05 Pres seminaire 13-03

Plasticité phénotypique du riz,
modèle pour les céréales:
Difficultés & enjeux pour la modélisation des plantes
D. Luquet
UPR59, modélisation intégrative

Plan de la présentation
• Intérêt de la plasticité phénotypique et de sa modélisation
(échelle plante, contexte de sélection variétale)
• Analyse intégrative des processus & paramètres de la plasticité
•Importance pour et de la modélisation
•Fonctionnement des méristèmes
•Métabolisme des sucres
• Exemples / analyses
•Carence en P (stress hydrique)
• Conclusions (implications & enjeux pour la modélisation)

Émergence de nouvelles opportunités pour la sélection variétale
Sélection assistée par marqueur, transgénèse
Découverte de gènes, marqueurs (QTL, études d’association, mutants…)
Nécessité d’outils ‘ad hoc’ pour le phénotypage
Caractères plus proches de l’action des gènes et + discriminants (génotypes)
Caractères génotypiques ‘libérés’ du ‘bruit’ environnemental
Rôle pour la modélisation
Capacité inhérente à intégrer & ‘dé-corréler’ les effets envt & génétique (GXE)
Paramètres génotypiques ‘process based traits’
Valeur + robuste & discriminante pour des analyses génétiques multi-sites…
(Quilot et al. 2005; Reymond et al. 2004…)
Contexte: Phenotypage assisté par modélisation
(discrimination & analyse genotypique)
⇒Avantage comparatif de la modélisation pour s’affranchir OU étudier
la plasticité phénotypique dans le cadre d’analyses génétiques

Plasticité Phénotypique
Environment
Variability
Genotypic
Diversity
Phenotype
(G x E x M)
small
large
• Processus de réponse (actif/passif) de la plante à l’environnement
Kim, 2003
Modélisation des intéractions GXE:
...Approche statistique ou + ‘mécaniste’...
… si études intégratives & cognitives au préalable…

Greenlab et la plasticité phénotypique
Plasticité phénologique : organisation temporelle
Température, Stress
Signaux spécifiques : Photopériodisme, Vernalisation…
Plasticité morphologique « passive » (?)
Simples effets des ressources sur la taille (plantes et/ou organes)
Plasticité architecturale adaptative, inductible
Compensations trophiques (ex: tallage)
Adaptations spécifiques (ex: étiolement, « sun/shadow leaves »)
Plasticité des défenses chimiques
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