18 - Le Spectromètre de masse « Malditof MS ».pptx
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Le Spectromètre de masse « Malditof MS » :
Intérêt dans l’identification bactérienne au
Service de Microbiologie de l’HPD
Fall B1; Ba Samb B1; Diawara S1; Geye M W1; Ndiaye K S1; Sokhna C. S2 ;
Fenollar F2 ; Dieme Y1; Mbaye E3; Wade B3 & Raoult D2
1‐ Fédéra)on des Laboratoires
2‐ URMITE‐IRD
3‐ Direc)on
1
Introduction :
Processus renforcement plateau technique et développement Recherche =>
HPD Collaborations scientifiques
(URMITE, IRD, Méditerranée Infections, Pharo)
Après Labo Chimiorésistance Plasmodium
=> MALDI TOF (depuis Juillet 2012)
Révolution technique utile Identification pathogènes
( bactéries, virus, champignons, arthropodes)
Seul spécimen disponible sous-région
2
Objectifs :
Décrire principales caractéristiques techniques plateforme
Expérience accumulée après 9 mois utilisation
3
Définition :
MALDITOF MS= Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time Of Flight Mass
Spectrometry
Identification par mesure composition moléculaire pathogènes étudiés.
4
Principe :
* Eclatement agent pathogène par rayons laser puissants
* Ionisation molécules produite avec matrice
* Accélération ions produits / champs électrique puissant
* Vitesse déplacement (TOF) fonction masse molécules
* Formation spectre dont chaque pic masse ion donné
* Spectre confronté avec base de données spectres connus
(> 40000 spectres)
* Identification précise pathogène avec taux concordance
(généralement > 99%)
5
Principales étapes :
6
Après 9 mois à HPD :
Juillet 2012 – Mars 2013
• 1931 souches idenKfiées en rouKne
(bactéries +++, champignons)
• Envoi souches parKculières :
« No matches » :
‐ nouvelles découvertes potenKelles !
‐ Examens plus spécialisés (Biomol+++)
Souches rares :
7
Envoi souches & No Matches :
207 souches envoyées dont 13 « No Matches »
4 souches inhabituelles après confirmation:
Kytococcus schroeteri
(Abcès ORL récidivant avec ATB sensible!)
Exiguobacterium aurantiacum
Exiguobacterium profundum
Bacillus nealsonii
8
Envoi souches & No Matches :
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9
Aspects techniques :
En permanence sous tension et climatisation
2 pannes sérieuses ayant nécessité télémaintenance
Quelques discontinuités électriques des Splits (redémarrage sans problème)
Manipulations par Mme Ba, Dr Fall, Dr Diawara
10
Avantages constatés :
Rapidité & fiabilité d’identification (Quelques mn Vs 24H)
Réalisation plus ciblée ATB
Economie en temps de travail et consommables
Possibilité découvertes nouvelles (No matches+++)
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Perspectives:
Identification insectes vecteurs de pathologies (IRD)
Identification colonies mycobactéries (Tuberculose)
Identification bactéries à partir bouillons d’Hémoculture suspects
Identifications à partir prélèvements d’origine (urine, LCR…)
Détection des profils de résistance selon spectre !
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Conclusion:
Spectromètre de masse MALDI-TOF
Méthode rapide & fiable identification pathogènes d’intérêt médical
Economies substantielles en temps et consommables
Meilleure qualité et délais de rendu résultats partiels
Prise en charge plus optimale patients
Ouverture à la Recherche de pointe en Microbiologie
Invitation Collègues Chercheurs (UCAD, IPD…)
13
MERCI
14
