Enseignant - ifoad-ugb

REPUBLIQUE DU SENEGAL
Ministère de l’Enseignement Supérieur
et de la Recherche
------------------UNIVERSITE GASTON BERGER
Unité de Formation et de Recherche
Des Sciences Agronomiques d’Aquaculture et
des Technologies Alimentaires
Section :
UE : Physique et Chimie Appliquée
Type (UE) :
Niveau :
Année :
Obligatoire
Semestre : Crédits(UE) :
1
7
Code (UE) :
PVA 113
Intitulé du cours (EC): BIOCHIMIE
Coefficient (ECUE) :
Contacts :
Pré-requis :
Objectif :
Volumes Horaires :
CM :20 H; TD: 6 H; TP:10H; TPE :
…..
Prénom et NOM : Saïdou Nourou SALL
Titre : Maitre Assistant
Faculté ou UFR ou Organisme : UFR des Sciences Agronomiques de
l’Aquaculture et des Technologies Alimentaires
Local : B12, Maison de l’Université.
Téléphone : 775620702
Email : [email protected]
La biochimie, EC enseigné en tronc commun pour l’ensemble des
spécialités de l’UFR est destinée à initier les étudiants sur les généralités
dans les processus chimiques à la base de la vie. Il contient les
connaissances et les outils de la biochimie structurale et métabolique qui
permettent de comprendre et d’analyser les phénomènes observés au
niveau des systèmes biologiques complexes (échelle cellulaire et
organisme entier). Les pré-requis sont les éléments de la chimie et de la
biologie cellulaire.
Objectifs généraux:
Les objectifs généraux sont de comprendre :
- les mécanismes de la vie au niveau moléculaire;
- les interactions entre les diverses voies métaboliques
Objectifs spécifiques (ou compétences attendues)
Au terme du cours, l’étudiant devra être capable de:
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles
d’assemblage, fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
;
- Décrire la structure et les mécanismes d’action des enzymes;
- Décrire le processus de formation de l’ATP et des autres composés à
potentiel énergétique élevé, chaîne respiratoire (énergétique
biochimique)
- Citer les principales techniques de caractérisation des biomolécules ;
- Choisir les techniques adéquates d’analyses biochimiques;
- Mesurer les activités catalytiques des enzymes
Types d’enseignement
Devoir en salle ;
Modalités
d’évaluation
Compte rendu de TP
Examen
1/3
2/3
Séance 1 :
Objectifs
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles d’assemblage,
fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules ;
Contenu
Architecture et logique moléculaire des être vivants:
- Les protides – Les acides amines, définition, classification,
propriétés physico-chimiques, la liaison peptidique,
Séance 2 :
Contenu
Objectifs
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles d’assemblage,
fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
Contenu
- Les protides – Les protéines, classification, les niveaux de structures:
primaire, secondaire, tertiaire, quaternaire, la relation structure-fonction,
la cavité catalytique, la dénaturation des protéines.
Séance 3 :
Objectifs
B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07
Internet : http://www.ugb.sn
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles d’assemblage,
fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
Contenu
- Les glucides - définition, classification, structure chimique et
représentations, des monosaccharides
Séance 4 :
Objectifs
- Résoudre les exercices de nomenclature des biomolécules acides aminés et
protéines ; Représenter les structures ; Lister les règles d’assemblage et leurs
fonctions biologiques
Contenu
Exercices en travaux dirigés sur les protides (acide amines et proteins)
Séance 5 :
Objectifs
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles
d’assemblage, fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
Contenu
- Les glucides – Les diholosides courants, les polysaccharides, structures
et fonctions
Séance 6 :
Objectifs
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles
d’assemblage, fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
Contenu
- Les lipides - les acides gras, définition, classification, structure chimique,
nomenclature, propriétés physiques, les triglycérides, les stérides, les
caroténoïdes, les phospholipides,
caractéristiques physico-chimiques des graisses.
Séance 7 :
Objectifs
- Nommer les classes de biomolécules les plus importantes ;
- Décrire les structures et les propriétés (composition, règles
d’assemblage, fonctions biologiques) de ces classes de biomolécules
Contenu
B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07
Internet : http://www.ugb.sn
- Les acides nucléiques - La structure chimique des nucléotides, la
structure primaire des acides nucléiques, la structure secondaire de l'ADN.
