sujet 2014-1 - Institut Méditerranéen d`Océanologie

PROPOSITION DE STAGE : MASTER 2
Laboratoire d’accueil :
Equipe Microbiologie Environnementale & Biotechnologie (MEB), UM110,
Institut Méditerranéen d’Océanologie (MIO)
Polytech, Bât B, case 901, Campus de Luminy
13288 Marseille cedex 9
Nom du Responsable du Laboratoire d’accueil : Richard Sempere
du Responsable de l’Equipe de Recherche : Patricia Bonin
Titre du sujet : Isolement et caractérisation de souches bactériennes
anaérobies d’environnements acides et leur implication dans la réduction de
composés soufrés ou dans la spéciation de l’arsenic
Responsable du stage (Nom, prénom, qualité, coordonnées) :
Agnès Hirschler-Réa
Maître de Conférences HC, HDR
[email protected]
tél : [phone]
Sujet :
Dans le cadre du programme International BIOMETAL (Bioprospection de sulfato-
réducteurs et métal-réducteurs de milieux acides et alcalins : application
biotechnologique pour le traitement d’effluents contaminés par des métaux et
métalloïdes), nous étudions la biodiversité microbienne d’environnements extrêmes avec
pour but de découvrir de nouvelles souches ayant des capacités de contribuer à la
dépollution d’environnements contaminés par de l’arsenic.
Les recherches proposées seront focalisées sur l’isolement et la caractérisation de
souches anaérobies, issues d’environnements acides, capables d’intervenir dans la
spéciation de l’arsenic ou de réduire les composés soufrés (sulfate, soufre) puisque les
sulfures résultant peuvent permettre la précipitation de l’arsenic. Plus précisément, il
s’agira d’une part de caractériser quelques souches sulfo- ou sulfato-réductrices déjà
isolées à partir d’une source thermale naturellement riche en métaux (Los Azufres,
Mexique), et, d’autre part, il s’agira d’isoler des souches bactériennes anaérobies
impliquées dans la spéciation de l’arsenic, à partir d’un site pollué par l’arsenic en raison
d’activités minières (Drainage Minier Acide, Carnoulès, France).
Techniques : microbiologie (bactéries anaérobies strictes), biochimie (dosages colorimétriques),
chimie (chromatographie en phase gazeuse, chromatographie ionique), biologie moléculaire
(PCR)
Recherches fiancées par un projet de recherche du gouvernement (ANR, Blanc
International France ̶ Mexique : BIOMETAL juin 2013 - juin 2016).