Dynamique moléculaire - Réseau Français de Chimie Théorique

Dynamique moléculaire
Dynamique moléculaire
Pascal Boulet
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Réseau français de chimie théorique

Dynamique moléculaire
Outline
Introduction
Objectifs – méthode
Historique
Principe de la dynamique moléculaire
Séquence de mise en pratique
Comment obtenir le potentiel ?
Les formalismes
Formalisme de Newton
Formalisme de Lagrange
Formalisme de Hamilton
Les algorithmes de propagation
Le propagateur de Verlet
Le propagateur Velocity-Verlet
Les dynamiques moléculaires ab initio
Dynamique de Ehrenfest
Dynamique Born-Oppenheimer
Dynamique moléculaire Car-Parrinello

Dynamique moléculaire
Introduction
Objectifs – méthode
Objectifs et méthode
1. Calculer des moyennes statistiques d’un système à l’équilibre
2. Idem Monte Carlo
3. Principe ergodique :
hA(r(t),p(t))itime =hA(r,p)iensemble (1)
4. Echantillonner l’espace des phases
5. Technique “temporelle" d’échantillonnage plutôt qu’aléatoire comme en
MC
6. Evolution dans le temps du système

Dynamique moléculaire
Introduction
Historique
Nick Metropolis et Jim Richardson

Dynamique moléculaire
Introduction
Historique
ISimulations
IPremière simulation sur le calculateur Mathematical And Numerical
Integrator And Computer, Los Alamos, 1952