Evolution à long des peuplements macrobenthiques de la baie de Seine orientale : variabilité de la diversité spécifique et fonctionnelle à différentes échelles spatiales Responsable du stage : Eric Thiébaut, Station Biologique de Roscoff, UMR 7144, Place Georges Teissier, 29680 Roscoff tél : 02 98 29 25 31 e-mail : [email protected] Co-responsable du stage : Jean-Claude Dauvin, Université de Caen, UMR 6143, 24 rue des Tilleuls, 14000 Caen tél : 02 31 56 57 22 e-mail : [email protected] Descriptif du stage Depuis la moitié du 19ième siècle, l’estuaire de la Seine et le secteur oriental de la baie de Seine ont été complétement façonnés par les activités humaines afin de faciliter la pénétration de l’onde de marée et la navigation de sorte que son évolution naturelle a été brusquement interrompue. Les changements géomorphologiques en relation avec les activités industrielles et l’urbanisation (construction de digues et de jetées, dragages intensifs) ont eu des conséquences sédimentaires significatives, le changement majeur étant l’expansion des dépôts vaseux depuis l’estuaire vers les fonds marins subtidaux en aval (Lesourd et al., 2001 ; Garnaud et al., 2002). A titre d’exemple, le long des côtes sud-est de la baie, entre Deauville et Ouistreham, le taux moyen de pélites dans les sédiments est passé de 3 à 35 % entre 1995 et 2000 (Garnaud et al., 2002). En parallèle à ces perturbations, les forts niveaux des contaminants organiques et des métaux lourds font de l’estuaire de la Seine l’un des estuaires les plus contaminés d’Europe (Dauvin et al., 2007). Afin d’évaluer l’évolution à long terme de la structure de la communauté macrobenthique des sables fins plus ou moins envasés du secteur oriental de la baie, la plus exposée à l’envasement et aux contaminants chimiques, une série de campagnes hivernales d’échantillonnage a été réalisée en 1987, 1988, 1991, 1996, 2001, 2006 et 2011. Chaque année, un réseau de 46 à 76 stations a été échantillonné. Un tel suivi à long terme à l’échelle d'une communauté constitue une approche originale d’étude de l’évolution à long terme des milieux côtiers en permettant d’appréhender la cinétique temporelle de la communauté à différentes échelles spatiales : la station d’échantillonnage, un faciès ou la communauté dans sa totalité. Les analyses précédentes des campagnes réalisées jusqu’en 2006 ont mis en évidence (1) une distribution des espèces dominantes en noyaux d’abondance relativement stables dans le temps sauf pour quelques espèces sujettes à de fortes variations inter-annuelles et (2) une forte structuration spatiale du peuplement des sables fins plus ou moins envasés présentant quant à elle une relative stabilité spatio-temporelle (Thiébaut et al., 1997 ; Ghertsos et al., 2000 ; Barnay, 2003 ; Alizier, 2011). Le suivi à long terme de la communauté combiné à d’autres campagnes ponctuelles a également permis de suivre l’installation en 1998 puis l’expansion de la population du couteau américain Ensis directus, mollusque bivalve exotique originaire d’Amérique du Nord (Dauvin et al. 2007). Par ailleurs, en réponse à l’envasement progressif du secteur oriental de la baie, plusieurs espèces vasicoles jamais signalées en baie de Seine se sont installées ; c’est le cas de l’annélide polychète Melinna palmata depuis 2002 et du crustacé décapode Asthenognathus atlanticus depuis 2008 (Dauvin et al., 2007 ; Jourde et al., 2012). Les différentes analyses du jeu de données réalisées jusqu’à présent montrent ainsi que la variabilité du niveau d’abondance de certaines espèces, l’apparition de nouvelles espèces ou les fortes contraintes anthropiques ne semblent pas remettre en cause l’organisation générale de l’ensemble du peuplement à moyen terme. Par ailleurs, cette stabilité de l’organisation en faciès, en dépit de la variabilité temporelle de l’abondance de certaines espèces, suggère une éventuelle redondance fonctionnelle des espèces. Comprendre la dynamique temporelle d'une communauté n’implique pas seulement de comprendre les variations du nombre d’espèces présentes ou de leur identité mais également de comprendre comment son fonctionnent est affectée. En cas de forte redondance fonctionnelle, le déclin d’une espèce peut être compensé par l’augmentation d’abondance d’une autre espèce voisine. Un moyen d’aborder cette question repose sur l’analyse des traits biologiques qui fournit une mesure de la diversité fonctionnelle (Bremner, 2008). L’analyse des traits biologiques repose sur le calcul d’indices de