I-1/ Définition de l`infection nosocomiale

SOMMAIRE
INTRODUCTION 9
1ère Partie : GENERALITES 10
I/ Epidémiologie 10
I-1 Définition de l’infection nosocomiale 10
I-1-1 Fréquence 10
I-1-2 Gravité 11
I-2 Flore de l’hôpital 12
I-3 Modes de contamination 12
I-3-1 Contamination aérienne 12
I-3-2 Contamination par contact 13
II Diagnostic bactériologique 14
II-1 les produits pathologiques 14
II-1-1 Généralités 14
II-1-1-1 Définition 14
II-1-1-2 Règles générales de l’examen bactériologique des
produits pathologiques 16
II-1-1-3 Résultats 17
II-1-2 Les produits pathologiques étudiés 18
II-1-2-1 Les urines 18
II-1-2-2 Le sang 20
II-1-2-3 Les pus 21
II-2 Les germes de l’atmosphère 23
II-3 Le manuportage et le matériel médical 23

II-4 Phénotypage :caractérisation des souches 24
II-4-1 Antibiotypie 24
II-4-1-1 Antibiogramme 24
II-4-1-2 Détermination de la CMI 25
II-4-2 Sérotypie 25
II-4-3 Biotypie 25
II-4-4 Lysotypie 26
II-4-5 Bactériocinotypie 26
II-4-6 Plasmides de résistance 27
II-4-7 Ribotypie 27
II-4-8 Toxinotypie 28
II-4-9 Zymotypie 28
II-4-10 Pulsotypie 28
II-5 Méthodes indirectes de diagnostic :
Méthodes Séro-immunologiques 29
II-5-1 Dosage des cytokines de l’inflammation : IL1, IL,
TNFalpha, INFgaman 29
II-5-2 Mise en évidence d’une réaction antigène-
anticorps (Ag-Ac) invisible 30
II-5-2-1 Réactions d’immunofluorescence 30
II-5-2-2 Réaction de fixation du complément 30
II-5-2-3 Hémagglutination passive 31
II-5-2-4 Réactions de précipitations 31
II-5-2-5 Réactions immuno-enzymatiques :
technique ELISA 32
III / Agents responsables et facteurs de risque 32
III-1 Agents responsables 32
III-2 Facteurs de risque 33

III-2-1 Facteurs antibiothérapiques 33
III-2-2 Les autres portes d’entrée 34
IV / Classification des antibiotiques 35
IV-1 Antibiotiques inhibiteurs de la synthèse
du peptidoglycane 35
IV-2 Antibiotiques actifs sur les membranes 37
IV-3 Antibiotiques inhibiteurs des synthèses proteiques 37
IV-4 Antibiotiques inhibiteurs des acides nucleiques 38
IV-5 Antibiotiques inhibiteurs de la synthèse des folates 39
IV-6 Antibiotiques antituberculeux 40
V / Mécanismes de résistance et phénotypes de résistance 40
V-1 Définitions 40
V-1-1 Notion de résistance 40
V-1-2 Type de résistance 41
V-1-2-1 Résistance naturelle 41
V-1-2-2 Résistance acquise 41
V-1-2-3 Résistance clinique 42
V-1-3 Support génétique 42
V-1-3-1 Résistance chromosomique 43
V-1-3-2 Résistance extrachromosomique 43
V-1-4 Phénotype de résistance 44
V-2 Mécanismes de résistance bactérienne aux antibiotiques 44
V-2-1 Résistance aux béta-lactamines 45
V-2-1-1 Mécanismes d’action des
béta-lactamines 45
V-2-1-2 Mécanismes de résistance aux
béta-lactamines 45
V-2-1-2-1 Résistance par

production d’enzymes 45
V-2-1-2-2 Résistance non
enzymatiques aux béta-lactamines 49
V-2-1-2-3 Autres mécanismes
de résistance aux béta-lactamines 53
V-2-2 Résistance aux aminosides 54
V-2-2-1 Mécanismes d’action des
aminosides 54
V-2-2-2 Mécanismes de résistance 54
V-2-2-2-1 Altération de la cible 54
V-2-2-2-2 Modification du
transport de l’antibiotique 55
V-2-2-2-3 Détoxication
enzymatique des antibiotiques 55
V-2-3 Résistance bactérienne aux macrolides,
lincosamines et streptogromines 58
V-2-3-1 Mécanismes d’action 58
V-2-3-2 Mécanismes de résistance 58
V-2-3-2-1 Résistance intrinsèque 58
V-2-3-2-2 Résistance acquise 59
V-2-4 Résistance aux tétracyclines 60
V-2-5 Résistance aux glycopeptides 60
V-2-5-1 Mécanisme d’action des glycopeptides 60
V-2-5-2 Mécanismes de résistance aux
Glycopeptides 61
V-2-6 Résistance vis à vis des sulfamides et du
Triméthoprime 62
V-2-7 Méthicillinorésistance ( ou Oxacilline et dérivés) 63

2ème partie : TRAVAIL PERSONNEL 65
I / Cadre de l’étude 66
II / Matériels et méthodes 66
II-1 Matériel 66
II-1-1 Origine des souches 66
II-1-2 Culture de germes 66
II-1-3 Résistance enzymatique 67
II-2 Méthodes 67
II-2-1 Isolement des germes chez les malades 67
II-2-1-1 Les prélèvements 68
II-2-1-2 Traitement des produits pathologiques 68
II-2-1-2-1 Définition des produits
pathologiques 68
II-2-1-2-2 Différents produits
Pathologiques 69
II-2-2 Isolement des germes de l’atmosphère 76
II-2-2-1 Prélèvements 76
II-2-2-2 Identification 76
II-2-3 Isolement des germes au niveau du matériel
médical et des mains du personnel 77
II-2-4 Identification 78
II-2-5 Sensibilité aux antibiotiques 86
II-2-5-1 Antibiogramme 86
II-2-5-2 Détermination de la CMI 87
II-2-5-2-1 Définition de la CMI 87
II-2-5-2-2 Méthode par dilution 88
II-2-5-2-2-1 En milieu liquide 88
II-2-5-2-2-2 En milieu solide 89