OFFRE DE CDD INGENIEUR D’ETUDE (6 mois)
Contexte du poste :
les laboratoires LPGN UMR 6112 CNRS et MMS EA 2160 bénéficient d’un contrat
régional (COmpréhension des Socio-Ecosystèmes Littoraux et MArins pour
l’amélioration de la valorisation des ressources marines, la prévention et la gestion
des Risques - COSELMAR) pour la réalisation de l’action 2.3. (estimation des
dynamiques de croissance de micro-organismes (mono et co-culture).
Profil de poste :
Poste d’ingénieur d’étude (IE) à temps plein.
Contrat de droit public de 6 mois, à compter de début 2014.
L’IE prendra en charge, sous la responsabilité de deux enseignants-chercheurs de
l’université et d’un chercheur IFREMER, une étude sur les co-cultures bactéries-
microalgues. Le travail portera à la fois sur les aspects fondamentaux d’écologie
microbienne régissant les interactions bactéries (en particulier Promoting Growth
Plant Bacteria (PGPB))-microalgues dans une perspective applicative (ingénierie
écologique) : production d’un complexe moléculaire à activité biologique utilisé pour
le verdissement des huitres, en cosmétologie et pharmacologie.
Le travail sera principalement de nature expérimentale en laboratoire avec un volet
modélisation.
Un étudiant Bac+5 sera également recruté pour la même période, dans le cadre de
cette étude, et sera co-encadré par l’IE.
Lieu d’exercice : Nantes (Université de Nantes et IFREMER)
Contexte scientifique :
Lorsque des végétaux sont co-cultivés en présence de bactéries, en particulier des
(PGPB) connues pour synthétiser des phyto-hormones de la famille des auxines, leur
biomasse peut être augmentée. Ce phénomène biologique bien connu et exploité en
agriculture chez les végétaux supérieurs est en revanche peu étudié chez les
microalgues, en vue d’applications diverses (lipides, pigments, principes actifs).
Le travail proposé consiste à comparer une monoculture de microalgues (diatomée
marine Haslea ostrearia) à une co-culture de PGPB-H. ostrearia et à analyser les
paramètres suivants : croissance microalgale et bactérienne, composition
élémentaire du milieu de culture (N, P, Si), analyse des pigments chlorophylliens (Chl
a, phéopigments, caroténoides), des lipides, glucides et protéines, des facteurs de
croissance (auxine) produits par les PGPB ainsi que d’un complexe moléculaire à
activité biologique synthétisé par H. ostrearia : la marennine. On observera
également le comportement des deux microorganismes en co-culture (association
morphologique étroite ou non) par microscopie électronique.
Les co-cultures seront réalisées en microplaques au moyen d’un dispositif
expérimental ad hoc, en vue de l’adapter à un système de mesure automatique de
densité optique de cultures sur micro-plaques. L’ensemble des données
expérimentales serviront à modéliser les interactions entre microorganismes en
fonction des données environnementales.
Formation et compétences : Master 2 avec des compétences et la pratique de la
microbiologie (aisance et goût pour le travail en stérilité) et de la biochimie. La
pratique de la culture de microalgues (diatomées marines) est un plus.
Contacts : Thierry Lebeau, Professeur ([email protected])
Vincent Turpin, Maître de Conférences (vincent.tu[email protected])
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