Spécialité : Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire

ULP - Mention Vie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire
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Université Louis Pasteur
Mention : Vie et Santé
Spécialité :
Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire
Plan 1
Porteurs du projet et Objectifs, Compétences à acquérir, 2
Insertion des étudiants 3
M2, Débouchés, Admissions de Droit 5
Pré-requis, validation M1, admissions M2 6
Effectifs prévisibles 7
Liste des Laboratoires 8
Modalités, innovations pédagogiques 10
Partenariats - passerelles 12
Dispositif d’évaluation 13
Semestre 1 14
Semestre 2 38
Semestre 3 43
Semestre 4 53
Evaluation de la charge d’enseignement 55
Annexe 1 - Liste des enseignants-chercheurs et chercheurs
participant aux enseignements magistraux et pratiques 56
Annexe 2 - Programmes des Enseignements modulaires 83
Annexe 3 - Réponse à l’évaluation de la CEPPE de Février 2005 92
Annexe 4 – Plaquette d’information sur la spécialité PCM 93

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MASTER DE SCIENCES MENTION Vie et Santé………………………….
SPECIALITE : Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire
Recherche : OUI Professionnelle : NON
Porteurs de la spécialité :
Nom et Prénom : Bahram Seiamak Qualité : PU-PH
Section CNU : 47 03 et/ou section comité national CNRS : ou Commission spécialisée INSERM : 2
Unité de recherche : Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de
Médecine, INSERM-CRES, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex.
Tél. : [phone] Fax : [phone] E-mail : [email protected]
Nom et Prénom : Prévost Gilles Qualité : MCU-PH, HDR
Section CNU : 45 01 et/ou section comité national CNRS : ou Commission spécialisée INSERM :
Unité de recherche : UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine, 3 rue
Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Fax : [phone]
Tél. : [phone] E-mail : [e-mail]
Objectifs :
Des équipes de recherche pour une grande part dans la Fédération de Recherche de la Faculté
de Médecine de Strasbourg participent à la mise en évidence de l’histoire naturelle des maladies dans
son échelle cellulaire et moléculaire, au développement du diagnostic et à la conceptualisation de
nouvelles thérapeutiques. Elles développent souvent plusieurs axes complémentaires dans leurs
thèmes de recherche. Pour aboutir aux connaissances et développer des applications, les
investigations sont souvent multidisciplinaires et mettent en oeuvre différentes approches
analytiques ou constructives. Ces équipes de recherche obtiennent donc un bénéfice réel
lorsqu’elles peuvent rassembler des chercheurs interdisciplinaires aux compétences multiples
tout en restant des collaborateurs privilégiés du secteur clinique. Ce sont ces intrications disciplinaires
que souhaite développer la spécialité de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire, afin de
constituer un point de nucléation pour une formation scientifique à visée médicale et pour les
différents services cliniques qui devront pérenniser les carrières hospitalo-universitaires, hospitalières
et scientifiques. Elle propose une formation solide dans des domaines disciplinaires importants en
lien avec de nombreuses préoccupations de la Santé Humaine. Cette formation vise également à
des échanges plus nombreux entre les laboratoires concernés et escompte que les étudiants auront
au travers de leur formation pluridisciplinaire, une vision précise et dynamique des possibilités de
recherche et des technologies présentes et accessibles dans cette Fédération. La spécialité
Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire est également soutenue par plusieurs équipes de l’ULP et
d’Universités étrangères.
Compétences à acquérir et débouchés (insertion professionnelle) :
Compétences à acquérir
La spécialité de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire propose aux étudiants
médecins, pharmaciens, dentistes (MPD dans le texte) et scientifiques un enseignement
modulaire et disciplinaire à la carte, soit de 2 modules pour les médecins, pharmaciens et
dentistes, et de 3 modules pour les scientifiques au choix parmi 5 proposés : Biologie et
Médecine de la Reproduction, Cancérologie, Génétique Humaine, Immunologie, Microbiologie
Médicale. Les parcours internes comprennent des modules disciplinaires complétés des Travaux
Dirigés et Pratiques en laboratoire et des conférences. Par ailleurs, ils s’appuient sur des
enseignements au choix de type fondamental (Stratégie de recherche en biologie cellulaire,
transcription-réplication, biologie du développement). Les différents enseignements sont répartis sur
les trois premiers semestres et créent des liens transversaux avec d’autres spécialités comme la
Biologie Cellulaire Intégrée et la Biologie Moléculaire et Structurale. Il ne peut, cependant s’agir de
parcours en Y vis à vis des spécialités citées avec lesquelles un réel effort de partage d’enseignement
est envisagé, tant l’ensemble des bases obligatoires ainsi que les finalités sont différentes.
