ou biliaires. La flore responsable des bactériémies est également classiquement dominée par les entérobactéries. Le pronostic est sévère avec une mortalité plus lourde que celle observée avec les péritonites spontanées. 3) Pneumopathies Les pneumopathies sont fréquentes avec une prévalence de l’ordre de 20%, le diagnostic bactériologique est plus difficile à établir, le pneumocoque pourrait être assez souvent en cause. Des agents opportunistes et des levures doivent être recherchés en cas d’échec des antibiothérapies probabilistes. 4) Autres infections Les infections dermatologiques sont observées dans environ 10% des cas, et sont favorisées par les œdèmes chroniques des membres inférieurs favorisant l’apparition d’ulcères cutanés. Parmi les autres infections bactériennes que l’on peut observer chez les cirrhotiques, le risque de méningites serait accru. 19 Outre les infections bactériennes, les malades cirrhotiques présentent un risque accru de tuberculose, en général de mauvais pronostic. (4). Les infections fongiques sont rares mais risquent de ne pas être reconnues. Les agents les plus fréquemment rencontrés sont les Candida et les cryptocoques, responsables d’infections systémiques, de péritonites, pneumopathies, et méningites. (5). Les agents doivent être recherchés dans une infection sévère, non documentée au plan bactériologique et/ou rebelle à l’antibiothérapie antibactérienne. A noter également, en raison d’une immunodépression latente, un risque de développer une infection à CMV (Cytomégalovirus), en général modérée et asymptomatique. (6). 20 III Caractères des infections nosocomiales dans la cirrhose Depuis quelques années, l’attention a été attirée sur les modifications épidémiologiques concernant la flore responsable des infections bactériennes observées chez les cirrhotiques. Ces derniers sont en effet fréquemment hospitalisés dès que la maladie est évoluée et compliquée avec souvent des séjours hospitaliers prolongés. Dans tous les domaines de la pathologie, les infections nosocomiales se caractérisent par une sélection de germes de plus en plus résistants aux antibiotiques. D’autre part, toutes les mesures invasives, tant à visée diagnostique que thérapeutique, exposent à un risque accru d’infections provoquées par des germes multi résistants. Il a été ainsi montré une évolution du spectre de sensibilité des germes responsables de péritonites spontanées de 1977 à 1997. (7). Alors que jusqu’en 1980, toutes les souches d’E.Coli avaient un phénotype sauvage, c'est-à-dire, étaient sensibles à l’amoxicilline, la prévalence de ce phénotype a régulièrement diminué et n’est plus que de 50% à la fin des années 90. Actuellement, 20% des souches sont devenues résistantes à l’association Amoxicilline_Acide clavulanique, tandis que près de 10% sont résistantes aux Céphalosporines de troisième génération. Si l’on considère l’ensemble des entérobactéries, c’est 20% des souches qui sont résistantes à ces dernières molécules. Parallèlement à l’augmentation des résistances aux BGN (Bacilles Gram négatifs), nous avons vu apparaître l’émergence des bactéries cocci à Gram+ pouvant présenter des phénotypes de haut niveau de résistance aux antibiotiques : c’est ainsi, le cas de certaines souches d’entérocoques (enterococcus faecium) et surtout Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM). L’épidémiologie des infections nosocomiales chez les malades cirrhotiques est grandement modifiée par rapport aux données classiques que nous avons précédemment rappelées. Elle est en effet dominée par la prévalence des infections à Cocci à Gram+ devenues majoritaires, cela est désormais bien montré par 2 études concordantes réalisées dans des centres différents. (8, 9). 21 Nous montrons dans le tableau 1 la prévalence des différents germes que nous avons isolés à l’origine des péritonites spontanées et des bactériémies observées dans notre centre : 94.4% et 87.3% des souches de staphylocoques dorés isolées lors des épisodes de PS et de bactériémies étaient des SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). Les bactériémies et les péritonites spontanées nosocomiales ont une plus grande mortalité que les mêmes infections communautaires. Plusieurs études (10) se sont déjà attardées à rechercher si la nature des germes isolés pouvait influencer le pronostic des infections. Les patients des infections à staphylocoques ont une mortalité supérieure aux patients ayant présenté des infections à streptocoques ou aux entérobactéries. La gravité particulière des infections à staphylocoques est en rapport avec leur caractère récidivant qui peut se manifester dans un grand nombre de sites (ascite, poumons, urine, revêtement cutané, appareil ostéo articulaire) Un point particulier que montre cette dernière étude (10) est le caractère cytologique des péritonites spontanées en fonction des germes en cause. Les infections à cocci à Gram+ se caractérisent par un nombre de leucocytes et polynucléaires dans l’ascite plus bas que les infections à Bacilles à Gram négatif. Ainsi 92% des péritonites spontanées à staphylocoques, 73% des péritonites spontanées à streptocoques et ,64% des péritonites spontanées à entérocoques ont un nombre de polynucléaires neutrophiles dans le liquide d’ascite inférieur à 250/mm3 alors que 39% et 15% seulement des péritonites spontanées à entérobactéries et aux autres Bacilles à Gram négatif ont un nombre de polynucléaires neutrophiles inférieur à ce seuil. La plupart des infections à cocci à Gram + étaient des bactérascites symptomatiques, équivalent de péritonites spontanées, comme le montre une mortalité identique. 22 IV Rôle du SARM dans les infections nosocomiales chez le malade cirrhotique Le SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) est un des principaux germes responsables d’infections nosocomiales. Son rôle pathogène est favorisé par un portage corporel transmis de façon manu portée, à l’origine d’infections systémiques. Le rôle pathogène de ce germe dans les infections nosocomiales est bien démontré dans les suites de la chirurgie, chez les patients hémodialysés, les patients immuno déprimés, et les transplantés. Les fosses nasales sont le principal réservoir de ce portage. Il a déjà été montré, par plusieurs auteurs, une prévalence élevée de portage nasal de SARM à l’admission chez les malades cirrhotiques (16%). (11). L’acquisition du portage pendant le séjour hospitalier est favorisée par la durée d’hospitalisation. Les facteurs liés à la recolonisation des fosses nasales après éradication sont d’une part la durée d’hospitalisation, et d’autre part le portage dans un autre site, plus particulièrement les selles. La prévalence des péritonites spontanées, bactériémies, et infections urinaires à SARM, est significativement plus élevée chez les malades porteurs que chez les malades non porteurs ; et le risque chez les malades porteurs de contracter une de ces infections provoquées par ce germe est multiplié par un facteur 10. (Figure 1, et 2). Les risques induits par ce portage ont pour conséquence que ce dernier est un facteur indépendant de mauvais pronostic au sein de cette population de malades hospitalisés. En revanche, le portage dans les selles de BGN (Bacilles à Gram négatif) multi résistants n’expose pas à un risque accru d’infections provoquées par ces mêmes germes. Les antibiothérapies prolongées et répétées jouent un rôle manifeste dans la sélection de germes résistants. L’antibioprophylaxie des péritonites spontanées reposant sur la norfloxacine joue vraisemblablement un rôle. 23 La prise de norfloxacine s’accompagne de l’apparition dans les selles d’entérobactéries résistantes aux quinolones. Il en résulte cliniquement l’émergence d’infections provoquées par des entérobactéries résistantes aux quinolones. (8). Il a également été montré que l’antibioprophylaxie au moyen de la norfloxacine favorise le portage nasal de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) et l’émergence de péritonites spontanées et bactériémies provoquées par le SARM. (10). Le risque de portage nasal de SARM était de 34% chez les patients sous norfloxacine et de 22% chez les patients ne recevant pas de prophylaxie (p<0.02). (11). Les prévalences de SARM dans les péritonites spontanées et bactériémies chez les malades sous norfloxacine étaient respectivement de 43.5 et 70.6% vs 9 et 36.7% chez les malades ne recevant pas de prophylaxie (p<0.001 et p<0.01). (12). Les modifications de l’épidémiologie des infections nosocomiales chez les malades cirrhotiques, caractérisées par la prédominance des germes à Gram+, ainsi que l’augmentation des germes résistants à la norfloxacine, sont susceptibles de remettre en cause le bien fondé de l’antibioprophylaxie par cette molécule dont l’usage devrait au moins être limité dans le temps. Les modifications de l’épidémiologie des infections devraient également conduire à des modifications de la pratique de l’antibiothérapie probabiliste. L’utilisation des Bêta lactamines dont les C3G restent légitimes car ces antibiotiques sont efficaces dans la plupart des infections provoquées par les bacilles à Gram négatif, stréptocoques, ou entérocoques. En revanche, l’usage des quinolones devrait être conditionné aux données de l’antibiogramme, après documentation bactériologique de l’infection. D’autre part, compte tenu de la responsabilité croissante du SARM, la vancomycine devrait être utilisée plus largement en seconde intention, en cas d’efficacité insuffisante de l’antibiothérapie probabiliste dans les 48-72 heures après initiation de cette dernière et avant les résultats des prélèvements bactériologiques. 24 DEUXIEME PARTIE ERADICATION DU PORTAGE NASAL DU SARM 25 I Les stratégies d’élimination Trois approches sont possibles en vu de l’élimination du portage nasal de Staphylococus aureus. (13). La première, consiste en l’application locale d’antibiotiques ou de désinfectant. Les plus souvent utilisés l’étaient sous forme de sprays ou de pommades parfois associés à des désinfectants locaux ; les résultats étaient pour la plupart décevants, montrant à la fois une faible efficacité des applications et l’émergence rapide de résistances aux différents produits utilisés.