diversité fonctionnelle (Mouillot et al., 2007) et sur des techniques d’ordination multivariées (Bremner et al., 2006) afin de faire le pendant avec les méthodes traditionnelles d’étude des communautés benthiques. L’objet du sujet de stage sera d’effectuer une analyse de la variabilité spatio-temporelle de la communauté macrobenthique sur l’ensemble du suivi, de 1987 à 2011. Il s’articulera autour des questions suivantes : (1) quelle est la variabilité spatio-temporelle des espèces dominantes de la communauté ; (2) quels sont les différents faciès de la communauté définis sur la base des 7 campagnes d’échantillonnage et quelles sont leurs caractéristiques ; (3) quel est le degré de variabilité de la communauté à différentes échelles spatiales : la communauté dans sa globalité, les faciès, les stations ; (4) quelle a été l’évolution à long terme de la communauté d’un point de vue fonctionnel ? Cette dernière question sera traitée à partir d’une analyse d’une matrice des traits biologiques qu’il faudra élaborer au cours du stage. Quelques références bibliographiques Alizier S., 2011. Echelles spatio-temporelles d’observation des relations macrobenthos-sédiments : organisation et changements à long terme (1988-2009) des communautés benthiques subtidales de la partie orientale de la baie de Seine. Thèse de doctorat de l’Université de Lille 1. Barnay A.S., 2003. Structure des peuplements de sables fins plus ou moins envasés en Manche : échelles spatiales et biodiversité. Thèse de doctorat de l’UPMC. Bremner J. (2008). Species’ traits and ecological functioning in marine conservation and management. J. Exp. Mar. Biol. Ecol., 366: 37-47. Bremner J., Rogers S.I., Frid C.L.J. (2006). Methods for describing ecological functioning of marine benthic assemblages using biological traits analysis. Ecol. Ind., 6: 609-622. Dauvin J.C., Desroy N., Janson A.L., Vallet C. & Duhamel S., 2006. Recent changes of estuarine benthic and suprabenthic communities in response to harbour infrastructural development. Mar. Poll. Bull., 53: 80-90. Dauvin J.C., Ruellet T., Desroy N. & Janson A.L., 2007. The ecological quality status of the Bay of Seine and the Seine estuary: use of biotic indices. Mar. Poll. Bull., 55: 241-257. Dauvin J.C., Ruellet T., Thiébaut E., Gentil F., Desroy N., Janson A.L., Duhamel S., Jourde J., Simon S., 2007.- The presence of Melinna palmata (annelid polychaete) and Ensis directus (mollusc bivalve) as indicators of environmental changes in the Bay of Seine. Cah. Biol. Mar., 48 : 391-401 Garnaud S., Lesueur P., Lesourd S., Poupinet N., Brun-Cottan J.C., 2002. Caractérisation des variations lithologiques saisonnières des sédiments de la baie de Seine orientale ; impact des crues de la Seine (France). C.R. Geoscience, 334: 323-330. Ghertsos K., Luczak C., Dauvin J.C. (2001) Identification of global and local components of spatial structure of marine benthic communities: example from the Bay of Seine (English Channel). J. Sea Res., 45: 63-77. Jourde J., Alizier S., Dancié C., Dauvin J.C., Desroy N., Dubut S., Gentil F., Grall J., Hanin C., Lanrhere J., Thiébaut E., 2012.- First and repeated records of the tropical-temperate crab Asthenognathus atlanticus Monod, 1932 (Decapoda: Brachyura) in the eastern part of the Bay of Seine (eastern English Channel, France). Cah. Biol. Mar., 53 : 525-532. Lesourd S., Lesueur P., Brun-Cottan J.C., Auffret J.P., Poupinet N., Laignel B., 2001. Morphosedimentary evolution of the macrotidal Seine estuary subjected to human impact. Estuaries, 24: 940-949. Thiébaut E., Cabioch L., Dauvin J.C., Retière C., Gentil F., 1997. Spatio-temporal persistence of the Abra alba-Pectinaria koreni muddy fine sand community of the eastern Bay of Seine (English Channel). J. Mar. Biol. Ass. U.K., 77: 1165-1185. Villeger S., Mason N.W.H., Mouillot, D., 2008. New multidimensional functional diversity indices for a multifaceted framework in functional ecology. Ecology, 89: 2290–2301. Villeger, S., Miranda, J.R., Hernandez, D.F. & Mouillot, D. (2010). Contrasting changes in taxonomic vs. functional diversity of tropical fish communities after habitat degradation. Ecol. Appl., 20: 1512– 1522. NB : Le stage se déroulera pour l’essentiel à la Station Biologique de Roscoff avec un ou deux séjours d’une semaine à Caen. Les échanges réguliers avec l’Université de Caen se feront prioritairement en visioconférence. L’étudiant(e) choisi(e) devra présenter un goût tout à la fois pour l’étude des communautés benthiques et l’analyse de données.