Cette spécialité est appelée à former des étudiants pouvant s’inscrire en doctorat à l’Ecole Doctorale
des Sciences de la Vie et de la Santé de Strasbourg : http://www-ed-sdvs.u-strasbg.fr/site/reglement.html

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Insertion des étudiants - M1. Les enseignements modulaires à la carte se déclinent
par environ 50 heures de cours . magistraux et 40 heures de TP-TD par module. Les cours magistraux
des modules sont non seulement orientés vers des connaissances disciplinaires, mais intègrent aussi
des connaissances fondamentales et les technologies utilisées pour mettre en évidence certains des
phénomènes décrits. Les formations pratiques sont réalisées dans les laboratoires s’affichant sur
des thèmes techniques prédéfinis. Ces formations pratiques ont déjà eu cours pour les MSBM ; elles
permettent aux étudiants d’appliquer individuellement des techniques actuelles en utilisant parfois
des appareillages rarement mis en place dans les salles de travaux pratiques (purification automatisée
de protéines, cytométrie en flux, amplification en temps réel, laboratoire P3, cultures cellulaires,...) et
de se familiariser avec les nécessaires contraintes de manipulation. D’autre part, dans ces formations
et dès M1, les étudiants sont amenés à être en contact avec différentes équipes de recherche.
Cela constitue une mise en situation concrète dans le monde de la recherche et une ouverture
professionnelle. Pour soutenir les enseignements fondamentaux, disciplinaires et pratiques, des
travaux dirigés sensibilisent les étudiant aux technologies de la biologie moléculaire et la manipulation
de banques de données et de logiciels spécialisés. Des travaux de communication sont également
demandés.
Cas des étudiants MPD
Les étudiants médecins, pharmaciens et dentistes (MPD) devront valider au moins 30 crédits de
la spécialité pour la première année du Master (M1), soit 2 modules à la carte sur les cinq proposés,
de deux « Travail d’Etudes et de Recherche » et de 6 crédits de Langues. Les 30 autres crédits seront
acquis après la validation de la sixième année (DCEM-4) des formations en Médecine ou Odontologie
(DCEO3) et de la cinquième année de la formation en Pharmacie. Les crédits de langues seront
néanmoins validables en Master ou en Médecine – Pharmacie – Odontologie.
La liste des groupes de deux modules à la carte pour la validation de M1 par les
étudiants MPD est la suivante :
Immunologie et Microbiologie Médicale ou
Cancérologie et Génétique humaine ou
Cancérologie et Immunologie ou
Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction ou
Génétique humaine et Immunologie ou
Cancérologie et Microbiologie Médicale ou
Biologie et Médecine de la Reproduction et Cancérologie
Les étudiants MPD pourront valider au moins un module au cours d’une année
universitaire, mais pourront utiliser deux semestres pour valider les cours magistraux et le
stage pratique en laboratoire d’un module. Les 30 crédits d’enseignements (CE) pourront donc
être validés en trois années au moins à partir du DCEM 1 pour les médecins ou équivalent pour
les dentistes, et à partir de la troisième année de la formation en Pharmacie. Les
enseignements spécifiques des formations médicale, pharmaceutique et odontologique
donneront équivalence à 30 crédits (15 par semestre de M1) auxquels pourra s’ajouter un
maximum de 6 crédits de langues, à l’issue des trois années de spécialisation de second cycle.
