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Les aspects environnementaux
de la résistance aux
antimicrobiens d’origine
communautaire
Tom Edge, Ph.D.
Recherche sur la protection des écosystèmes aquatiques
Direction de la science et de la technologie de l’eau
Institut national de recherche sur les eaux
Environnement Canada
Burlington (Ontario)
Consultation sur la RAMoc, Winnipeg (Manitoba)
Le 10 février 2010
Aperçu de l’exposé
•
•
•
•
•
les considérations environnementales de la RAMoc
les antimicrobiens
les bactéries résistantes aux antimicrobiens (RAM)
les gènes des bactéries résistantes aux
antimicrobiens (RAM)
les points de discussion
Des considérations
environnementales sur la RAM
• Santé humaine, santé animale + problème écologique
• Hôpitaux, fermes ne sont pas des systèmes clos
• Collectivité (êtres humains et animaux) → rejets dans
l’environnement
• Environnement → collectivité (êtres humains et animaux) exposition
• Résistome environnemental – réservoir de la résistance aux
antimicrobiens ayant des retombées possibles sur l’émergence de
la résistance chez les agents pathogènes importants sur le plan
clinique
• Composante écologique de la bonne intendance des antimicrobiens
Antimicrobiens → Environnement
• Généralisés dans les effluents
des eaux usées des services
municipaux et des déchets
d’élevage
• Conc. habituelle : <µg/L
• Effets des sous inhibiteurs sur
les colonies microbiennes des
écosystèmes
• Métabolite de l’antiviral Tamiflu
dans les effluents des eaux
usées → exposition à la
sauvagine?
–
Ghosh et autres, 2010. Env. Health
Persp. 118: 103-107
Bactéries RAM → Environnement
• Bactéries RAM sont rejetées dans les effluents des installations
d’assainissement et dans les déchets d’élevage.
• Installations d’assainissement (IA)
– > 4000 IA à l’échelle du Canada – des « bordels » bactériens
– Augmentation élective de la RAM au moyen de l’assainissement des eaux?
▪ Zhang et autres, 2009. Sci. Total Env. 407: 3702-3706
% d'ampicilline résistante
>32ug/ml
E. coli de sources polluantes fécales de la région de Toronto-Hamilton
25
20
15
10
5
0
Bernache du
Canada
n=1672
Mouette
n=1212
Canard
n=911
Cygne n=206Pigeon n=27 Cormoran
n=158
Oiseaux
Chien
n=522
Chat
n=507
Animaux de compagnie
Eaux
Boues des
d’égouts
marinas
municipaux
n=103
n=2153
Eaux usées
Bactéries RAM → Environnement
• La résistance aux antimicrobiens peut être utile dans le
– Edge et Hill, 2007. Water Res. 41:3585-3594.
E. coli Antibiotic Resistance Analysis
60
50
Lake Ontario
HUM2
Toronto
HUM1
Humber
River
B
C
A
1 km
1 mi
40
Wastew ater
30
Birds
20
Unknow n
10
HUM0
N
% fecal source
•
pistage des sources microbiennes de la pollution fécale.
~ 30 000 isolats de E. coli des plages du lac Ontario,
des effluents des installations d’assainissement, du
crottin des animaux de compagnie et de la sauvagine
Sunnyside
Beach
0
Hum2 n=170
Hum1 n=211
Humber River
Hum0 n=154
Transect B
n=1278
Transect C
n=741
Sunnyside Beach
Environnement → Bactétries RAM
• Bactéries RAM des écosystèmes aquatiques et des sources d’eau
potable, et des sources d’eau à des fins récréatives et de la
production alimentaire
• Bactéries RAM dans l’eau de puit, d’irrigation et des mollusques et
des crustacés
• Signifiance du résistome du sol et des réservoirs telluriques?
D’Costa et autres, 2006. Science 311: 374-377.
% d'ampicilline résistante >32ug/ml
–
E. coli des écosystèmes aquatiques de la région de Toronto-Hamilton
25
20
15
10
5
0
Port de Le long de Pier4 n=262 Burlington Sunnyside Centre Is.
Hamilton
la baie
n=334
n=6440
n=1900
n=403
n=4133
Port
Plages
Kew
n=2645
Bluffers
n=3619
Rouge
n=3263
Rivière
Rouge
n=420
Rivière Black Creek
Humber
n=275
n=362
Rivières
Gènes résistants aux antimicrobiens
• Plasmides de gènes résistants
à de multiples antimicrobiens
• Sort des gènes RAM dans les
écosystèmes aquatiques
• Gènes RAM dans les réseaux
de distribution d’eau potable
• Augmentation croissante de la
présence de gènes RAM dans
le sol
–
Knapp et autres, 2010. Env. Sci.
Technol. 44: 580-587.
• Gènes RAM des contaminants
en émergence?
Points de discussion
• Rejets d’antimicrobiens généralisés et continus dans l’environnement, de
•
•
bactéries résistantes aux antimicrobiens et de gènes résistants aux
antimicrobiens
Possibilité de l’émergence et de la transmission généralisées d’agents
pathogènes zoonotiques, de bactéries RAM et de gènes RAM là où les
écosystèmes humains et animaux se croisent → RAMoc
Des questions de recherche et de surveillance
–
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La compréhension du résistome et des réservoirs telluriques de la RAM
L’initiation de la RAM et sa prévalence dans l’environnement - signifiance et tendances
La signifiance relative de l’exposition environnementale
Les retombées de la RAM sur la gestion des eaux usées et des déchets d’élevage
Des sites sentinelles de contrôle de l’augmentation et de la transmission de la RAM
Les effets des antimicrobiens sur les colonisations et les écosystèmes de microbiens
La considération de gènes RAM à titre de contaminants