Programme LPA - E

SEMESTRE 5
UEF 1 : Physiologie digestive, rénale et thermorégulation
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie digestive
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I.
II.
III.
IV.
V.
VI.
Métabolisme hydro-électrolytique
Métabolisme des glucides
Métabolisme des protéines
Métabolisme des lipides
Métabolisme des vitamines
Les besoins énergétiques :
- d'entretien cellulaire
- pendant la croissance
- pendant la grossesse
- pendant la lactation
- chez l'adulte
- dans les cas pathologiques
VII. Les Besoins Nutritionnels
VII. Les Désordres Métaboliques
Diabète, Athérosclérose, Malnutrition
Travaux Pratiques

Etude de la digestion : digestion enzymatique des glucides, des lipides et des protides.
UEF 1 : Physiologie digestive, rénale et thermorégulation (suite)
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie rénale
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I- Organisation structurale et physiologie des reins
1- Néphron unité structurale
2- Néphron unité fonctionnelle
a- Analyse comparée du plasma et de l’urine
b- Filtration glomérulaire
c- Réabsorptions et sécrétions tubulaires
d- Régulation de la concentration et le volume de l’urine
II- Les équilibres hydriques et électrolytiques
A- Nécessité d’un équilibre hydrominéral
B- L’eau et le volume extracellulaire
C- Régulation des ions sodium et de potassium
D- l’équilibre des ions calcium
E- Les ions hydrogène : l’équilibre acido-basique
Thermorégulation
Les facteurs de régulation
Les mécanismes de régulation
Travaux Pratiques



Dissection du rein.
Etude de la diurèse : excrétion rénale et sa régulation.
Régulation de la température (température centrale).
UEF 2 : Biologie Moléculaire : mécanismes de régulation de l'expression génétique
VHG : 42 h
Cours : 21 h
TP/TD : 21h
Coeff. : 02
Notion de Biologie moléculaire.
1. Introduction et rappel sur la réplication et ses mécanismes
2. Differents types d’ARN
 ARNm
 ARNt
 ARNr
3. Les synthéases amino acyl synthétases
 Structure
 Mode d’action
4. Elucidation du code génétique
 Chez les procaryotes
 Chez les eucaryotes
5. Relation gène protéine chez les procaryotes et les eucaryotes
 Définition du gène, génétique et biochimie
 Relation et mutation en acides amines
6. Séquences
 Méthodes d’analyses
 Structure de gène procaryote et eucaryote
7. Notion de traduction et de transcription in vitro
8. Recombinaison génétique in vitro et clonage des gènes
 Méthodes de clonages
 Clonages des gènes spécifiques
 Expression des gènes spécifiques clonage des gènes dans les cellules eucaryotes
 Avantage de clonage des gènes
9. Les acides nucléiques viraux
 Particularité structurale
 Expression des gènes des virus a ARN et a ADN
10. Réponse de la cellule a l’infection virale
 Mécanisme de restriction
 Production d’interféron
 Méthode de purification de l’interféron
 Mode d’action
11. Virus oncogènes
 Divers types de virus oncogènes
 Transformation abortive et stable
 Intégration induction et excision des virus
 Etablissement et maintien de la transformation
UEF 3 : Physiologie respiratoire et cardiaque intégrées
VHG : 84 h
Cours : 42 1h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie respiratoire :
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I- Appareil respiratoire
a- Les voies respiratoires
b- Les poumons étude anatomique et physiologique
c- La plèvre
II- Les phénomènes mécaniques de la respiration
a- Les mouvements respiratoires
b- Les volumes et capacités respiratoires
III- Les phénomènes physico-chimiques de la respiration
a- Propriétés physiques des gaz.
b- Les mécanismes des échanges gazeux.
c- Le transport des gaz respiratoires par le sang (oxygène ; dioxyde de carbone)
IV-La régulation de la respiration
a- Les mécanismes nerveux.
b- Les mécanismes chimiques.
Travaux Pratiques


Dissection de l’appareil respiratoire
Exploration de la ventilation pulmonaire (Mesure de la respiration et sa régulation).
UEF 3 : Physiologie respiratoire et cardiaque intégrées (Suite)
VHG : 84 h
Cours : 42 1h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie cardiaque :
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I. Le sang
a- Les éléments figurés du sang (structure et origine)
b- Le plasma, le sérum et les protéines sériques.
II. Le cœur
a- Morphologie et structure
b- La contraction cardiaque
c- Activité électrique du cœur (myocarde et tissu nodal)
III. Le mouvement du sang
a- Les artères.
b- Les veines.
c- Les capillaires
d. Le circuit du sang.
IV. Les mécanismes de contrôle et de régulation
a- Au niveau de cœur : l’innervation extrinsèque (les voies motrices et sensitives)
b- Au niveau des vaisseaux la vaso-motricité (les mécanismes nerveux et hormonaux)
c- Les variations de volume sanguin
Travaux Pratiques




