TP2 : Les anticorps et l`intégrité du milieu
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T P 2 : Les anticorps et l’intégrité du milieu extracellulaire A- structure et fonction des anticorps Les ressources : Logiciels : - Le logiciel RASTOP de visualisation 3D des molécules - Le logiciel ANAGENE de visualisation et de comparaison de séquences peptidiques et nucléiques Voir fiches annexes Données : Données 3D : - Iggtotal.pdb (anticorps complet) - 1E60.pdb et 1NLD.pdb (fragment de 2 anticorps dirigés contre des protéines virales p24 pour 1E60 et gp41 pour 1NLD) - 1ACY.pdb, 1EGJ.pdb, 1F58.pdb (fragment de 3 anticorps avec les antigènes. gp120 pour le 1ACY et le 1F58, p24 pour le 1EGJ) Séquences protéiques : - igg-sida-4 chaînes.edi ( séquences de 4 chaînes d’un anticorps humain anti-VIH) - igg-vih-8seq.edi (4 chaînes légères : 1NLDch .legere, 1E6Jch.légère, chaineL_1F58, chaineL_ACY et 4 chaînes lourdes : 1NLDch .lourde, 1E6Jch.lourde, chaineH_1F58, chaineH_ACY 1. 2. 3. 4. Donnez sous forme d’un schéma légendé la structure d’un anticorps complet. Précisez les caractéristiques des chaînes qui composent cet anticorps. Encadrez sur le schéma précédent les parties des anticorps qui se fixent sur les protéines virales. Précisez les caractéristiques peptidiques des parties se fixant sur les protéines virales. B- La production des anticorps Vous disposez d’un modèle de ganglions lymphatique situé à proximité d’une plaie (envahi par des bactéries) et dans lequel se trouvent des cellules phagocyaires. A partir de l’utilisation du logiciel NetBiodyn, préciser les conditions nécessaires à la production d’anticorps et les cellules qui les produisent. Imaginez différentes situations expérimentales à modéliser pour déterminer les conditions nécessaires à la production d’anticorps dans le ganglion lymphatique. Complétez le tableau suivant avec vos différentes situations expérimentales. Acteurs présents au début de la modélisation Acteurs présents à la fin de la modélisation Présence d’anticorps. Parmi les cellules apparues au cours de la réponse immunitaire quelles sont celles qui produisent les anticorps ? Précisez l’origine de ces cellules. Lymphocyte B Plasmocyte A partir de la comparaison des photos ci-dessus, préciser les transformations subies par le lymphocyte B pour devenir plasmocyte. Mettre en relation ces transformations avec l’activité des plasmocytes. Document 7 page 149 En quoi l’expérience décrite dans ce document permet-elle d’affirmer qu’il existe des lymphocytes B reconnaissant un antigène spécifique et que ceux-ci préexistent avant tout contact avec cet antigène. C- Mode d’action des anticorps. - Compte tenu de vos connaissances sur le cycle viral du VIH et sur la relation antigène/anticorps, proposez des hypothèse pour expliquer le blocage de l’infection cellulaire par le virus du SIDA. (Vous schématiserez votre réponse). Justifiez l’incapacité d’action des anticorps sur la multiplication cellulaire du virus. - Le complexe anticorps/virus est phagocyté par les macrophages : schématisez ce phénomène d’après vos « souvenirs » de troisième.
