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Caractérisation moléculaire de souches d’ E. coli aviaires productrices de BLSE,
isolées de la région Centre d’Algérie
Nacima Meguenni1, Laetitia Le Devendec2, Eric Jouy2, Saliha Bounar-Kechih3, Rabah
Bakour 4et Isabelle Kempf2.
1
Département de Biochimie Microbiologie. Faculté des Sciences biologiques et Agronomiques.
Université Mouloud Mammeri. Tizi Ouzou. Algérie. 2 ANSES - Laboratoire de Ploufragan- Plouzané Unité
mycoplasmologie bactériologie. 3 Laboratoire vétérinaire régionale de Draa Ben Khedda. Wilaya de Tizi Ouzou.
Algériev .4 Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire, Faculté des Sciences Biologiques, Université des
Sciences et de la Technologie Houari Boumediene, Bab-Ezzouar, Alger, Algérie.
Introduction
En Algérie, les caractéristiques d’antibioréisitance en général et des BLSE en
particulier des souches animales ont, jusqu’à présent, très peu été décrites.
11 souches d’E.coli responsables de lésions de colibacilloses aviaires isolées dans
différents élevages de la région Centre Algérien et au cours de différentes années ont fait
l’objet d’une caractérisation de leur antibiorésistance.
Matériel et méthodes
Les Antibiogrammes ont été réalisés selon la norme NF U47-107 et les interprétations selon
les recommandations du CA-SFM.
La Détermination des profils plasmidiques (extraction plasmidique par le protocole de
Takahashi et al. (2005). L’électrophorèse en champ pulsé (PFGE ou pulsed field gel
electrophoresis) a été également réalisée après restriction par l’enzyme XbaI.
Le gène bla-CTX-M1 a été recherché par PCR et les gènes de résistance aux bêta-lactamines
(C3G) ont été caractérisés par utilisation de puces (Checkpoint, Biocentric).
Résultats et discussion
Les résultats ont permis de mettre en évidence la présence d’un même profil de multirésistance chez les onze isolats à savoir la résistance aux céphalosporines de troisième
génération, liée à la présence de bêta-lactamases à spectre élargie (BLSE) comme indiqué par
l’observation d’images de synergie entre le disque d’amoxicilline –acide clavulanique et les
disques de céfotaxime, céftazidime et céfépime.
L’analyse par PCR des groupes phylogénétiques des isolats selon la PCR développée
par Clermont et al., (2000) a révélé que tous les isolats présentant le même profil de résistance
appartenaient au même groupe D. De plus, l’analyse des souches par électrophorèse en champ
pulsé après digestion par Xba1 montrait que les onze isolats présentaient un même profil
Pour la plupart des souches, les essais répétés de conjugaison vers trois souches
réceptrices n’ont pas permis d’observer le transfert du caractère BLSE. Seule une des souches
a permis le transfert des résistances vis-à-vis des céphalosporines de troisième génération, de
la tétracycline et du cotrimoxazole.
La recherche par PCR du gène blaCTX-M selon la PCR décrite par Wooford et al.,
(2006) a révélé, la présence pour l’ensemble des souches analysées de bandes correspondant
au groupe blaCTX-M1. Ce résultat a été confirmé par l’analyse de nos souches par puces ADN
(Check-MDR CT101, Biocentric). Un séquençage partiel sur deux souches a mis en évidence
une séquence identique à 100% du gène CTX-M15.
Toutes les souches possédaient des réplicons de type F et FIB. Une préparation de
plasmides selon la méthode de Takahashi et al., (2005) montrait des profils semblables pour
les différentes souches.
Conclusion
Les travaux effectués ont permis de caractériser une série de souches d’E. coli isolées
de cas de colibacillose aviaire et présentant une multi-résistance vis-à-vis d’antibiotiques
d’intérêt majeur (céphalosporines et fluoroquinolones). Cette étude a également permis de
mettre en évidence une probable dissémination dans la région centre Algérien d’un même
clone d’E. coli pathogène aviaire producteur de BLSE et résistant aux fluoroquinolones.
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