A.Michot – F.Chibon

publicité
A.Michot – F.Chibon ! 
Morphologie variable Fletcher J.,WHO 2013 ! 
Complexité génomique Génétique simple Génétique complexe : remaniements+++ Chibon F.,Oncologie 2007 ! 
Enjeu chirurgical : Marges carcinologiques (R0++ >R1 >R2) Stoeckle E.,EJSO 2006 pour éviter la rechute locale ≈ 10 % Préservation de la fonction Limb sparing , Conference CONSENSUS, JAMA ! 
1985 Le seul facteur prédictif modifiable de la rechute locale c est la chirurgie large = marges d exérèse saines ! 
Comparaison de profil expression tissu fixé et congelé hépatique (tumeur et cicatriciel sain) " Signature tissu péri tumoral sain = récidive tardive Hoshida Y et al. NEJM . 2008 Comparaison transcriptomique tissu tumoral, péri tumoral et sain à distance dans les CCR : ! 
" Métabolisme, MEC, Homéostasie cellulaire Wu et al. Plos one. 2012 ! 
Présence de gènes de la Tumeur au niveau péritumoral sain: " Interaction et recrutement de cellules modifiées ? Présence de cellules dormantes? Mangiola et al. Plos one. 2013 ! Pourquoi analyser le tissu péri tumoral ? lieu de la récidive " Corrélé à la rechute locale et à la survie Potter et al. JBJS Am. 2013 ! Comparer le profil moléculaire de trois zones : TS, R1, T ! Trouver une différence entre deux zones de tissu sain : R1 et TS ! Rechercher une hétérogénéité au sein du groupe de R1 afin de définir deux groupes ! Identification d une population à risque de récidive Tumeur
R1
Sain
Anatomopathologie : 3 prélèvements par pièce Zone tumorale stricte / Stroma sain R1 / Stroma sain à distance Prélèvement miroir pour contrôle ! 
! 
! 
! 
! 
! 
! 
! 
! 
! 
20 patients = 60 échantillons congelés (ADN et ARN – CGH et puces d’expression) Age : 60 ans Taille tumorale : 80mm Atteinte des membres Histologie : 5LMS, 4 MFS, 7 UPS, 4 autres 12 chimiothérapie néoadjuvante 9 tumeurs infiltrantes / 11 bien limitées 15 Sous aponévrotiques et 18 unifocales 4 métastatiques pulmonaires (2 décès) Pas de rechute locale T
Tumeurs : Profils remaniés sauf 1 cas
R1
R1 : Profils plats sauf 1 cas
TS
TS : Profils plats
Métabolisme oxydatif
Système musculaire
Réponse aux stimuli
Tissu sain
R1
Tumeur
Réponse immune
Cycle cellulaire
Organisation de la MEC
Réponse au stress
Organisation de la MEC
Système immune
Réponse aux stimuli
Mobilité – Migration – Adhésion
Tissu sain
R1
Système musculaire
Métabolisme oxydatif
Résultats Expression différentielle Classification par Clustering de tous les
échantillons (sur toutes les sondes de la
puce) " Réassignation par groupes
TS
R1-TS
R1-T
T
Résultats Clustering 1387 gènes DOWN dans le R1-­‐TS 3101 gènes DOWN dans le R1-­‐T 3291 gènes DOWN dans la Tumeur 2502 gènes UP dans le R1-­‐TS 4130 gènes UP dans le R1-­‐T 4116 gènes UP dans la T Par rapport au Tissu Sain
!  Métabolisme oxydatif
!  Système musculaire
!  Réponse immunitaire
!  Organisation de la MEC
!  Adhésion / Migration / Mobilité
Résultats Clustering 4116 gènes DOWN TS 1551 gènes DOWN R1-­‐TS 1176 gènes DOWN R1-­‐T 3291 gènes UP TS 1730 gènes UP R1-­‐TS 1329 gènes UP R1-­‐T Par rapport à la Tumeur
!  Cycle cellulaire et Mitose
!  Réponse immunitaire
!  Organisation de la MEC
!  Métabolisme oxydatif
!  Système musculaire
Résultats Clustering 1073 gènes DOWN dans le R1-­‐TS 1376 gènes UP dans le R1-­‐TS Entre les 2 R1
! Synthèse et métabolisme des Lipides et
Stéroïdes
! Réponse inflammatoire
! Différenciation musculaire
! Métabolisme oxydatif
Gènes différents Clustering Heat Map 71 gènes R1-T
R1-TS
Exemple de gène différentiellement exprimé LDHD : lactate deshydrogenase D (catalyse la conversion du pyruvate en lactate) Métabolisme oxydatif ! 
Profils plats du tissu péritumoral R1 et tissu sain TS ! 
Profils remaniés des prélèvements tumoraux T ! 
Identification d un différentiel d expression dans le tissu p é r i t u m o r a l R 1 n o n i d e n t i fi a b l e p a r l e x a m e n anatomopathologique ! 
R1 +
−
métabolisme oxydatif Warburg, Science 1956 différenciation musculaire réponse immunitaire organisation de la MEC réponse aux stimuli mobilité / migration / adhésion Identification de deux groupes de R1 différents en fonction de leur profil transcriptomique ! 
! 
R1 proche de la T − différenciation musculaire métabolisme oxydatif + synthèse de lipides et de stéroïdes
réponse inflammatoire Valider la liste de gènes différentiellement exprimés dans le R1 !  Rechercher leur présence par IHC sur les 60 échantillons (et si positif, sur série rétrospective de sarcomes ) !  Rechercher une corrélation entre un groupe de R1 et la rechute locale !  Poursuivre l inclusion de pièces !  Ouvrir l étude aux autres centres ! 
! 
! 
Compréhension du tissu péritumoral : Enjeu majeur pour le chirurgien et le patient Proposer une modification de la prise en charge et du suivi à un groupe en particulier (chirurgie reconstructrice) " vers une étude multicentrique à la recherche d’une SIGNATURE GENETIQUE du tissu péritumoral à risque de récidive 
Téléchargement