(14, 15, 16). Récemment, un nouvel antibiotique, la mupirocine a été utilisé en application locale et semble être très efficace quant à l’élimination des Staphylocoques dorés, offrant par conséquent une réelle possibilité d’éliminer le portage nasal. Par ailleurs la mupirocine est mieux tolérée et il ne semble pas se développer de résistances quand elle est utilisée sur de courtes périodes (2 applications par jour pendant 5 jours). L’application de mupirocine à ce rythme chez des patients sains porteurs de Staphylococcus aureus a montré 91% d’élimination de portage. Après 4 semaines de ce traitement de 5 jours, 87% d’entre eux restaient non porteurs (dans le groupe placebo, les taux d’élimination à 5 jours et à 4 semaines était de 6 et de 7%) A 6 mois, le portage nasal dans le groupe traité était de 48% versus 72% dans le groupe placebo et à 1 an, 53% versus 76%. De la même façon, le portage manuel à 6 mois était significativement réduit dans le groupe traité 15% versus 48% dans le groupe placebo. (17, 18, 19). Les limites de l’efficacité de cet antibiotique semblent être liées à une possible recolonisation, soit à partir d’autres sites corporels, soit à partir de sources externes chez des patients initialement « éradiqués » avec succès. Enfin, il semble que l’apparition de souches résistantes à cet antibiotique bien que rare soit possible, essentiellement chez des patients traités sur de plus longues périodes, et à grande échelle, avec développement de 2 types de résistance ; soit de bas niveau (CMI de 8 à 256 mg/l) en rapport avec une modification de l’enzyme cible, soit de haut niveau (CMI>500mg/l) en rapport avec une enzyme de résistance plasmidique. (17, 20). 26 Une deuxième approche afin d’éliminer ce portage nasal, consiste en l’utilisation d’une antibiothérapie par voie générale. Cependant, les résultats ont été décevants pour la plupart des agents utilisés. Seule la Rifampicine semble avoir une efficacité, mais les effets secondaires et l’émergence de résistances en limitent l’utilisation dans cette indication. (14). Une troisième approche repose sur la notion d’interférence bactérienne, qui consiste à provoquer une colonisation avec une souche de staphylocoques dorés de faible activité pathogénique mais capable de prévenir une colonisation par des souches plus virulentes, en supposant que les sites de fixation nasale seront occupés par les souches de faible virulence. Des complications septiques dramatiques sont malheureusement survenues et cette stratégie est pour le moment en suspens. (21, 22, 23). De ces 3 approches, seule l’utilisation de mupirocine semble offrir de réels espoirs dans l’éradication du portage nasal du staphylocoque doré. 27 II Résultats des stratégies d’élimination dans diverses situations pathologiques 1) La Chirurgie L’utilisation locale en prophylaxie péri opératoire chez des patients opérés ayant un portage nasal clairement établi, montre une diminution du taux d’infection des sites chirurgicaux et une diminution significative du taux d’infection nosocomiale à staphylocoques dorés. Le protocole de traitement débute la veille de l’intervention par l’application locale de mupirocine 2 fois par jour pendant 5 jours. Aucune résistance à la mupirocine n’a été observée lors de l’utilisation sur de courtes périodes, la mupirocine apparaissant être un traitement sans danger avec un effet protecteur chez les porteurs nasal de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) et un traitement adjuvant notable pour prévenir les infections nosocomiales chez les porteurs après intervention. (24). 2) L’hémodialyse La rifampicine a longtemps été l’antibactérien le plus utilisé avec succès chez les patients hémodialysés afin d’éradiquer le portage nasal de staphylocoques dorés. Cependant, les effets secondaires et l’émergence rapide de souches résistantes à la rifampicine ont favorisé l’essai de la mupirocine chez ce type de patients (14, 25). Dans les différentes études réalisées, la mupirocine est utilisée sur de plus longues durées, jusqu‘à 9 mois pour certaines, permettant d’éliminer le portage nasal de staphylocoque doré et de diminuer significativement le risque d’infections à ce germe, au détriment cependant du risque de développement de résistances. Il semble que ce risque soit majoré chez les patients soumis à une dialyse péritonéale continue, d’autant plus que l’utilisation locale de la mupirocine se fait sur de longues périodes. Cependant, l’élimination du portage nasal diminue le taux d’infections au site de ponction. (26 ; 27). 28 3) L’infection VIH Les études réalisées chez les patients infectés par le VIH montrent que l’application intra nasale, 1 fois par jour, et ce 5 jours de suite, élimine le portage nasal de staphylocoque doré pour plusieurs semaines., Mais la recolonisation ultérieure est fréquente, posant le problème de l’existence d’autres sites réservoirs (comme les mains), de l’efficacité de l’éradication dans la prévention des infections à ce germe et de l’intérêt de la seule éradication nasale dans la prévention des infections si d’autres sites existent. Par ailleurs, il semble exister une différence quant à l’efficacité dans la durée de l’éradication selon que le patient soit porteur sain ou qu’il soit déjà symptomatique (71% d’éradication à 12 semaines versus 29% d’éradication à 10 semaines chez les malades).(28). Toutefois, pour les patients VIH + ayant une histoire d’infections à staphylocoque doré et ceux à haut risque de faire une infection à ce germe, le traitement préventif local par mupirocine ne semble pas être remis en question si un protocole de traitement court est institué et consécutif à la recherche locale du germe pendant les périodes à haut risque. (29). 4) Les unités de long séjour L’application nasale pendant un temps très court de mupirocine chez les patients résidents colonisés par le SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) ainsi que chez le personnel paramédical, pourrait casser la chaîne de transmission du staphylocoque doré. (30). 29 III Les limites de l’utilisation de la mupirocine La mupirocine est apparue dans la pharmacopée de la pratique clinique en Angleterre en 1985, après avoir prouvé être un traitement extrêmement efficace des infections de la peau et l’un des antibiotiques locaux les plus efficaces dans l’élimination des staphylocoques dorés isolés dans le nez, y compris les souches multi résistantes. (31). Que ce soit la pommade ou la crème pour application nasale, son utilisation s’est largement répandue dans plus de 90 pays. Dans la plupart de ces pays, les indications actuelles de cette antibiothérapie locale incluent l’éradication des souches de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline), alors que l’indication initiale de la mupirocine était différente. En effet, l’indication originelle de cet antibiotique était le traitement ou dans certains pays la prévention de la colonisation bactérienne des lésions cutanées abrasives et des coupures. Malheureusement, des cas de résistances ont été décrits très précocement après le début de son utilisation, limitant les indications. (32) 30 IV Mécanismes de son activité La mupirocine est un antibiotique bactériostatique mais apparaît être bactéricide à un PH plus acide, correspondant à celui de la majorité de la surface cutanée. L’équipe de Yanagisawa a récemment postulé que la mupirocine se lie à la cible de l’ARNt isoleucine synthétase(IleS), dans le voisinage immédiat d’un site ATP, et qu’elle est ainsi un inhibiteur bi fonctionnel avec à la fois les caractéristiques de l’isoleucine et de l’ATP, c'est-àdire un analogue de l’isoleucineadénylate. (33). 31 V Emergence de résistance à la mupirocine Comme nous l’avons vu précédemment, il existe deux types de populations résistantes: celles qui montrent un faible niveau de résistance (CMI : concentration minimale inhibitrice=8256mg/l) et celles qui ont un haut niveau de résistance (CMI>256mg/l). Plusieurs facteurs sont à considérer comme potentiellement susceptibles de favoriser les échecs de ce traitement : • Les concentrations de l’agent bactérien rencontrées dans les couches profondes de la peau sont plus faibles que celles rencontrées dans le nez. • L’existence de réservoir de bactéries constituant une réelle menace (rectal/fécal), ou les applications de mupirocine sont, du fait de leur localisation, irrégulières ou inefficaces (32). • La ré-acquisition bactérienne provenant d’autres individus de la même unité, soit par le portage transitoire du personnel, soit parce que ce même personnel est colonisé avec cet organisme. • Rarement, dans les services de dermatologie ou les unités grands brûlés, une transmission aérienne et environnementale a été mise en évidence. Ainsi, les brassards à tension artérielle ont été incriminés dans la dissémination des souches bactériennes, chez les patients ayant une desquamation cutanée importante. (34). 1) Mécanismes de résistance à la mupirocine Le niveau de résistance à la mupirocine est lié aux altérations de l’IleS. La concentration d’antibiotique qui divise par deux l’activité enzymatique est bien corrélée à la CMI. Un faible niveau de résistance est probablement dû à des mutations sur le gène chromosomique codant pour l’IleS. De récentes études ont aussi montré que la substitution d’un seul acide aminé codant pour la synthétase d’E.Coli altère significativement sa susceptibilité à la mupirocine. D’autres mécanismes ont été proposés afin d’expliquer la résistance, notamment un complexe protéique ARNt synthétase altéré qui pourrait réduire la capacité de la mupirocine à se lier à l’IleS. 32 Il a été montré in vivo, qu’un haut niveau de résistance était dû à l’acquisition d’un nouvel ILeS, additionnel. (33, 35, 36). 