Hématologie : mesure de l’hématocrite et de la résistance globulaire ; énumération des
éléments figurées du sang ; mesure de la volumie (mesure du volume sanguin totale par
colorimétrie).
Dissection de l’appareil cardiaque
Etude de la pression artérielle : mesure de la pression artérielle et sa régulation.
Etude des contractions cardiaques (Electrocardiographie de repos et d’effort).
UEF 4 : Structure et Fonction des Complexes Biologiques
VHG : 42 h
Cours : 21h
TP/TD : 21h
Coeff. : 01
1. Structure, biosynthèse et fonctions des complexes formés avec les protéines :
-Glycoprotéine
- Lipoprotéines
- Phosphoprotéines
- Chromoprotéines
1. Structure, biosynthèse et fonctions des complexes formés avec les lipides :
- Phosphatides
- Sphingolipides
- Lipides isopréniques
2. Structure, biosynthèse et fonction des complexes formés avec les glucides :
- Glycannes
- Mucopolysaccharides
4. Structure, biosynthèse et fonctions des hormones :
- Définition
- Structure chimique
- Biosynthèse et sécrétion
- Circulation et dégradation des hormones
- Récepteurs membranaires
- Récepteurs intracellulaires
5. La matrice extracellulaire
a- La substance fondamentale
b- Les fibres
 Structure de collagène
 Structure d’élastine
 Structure de réticuline
UEF 5 : Techniques de Biologie cellulaire et moléculaire
VHG : 42 h
Cours : 0h
TP : 42 h
Coeff. : 01
Biologie Cellulaire
1 - Méthodes d’étude de la cellule
1.1 Méthodes morphologiques
1.2 – Microscopies
1.3 Détection et identification in situ des constituants moléculaires de la cellule.
1.4 Les méthodes de fractionnement cellulaire.
1.5 Culture de tissus et de cellules
1.6 Applications industrielles.
Les méthodes et les techniques de la biologie moléculaire
1- Les outils de la biologie moléculaire :
1.1-Les enzymes de restriction
1.2- Les vecteurs :
1.2.1- Plasmides
1.2.2- Phages
1.2.3- Cosmides,
1.2.4- YAC, virus
1.3- Les sondes
2 - Les méthodes de la biologie moléculaire :
Les méthodes d’extraction, purification et de séparation des acides nucléiques
3-Les méthodes de caractérisation et d’identification des acides nucléiques:
3.1- Dot blot
3.2- Southern blot
3.3- Northern blot
3.4- Hybridation in situ
3.5- Puces à ADN
4- Les méthodes de dosage des acides nucléiques
4.1- Les méthodes d’amplification de l’ADN
4.2- Le séquençage des génomes et l’identification des gènes
5 -Les méthodes d’étude du transcriptome
6 -Les méthodes d’étude du protome.
7 -Le clonage moléculaire
8 -Le génie génétique
Répression de l’expression génique : antisens, ARN double brin interférent
9- Les organismes génétiquement modifiés
9.1- Les banques de gènes
9.2- Applications du génie génétique
10- Production de molécules thérapeutiques
Thérapie génique, applications dans le domaine agronomique
SEMESTRE 6
UEF 1 :Physiologie nerveuse et endocrinienne intégrée
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie Nerveuse
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
11234-
Notions générales sur le système nerveux
Cytologie du neurone et des éléments cellulaires associes
Histologie et anatomie du système nerveux
Embryologie et développement
Culture in-vitro des neurones des cellules associées
2- Chimie du système nerveux
1- les constituants chimiques du système nerveux
2- les transmetteurs chimiques
- Le système cholinergique
- le système cathécol- indolamine
- Autres système de neurotransmission
3-Pharmacologie moléculaire et cellulaire des neurotransmetteurs
1- Electrophysiologie du système nerveux
2- Electrophysiologie du neurone
3- Electrophysiologie des structures cérébrales
4123456-
Bases moléculaires des comportements
Apprentissage et mémoires
Sommeil et vigilance
Agressivité
Douleur
Soif, faim et thermogenèse
Autres comportements
Travaux Pratiques