Les catégories d'ARN et leur structure secondaire
Séance 8 :
Objectifs
- Résoudre les exercices de nomenclature des biomolécules glucides,
lipides et acides nucléiques ; Représenter les structures ; Lister les règles
d’assemblage et leurs fonctions biologiques
Contenu
Exercices en travaux dirigés sur les glucides, lipides et acides nucléiques
Séance 9 :
Objectifs
- Décrire la structure et les mécanismes d’action des enzymes
Contenu
Enzymes et catalyse enzymatique
- Elément d'enzymologie définition, classification et nomenclature des
enzymes les propriétés, les modes d’action, la théorie cinétique de
Michaelis-Menten (vitesse de r&action), les facteurs influençant
l'activité enzymatique : la température, le pH, les cofacteurs, les
inhibiteurs, la spécificité de substrat des enzymes.
Séance 10 :
Objectifs
- Décrire la structure et les mécanismes d’action des enzymes
Contenu
Enzymes et catalyse enzymatique
- Les mécanismes de la catalyse enzymatique
Séance 11 :
Objectifs
- Décrire le processus de formation de l’ATP et des autres composés à
potentiel énergétique élevé, chaîne respiratoire (énergétique biochimique)
Contenu
Energétique biochimique (Métabolisme)
- Introduction au metabolism (anabolisme et catabolisme), Chaînons
métaboliques
B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07
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Séance 12 :
Objectifs
- Décrire le processus de formation de l’ATP et des autres composés à
potentiel énergétique élevé, chaîne respiratoire (énergétique biochimique)
Contenu
Energétique biochimique (Métabolisme)
- Métabiolisme des glucides, cycle de krebs, le rôle clé de l'ATP dans le
stockage de l'énergie à court terme.
Métabolismes des, glucides, introduction à la respiration
Séance 13 :
Objectifs
- Classifier les enzymes et les réactions catalytiques
- Représenter la constante de Michaélis Menten et la vitesse des réactions
enzymaiques
- Lister et expliquer les étapes la glycolyse et du cycle de Krebs
- Faire les bilans de reaction métabolique et quantifier l’ATP.
Contenu
Exercices en travaux dirigés sur la catalyse enzymatique et sur le métablolisme
Séance 14 :
Objectifs
- Citer les principales techniques de caractérisation des biomolécules ;
- Choisir les techniques adéquates d’analyses biochimiques;
Contenu
Introduction sur les Travaux Pratiques au laboratoire
Préparation de solution
Les techniques de caractérisation des biomolecules: avantage et utilisation
contextuelle
Séance 15:
Objectifs
- Estimer les concentrations les biomolécules
Contenu
Préparation gamme étalonnage
Dosage de solution de proteins et de sucre
Séance 16 :
Objectifs
B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07
Internet : http://www.ugb.sn
- Séparer et identifier les biomolécules
Contenu
Travaux Pratiques de separation des biomolecules par Chromatographie sur
Couche Mince
Séance 17 :
Objectifs
- Manipuler des extraits d’ADN
Contenu
Travaux Pratiques d’extraction et quantification d’ADN
Séance 18 :
Objectifs
- Mesurer les activités catalytiques des enzymes
Contenu
Travaux Pratiques de mesure d’activités enzymatiques dans des extraits de
plante
Le Stryer (Berg Jeremy, Tymockzo John & Stryer Lubert) (2003). La
Biochimie
5ème édition, Flammarion Médecine-Sciences, 1052 pages.
Alberts, B., (2004). Biologie Moléculaire de la Cellule 4ème édition,
Flammarion Médecine-Sciences, 1472 pages.
Bibliographie
Jacques-Henry Weil (2005). Biochimie générale : Cours et exercices
corrigés Édition : 10e édition .Dunod Collection : Sciences Sup
Serge Weinman (2004). Toute la Biochimie. Cours. 451 pages. Dunod
Collection : Sciences Sup
B.P. : 234 – 46024 Saint-Louis, SENEGAL – Tél. : (+221) 33 961 98 95 – Fax. : (+221) 33 961 67 07
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