2) Signification clinique des résistances Il semble que pour les souches de faible niveau de résistance à la mupirocine (avec au moins une CMI de 32mg/l), la signification clinique soit douteuse, et que les échecs de l’éradication de ces souches aient d’autres explications, comme la multiplication de sites de portage de staphylocoque doré. L’avis général concernant les souches de haut niveau de résistance est que ces dernières ne peuvent pas être éradiquées par la mupirocine. (37, 38, 39). 3) Bases génétiques des résistances à la mupirocine Les souches de haut niveau de résistance à la mupirocine transportent un élément de résistance appelé mupA sur un plasmide inhabituel qui pourrait être transféré par un processus de conjugaison. (40). Le mupA code pour un polypeptide de 1024 acides aminés dont la structure primaire présente une homologie significative avec l’IleS. Cependant, mupA présente seulement 57% d’ADN identique avec l’IleS de staphylocoque doré, et pourrait provenir d’un autre organisme, non encore identifié. (41). Il est maintenant bien connu in vitro, que les souches de staphylocoques dorés sensibles à la mupirocine peuvent parvenir à de hauts niveaux de résistance par des passages progressifs dans des milieux à des concentrations croissantes en mupA, mais ne peuvent pas survivre in vivo. L’utilisation de la mupirocine seule (sans agent de diffusion systémique) dans des situations où la diffusion ne peut être optimale ou est impossible, pourrait participer à la survenue de telles mutations, particulièrement si les populations staphylococciques sont conséquentes. (42). 33 4) Incidences de la résistance à la mupirocine L’estimation de l’incidence de la résistance à la mupirocine pose plusieurs problèmes : réalité de l’utilisation globale de la mupirocine, diversité et efficacité des méthodes de détection des résistances à la mupirocine, qualité et quantité des inoculats. (43). Une étude réalisée en 1990 dans une unité de dermatologie et quatre autres centres anglais a mis en évidence sur 7137 souches de staphylocoques dorés testées, seulement 0.3% de résistance à la mupirocine, et seule un sixième de celle-ci montrait un haut niveau de résistance. Il n’y avait pas de façon évidente de colonisation croisée, de transfert ou de réadmission de patients porteurs de ces souches. (44, 45). Une autre étude réalisée sur une période de six mois en 1991 dans l’hôpital de Birmingham n’a montré qu’un seul cas de résistance parmi 429 souches isolées. Cependant, durant la même période et dans un secteur de dermatologie proche, une incidence de 8.3% sur 228 souches isolées a été montrée et une utilisation de mupirocine multipliée par six. (46). Il n’y a pas de données quant à la durée et au rythme d’administration de la mupirocine, qui pourrait mettre en évidence une utilisation sub normale ; soit plus de deux fois par jour comme initialement recommandée, afin de diminuer la susceptibilité à l’émergence de résistances. (47). Plusieurs études réalisées entre 1986 et 1995 aux USA, en Nouvelle Zélande et en Australie laissent finalement apparaître que, chez des patients traités pour brûlures, de haut niveau de résistance à la mupirocine surviennent dans un contexte d’utilisation répétée, soit d’utilisation sur de longues durées, alors que les auteurs recommandent moins de 10 jours de traitement et de laisser un intervalle d’au moins un mois entre deux traitements. (48). 5) Origines de la résistance à la mupirocine L’origine de l’existence de haut niveau de résistance à la mupirocine fait encore l’objet de conjectures. De nombreuses études sont encore en cours. Les recherches concernant le mupA ont été étendues aux souches de faible niveau de résistance, car son existence a été mise en 34 évidence chez ces souches de staphylocoques dorés. Par ailleurs, les laboratoires de recherches sur les infections hospitalières ont également mis en évidence un staphylocoque doré mupirocine et méthicilino sensible porteur d’un plasmide qui pourrait s’hybrider avec le mupA. (49, 50). La récente description d’un gène « mec A like » chez des souches de staphylocoques dorés méthicilino sensibles, pourrait conforter la possibilité de l’existence d’autres gènes de résistance tels que le mupA, qui pourraient être présents sur les chromosomes d’organismes sensibles à la mupirocine, réalisant une fonction d’IleS. (51). 35 VI Traitement des staphylocoques résistants à la mupirocine L’élimination des souches de haut niveau de résistance à la mupirocine requiert une approche stratégique. Les blessures et autres sites colonisés ou infectés peuvent être traités. Un traitement systémique peut être envisagé pour l’éradication du portage nasal ou cutané de staphylocoque doré si celui-ci est également présent dans l’oropharynx ou dans les selles. De nombreuses souches de haut niveau de résistance à la mupirocine ont été isolées chez des patients en cours de traitement par la mupirocine, et il est peu probable que la mupirocine soit capable d’éliminer ces souches de la peau et encore moins du nez (32). L’émergence de résistance à la mupirocine et de fait, la perte potentielle d’une des armes les plus efficaces sur l’éradication des souches de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) a fait l’objet de nombreux débats concernant les indications de sa prescription. Les indications hors AMM ont été réactualisées par Hudson en 1994 et incluent : • le traitement nasal péri opératoire dans tous les types d’interventions chirurgicales, • le traitement prolongé afin d’éradiquer le portage nasal de Staphylocoque doré chez les patients hémodialysés, en dialyse péritonéale prolongée, en unité de soins intensifs ou dans les cas familiaux d’infections à Staphylocoque , • l’éradication de Staphylococcus épidermidis résistant à la méthicilline chez le personnel médical et paramédical ainsi que chez les patients hospitalisés en chirurgie thoracique. (17). De nombreux autres agents ont démontré leur efficacité in vitro sur la destruction des souches de haut niveau et de bas niveau de résistance à la mupirocine. Cependant des recherches sont encore à faire concernant leur efficacité in vivo, leur toxicité éventuelle, leur mode d’utilisation, leur indication, leurs associations possibles, et leur coût. De tous les topiques testés jusqu’à présent, la mupirocine reste le traitement ayant le plus de réussite sur l’éradication du SARM, et est encore largement utilisée. Elle doit être cependant appliquée avec précaution et débutée chez des patients indemnes de tout portage chronique extra nasal de SARM (52). 36 VII Prévention de la résistance à la mupirocine : L’apparition de résistance à la mupirocine conduit à devoir utiliser cet antibiotique le plus judicieusement possible. Toute utilisation prolongée et/ou trop largement répandue de la mupirocine, doit être proscrite dans les hôpitaux et autre secteur hospitalier. Les stratégies d’éradication du SARM doivent être relayées par les laboratoires qui sont à même de détecter tout cas de résistance, de contrôler les prescriptions périodiques d’antibiotiques et de réaliser des audits sur le contrôle des infections, afin de détecter rapidement et d’intervenir le plus tôt possible dans le but de minimiser toute transmission. Par ailleurs, les mêmes stratégies doivent être appliquées à tout agent utilisé pour contrôler les SARM et particulièrement les souches de haut niveau de résistance à la mupirocine. Aucun agent ne doit être utilisé comme substitut à la mupirocine dans le contrôle des petites infections de même que les prescriptions d’antibiotiques usuels, sans que ceux-ci n’aient fait l’objet d’études et d’audits de la part des professionnels de santé. L’utilisation répétée d’antibiotiques et d’autres agents destinés à l’éradication de SARM doit être contrôlée par des agréments hospitaliers et réévaluée régulièrement. Leur utilisation prophylactique ou prolongée dans le cadre de la prophylaxie en chirurgie ou de la prévention des infections chez les patients dialysés doit également faire l’objet d’études et d’agréments régulièrement renouvelés et mis à jour, leur coût établi et le développement de résistance aux staphylocoques attentivement surveillée. (31). 37 TROISIEME PARTIE L’ETUDE 38 I Buts de l’étude En raison d’une prévalence élevée du portage nasal de SARM chez les patients admis dans le service de rééducation digestive, il est procédé à l’éradication du portage nasal de SARM au moyen de la mupirocine depuis 2000. Les buts de cette étude prospective consistaient en l’évaluation des effets de cette pratique sur : • L’incidence des infections systémiques à SARM • Les modifications de l’acquisition du portage du SARM durant le séjour hospitalier • L’incidence des résistances des souches de SARM isolées à la mupirocine. 39 II Malades et méthode 1) Description de l’étude Sur une période de 55 mois (mars 2000 à septembre 2004), nous avons procédé à une étude prospective. Ainsi, tous les patients dans le service de rééducation digestive ont été inclus dans l’étude. Notre service reçoit des patients provenant d’autres hôpitaux de la région parisienne. La plupart de ces patients nécessitent un long séjour d’hospitalisation et de réhabilitation en raison de sévères complications de la maladie. Un total de 2242 patients fût inclus dans l’étude. Les malades ont été répartis en trois groupes de patients : • Patients avec une maladie chronique du foie (MCF=1435) incluant des patients avec des maladies alcooliques (n=1253) et non alcooliques (n=124) du foie, et des patients présentant un carcinome hépatocellulaire (n=58). • Patients hospitalisés pour des pathologies médicales non hépatiques (PM=563), incluant des patients hospitalisés pour sevrage alcoolique (n=301), des patients hospitalisés pour des complications nutritionnelles et neurologiques de l’alcool (syndrome de Gayet Wernicke et de korsakoff, dénutrition, polynévrites (n=86) et autres maladies du tube digestif (n=176) • Patients hospitalisés en post chirurgie (PC=244), incluant ceux admis après chirurgie digestive (n=169), et ceux admis après transplantation hépatique (n=75). Le portage, nasal et dans les selles, était recherché dans les 48 heures suivant l’admission, puis toutes les semaines pour le portage nasal durant la totalité du séjour hospitalier. Le portage nasal était recherché par l’écouvillonnage (cinq rotations) de chaque narine antérieure, le portage dans les selles était recherché par une coproculture. Ces prélèvements étaient apportés au laboratoire de bactériologie dans l’heure suivante. 