Mesure de l’activité électrique du système nerveux.
Organes des sens :
-
Audition et équilibration, Dissection, Orientation spatiale, Ondes acoustiques.
-
Vision : Dissection, Notion de champ visuel.
UEF 1 :Physiologie nerveuse et endocrinienne intégrée
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie endocrinienne intégrée
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I. Les grands principes du fonctionnement du système endocrinien
II. Les transducteurs neuroendocriniens
1. L'épiphyse
2. Le complexe hypothalamo-hypophysaire
III. Les glandes endocrines hypothalamo-hypophyso-dépendantes
1. La thyroïde
2. Les gonades (étudiées en physiologie de la reproduction)
3. La corticosurrénale
3.1. La zone glomerulée et les minéralocorticoïdes
3.2. La zone fasciculée et les glucocorticoïdes
3.3. La zone réticulée et les sexocorticoïdes
IV. Les glandes endocrines hypothalamo-hypophyso-Indépendantes
1. La médullosurrénale
2. Les parathyroïdes
3. Le pancréas endocrine
V. Le système endocrinien "diffus"
1. Les hormones gastrointestinales
2. Les facteurs de croissance
3. Les prostaglandines
4. Le "Coeur endocrine" : les hormones natriurétiques
5. Autres tissus endocrines: hormones thymiques et immuno-endocrinologie,
Cerveau endocrine et neurostéroïdes, etc...
VI. Immunoendocrinologie
Pour chaque chapitre seront rappelés l'anatomie, l'histologie et l'origine embryonnaire et seront
étudiées en détail la biochimie des hormones, leur biosynthèses, dégradation, actions physiologiques,
régulation, mécanisme d'action cellulaire et pathologie endocrinienne
Travaux Pratiques

Dosage des hormones ( ELISA).
UEF 2 : Biologie Cellulaire et Immunologie
VHG : 42 h
Cours : 21 h
TP/TD : 21 h
Coeff. : 02
Biologie Cellulaire
I. BIOMEMBRANE
1. Méthodes d'études
2. Compositions des membranes : Isolement, composition
- Glucides
- Lipides
- Protéines
- Récepteurs
3. Modèles membranaires
4. Transports membranaires
- Procaryotes
- Eucaryotes
II. RELATIONS : Structure - Fonction de la cellule
1. Biosynthèse des lipides et des protéines membranaires et des protéines de sécrétion
2. Cytosquelette; structure, synthèses et fonctions
3. Mécanisme de la division cellulaire et la différenciation
4. Energétique biochimique (synthèse de l'ATP)
5. Principes cellulaires de la défense immunitaire
6. Récepteurs et réception
7. Bases cellulaires de la conduction nerveuse et la transmission synaptique
8. La fibre musculaire et la contraction musculaire
III. REGULATION ET INTEGRATION
1. Croissance : étapes et développement, déterminisme et taille des cellules
2. Sénescence et mort cellulaire
Immunologie
1. Rappels sur la réponse immunitaire
1.1. Moelle osseuse
1.2. Thymus
1.3. Gonglions lymphatiques
1.4. Tissus lymphoïdes associés aux muqueuses (TLAM)
1.5. La rate
1.6. Cellules présentant l’antigène (CPA et autres)
2. Activation des lymphocytes (T et B)
3. Synthèse des anticorps et leurs diversité.
4. Immunité cellulaire.
4.1. Lymphocytes T auxiliaires et production des lymphokines.
4.2. Lymphocytes T cytotoxiques.
4.3. Récepteurs des lymphocytes T.
4.4. Phénomènes de la cytotoxicité.
5. Acquisition de la mémoire.
6. La spécialité de l’immunité acquise.
7. La vaccination.
8. Les hybridomes. Les anticorps monoclonaux.
9. Contrôle de la réponse immunitaire.
10. Développement du système immunitaire.
11. Immunité anti-infectieuse.
12. Immuno-pathologie.
12.1. Les maladies auto immunes.
12.2. Les états d’hyper sensibilité.(H.S.)
12.2.1. Les différents types d’HS (I, II, III et IV)
12.2.2. L’HS médicamenteuse.
12.3. Les déficits immunitaires.
13. les relations fonctionnelles entre SI et système neuroendocrinien.
14. Aspects moléculaires de la transplantation et rejet des greffes.
UEF 3 : Physiologie de la Reproduction et Génétique du Développement
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Physiologie de la Reproduction
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
 I. Physiologie des Gonades
1. Rappel sur la gamétogenèse
2. Hormones sexuelles (biochimie, biosynthèse, actions physiologiques, mécanismes d'actions)
3. Régulations neuroendocrines, endocrines, paracrines, autocrines, intracrines,...
4. Aspects endocriniens de la puberté et de la fertilité
 II. Fécondation - Nidation
 II. Gestation et Physiologie de la femelle gestante
 IV. Physiologie et endocrinologie foetale
- Bases génétiques et endocrines de la différenciation sexuelle
 V. Parturition
 VI. Lactation
 VII. Contraception
 VIII. Immuno-pharmacologie de la reproduction
1. Immunodéficience
2. Immunopathologie
Travaux Pratiques




