Analyse scientifique de la recherche sur le virus variolique, 1999-2010

ALERTE ET ACTION
AU NIVEAU MONDIAL
WHO/HSE/GAR/BDP/2010.3
Analyse scientifique de la
recherche sur le virus variolique,
1999-2010
Décembre 2010

Analyse scientifique de la
recherche sur le virus variolique,
1999-2010
Décembre 2010

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Remerciements
L’OMS remercie tous ceux qui ont participé à la rédaction du présent document, à savoir :
Responsables de la rédaction
Ali S. Khan
Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, États-Unis d’Amérique
Geoffrey L. Smith
Imperial College London, Royaume-Uni de Grande-Bretagne et d’Irlande du Nord
Auteurs
Antonio Alcami, Inger Damon, David Evans, John W. Huggins, Christine Hughes, Peter B. Jahrling,
Grant McFadden, Hermann Meyer, Bernard Moss, Sergei Shchelkunov, Evgeny Stavskiy, Nina Tikunova
Secrétariat de l’OMS
Pierre Formenty, Daniel Lavanchy

iii
Table des matières
Historique ............................................................................................................................... vii
1. Les vaccins antivarioliques......................................................................................... 1
Résumé d’orientation...................................................................................................... 2
1.1 Introduction ....................................................................................................... 3
1.2 Historique de la vaccination antivariolique........................................................ 3
1.3 Le Programme mondial d’éradication de la variole lancé par l’OMS ................ 4
1.4 Origine du virus de la vaccine........................................................................... 5
1.5 Le vaccin utilisé pour éradiquer la variole......................................................... 6
1.6 Culture tissulaire et vaccins antivarioliques clonaux......................................... 7
1.7 Vaccins antivarioliques atténués par passage en culture tissulaire ou par
recombinaison génétique.................................................................................. 7
1.8 Vaccins antivarioliques constitués de sous-unités protéiques ou d’ADN.......... 9
1.9 Vaccination après exposition ............................................................................ 9
1.10 Les futurs enjeux de la vaccination antivariolique............................................. 9
Abréviations.................................................................................................................... 11
Références bibliographiques .......................................................................................... 12
2. Tests pour le diagnostic de la variole (virus variolique) au laboratoire.................. 15
Résumé d’orientation...................................................................................................... 16
2.1 Introduction ....................................................................................................... 17
2.2 Collecte et manipulation des échantillons......................................................... 17
2.3 Isolement du virus............................................................................................. 19
2.4 Microscopie électronique .................................................................................. 19
2.5 Tests de diagnostic basés sur l’examen du génome ou d’éléments du
génome............................................................................................................. 20
2.5.1 Les travaux sur l’ADN du virus variolique ........................................... 20
2.5.2 Polymorphisme de longueur des fragments de restriction.................. 21
2.5.3 Amplification génique (PCR)............................................................... 21
2.5.4 Amplification génique – polymorphisme de longueur des fragments
de restriction ....................................................................................... 22
2.5.5 PCR en temps réel.............................................................................. 22
2.5.6 Analyse avec des micropuces à oligonucléotides............................... 26
2.5.7 Séquençage........................................................................................ 27
2.6 Tests de diagnostic basés sur les protéines..................................................... 28
2.7 Tests de diagnostic basés sur la sérologie....................................................... 28
2.8 Quelques réflexions en guise de synthèse ....................................................... 29
Abréviations.................................................................................................................... 31
Références bibliographiques .......................................................................................... 32

iv Analyse scientifique de la recherche sur le virus variolique, 1999-2010
3. Génomique de la variole.............................................................................................. 35
Résumé d’orientation...................................................................................................... 36
3.1 Le génome du virus variolique.......................................................................... 37
3.2 L’évolution de la variole .................................................................................... 41
3.3 Technologies portant sur le génome des poxvirus ........................................... 42
3.4 Lignes directrices applicables au génome des virus varioliques ...................... 43
Abréviations.................................................................................................................... 48
Références bibliographiques .......................................................................................... 49
4. La situation des conservatoires de virus variolique et d’ADN viral des centres
collaborateurs de l’OMS............................................................................................... 53
Résumé d’orientation...................................................................................................... 54
4.1 Introduction ....................................................................................................... 55
4.2 La situation des conservatoires de souches de virus variolique et d’acide
nucléique viral établis au centre collaborateur OMS de la Fédération
de Russie.......................................................................................................... 55
4.2.1 L’état de la collection de souches de virus variolique et de son
conservatoire ...................................................................................... 55
4.2.2 L’état de la collection d’ADN du virus variolique détenue par le
VECTOR et de son conservatoire....................................................... 61
4.3 La situation des conservatoires de souches du virus variolique et d’acide
nucléique viral établis au centre collaborateur OMS des États-Unis ................ 68
Abréviations.................................................................................................................... 83
Références bibliographiques .......................................................................................... 84
5. Modèles animaux et pathogenèse .............................................................................. 85
Résumé d’orientation...................................................................................................... 86
5.1 Introduction ....................................................................................................... 87
5.2 Modèles animaux.............................................................................................. 87
5.3 Conclusions ...................................................................................................... 96
Abréviations.................................................................................................................... 97
Références bibliographiques .......................................................................................... 98
6. La mise au point d’antiviraux pour le traitement de la variole – la situation des
agents thérapeutiques constitués de petites molécules.......................................... 103
Résumé d’orientation...................................................................................................... 104
6.1 Introduction ....................................................................................................... 106
6.2 Recherche de médicaments ............................................................................. 108
6.2.1 Les thiosemicarbazones ..................................................................... 108
6.2.2 Évaluation des nouveaux médicaments autorisés ou expérimentaux 108
6.2.3 Phosphonates nucléosidiques acycliques .......................................... 109
6.2.4 Inhibiteurs de l’inosine monophosphate déshydrogénase.................. 109
6.2.5 Inhibiteurs de la S-adénosylhomocystéine hydrolase......................... 110
6.2.6 Inhibiteurs de l’orotidine-5’-monophosphate décarboxylase............... 110
6.2.7 Inhibiteurs de la thymidylate synthétase ............................................. 110
6.2.8 Composés qui entravent le processus d’assemblage du virus ........... 110