40 Les prélèvements étaient disposés sur des disques et agar supplémentés en Tétramycine (10mg/l) ou ofloxacine (1mg/l) pour la détection simultanée de la résistance aux aminoglucosides et aux fluoroquinolones habituellement associée à la résistance à la méthiciline des souches de Staphylococus aureus. Les disques étaient incubés pendant 48 heurs à 37 degrés. L’identification de Staphylococus aureus était confirmée par des méthodes standards. La sensibilité aux antibiotiques était déterminée suivant la technique de diffusion sur disque, ainsi qu’elle est recommandée par le Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie. La concentration minimale inhibitrice (CMI) de la mupirocine était déterminée pour toutes les souches à l’aide du test « Antibiotic gradient ship E ».(E test) Les seuils pour la mupirocine étaient <7mg/l pour les souches sensibles, 8-64mg/l pour les souches de bas niveau de résistance, 128-256mg/l pour les souches de niveau intermédiaire de résistance, et supérieur ou égal à 500mg/l pour les souches de haut niveau de résistance. Le portage nasal du staphylocoque doré était défini par la présence du SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) dans les cultures nasales. Les porteurs furent assignés à un traitement intra nasal de 5 jours avec la mupirocine. Le produit était appliqué dans les 2 narines 2 fois par jour pendant 5 jours, le nez était ainsi massé pendant une minute. Durant le traitement avec la mupirocine, les patients étaient soumis à un lavage complet du corps, shampoing, alternant un jour avec une solution chlorexidine 4% (hibiscrub) et les jours suivants avec un savon plus doux. Parallèlement, les mesures d’hygiène visant à diminuer et limiter la diffusion du SARM furent renforcées : lavage des mains à l’aide de solution hydro alcoolique, port de gants, port de sur blouses lors des soins. Les échantillons nasaux furent collectés chaque semaine le long de l’hospitalisation hormis les jours de traitement. Le résultat des cultures de SARM fournissait la base d’évaluation de l’efficacité du traitement. Le traitement par mupirocine était considéré efficace quand la culture de l’échantillon nasal prélevé au moins une semaine après le dernier jour de traitement était négative. Si la culture nasale était toujours positive, le cas était alors considéré comme un échec thérapeutique. 41 Si les cultures nasales restaient négatives chaque semaine, le portage nasal était alors considéré comme éradiqué. Dans le cas de cultures nasales positives une ou plusieurs semaines après un premier contrôle négative, le portage était considéré comme une réacquisition. 2) Les trois périodes de l’étude Trois périodes furent considérées dans l’analyse : • Période 1 (Mars 2000 au 30 septembre 2001) : L’éradication du SARM était débutée après deux cultures positives, et les patients exposés aux réaquisitions furent retraités une ou deux fois avec le même protocole et les mêmes critères que mentionnés ultérieurement. • Période 2 (1 octobre 2001 au 30 septembre 2002) • Période 3(1 octobre 2002 au 30 septembre 2004) : A cause du risque des infections à SARM chez les porteurs avant le début de l’éradication, et l’émergence de souches résistantes à la mupirocine, l’éradication du SARM fut débutée dès la première culture nasale positive, et les patients soumis à une réaquisition ne furent pas retraités durant ces deux périodes. Les infections systémiques causées par le SARM durant les 3 périodes furent colligées et analysées. 3) Analyse statistique Les données quantitatives sont exprimées suivant la moyenne +/- la déviation standard et la médiane pour certains paramètres. Les comparaisons des variables quantitatives ont été effectuées à l’aide du test de Student. Les comparaisons entre les 3 groupes ont été effectuées à l’aide d’une analyse de la variance, les comparaisons ultérieures entre 2 groupes ont été réalisées à l’aide du test de Bonferroni Dunn. 42 Les comparaisons de pourcentages ont été effectuées à l’aide du test du Χ2.Une analyse multi variée a été effectuée suivant le modèle de la régression logistique. Le seuil de signification était p<0.05. Les données ont été analysées à l’aide du logiciel Statview 5.0. 43 III Résultats 1) Caractéristiques des patients Les caractéristiques des patients sont montrées dans le tableau 2 : Les malades du groupe PC (pathologies post chirurgicales) étaient les plus âgés alors que ceux du groupe PM (pathologies médicales) étaient les plus jeunes dans les 3 périodes. La durée moyenne du séjour hospitalier était comparable dans les 3 groupes, hormis dans la période 3 avec un séjour hospitalier plus long chez les PC. La prévalence des MCF (patients hospitalisés pour maladies chroniques du foie) décroissait dans les période1, 2, 3 le long de l’étude avec respectivement : 68.1%,64.5%, 60.4%, tandis que la population des malades PC croissait de 7.6%à 10.7% et13.6%, et que la prévalence des malades du groupe PM restait dans la même proportion (24.3, 24.8, et 26%). 2) Prévalence du portage nasal à l’admission et du portage acquis durant l’hospitalisation Les prévalences du portage nasal à l’admission et du portage acquis durant l’hospitalisation sont montrées dans le tableau 3 : Le portage nasal à l’admission aussi bien que le portage nasal acquis étaient plus élevés chez les patients hospitalisés pour maladie du foie (MCF) dans les 3 périodes sauf dans la période 2 pour le portage acquis. Le portage à l’admission dans la population entière tendait à décroître, mais la différence n’a pas atteint un seuil significatif (p=0.08). Le portage acquis décroît aussi bien chez les patients hospitalisés pour maladie du foie (MCF) (p=0.018), que dans l’ensemble de la population (p=0.006). La culture des selles fut réalisée chez 511 patients dans la période 1, 263 patients dans la période 2, et 632 patients dans la période 3. La prévalence du portage de SARM dans les selles décroît de 9.4% dans la période 1 à 4.9% dans la période 2, et 3.3% dans la période 3(p<0.001). 44 La prévalence du portage de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) dans les selles était plus élevée chez les porteurs nasaux de SARM à l’admission et chez les porteurs acquis que chez les patients non porteurs durant l’étude, avec respectivement : 75 vs 15.6%, 92.3 vs 18%, 61.9 vs 13.7% dans les périodes 1, 2, 3 (p<0.0001). La prévalence du portage dans les selles était plus élevée chez les malades ayant réacquis un portage après éradication (39.2 vs 16.3% : p<0.001). La prévalence des patients antérieurement hospitalisés dans un autre hôpital avant l’admission dans notre service était respectivement 92.3, 92.7, et 90.1% dans les périodes 1, 2, et 3. La prévalence des patients porteurs à l’admission tendait à être plus élevée chez les patients qui étaient antérieurement hospitalisés en comparaison avec ceux qui ne l’étaient pas dans les groupe 1 et 2 (respectivement 11.1 vs 8.2% ; et 7.6 vs 5.9%), et était significativement plus élevée dans le groupe 3 (9.2 vs 3.1% ; p=0.0411). 3) Durée moyenne d’hospitalisation Concernant les patients ayant un portage acquis, la durée moyenne d’hospitalisation, et le temps s’écoulant entre l’admission dans notre service et l’acquisition de SARM sont montrés dans le tableau 4 : La durée moyenne d’hospitalisation était plus longue chez les porteurs que chez les non porteurs dans les 3 groupes et pendant les 3 périodes. Le délai entre l’admission et l’acquisition était comparable dans les 3 groupes tout au long de l’étude. 4) Efficacité de l’éradication et prévalence de la réaquisition L’efficacité de l’éradication et la prévalence des réacquisitions sont montrées dans le tableau 5: L’efficacité allait de 96 à 100%. La prévalence des réacquisitions tendait à décroître au cours de l’étude mais la différence n’est pas statistiquement significative. Le délai entre l’éradication et la réacquisition était comparable durant les 3 périodes. 45 5) Caractéristiques des infections à SARM : Les caractéristiques des infections à SARM (Staphylococccus aureus résistant à la méthicilline) sont montrées dans le tableau 6 : 81 épisodes d’infections systémiques à SARM sont apparus chez 69 patients. La prévalence des infections était plus élevée chez les patients hospitalisés pour maladie du foie (MCF) que chez les malades du groupe PC (pathologies post chirurgicales) et les malades du groupe PM (pathologies médicales), avec respectivement 3.8 vs 2.5%, et 1.4% , (p=0.017). Les principaux sites d’infections étaient les voies urinaire (35.8%), l’ascite (32.8%), et les bactériémies (26.9%) chez les malades hospitalisés pour maladie du foie (MCF) ; et les voies urinaires (57.1%) et bactériémies (28.6%) pour les autres malades. Les autres infections répertoriées furent les pneumopathies avec SARM isolés dans les aspirations bronchiques, les infections articulaires, et les pleurésies purulentes. 10 patients ont eu une infection cutanée avec culture positive à SARM. Quand les malades (MCF) étaient comparés aux autres patients, davantage de malades MCF étaient porteurs au moment de l’infection (83.6 vs 42.9% soit p=0.011), et le taux de mortalité était plus élevé chez les malades MCF après infections (66.7 vs 21.4%, soit p=0.017). Concernant les 3 périodes de l’étude, le pourcentage de patients chez qui l’éradication avait été débutée au moment de l’infection était plus bas en période 1 que dans les périodes 2 et 3. Les pourcentages de patients contractant des infections dans les 8 jours, et au-delà de 35 jours après l’admission restaient comparables durant les 3 périodes avec respectivement : 34.1 vs 28.6 vs 26.1%, et 31.8 vs 57.1 vs 30.4%. Tenant compte du taux de portage total (portage à l’admission et portage acquis) durant le séjour hospitalier, le pourcentage des patients contractant une infection était plus élevé chez les porteurs que chez les non porteurs dans les 3 périodes avec respectivement 12.2 vs 1.6%, 11.9 vs 0.3%, 11.7 vs 0.1% pour les périodes 1, 2, et3, (p<0.0001). 