Effet de la castration sur le tractus génital.
Etude de la fécondation chez les oursins.
Dosages des hormones sexuelles ELISA
Etudes des gonades et des gamètes
UEF 3 : Physiologie de la Reproduction et Génétique du Développement (Suite)
VHG : 84 h
Cours : 42 h
TP/TD : 42 h
Coeff. : 02
Génétique du Développement
VHG : 42 h
Cours : 1 h30
TP/TD : 03 h
Coeff. : 02
I-
abcdeII-
abcde-
Expression du plan du développement chez l’embryon de drosophile
Organisation de l’embryon (axe antéro-postérieur)
Organisation de l’embryon (axe dorso-ventral)
Les gènes de segmentation
Les gènes sélecteurs homéotiques
Différenciation d’un tissu ou d’une ébauche Génétiquement programmé
Les gènes régulateurs dans le développement des vertèbres
Les gènes sélecteurs homéotiques dans la différenciation antéro-postérieure du corps
Expression de plusieurs gènes homéotiques
Modification du domaine d’expression d’un gène modifie l’identité de l’organe
Les gènes régulateurs homéotiques dans la différenciation
Autres gènes organisateurs.
IIIIV-
abcde-
Induction embryologique pendant la gastrulation et la morphogenèse
Expression du génome embryonnaire
Evolution de la population d’ARNm de l’ovocyte à la larve.
Synthèse d’ARNm nouveaux et différenciation.
Effet régulateur du cytoplasme sur l’expression du gène.
Clonage par transplantation du noyau
Cellules souches embryonnaires.
UED 1 : BIO-INFORMATIQUE
VHG : 63 h
Cours : 21 h
TP/TD: 42 h
Coeff. : 01
Chapitre I Les banques de séquençage.
1. Historique.
2. Les banques générales.
2.1. Qualité de données.
3. Les banques spécialisées.
3.1. Le bases de motifs.
3.1.1 Les bases de motifs nucléiques.
3.1.2 Les bases de motifs protéiques.
4. La diffusion et l’utilisation des banques de données
4.1. La diffusion.
4.2. L’intégration.
4.2.1. Les systèmes dédiés.
4.2.2. Les systèmes de gestion des bases de données.
Chapitre II La recherche de similitude entre les séquences biologiques.
1. Les systèmes de score.
1.1. Le principe et détermination d’un score.
1.2. Les matrices nucléaires.
1.3. Les matrices protéiques.
1.3.1. Les matrices protéiques liées à l’évolution.
1.3.2. Les matrices protéiques liées aux caractéristiques physico-chimique..
1.3.3. Le choix d’une matrice.
2. Les algorithmes et les programmes de comparaison de séquences.
2.1. Les principes de bases.
2.1.1. L’identité, la similitude et l’alignement
2.1.2. La recherche de segments similaires.
2.1.3. La recherche d’alignement optimal.
2.1.4. La recherche de segments identiques..
2.2. L’évaluation des résultats.
2.2.1 .Les méthodes pratique et empiriques.
2.2.2. Les méthodes d’analyse de Mont Carlo.
2.3. Les programmes de comparaison avec les banques de séquence.
2.3.1. Le programme FASTA.
2.3.2. Le programme BLAST
2.3.3. La disponibilité des programme à travers les réseaux informatiques
2.4. Le programme de recherche de motifs.
2.4.1. Les différents types de motifs.
2.4.2. La définition de motif.
2.4.5. Les algorithmes de recherche de motifs.
TP Bioinformatique
1-Les centres de ressources en bioinformatique
2-Introduction aux bases de données biologiques
3-Outils de biologie moléculaire ('bioinfo de labo') Comparaison de 2 séquences
4-Recherche dans les banques par similarité de séquence
5-Alignements multiples de séquences
6-Recherche de domaines conservés
7-Structures II et motifs de repliements des protéines
8-Structure III des protéines
9-Analyse 'in silico' d'une séquence inconnue
UED 2 : ANGLAIS SCIENTIFIQUE.
TD :21 H
Crédits : 2
1)
2)
3)
4)
5)
6)
7)
La forme active et passive
Le passe simple
Passe avec ses différentes formes
Présent avec différentes formes
Traduction de texte scientifique
Rédaction de sujet scientifique
Traduction de l’orale a l’écrit