5V809 - Master BMC
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Intitulé de l’UE : BIOLOGIE DES SYSTEMES CELLULAIRES Code de l’UE : 5V809 Responsable de l’UE : Secrétariat : Frédéric DEVAUX, Professeur Mel : [email protected] Denis THIEFFRY, Professeur ENS Mel : [email protected] Carine Joseph / Marie EMBS Tél. : 01 44 27 34 36 / 01 44 32 37 40 Mel : [email protected] / [email protected] 1. Descriptif de l’UE Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage autre…) : 120 h (60 h CM + 60 h TD/TP) Nombre de crédits de l’UE : 12 ECTS Mention et Parcours de Master où l’UE est proposée : Mention "Biologie Moléculaire & Cellulaire", Parcours "Biochimie & Biologie moléculaire", "Bioinformatique & Modélisation", "Biologie cellulaire, Développement & Cellules souches", "Génétique et Epigénétique" et "Immunologie" Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 3 du Master Effectifs prévus : 15 2. Présentation pédagogique de l’UE a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement La biologie des systèmes élabore de nouveaux modèles quantitatifs permettant de comprendre l’organisation et le fonctionnement du vivant. Ce cours, organisé à l’ENS Paris en partenariat avec l’UPMC, a pour objectif de former les étudiants aux concepts et aux techniques de la biologie des systèmes appliquée aux grandes questions de la biologie cellulaire contemporaine. Il aborde ces questions selon plusieurs échelles d’analyse, de l’étude du comportement de molécules uniques in vivo jusqu’à l’analyse de réseaux d’interactions physiques et génétiques à l’échelle cellulaire, et, dans une perspective multidisciplinaire, de l’analyse expérimentale à très haut débit à la modélisation in silico du fonctionnement cellulaire normal et pathologique. b) Thèmes abordés L’enseignement est orienté selon deux axes : • Analyses globales et modélisation des réseaux génétiques : cette partie aborde tous les aspects d’analyse expérimentale et de modélisation in silico du fonctionnement des réseaux de régulation dans la cellule. Les cours traiteront des approches expérimentales d’analyse très haut débit des réseaux cellulaires ainsi que de l’analyse quantitative de petits réseaux, des méthodes in silico de reconstruction de la structure et de l’évolution des réseaux de régulation ainsi que les méthodes de modélisation dynamique du fonctionnement de petits réseaux. • De la molécule unique à la dynamique des ultrastructures cellulaires : cette partie traite de toutes les méthodes d’investigation du fonctionnement cellulaire associées à l’imagerie et à la manipulation et l’observation de molécules uniques in vivo et ex vivo. Les thèmes abordés comprendront des notions techniques et théoriques en microscopie optique, l’imagerie des acides nucléiques et de leur métabolisme (organisation fonctionnelle du noyau, dissection d’activités enzymatiques liées à l’épissage et à la transcription in vivo) ainsi que l’imagerie neuronale et l’étude des récepteurs membranaires (dynamique des récepteurs synaptiques, transport et interactions protéiques dans les neurones, …). c) Organisation pédagogique Chacun des axes est couvert par plusieurs cours abordant différents aspects. Les étudiants doivent choisir parmi ces cours. Le détail des cours proposés est disponible sur le site : http://www.gradprog.biologie.ens.fr/spip.php?rubrique11&lang=en. Pratiquement tous les cours sont couplés à une partie TD/TP qui permet aux étudiants de mettre en pratique les notions théoriques abordées. La majorité des cours est en anglais. d) Pré-requis Aucun pré-requis n'est exigé pour suivre cette unité d'enseignement. 3. Equipe pédagogique Animateurs de l’équipe : F. Devaux et D. Thieffry. Cours Magistraux / Travaux Dirigés / Travaux Pratiques : P. Charnay, F. Devaux, M.A. Félix, S. Le Crom, H. Roest-Crollius, D. Thieffry et Morgane Thomas-Chollier.