46 L’incidence des infections à SARM a décru le long de l’étude ainsi que le montrent le rapport du nombre d’infections/jours d’hospitalisation, ainsi que par le pourcentage des infections dans chaque groupe de patients qui a décru : • de 7% en période 1 à 3.7% en période 2 et à 3.1% en période 3 chez les patients hospitalisés pour MCF (p=0.0062) • de 2.4% à 1.8% puis 1.4% pour les périodes 1, 2, 3 dans les 2 autres groupes • de 5.5% en période 1 à 3% en période 2 et 2.4% en période 3 dans l’ensemble des 3 groupes (p=0.0024). 6) Facteurs associés à la mortalité : Les facteurs associés avec la mortalité sont montrés dans le tableau 7 : Une analyse multi variée a montré que l’âge, les hépatopathies, le portage de SARM (excepté en période 2), et les infections à SARM étaient des facteurs indépendants associés à la mortalité. L’ Odd ratio des infections à SARM avait les valeurs les plus élevées dans les périodes 1 et 2, en comparaison avec les autres facteurs, et décroissait en période 3. La mortalité causée par les infections à SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) décroissait de 0.31% en période 1 à 0.19% en période 2 et 0.13% en période 3 (p=0.035). 7) Résistance à la mupirocine : A l’admission, 3 souches de faibles résistance furent isolées (2 en période 2, et 1 en période 3). Concernant les souches acquises, 3 souches de faible niveau de résistance, et 9 souches de haut niveau de résistances ont été isolées en période 1 ; 2 souches de bas niveau, et 2 souches de haut niveau de résistance ont été isolées en période 2 ; et enfin, 3 souches de haut niveau de résistance ont été isolées en période 3. Toutes les souches de haut niveau de résistance, à l’exception d’un cas, furent isolées après traitement par mupirocine. 47 QUATRIEME PARTIE DISCUSSION 48 I Prévalence du portage La prévalence du portage nasal du SARM observée dans notre étude, à l’admission tout comme le portage acquis, s’avère élevée. En effet, la prévalence du portage nasal à l’admission chez les patients hospitalisés pour MCF (maladies chroniques du foie) était de 12.7%, 10.6%, et 10.7%, respectivement dans les périodes 1, 2, et 3. La prévalence du portage nasal acquis chez les cirrhotiques (MCF) était de 15.8%, 18.7%, et 11.9% respectivement en période 1, 2, et 3. Le portage nasal du SARM à l’admission dans l’ensemble des patients étudiés tendait à décroître le long de l’étude, mais la différence n’a pas atteint de seuil significatif (p=0.08). Par contre, la prévalence du portage acquis décroît aussi bien chez les patients hospitalisés pour cirrhose (MCF) passant de 15.9% en période 1 à 11.9% en période 3 (p=0.018) ; que dans l’ensemble des patients étudiés (p =0.006). Le dépistage du SARM dans les selles ne fut réalisé qu’à l’admission dans notre étude. La prévalence du portage dans les selles décroît le long de l’étude avec respectivement en période 1, 2, et 3 : 9.4%, 4.9%, et 3.3%, soit p<0.001. La prévalence du portage de SARM dans les selles était plus élevée chez les porteurs nasal de SARM à l’admission, ainsi que chez les patients ayant réacquis un portage après éradication ( p<0.001). Conformément à diverses études antérieures, que nous parcourrons brièvement, la prévalence du portage nasal du SARM est élevée chez les malades hospitalisés pour maladie du foie. Une étude réalisée dans le service de rééducation digestive à l’hôpital Albert Chenevier par C. Dupeyron, et al, a observé sur une année, de manière prospective, un total de 484 patients (dont près de 70% était hospitalisé pour maladie chronique du foie). (53). L’étude tenait d’une part à rendre compte de la prévalence du portage nasal du SARM chez les cirrhotiques (portage à l’admission + portage acquis), et d’autre part à évaluer l’efficacité de la mupirocine sur le portage nasal du SARM (les porteurs nasaux étaient soumis à un traitement mupirocine de 5 jours). 117 des patients étaient porteurs de SARM soit un total de 24.2%, parmi lesquels 57(11.8%) étaient porteurs à l’admission, et 60(12.4%) acquirent le portage durant l’hospitalisation. 49 Sur ces 117 patients, 86 furent traités au moyen de la mupirocine avec une efficacité à 98.8%, mais 25.9% de ces derniers devinrent à nouveau colonisés. Chez les patients recolonisés, la souche retrouvée était la même dans 70% des cas. La durée du séjour hospitalier, et le portage dans les selles, étaient indépendamment associés à la ré acquisition du portage nasal du SARM (p=0.0105, et p=0.0462). Cette étude s’accorde avec les précédentes sur l’efficacité à court terme de la mupirocine (54, 55). Concernant la ré acquisition du portage nasal, ces résultats sont en accord avec une autre étude réalisée sur le personnel médical soignant, qui retrouvait une éradication du portage dans 91%, avec une ré acquisition dans 18%(57). Martin et al (57) ont observé une éradication dans 88% chez les patients VIH avec une ré acquisition à 27%, 45%, et 71%, respectivement aux semaines 2, 6, et 10. Le taux de ré acquisition dans l’étude de Dupeyron était plus élevé car les patients séjournaient plus longtemps à l’hôpital après éradication, le nombre de traitement antibiotique était plus élevé, et le taux de portage dans les selles plus important. (53). La réduction du portage nasal n’a malheureusement pas été associée dans cette étude à une diminution des infections à staphylocoques, contrairement aux résultats rapportés dans les unités de dialyse et de chirurgie cardiaque (58, 59). Cette étude s’est d’autre part confrontée aux problèmes de résistance à la mupirocine, convenant par la suite de ne pas retraiter les patients à nouveau recolonisés, en raison d’une part de la fréquence des ré acquisitions rapides, et d’autre part, de la favorisation de résistance à la mupirocine. Une autre étude, à nouveau réalisée à l’hôpital Albert Chenevier à Créteil, évaluait la prévalence du portage nasal, et dans les selles du SARM, ainsi que les conséquences de ce portage sur l’épidémiologie des infections acquises en milieu hospitalier chez ce type de patients. (11). Il s’agissait d’une étude prospective qui incluait les patients cirrhotiques hospitalisés de1996 à 2000. Un total de 748 patients fut inclus dans l’étude. Le dépistage du portage du SARM (fosses nasales, selles), ne fut réalisé qu’à l’admission. 50 125 patients étaient porteurs de SARM à l’admission, soit un total de 16.7%. Sur les 748 patients, 173 étaient traités par antibiotiques pour une période d’au moins 10 jours, et 183 étaient sous norfloxacine comme prophylaxie primaire ou secondaire. Une plus grande proportion des porteurs de SARM avait reçu de la norfloxacine par rapport aux non porteurs (p<0.05). Le pourcentage des péritonites spontanées était plus élevé chez les porteurs, sans atteindre de différence significative. Les bactériémies et les infections urinaires étaient plus fréquentes chez les porteurs de SARM (p<0.01). Les infections à SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) avaient un taux plus élevé chez les porteurs de SARM dans les péritonites spontanées, les bactériémies, et les infections urinaires (p<0.001). Le taux de mortalité était plus élevé chez les porteurs par rapport aux non porteurs (p<0.001). Cette étude a montré que le portage de SARM est un important pourvoyeur d’infections causées par cette souche. On rapportait que les entérobactéries, principalement E.Coli, étaient les principaux agents responsables des péritonites spontanées. Cependant ces données se rapportaient principalement aux infections communautaires acquises. (2). La prévalence des différentes bactéries retrouvées dans les infections des cirrhotiques acquises à l’hôpital n’avait pas été étudiée de manière extensive jusqu’alors. Cette étude a montré des changements dans la nature des bactéries à l’origine des péritonites spontanées. Il est également noté une émergence de souches d’entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération depuis 1993 (7). Dans cette étude, sur un total de 106 PSB, la prévalence de l’ensemble des entérobactéries était seulement de 30.2% avec 20.8% d’E.Coli. Parallèlement, la prévalence des streptocoques, entérocoques, et staphylocoques était respectivement de 24.5, 17, et 19.8%. Les staphylocoques prédominaient dans les bactériémies, avec une grande prévalence de SARM. Aujourd’hui, le SARM est reconnu comme un agent pathogène majeur. Le réservoir écologique du SARM est les fosses nasales, et les études ont montré que les narines étaient le principal site ou le staphylocoque pouvait être isolé (13). Plusieurs facteurs pouvaient expliquer cette importante prévalence du portage, notamment, un séjour hospitalier antérieur prolongé, une cirrhose en phase terminale avec majoration des risques septiques, et un usage répété d’antibiotiques. 51 Dans cette étude, pour des raisons pratiques, le dépistage n’a été réalisé qu’à l’admission. Il est ainsi possible que la prévalence du portage ait pu augmenter durant l’étude, pouvant alors expliquer les 15 cas d’infections à SARM observées chez des patients initialement non porteurs. La norfloxacine réalise la décontamination intestinale sélective chez les cirrhotiques, car elle est incomplètement absorbée par l’intestin, hautement active sur les BGN (bacilles à Gram négatif), et faiblement active sur les bactéries anaérobies (60, 61). Des études antérieures ont déjà montré que l’utilisation à long terme de la norfloxacine entraînait une redistribution de la flore bactérienne des patients, avec l’émergence de souches d’entérobactéries hautement résistantes aux quinolones, et l’apparition de SARM dans les selles (62). Plus récemment, nous avons montré que l’administration à long terme de la norfloxacine chez les cirrhotiques favorise les péritonites spontanées, et les bactériémies à staphylocoques, et risque de majorer le risque de portage du phénotype résistant (12). 