Séance 2 : L’immunité adaptative La réponse immunitaire spécifique ou acquise RIA Partie 1 : la liaison antigène-anticorps L’immunité adaptative étant spécifique, il y a nécessité d’une reconnaissance de l’agresseur (dont une partie est nommé antigène) par des molécules de reconnaissance que l’on appelle des anticorps. Ces sont des protéines constituées de l’assemblage de chaînes polypeptidiques, identiques deux à deux : deux chaînes qualifiées de lourdes (I et H) et deux chaînes légères (M et L). Les chaînes sont associées par des ponts disulfures. Objectif : Identifier les structures d’un anticorps Identifier les structures impliqués dans la reconnaissance antigène/anticorps (=Ag/AC). Matériel à votre disposition Consignes Logiciel Rastop - Ouvrir le fichier Rastop/Immuno/ iggtotal.rsm - Ouvrir le fichier igg-lys puis changer la représentation « Boules et bâtonnets » fiche technique Poste 1 : Utiliser les fonctionnalités du logiciel RASTOP : - pour mettre en évidence la forme de l’anticorps, les chaînes légères (notées L et M) et lourdes (notées H et I), le nombre d’acides aminés par chaînes (molécules / séquences). - pour mettre en évidence la zone de fixation antigène-anticorps et identifier 4 acides aminés impliqués dans cette reconnaissance spécifique. appeler le professeur pour vérifier Bilan RASTOP : Réaliser un schéma légendé d´un anticorps et du complexe anticorps-antigène. Poste 2 : Logiciel Anagène Fichier/ouvrir/IGG-divers.edi Utiliser les fonctionnalités du logiciel Anagène pour comparer judicieusement les séquences en acides aminés des deux chaînes d´anticorps (lourdes et légères) et préciser où sont localisés les parties constantes et variables des deux chaînes d´anticorps. appeler le professeur pour vérifier - Compléter votre schéma précédant en tenant compte de votre comparaison. Fiche technique : mettre en évidence la zone de contact entre l´antigène et l´anticorps Partie 2 : Identifier un antigène d’Ouchterlony. On cherche à identifier l’antigène injecté à un lapin. A des fins expérimentales, des lapins reçoivent par injection un antigène. Ils produisent alors des anticorps spécifiques contenus dans leur sérum dont la présence peut être mise en évidence par la méthode d’Ouchterlony. On cherche à identifier l’antigène injecté à un lapin. PRINCIPE : C`est une méthode d´immunodiffusion sur gel : les solutions déposées dans les puits creusés dans le gel diffusent de façon homogène dans toutes les directions autour du puits. Deux auréoles de diffusion peuvent donc entrer en contact. Cette zone de contact reste invisible s´il n´y a pas de réaction entre les deux solutions. Quand il y a réaction entre les solutions, il se forme un arc de précipitation visible á l´oeil nu. Celui-ci est dû à l´interaction entre les anticorps et les antigènes spécifiques, entraînant la formation d´un complexe immun anticorps-antigène. Consignes de l´activité 1. Réaliser la partie I du protocole de la fiche-protocole fournie. Capacités Réaliser une manipulation d´après un protocole Appeler le professeur pour vérifier la qualité de la boite de gel 2. Après refroidissement de votre gélose, réaliser la partie II du protocole. 3. Avant de passer à la partie III, justifier la position du sérum contenant les anticorps anti BSA et les solutions d’antigènes correspondants aux extraits d’albumines. Comprendre la manipulation Appeler le professeur pour justifier votre choix. 4. Réaliser la partie III du protocole. Traduire des informations par un schéma 5. Attendre quelques minutes pour observer les résultats. Schématiser les résultats. BILAN : - Dans chaque cas, réaliser un schéma d’interprétation à l’échelle moléculaire, puis déterminer quel est l’antigène injecté au lapin. Ranger le poste de travail. Adopter une démarche explicative Gérer et organiser le poste de travail Critères d’évaluation du schéma : - interprète la présence d’un arc - interprète l’absence d’arc - légendes correctes - titre pertinent - soigné Appliquer une démarche explicative Les Ac testés réagissent en présence de l´albumine de sérum de bœuf. Ils ne réagissent pas en présence des autres Ag et de l´eau. Ils sont donc strictement spécifiques de la BSA L´Ag injecté est donc BSA Prise en compte de toutes les donnés ou presque toutes, mise en relation pertinentes et cohérentes Réponse partielle au problème Pas de conclusion ou trop maladroite et confuse. 2 1 0 Principe de la méthode d'Ouchterlony C'est une méthode d'immunodiffusion sur gel : les solutions déposées dans les puits creusés dans le gel diffusent de façon homogène dans toutes les directions autour du puits. Deux auréoles de diffusion peuvent donc entrer en contact lorsqu'elles ont suffisamment progressé. Cette zone de contact reste invisible s'il n'y a pas de réaction entre les deux solutions. Quand il y a réaction entre les solutions, il se forme un arc de précipitation visible à l'œil nu. Celui-ci est dû à l'interaction entre de nombreux anticorps et les antigènes spécifiques. Deux exemples de schéma bilan : Comparaison des séquences d'acides aminés de différents anticorps 1. Comparaison entre elles des chaînes lourdes d'anticorps différents On effectue avec le logiciel Anagène un alignement avec discontinuité des chaines lourdes appartenant à quatre anticorps différents : deux anticorps anti-gp120 (dirigés contre des épitopes différents), un anticorps anti-gp41 et un anticorps antip24. Dans la portion de séquence comprise entre les positions 1 et 120, la dispersion importante des astérisques souligne le peu de similitude entre les séquences. Cela correspond à la région variable des chaines lourdes : Dans la portion de séquence située au delà de la position 120, on note au contraire une densité très importante d'astérisques, soulignant ainsi la très forte ressemblance entre les séquences. Cela correspond à la région constante des chaînes lourdes : 2. Comparaison entre elles des chaînes légères d'anticorps différents On effectue avec le logiciel Anagène un alignement avec discontinuité des chaines légères appartenant à quatre anticorps différents : deux anticorps anti-gp120 (dirigés contre des épitopes différents), un anticorps anti-gp41 et un anticorps antip24. Dans la portion de séquence comprise entre les positions 1 et 110, la dispersion importante des astérisques souligne le peu de similitude entre les séquences. Cela correspond à la région variable des chaines légères : Dans la portion de séquence située au delà de la position 110, on note au contraire une densité très importante d'astérisques, soulignant ainsi la très forte ressemblance entre les séquences. Cela correspond à la région constante des chaînes légères : Comparaison des séquences d'acides aminés de différents anticorps On effectue avec le logiciel Anagène un alignement avec discontinuité des chaînes lourdes appartenant à quatre anticorps différents. - Extrait de séquence dans la portion comprise entre les positions 1 et 120 : - Extrait de séquence dans la portion située au delà de la position 120 : On effectue avec le logiciel Anagène un alignement avec discontinuité des chaînes légères appartenant à quatre anticorps différents : - Extrait de séquence dans la portion comprise entre les positions 1 et 110 : - Extrait de séquence dans la portion située au delà de la position 110 :