UE SECC14 Intitulé : Ecosystèmes Littoraux Responsable : Katherine Costil Résumé : Le module « Ecosystèmes Littoraux » a pour objectif d’acquérir des connaissances sur la caractérisation et le fonctionnement des écosystèmes littoraux terrestres et marins. Objectifs, contenu et organisation : Cours Magistraux (30 h) Les cours magistraux visent à présenter les environnements littoraux au sens large, depuis la bande terrestre côtière jusqu’au domaine subtidal. Ils apportent des connaissances fondamentales sur la biodiversité, les processus d’adaptation des organismes à leur environnement (potentiellement fluctuant), les répartitions spatio-temporelles ainsi que la structure et le fonctionnement des peuplements. Les organismes considérés correspondent aux halophytes, aux algues et aux faunes pélagique et benthique. Travaux Dirigés (20h) Les TD ont pour objectif : 1) d’illustrer les éléments abordés lors des cours magistraux par des exemples concrets, 2) d’apporter des connaissances sur les caractéristiques physico-chimiques des milieux marins (utiles pour comprendre l’organisation et le fonctionnement des peuplements floristique et faunistique) et 3) d’aborder des notions de gestion environnementale et d’applications de la recherche pour l’industrie et l’aquaculture. Les TD sont organisés en 10 séances de 2 heures : Méthodologie (instrumentation) et caractéristiques des milieux côtiers (2 séances) Planctonologie animale Ecophases et cycles biologiques Halieutique et gestion de la bande côtière Production des milieux estuariens Protection des dunes Introduction d’espèces algales Algocultures (2 séances) UE AQUA10 Intitulé : Endocrinologie évolutive et comparée Responsable : Pascal Favrel Résumé : - Mécanismes de régulations chez les modèles animaux invertébrés et vertébrés - Aspects phylogénétiques et comparés - Applications à l’agronomie et l’aquaculture Objectifs, contenu et organisation (50h) : Cours Magistraux (30 h) : - Apports de la génomique, de la protéomique et des outils de la génomique fonctionnelle à l’endocrinologie. - Diversité des neuropeptides et des (neuro) hormones : aspects évolutifs. - Diversité des récepteurs, couples récepteurs - ligands, coévolution. - Endocrinologie comparée de la reproduction (modèles vertébrés, insectes, crustacés, mollusques) - Aspects comparatifs et phylogénétiques de la régulation endocrine de la croissance : Chez les vertébrés à travers l’étude de la structure et de l’évolution des hormones de la famille des somatotropines et des IGF, de l’étude de leur récepteurs et des modalités de transduction du signal, l’évolution des activités biologiques et des facteurs de régulation. Chez les invertébrés : Identification, structure et rôles des peptides de la superfamille des insulines : les modèles d’étude : Mollusques (Limnée), Insectes (Bombyx et Drosophile) nématodes (Caenorhabditis elegans). Panorama des phéromones d’invertébrés aquatiques : identification, structure et fonction. Travaux Dirigés (20 h) : - Techniques de séparation : HPLC 1D et 2D / SDS-PAGE 1 et 2D / électro-focalisation préparative. - Séquençage de peptides (Edman et SM). - Analyse in silico de données transcriptomiques et peptidomiques-protéomiques, analyse de précurseurs protéiques. - PCR : principe et utilisation dans le cadre d’approches peptidomiques-protéomiques . - PCR quantitative en temps réelle - Étude et présentation de publications UE SECC13 Intitulé : Ecosystèmes et Environnements littoraux : étude de terrain Responsable : Philippe Laîné Résumé: Etude pratique des milieux littoraux: peuplements et écosystèmes, biologie et écophysiologie des organismes. Mots clés : distribution spatiale, diversité, végétation du littoral, phycologie, zoologie Objectifs, contenu et organisation (55h TP - Excursions / 5h TD) : Objectif: Acquérir les connaissances relatives aux structures et au fonctionnement des milieux littoraux. Descriptif: Les étudiants feront 5 sorties sur le terrain (2 sorties en enseignement commun et 3 sorties dans l’option choisie). Elles seront précédées d’une préparation et suivies d’une exploitation du matériel et des données collectées. Programme des options : Les étudiants devront obligatoirement suivre un enseignement commun leur permettant d’acquérir des connaissances générales sur les peuplements et les écosystèmes littoraux puis choisir l’une de trois options proposées : -Ecophysiologie végétale: aspect physiologiques de l’halophilie et de la résistance au sel des plantes du littoral; utilisation et protection des milieux saumâtres et dunaires; étude de la végétation des vases salées, des falaises, des dunes calcaires et siliceuses; caractéristiques morphologiques, cytologiques, physiologiques des végétaux rencontrés dans ces biotopes. - Phycologie: biodiversité des algues marines, cytologie, morphologie, écologie, sexualité et reproduction; généralités sur l’écologie; étude de la zonation du phytobenthos sur les côtes rocheuses; intérêts des algues marines et leurs applications; étude qualitative du phytoplancton littoral. - Zoologie: systématique et diversité des invertébrés benthiques; diversité des invertébrés des estrans meubles et rocheux; éléments de systématique et d’écologie de l’ichtyofaune; répartition spatiale des organismes (cartographie et introduction à l’analyse spatiale des populations). UE SECC15 Intitulé : Facteurs du milieu et adaptations Responsable : Jean-Marc LEBEL Résumé : Cette unité d’enseignement est centrée sur l’analyse de l’incidence des facteurs du milieu (facteurs abiotiques) sur la physiologie et les adaptations des organismes végétaux et animaux) Cours magistraux : 30 heures E Organismes végétaux - Effets des facteurs du milieu sur la végétation – Adaptations : Lumière et végétation, Température et végétation, Facteur hydrique et végétation (milieu aquatique et milieu sec), Hypoxie et végétation E Organismes animaux - Effets des facteurs du milieu sur les espèces animales – Adaptations : Température et métabolisme, ectothermie, endothermie, cas de la résistance au gel ; lumière et cycles biologiques ; facteurs hydriques (milieu désertique et économie de l’eau) ; facteurs du milieu et métamorphose des amphibiens. Travaux dirigés : 20 heures - Formation des sols (pédogenèse), les relations plante-sol, les plantes calcicoles et calcifuges, la photosynthèse en C4 et CAM, les facteurs climatiques et la répartition des espèces végétales - Facteurs du milieu et : 1- développement larvaire, 2- physiologie d’un organisme de type aquatique (adaptation des organismes marins à l’émersion ; la vie animale en milieu extrême. E Contrôle des connaissances : contrôle terminal écrit pour les CM, et contrôle continu pour les TD