52 II Facteurs liés à l’acquisition 1) La durée d’hospitalisation Dans notre étude la prévalence des patients antérieurement hospitalisés dans un autre hôpital avant l’admission dans notre service était respectivement de 92.3, 92.7, et 90.1% dans les périodes 1, 2, et 3. Ceci pourrait en partie expliquer la forte prévalence du portage à l’admission, chez des patients qui pour la plupart, nous étaient adressés de divers hôpitaux dans les suites de complications aigues de la maladie. Par ailleurs, la prévalence des patients porteurs à l’admission dans notre étude tendait à être plus élevée chez les patients qui étaient antérieurement hospitalisés en comparaison avec ceux qui ne l’étaient pas dans les groupes 1, et 2 sans atteindre de différence significative, mais s’avérait significativement plus élevée dans le groupe 3 (p=0.0411). L’acquisition et la ré acquisition du portage nasal du SARM étaient ainsi étroitement liées à la durée d’hospitalisation. Les longs séjours hospitaliers s’accompagnaient d’une majoration certaine du risque de colonisation au SARM. 2) Le portage sur d’autres sites et dans les selles : Bien que les fosses nasales soient le principal réservoir écologique du SARM, le portage sur d’autres sites, notamment les selles, était source de ré acquisition. En effet, malgré une éradication efficace du portage nasal du SARM au moyen de la mupirocine, la présence de staphylocoques sur d’autres sites pérennise la colonisation, et serait alors source de ré acquisition. La prévalence du portage du SARM dans les selles était plus élevée chez les porteurs nasaux de SARM à l’admission ainsi que chez les porteurs acquis par rapport aux non porteurs, avec 75 vs 15.6%, 92.3 vs 18%, et 61.9 vs 13.7% respectivement dans les périodes 1, 2, et 3 (soit, p<0.0001). Enfin, la contamination par des sources extérieures, telles que le personnel médical, les patients résidents, et le matériel médical, serait également la cause de nombreuses ré acquisitions. 53 On ne recommande jamais assez d’insister sur la nécessité de respecter les règles d’hygiène et d’asepsie rigoureuses, et de maintenir des barrières d’isolation avec gants et sur blouses lors des soins prodigués aux patients colonisés à SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). 54 III Effets sur l’incidence des infections à SARM 1) Rôle des infections à SARM dans le pronostic de la cirrhose Le stade avancé de la cirrhose génère chez les patients une plus grande sensibilité au développement des infections systémiques, notamment par un amoindrissement des défenses immunitaires. Comme évoqué dans les paragraphes précédents, la prévalence du portage nasal du SARM est élevée dans la population des cirrhotiques. Ce même portage prédispose aux infections à staphylocoques, retrouvant dans une grande majorité des cas une souche identique à celle isolée dans les fosses nasales. Ces infections à SARM, sont en relation étroite avec la morbidité et le taux d’infection chez ces patients. En effet, comme le relate notre étude, sur l’éventail des 81 épisodes d’infections systémiques objectivées le long des 3 périodes, le nombre d’infections était significativement bien plus élevé, dans chacune des périodes, chez les porteurs (au moment de l’infection) que les non porteurs, avec respectivement en période 1 : 72.7 vs 27.3%, en période 2 : 85.7 vs 14.3%, et en période 3 :78.3 vs 21.7%. Le nombre d’infections systémiques à SARM, dans chacune des 3 périodes, était significativement plus élevé chez les patients hospitalisés pour cirrhose (MCF) comparé aux patients hospitalisés pour PM et PC, avec respectivement en période 1, 2, et 3 :81.8 vs 9.1 vs 9.1%, 78.6 vs 0 vs 21.4%, et 77.3 vs 13.6 vs 9.1%. Enfin, le taux de mortalité dans chacune des 3 périodes de l’étude en rapport avec les infections à SAMR s’avère extrêmement élevé, avec, en période 1, 2, et 3 :56.8, 69.2%, et 56.5% ; révélant bien d’une part la participation du portage nasal dans le développement des infections, et d’autre part, la mortalité associée à ces infections, en particulier chez les malades cirrhotiques (66,7 vs 21,4% p=0,017). 55 2) Diminution de l’incidence des infections Aucune étude menée jusqu’à ce jour chez les cirrhotiques, n’avait permis d’objectiver de manière significative de diminution du nombre d’infections systémiques au moyen de la mupirocine chez les porteurs nasals de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). L’étude réalisée dans notre service de rééducation digestive montre une diminution des infections à SARM au cours des 3 périodes. En effet, on retrouve d’une part une diminution du nombre d’infections par rapport au nombre de journée d’hospitalisation, et d’autre part, une diminution du nombre d’infections dans chacune des pathologies, retrouvant un pourcentage d’infections chez les patients MCF passant de 7, à 3.7, puis 3.1% dans les périodes 1, 2, et 3 ; et de 2.4, à 1.8, puis à 1.4% dans les périodes1, 2, et 3 pour les 2 autres groupes de pathologie. Enfin, dans l’ensemble des 3 groupes de pathologie, on a pu également observer une diminution des infections, passant de 5.5% en période 1, à 3% en période 2, et 2.4% en période 3 (p=0.0024). Enfin, nous montrons également une diminution de la mortalité globale liée aux infections à SARM. 3) Facteurs liés aux infections chez les patients éradiqués Bien qu’ayant montré dans notre étude la nécessité d’éradiquer le portage nasal du staphylocoque doré chez les cirrhotiques, qu’en est il des infections retrouvées chez des patients chez lesquels l’éradication avait été réalisée ? Par ailleurs, l’étude rapporte, respectivement dans les périodes1, 2, et 3 : 12, 2, et 5 épisodes d’infections chez les sujets non porteurs de SARM. Deux principaux facteurs pouvaient expliquer ces infections chez les patients éradiqués : • D’une part, le portage sur d’autres sites que les fosses nasales, maintenant une colonisation endogène, susceptible de développer une infection. • D’autre part, le délai d’action propre de la mupirocine, et le fait d’avoir attendu 2 prélèvements successifs positifs avant de débuter le traitement en première période, ont permis la survenue d’infections avant que la mupirocine ne puisse apporter son effet escompté. 56 4) Données de la littérature Diverses études de la littérature, dans différentes spécialités, rejoignent ou non, les données retrouvées dans notre étude chez les patients cirrhotiques, quant à la réduction significative du taux d’infections systémiques au moyen de la mupirocine. a) Etude de Desai Une première étude réalisée par Desai de 1998 à 2001, tentait de comparer des patients en attente de transplantation hépatique, avec et sans portage nasal de SARM, et de déterminer les conséquences du portage nasal du SARM en période de pré transplantation, sur l’incidence des infections systémiques en post transplantation. (63). 374 patients furent inclus dans cette étude prospective, dans un centre de transplantation hépatique. Les patients étaient dépistés à l’admission pour la colonisation nasale du SARM, puis séparés en 2 groupes : les porteurs (n=157), et les non porteurs (n=217). Les patients dont les résultats montraient des cultures nasales de SARM positives, furent traités par l’application de mupirocine, 3 fois par jour pendant 5 jours, et des bains de chlorexidine. L’incidence des infections systémiques à SARM dans la période suivant la transplantation, était significativement plus élevée dans le groupe porteur que dans le groupe non porteurs, avec 31% vs 9%, soit p=0.002. L’incidence des autres infections n’était pas significativement différente dans les 2 groupes. Le portage nasal était associé à un risque élevé d’infections chez les patients transplantés. Bien que les fosses nasales étaient la principale souche des staphylocoques, d’autres sites avaient pu jouer un rôle, et avaient donc fait l’objet d’un dépistage, à savoir les selles, l’aine, et les creux axillaires. 57 Cette étude soulève l’intérêt du dépistage préopératoire du portage du SARM chez les patients en attende de transplantation hépatique, et propose comme stratégie préventive raisonnable chez les patients porteurs un traitement associant mupirocine et chlorexidine pendant 5 jours. b) Etude de Paterson Une seconde étude, réalisée par l’équipe de Paterson, se confronte à la précédente pour éclaircir les relations entre le portage nasal du SARM et les infections ultérieures, dans un service de transplantation hépatique. (64). L’étude consistait en un dépistage préventif du portage nasal du SARM chez 70 candidats à la transplantation hépatique. La mupirocine était administrée 2 fois par jour pendant 5 jours aux sujets porteurs, et les premiers résultats étaient basés sur le développement d’infections à staphylocoque. 31 des 70 patients (44%) étaient porteurs nasals, et 27 des 31 porteurs ont été décolonisés avec succès. Cependant, 12 des 27 patients décolonisés, devinrent à nouveau colonisés à SARM, avec un supplément de 9 patients initialement non porteurs, qui sont devenus nouvellement colonisés à SARM le long de l’étude. 16 des 70 patients ont développé une infection systémique à staphylocoque doré. 15 des 16 infections étaient dues au SARM, et une souche de SASM (Staphylococccus aureus sensible à la méthicilline) fut également isolée. 