Caractérisation moléculaire de souches d’ E. coli aviaires productrices de BLSE,
isolées de la région Centre d’Algérie
Nacima Meguenni
1
, Laetitia Le Devendec
2
, Eric Jouy
2
, Saliha Bounar-Kechih
3
, Rabah
Bakour
4
et Isabelle Kempf
2
.
1
Département de Biochimie Microbiologie. Faculté des Sciences biologiques et Agronomiques.
Université Mouloud Mammeri. Tizi Ouzou. Algérie.
2
ANSES - Laboratoire de Ploufragan- Plouzané Unité
mycoplasmologie bactériologie.
3
Laboratoire vétérinaire régionale de Draa Ben Khedda. Wilaya de Tizi Ouzou.
Algériev .
4
Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire, Faculté des Sciences Biologiques, Université des
Sciences et de la Technologie Houari Boumediene, Bab-Ezzouar, Alger, Algérie.
Introduction
En Algérie, les caractéristiques d’antibioréisitance en général et des BLSE en
particulier des souches animales ont, jusqu’à présent, très peu été décrites.
11 souches d’E.coli responsables de lésions de colibacilloses aviaires isolées dans
différents élevages de la région Centre Algérien et au cours de différentes années ont fait
l’objet d’une caractérisation de leur antibiorésistance.
Matériel et méthodes
Les Antibiogrammes ont été réalisés selon la norme NF U47-107 et les interprétations selon
les recommandations du CA-SFM.
La Détermination des profils plasmidiques (extraction plasmidique par le protocole de
Takahashi et al. (2005). L’électrophorèse en champ pulsé (PFGE ou pulsed field gel
electrophoresis) a été également réalisée après restriction par l’enzyme XbaI.
Le gène bla-CTX-M1 a été recherché par PCR et les gènes de résistance aux bêta-lactamines
(C3G) ont été caractérisés par utilisation de puces (Checkpoint, Biocentric).
Résultats et discussion
Les résultats ont permis de mettre en évidence la présence d’un même profil de multi-
résistance chez les onze isolats à savoir la résistance aux céphalosporines de troisième
génération, liée à la présence de bêta-lactamases à spectre élargie (BLSE) comme indiqué par
l’observation d’images de synergie entre le disque d’amoxicilline –acide clavulanique et les
disques de céfotaxime, céftazidime et céfépime.
L’analyse par PCR des groupes phylogénétiques des isolats selon la PCR développée
par Clermont et al., (2000) a révélé que tous les isolats présentant le même profil de résistance
appartenaient au même groupe D. De plus, l’analyse des souches par électrophorèse en champ
pulsé après digestion par Xba1 montrait que les onze isolats présentaient un même profil
Pour la plupart des souches, les essais répétés de conjugaison vers trois souches
réceptrices n’ont pas permis d’observer le transfert du caractère BLSE. Seule une des souches
a permis le transfert des résistances vis-à-vis des céphalosporines de troisième génération, de
la tétracycline et du cotrimoxazole.
La recherche par PCR du gène bla
CTX-M
selon la PCR décrite par Wooford et al.,
(2006) a révélé, la présence pour l’ensemble des souches analysées de bandes correspondant
au groupe bla
CTX-M1.
Ce résultat a été confirmé par l’analyse de nos souches par puces ADN
(Check-MDR CT101, Biocentric). Un séquençage partiel sur deux souches a mis en évidence
une séquence identique à 100% du gène CTX-M15.
Toutes les souches possédaient des réplicons de type F et FIB. Une préparation de
plasmides selon la méthode de Takahashi et al., (2005) montrait des profils semblables pour
les différentes souches.
Conclusion
Les travaux effectués ont permis de caractériser une série de souches d’E. coli isolées
de cas de colibacillose aviaire et présentant une multi-résistance vis-à-vis d’antibiotiques
d’intérêt majeur (céphalosporines et fluoroquinolones). Cette étude a également permis de
mettre en évidence une probable dissémination dans la région centre Algérien d’un même
clone d’E. coli pathogène aviaire producteur de BLSE et résistant aux fluoroquinolones.
Références bibliographiques
Anses. 2010. FARM 2007-2008, Programme français de surveillance de l'antibiorésistance
des bactéries d'origine animale.
CLERMONT, O., S. BONACORSI, ET E. BINGEN. 2000. Rapid and simple
determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Appl Environ Microbiol 66: 4555-
4558.
CLOECKAERT, A., K. PRAUD, M. LEFEVRE, B. DOUBLET, M. PARDOS, S.A.
GRANIER, A. BRISABOIS, ET F.X. WEILL. IncI1 plasmid carrying extended-spectrum-
β-lactamase gene bla CTX-M-1 in Salmonella enterica isolates from poultry and humans in
France, 2003 to 2008. Antimicrobial Agents and Chemotherapy 54: 4484-4486.
GIRLICH, D., L. POIREL, A. CARATTOLI, I. KEMPF, M.F. LARTIGUE, A.
BERTINI, ET P. NORDMANN. 2007. Extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-1 in
Escherichia coli isolates from healthy poultry in France. Appl Environ Microbiol 73: 4681-5.
GREKO, C. 2009. Reflection paper on the use of third and fourth generation cephalosporins
in food producing animals in the European Union: Development of resistance and impact on
human and animal health. Journal of Veterinary Pharmacology and Therapeutics 32: 515-
533.
LE DEVENDEC, L., A. BOUDER, A. DHEILLY, G. HELLARD, ET I. KEMPF. 2011.
Persistence and Spread of qnr, Extended-Spectrum Beta-Lactamase, and ampC Resistance
Genes in the Digestive Tract of Chickens. Microb Drug Resist 17: 129-34.
LEVERSTEIN-VAN HALL, M.A., C.M. DIERIKX, J. COHEN STUART, G.M.
VOETS, M.P. VAN DEN MUNCKHOF, A. VAN ESSEN-ZANDBERGEN, T.
PLATTEEL, A.C. FLUIT, N. VAN DE SANDE-BRUINSMA, J. SCHARINGA AND
OTHERS. Dutch patients, retail chicken meat and poultry share the same ESBL genes,
plasmids and strains. Clinical Microbiology and Infection 17: 873-880.
TAKAHASHI, T., K. ISHIHARA, A. KOJIMA, T. ASAI, K. HARADA, ET Y.
TAMURA. 2005. Emergence of fluoroquinolone resistance in Campylobacter jejuni in
chickens exposed to enrofloxacin treatment at the inherent dosage licensed in Japan. Journal
of Veterinary Medicine Series B: Infectious Diseases and Veterinary Public Health 52: 460-
464.
WOODFORD, N., E.J. FAGAN, ET M.J. ELLINGTON. 2006. Multiplex PCR for rapid
detection of genes encoding CTX-M extended-spectrum (beta)-lactamases. J Antimicrob
Chemother 57: 154-5.
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