Salinité et toxicité des métaux chez l`embryon de médaka marin

Salinité et toxicité des métaux chez l'embryon de médaka marin
Caractérisation des mécanismes moléculaires mis en jeu
Contexte : Les zones estuariennes et côtières sont soumises à des variations de salinité. La
biogéochimie des métaux évolue en fonction de la salinité du milieu, ce qui peut avoir des
conséquences sur la biodisponibilité de ces métaux ou sur leur mécanisme d'action. L'espèce de
médaka marin, Oryzias melastigma, est capable de réaliser tout son cycle de vie aussi bien en eau
douce qu’en eau salée. En utilisant les embryons de cette espèce, nous avons pu démontrer que la
toxicité en réponse à des expositions à des métaux augmentait quand la salinité du milieu
décroissait. La modélisation de la spéciation des métaux dans ces milieux prévoit la présence
d'espèces différentes. Il importe maintenant de poursuivre la caractérisation de ces observations.
Objectifs 2) Pour identifier les mécanismes sous-jacents à la toxicité différentielle des métaux en
fonction de la salinité, il convient de caractériser les mécanismes moléculaires impliqués. Un
programme de séquençage massif est en cours de réalisation qui nous informera sur les niveaux
d'expression d'un large ensemble de séquences. L'objectif du stage est de poursuivre l'annotation et
la quantification de l'expression des gènes identifiés par le séquençage. Il sera nécessaire de
confirmer par qPCR la variation des niveaux d'expression en réponse à des expositions.
Compétences souhaitées : biologie moléculaire, génomique, qPCR – des notions d'embryologie et
d'écotoxicologie seraient un plus.
Encadrant : Benoit Simon-Bouhet ([e-mail]) et Xavier Cousin
([email protected])
Déroulement du stage : Ifremer L'Houmeau et UMR LIENSs Université de La Rochelle.