7 des 16 infections sont apparues chez des patients qui n’étaient pas colonisés à staphylocoque doré ; et les 9 autres infections sont apparues chez des patients colonisés. Malgré l’utilisation de la mupirocine, 23% des patients ont développé une infection systémique à Staphylocoque doré dans ce service de transplantation hépatique. Malheureusement, ces données sont comparables à d’autres séries précédemment publiées dans ce même service de transplantation hépatique, avant l’utilisation de la mupirocine (65, 66). Dans cette ancienne cohorte de patients hospitalisés pour transplantation hépatique, sous la même équipe chirurgicale, et le même protocole d’immunosuppresseurs, 18 des 114 patients 58 (16%), non traités par la mupirocine, ont développé une infection systémique à staphylocoque doré. Ainsi, au terme de l’étude réalisée par Paterson, la mupirocine n’est pas parvenue à réduire les infections à SARM dans ce service de transplantés. Aucun cas de résistance à la mupirocine n’a été isolé pour expliquer les résultats de l’étude. Ici encore, la colonisation du staphylocoque doré sur d’autres sites corporels pourrait expliquer la non suffisance de l’application locale de mupirocine. La colonisation du staphylocoque est en effet bien documentée pour se manifester au niveau de l’aine, et des sites cutanés, tels que les plaies cutanées et les ulcères chroniques (52). On a par ailleurs montré que l’appareil digestif était un réservoir de staphylocoques, et pouvait représenter un site significatif de colonisation endogène, sources d’infections soudaines au staphylocoque doré (67, 68). Cette étude a donc montré que l’application de mupirocine chez les porteurs n’était pas efficace sur la réduction des infections à SARM chez les transplantés. Cependant, la recherche du portage nasal chez les patients candidats à la greffe n’était effectuée qu’une fois par mois. Des malades pouvaient ainsi devenir porteurs, et développer une infection à SARM avant qu’une éradication puisse être entreprise. c) Etude de Wertheim Une autre étude, différente des précédentes, réalisée par Wertheim de 1999 à 2001, tentait d’évaluer sur une étude prospective, randomisée, double aveugle, placebo vs mupirocine, l’efficacité de cette dernière sur les infections nosocomiales à staphylocoques chez les patients non chirurgicaux. (69). Les résultats de l’étude ne retrouvent pas de différence significative dans les 2 groupes quant au taux des infections nosocomiales (2.6% dans le groupe mupirocine, et 2.8% dans le groupe placebo) ; ni dans le taux de mortalité, et la durée d’hospitalisation (médiane de 8 jours dans les 2 groupes). Le dépistage nasal routinier du SARM, et l’application ultérieure de mupirocine, ne fournissent pas de prophylaxie efficace contre les infections nosocomiales à staphylocoques chez les patients non chirurgicaux. Cependant, l’application de mupirocine retardait le délai 59 d’apparition des infections à SARM, une hospitalisation courte pouvait ainsi masquer le bénéfice de l’éradication. d) Etude de Mody Une autre étude, réalisée par Mody, dans une unité de long séjour pour personnes âgés sur différents hospices (Ann Arbor, Michigan), évaluait la décolonisation du portage nasal du SARM au moyen de la mupirocine, et les éventuelles infections ultérieures. (70). La colonisation du SARM, et les infections à staphylocoques sont fréquentes chez les personnes âgées. La mortalité due à une bactériémie à staphylocoque est plus importante chez les personnes âgés, et supérieure à 60% parmi les résidents d’unité de long séjour (71, 72). Le portage de SARM a été reconnu comme majorant le risque d’infections et de mortalité au sein des patients d’unité de long séjour (73, 74). Il s’agissait d’une étude randomisée, double aveugle, mupirocine vs placebo, où les patients colonisés étaient soumis à traitement mupirocine de 15 jours, avec un suivi sur 6 mois. Les échantillons de dépistage étaient prélevés au niveau des fosses nasales, et de plaies éventuelles. Dans cette étude, la mupirocine s’est révélée très efficace dans l’éradication du portage du SARM, avec 93% des résidents éradiqués dans le groupe mupirocine. La décolonisation persistait jusqu’au 45ème jour de traitement soit j60, et l’efficacité de la mupirocine commençait à diminuer à partir de j90. Dans cette étude, la recolonisation de 12 des 14 résidents retrouvait la même souche que la souche dépistée initialement. La rechute du portage du SARM chez les résidents d’unité de long séjour, était surtout due à la persistance des facteurs de risque qui contribuaient à la colonisation initiale (74, 75, 76), à savoir, une hospitalisation récente, l’usage répété d’antibiotiques dans les 30 jours précédant l’entrée dans l’étude, et la présence de diabète. Une approche pour réduire la recolonisation serait une utilisation intermittente de la mupirocine, 2 fois par semaine, une fois par semaine, puis une fois par mois, utilisée pour 60 maintenir la décolonisation des patients sous hémodialyse (77, 78), sans le développement de résistance. Néanmoins, l’utilisation hebdomadaire de la mupirocine chez les patients colonisés d’unité de long séjour était moins efficace, et s’accompagnait de résistance (79). Près de 20% des participants de l’étude n’ont pas complété les 14 jours de traitement, ce qui a entravé la possibilité de détecter de différence significative dans le taux d’infections entre les 2 groupes. Le nombre d’infections à SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) était par ailleurs trop restreint dans les deux groupes, pour objectiver de différence significative, bien qu’une tendance à la réduction des infections s’observait dans le groupe mupirocine. e) Etude de Perl Enfin, une étude réalisée par Perl, au Massachusetts, comparait sur une étude double aveugle, placebo vs mupirocine, l’efficacité de la mupirocine dans la réduction du taux d’infections post opératoire à staphylocoques au niveau des sites chirurgicaux, et sur l’incidence des infections nosocomiales. (80). Sur 4030 patients hospitalisés pour chirurgie générale, neurologique, ou cardiothoracique, 3864 furent inclus dans l’étude. Le portage était recherché avant l’intervention chirurgicale, et les patients étaient suivis durant un mois. Sur les 891 patients qui étaient colonisés à SARM dans les fosses nasales, 444 ont reçu la mupirocine, et 447 ont reçu le placebo. Parmi les porteurs nasaux de SARM, 4% de ceux qui ont reçu la mupirocine, ont présenté des infections nosocomiales à staphylocoque, comparé au 7.7% de ceux traité par le placebo (p=0.02). Si la mupirocine n’a pas significativement diminué le taux global d’infections post opératoires à staphylocoque doré au niveau des sites chirurgicaux, elle a en revanche diminué le taux d’infections à SARM chez les patients porteurs. Mais la prévalence des infections à SARM était peu élevée, et seulement 47% des infections sont survenues chez les patients porteurs avant l’intervention chirurgicale, suggérant qu’un bon nombre de patients ont acquis secondairement le portage. 61 D’autre part, les résultats de l’électrophorèse sur gel en champs pulsé, suggèrent que quelques patients pourraient avoir été infectés avec une souche transmise par le personnel médical, ou par d’autres patients. Ainsi, dans ce type de pathologie, la mupirocine, sans risque (4 cas de résistance seulement), peut être considérée comme un adjuvant raisonnable pour prévenir de telles infections chez les patients porteurs, en association à l’application de règles d’asepsie rigoureuse. La discordance entre les résultats de ces différentes études et nos propres résultats montre que les conditions dans lesquelles est réalisée l’éradication et l’influence des facteurs liés à l’hospitalisation jouent un grand rôle. En effet, le bénéfice d’une éradication du portage du SARM risque de ne pas être mis en évidence si la population étudiée est à faible risque d’infections sévères à ce germe, ou si la durée d’hospitalisation est trop courte. Par ailleurs, si la recherche du portage n’est réalisée qu’à l’admission des patients, ou si l’intervalle entre deux prélèvements est trop long, l’éradication initialement réalisée perdra son efficacité en raison de l’acquisition du portage durant le séjour hospitalier entre deux prélèvements. 62 IV Effet sur les résistances : Justification des modifications du protocole L’observation des premiers résultats en première période de l’étude, nous a conduit à modifier quelque peu les modalités de dépistage et de traitement. En effet, en première période, la décolonisation au moyen de la mupirocine, ne fut débutée qu’après deux prélèvements successifs positifs, et les patients exposés aux ré acquisitions étaient retraités selon le même schéma thérapeutique. Cependant, les premières données de l’étude, révélaient déjà un taux élevé d’infections systémiques à SARM en première période, avec notamment, 13 cas d’ascite, 15 cas d’infections urinaires, et 15 cas de bactériémies. Ceci nous a alors conduit à traiter les patients colonisés dès la première culture positive dans les périodes 2, et 3. D’autre part, hormis les 3 cas de souche de faible niveau de résistance à la mupirocine, isolées à l’admission (2 en période 2, et 1 en période 3), nous avons assisté à l’apparition de souches de résistance acquise. En effet, 3 souches de faible niveau de résistance, et 9 souches de haut niveau de résistance, ont été isolées en première période, probablement dû au retraitement des ré acquisition, et nous conduisant à ne plus traiter les ré acquisition en période 2, et 3. 