sujet 2014-4 - Aix
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Organisme d’accueil : CNRS Délégation Provence et Corse 31, chemin Joseph Aiguier 13402 Marseille Cedex 20 France Laboratoire d’accueil : Information Génomique & Structurale UMR7256-CNRS Aix-Marseille Université Parc Scientifique de Luminy, Institut de Microbiologie de la Méditerranée 163 Avenue de Luminy - case 934 13288 Marseille cedex 09 (France) Tel: +33 4 91 82 54 20 fax: +33 4 91 82 54 21 http://www.igs.cnrs-mrs.fr Activités confiées : Détection et étude de virus géants par la mise en culture d’échantillons environnementaux en présence d’amibes des genres Acanthamoeba et Dictyostelium. Lors de son stage, l’étudiant sera chargé d’amplifier la fraction virus géants contenue dans des échantillons environnementaux collectés dans le cadre de différentes missions, notamment TARA-océans. Le stagiaire devra déterminer les conditions appropriées de remise en culture des virus infectant les amibes des genres Acanthamoeba afin de les rendre capables d’infecter Dictyostelium. Les infections produites seront étudiées de façon approfondie, en microscopie optique et électronique pour déterminer la nature de l’agent infectieux ainsi que les différentes étapes du cycle infectieux. Les virus géants potentiels seront ensuite analysés selon plusieurs dimensions (génomique, protéomique…etc..) dans le but de les caractériser plus précisément et de déterminer leur place dans la phylogénie des virus géants. Les outils permettant la manipulation génétique de Dictyostelium étant bien établis, la découverte de virus géants capables d’infecter Dictyostelium ouvrira la voie à l’étude moléculaire approfondie de ces organismes et des relations hôte-pathogène. Encadrement : Nadège Philippe, Ingénieur de Recherche CNRS Responsable : Chantal Abergel, Directeur de Recherche CNRS