63 V Pourquoi ne pas avoir réaliser une étude randomisée ? Bien que la réalisation d’une étude randomisée, double aveugle, placebo vs mupirocine, eusse été plus objective pour démontrer l’efficacité de la mupirocine sur la réduction des infections systémiques à staphylocoques dorés chez les patients cirrhotiques, notre choix s’est porté sur une étude ne comportant pas de groupe contrôle, pour différentes raisons : D’une part, la réalisation des 2 groupes, placebo et mupirocine, aurait posé le problème d’une nouvelle source de contamination, à savoir le groupe placebo, véritable réservoir de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline), favorisant la transmission du germe aux patients non porteurs. Il est en effet impossible d’isoler les patients porteurs pour des raisons organisationnelles. La conséquence pourrait en être l’absence de diminution de l’acquisition du portage, qui est probablement le premier facteur responsable de la diminution de la prévalence des infections. D’autre part, la réalisation d’une étude randomisée demande également plusieurs exigences, notamment quant à l’homogénéité et la stratification des 2 groupes de patients, et aurait donc posé un grand problème de faisabilité, car la prévalence du portage nasal du SARM est bien plus élevée chez les cirrhotique, qu’elle ne l’est dans les autres groupes de patients. Enfin, l’effet temps joue probablement un rôle dans la mise en évidence de l’efficacité de l’éradication, car la diminution de la prévalence des infections est progressive et consécutive à la diminution du portage global dans le service. Une étude randomisée, limitée dans le temps, risque de conclure par excès à l’absence d’effet positif du traitement éradicateur devant une différence de résultats insuffisante entre les groupes ayant reçu le traitement et le placebo. 64 CONCLUSION 65 Notre étude a montré que l’éradication du portage de SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) au moyen de la mupirocine diminue la prévalence des infections à SARM dans une population de malades cirrhotiques, caractérisée par une prévalence élevée de portage. Ce résultat parait important en raison du rôle pronostique très défavorable que jouent ces infections chez ces malades. Il impose d’autre part une recherche hebdomadaire du portage afin d’éradiquer le portage acquis, dont la diminution semble le facteur essentiel dans la diminution du risque infectieux. Le risque d’émergence de souches résistantes à la mupirocine peut être contrôlé si les patients ne sont traités qu’une seule fois. Ce risque de résistance est d’autant plus menaçant qu’il fait de la mupirocine une utilisation et une prescription exclusivement hospitalières. Enfin, cette pratique doit être complémentaire des mesures générales d’hygiène, en particulier, celles concernant le lavage des mains des soignants, visant à diminuer la transmission manu portée du SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). 66 BIBLIOGRAPHIE 67 1) Caly WR, Strauss E. A prospective study of bacterial infections in patients with cirrhosis. J Hepatol 1993; 18: 353-8 2) Rimola A, Garcia-Tsao G, Navasa M, Piddock LJV, Planas R, Bernard B, et al. Diagnosis, treatment and prophylaxis of spontaneous bacterial peritonitis: a consensus document. J Hepatol 2000; 32: 142-53 3) Cadranel JF, Denis J, Pawels A, Barbare JC, Eugene C, Di Martino V, et al. Prevalenceand risk factors of bacteriuria in cirrhotic patients :a prospective casecontrol multicenter study in 244 patients. 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Portage nasal acquis n (%) Portage nasal à l’admission n (%) Causes d’hospitalisation Période 1 Période 2 Période 3 Période 1 Période 2 Période 3 p MCF 69 (12.7) 32 (10.6) 63 (10.7) 86 (15.8) 55 (18.7) 70 (11.9) 0.018 PM 12 (6.2) 2 (1.7) 8 (3.2) 17 (8.8) 13 (11.4) 14 (5.6) PC 6 (9.8) 1 (2) 13 (9.8) 11 (18) 6 (12) 14 (10.5) p 0.0437 0.0025 0.0015 0.0390 0.1387 0.0317 Ensemble des patients 87 (10.9) 35 (7.5) 84 (8.6) 114 (14.3) 74 (16.2) 99 (10.2) MCF : Maladie chronique du foie PM : Pathologies médicales non hépatiques PC : Post chirurgical 0.006 79 TABLEAU 4 : Durée du séjour d’hospitalisation et délai entre l’admission et l’acquisition chez les patients ayant présenté un portage acquis du SARM. Durée d’hospitalisation Causes d’hospitalisation MCF PM PC Patients porteurs nasaux n Moyenne Médiane n Moyenne Médiane n Période 1 86 a 60.1 ± 64.8 36 17 d 79.2 ± 95 52 11 Période 2 55 b 65.3 ± 48.4 51 13 e 77.5 ± 79.2 56 6 Moyenne 53 ± 30.5 93.2 ± 103.1 Médiane n 53 114 52 74 Ensemble des Moyenne patients Médiane f j g Patients non porteurs Période 3 70 c 62.6 ± 55.5 42.5 15 k 53.5 ± 35 35 14 Période 1 459 a 34.8 ± 30.6 28 177 d 33.8 ± 25.9 28 50 Période 2 239 b 33.6 ± 28.1 27 101 e 33 ± 27.7 22 44 73.6 ± 47.8 40.1 ± 30.7 33 ± 24.5 69.5 99 31.5 686 28 384 i h f j g 62.3 ± 67.7 69.5 ± 59.1 62.8 ± 51.8 35 ± 29.5 32.5 ± 27.6 37 52 43 28.5 26 MCF ; Maladie chronique du foie PM ; Pathologies médicales non hépatiques PC ; Post chirurgical SARM : Staphylococcus aureus methicilinorésistant Les comparaisons sont réalisées à l’aide du test de Student. a → h : p < 10 -4 ; i : p < 10 -3 ; j : p < 10 -2 ; k : p < 0.05 Période 3 519 c 34.6 ± 23 29 238 k 34.6 ± 33.3 28 119 i 41.4 ± 29 .9 35 876 h 35.5 ± 27.2 29 Délai entre l’admission et l’acquisition Période 1 86 30 ± 44.4 21 17 30.8 ± 42 15 11 Période 2 55 27.6 ± 25.8 15 13 31.6 ± 29.5 24 6 Période 3 70 34.1 ± 38.6 21.5 15 14.3 ± 6 15 14 29.7 ± 19.6 15.8 ± 19.1 36.4 ± 32.2 28 115 11.5 74 27 99 30.1 ± 42.1 27.4 ± 25.8 31.4 ± 35.5 21 21.5 18 80 TABLEAU 5: Efficacité de l’éradication et de la ré acquisition selon les catégories cliniques dans les trois périodes de l’étude. Causes d’hospitalisation Efficacité de l’éradication n (%) Période 1 Période 2 Période 3 Ré acquisition n (%) Période 1 Période 2 Période 3 MCF 97 (99) 66 (97) 122 (98.4) 28 (28.9) 11 (16.9) 25 (20.5) PM 20 (100) 13 (100) 22 (100) 5 (20) 2 (15.4) 4 (19) PC 11 (100) 5 (100) 24 (96) 2 (18.2) 3 (60) 2 (8.3) Ensemble des patients 128 (99.2) 84 (97.7) 168 (98.3) 35 (27.3) 16 (19.2) 31 (18.6) MCF : Maladies chroniques du foie PM : Pathologies médicales non hépatiques PC : Post chirurgical Nombre de jours entre l’éradication et la ré acquisition Période 1 Période 2 Période 3 n 28 11 25 Moyenne 27.4 ± 17.5 25.8 ± 12.2 36.2 ± 20.2 Médiane 21.5 27 35.0 n 5 2 4 Moyenne 61.0 ± 48.1 30.5 ± 5.0 36.0 ± 6.6 Médiane 55 30.5 35.0 n 2 3 2 Moyenne 24.5 ± 24.8 120.0 ± 91.8 40.5 ± 29.0 Médiane 24.5 173 40.5 n 35 16 31 Moyenne 32.0 ± 26 44.1 ± 51.4 36.5 ± 19.3 Médiane 22.0 27.0 35.0 81 TABLEAUX 6 : Caractéristiques des infections à SARM. Nature des infections Périodes Ascites Infections Bactériémies urinaires Motif des hospitalisations Autres MCF n (%) PM PC Porteur au moment de l’infection n (%) n (%) 1 13 (29.5) 15 (34.1) 15 (34.1) 1 (2.3) 27 (81.8) 3 (9.1) 3 (9.1) 32 (72.7) 12 (27.3) 2 5 (35.7) 6 (42.9) 2 (14.3) 1 (7.1) 11 (78.6) 0 (0) 3 (21.4) 12 (85.7) 2 (14.3) 3 5 (21.7) 11 (47.8) 6 (21.6) 1 (4.3) 17 (77.3) 3 (13.6) 2 (9.1) 18 (78.3) 5 (21.7) Délai entre l’admission et les infections Moyenne Médiane Délai entre premier prélèvement nasal positif et l’infection Moyenne Médiane Délai entre le dernier prélèvement nasal positif et l’infection Moyenne Nombre d’infections Efficacité de Eradication l’éradication (n/nombre total n (%) de jours n (%) Médiane d’hospitalisation %o) Période avant éradication 2 3 40.4 ± 57.1 p Taux de mortalité n (%) 24 (1.41) 29.6 ± 31.4 41.1 ± 33.7 1 Non porteur 41.5 19.5 ± 22.2 30.5 ±30.3 27 13.0 ± 20.8 18.6 ± 22.5 14 36.4 ± 61.4 8 6.3 ± 10.1 15 9 2.5 2 11 (30.6) 7 (70) 44 (1.40) 25 (56.8) 6 8 (66.7) 6 (75) 14 (0.74) 9 (69.2) 13 (72.2) 11 (84.6) 23 (0.59) 13 (56.5) 0.0059 MCF : Maladies chroniques du foie ; PM : Pathologies médicales non hépatiques ; PC : Post chirurgical 0.0022 82 TABLEAUX 7 : A : Facteurs associés avec la mortalité en analyse uni variée : Age Périodes Survivants Décédés 1 2 3 53.5 ± 11.4 54.1 ± 11.4 55.3 ± 12.5 58.2 ± 11.6 59.9 ± 10.7 64.1 ± 12 SARM Pourcentage de mortalité Portage (%) Survivants Décédés Survivants Infections (%) Décédés -4 2.1 19.4 < 10 -4 38.5 0.0062 1.2 17.3 < 10 -4 37.1 < 10 -4 1.2 9.7 < 10 -4 p MCF PM PC p 0.0002 15.8 3.1 1.6 < 10 -4 20.7 46.2 < 10 0.0005 15.6 4.3 0 < 10 -4 21.4 -4 18.8 3.7 3 < 10 -4 15.6 < 10 P p B : Facteurs associés avec la mortalité en analyse multi variée : Age Périodes OR 1 1.030 2 1.052 3 1.070 IC 95 1.0071.052 1.0211.083 1.0521.089 SARM MCF p OR 0.0092 5.770 0.0011 5.728 -4 9.066 < 10 IC 95 2.59212.849 2.13215.394 4.77717.204 p < 10 -4 0.0005 < 10 Portage nasal IC 95 P 1.3162.151 0.0022 3.516 0.4520.9953 0.8997 2.009 1.3192.119 0.0019 3.404 OR -4 MCF ; Maladies chroniques du foie ; PM : Pathologies médicales non hépatiques ; PC : Post chirurgica Infections IC 95 p 6.675 2.983-14.936 < 10 -4 15.737 4.216-58.742 < 10 -4 4.335 1.569-11.981 0.0047 OR 83 Prévalence des infections chez les porteurs et non-porteurs ISA % 30 Bactériémies IU * * 25 20 * # 15 # 10 5 0 Porteurs SAMR Non-porteurs Figure 1 # p < 0,01 84 Risques d’infections à SAMR chez les porteurs et non-porteurs ISA % Bactériémie IU Total + 35 + 30 ° 25 20 * 15 10 p < 0,001 # * # ° 5 * # ° 0 Porteurs SAMR Non-porteurs Figure 2 + 85 RESUME 86 Synthèse La cirrhose du foie génère chez les patients atteints de la maladie une immunodépression certaine, qui fait des infections bactériennes, les complications les plus fréquentes et les plus sévères de la maladie. Nous avons assisté ces dernières années à de profondes modifications de l’écologie bactériennes de ces infections, avec une augmentation de la prévalence des germes à GRAM+, du risque d’infections nosocomiales à des germes de plus en plus résistants, notamment le Staphylocoque aureus résistant à la méthicilline. L’augmentation de l’incidence des infections dues à ce germe est liée à un portage nasal observé chez environ 16% des malades hospitalisés. L’utilisation de la mupirocine, en application nasale biquotidienne durant 5 jours représente une stratégie nouvelle et efficace dans l’éradication du portage nasal du SAMR (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). Notre étude, réalisée sur une cohorte de 2242 patients, pour la plupart des patients cirrhotiques, a montré que l’éradication du portage nasal du SAMR au moyen de la mupirocine diminue la prévalence des infections à SAMR, réduisant ainsi la mortalité dans ce groupe de patients. Enfin, la mupirocine apparaît comme un traitement adjuvant à bien d’autres mesures générales d’hygiène, notamment le lavage des mains du personnel soignant, et le port de sur blouses, visant à diminuer la transmission manu portée du SAMR (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline). Mots clés : Cirrhose, Infection, Staphylococcus auréus ADRESSE DE L’UFR 8, rue du général SARRAIL 94010 CRETEIL CEDEX