Exemple de deux types de validations de M1, pour des étudiants médecins :
I)
Année 1 (DCEM 2) Année 2 (DCEM 3) Année 3 (DCEM 4)
Semestre 1
CM Module 1
6 CE
Semestre 2
TP
Module 1
3 CE
Langues 3
CE
S1
TER I,
Langues
3 + 3 CE
S2
TER II
ou IIII
3 CE
S1
CM Module 2
6 CE
S2
TP
Module 2
3 CE
II)
Année 1 (DCEM 2) Année 2 (DCEM 3) Année 3 (DCEM 4)
Semestre 1
CM.Module
1 - 6 CE
TP Module1
3 CE
S2
TER
II ou
IIII
3 CE
S1
Langues
3 CE
S2
CM Module 2
6 CE
TP
Module2
3 CE
S1
TER I,
3 CE
S2
Langues
3 CE

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Afin que l’ensemble des étudiants puissent trouver une souplesse de choix horaires des
enseignements modulaires ou puissent valider les CM de 4 des modules à la carte, il nous parait
opportun d’inscrire les CM des mêmes modules en option (6 crédits de CM seront alors concernés).
Pour les étudiants MPD, les cours magistraux nécessiteront quatre heures de temps présentiel
hebdomadaire aux premier (1 module) et/ou second semestres. Les TER nécessiteront deux heures
de disponibilité hebdomadaire sur deux semestres d’une quelconque année où ils suivront cette
formation. Ces cours seront dispensés soit à partir de 16h00 deux fois par semaine, soit sur une
après-midi. Une rotation horaire bisannuelle des modules enseignés chaque semestre sera mise en
place par semestre, afin d’assurer leur accès à tous les étudiants. Les modules de Biologie et
Médecine de la Reproduction et de Microbiologie Médicale seront enseignés simultanément, car ils
ont peu d’intérêts scientifique en commun. Les autres modules seront enseignés chacun à des
horaires différents pour permettre leur accès aux étudiants scientifiques. Les mêmes modules sont
affichés en option, afin que les étudiants puissent validés plus de trois modules ou bien qu’après le jeu
de compensations (option --> module), ils puissent valider des options lors du (second) semestre où
elles sont ouvertes. Par ailleurs, pour l’année M1, les crédits de langue (6 crédits maximum)
seront validés s’ils ont été suivis, tout ou partie, au cours des formations en Médecine,
Pharmacie, Odontologie ou bien durant le cursus Master. Enfin, les stages pratiques (TP, TD-
TP) validés dans les enseignements de Master (6 crédits) pourront être valorisés au titre des
stages d’initiation en laboratoire de DCEM-3, voire des stages de Biologie de la filière Internat
de la formation pharmaceutique. Les titulaires d'unité d'enseignement/ou de modules obtenus
durant le Master pourront bénéficier de la dispense d'un enseignement complémentaire (afférent au
DCEM1 pour Médecine) ou d'un enseignement optionnel (pour les DCEM2, DCEM3 ou DCEM4) selon
les dispositions prises par les conseils d'UFR.
Cas des étudiants scientifiques
Les étudiants scientifiques devront valider un parcours de 60 crédits, et choisir trois
modules sur les cinq au cours de l’année M1. Sept parcours à la carte seront proposés pour
l’année M1 aux étudiants scientifiques :
Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction et Cancérologie ou
Génétique humaine et Cancérologie et Immunologie ou
Cancérologie et Immunologie et Microbiologie Médicale ou
Génétique humaine et Microbiologie Médicale et Immunologie ou
Immunologie et Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction ou
Immunologie et Cancérologie et Biologie et Médecine de la Reproduction ou
Génétique humaine et Cancérologie et Microbiologie Médicale
Les enseignements sont prévus selon le schéma général suivant :
M 1 – semestre 1 semestre 2
CM Module 1 6 CE
TP Module1 3 CE
Ens. Fond. I 3 CE
Histo TD/TP 3 CE
TER I 3 CE
Option 6 CE
Ens. Libre 3 CE
Langues 3 CE
Total = 30 CE
CM Module 2 6 CE
TP Module 2 3 CE
CM Module 3 6 CE
TP Module 3 3 CE
TER II 3 CE
TER III 3 CE
Ens. Libre 3 CE
Langues 3 CE
Total = 30 CE
NB : Pour les enseignements fondamentaux partagés avec les spécialités de Biologie Cellulaire
Intégrée et de Biologie Moléculaire et Structurale lors du premier semestre de M1, les étudiants
scientifiques devront suivre les cours à des horaires correspondant à leur disponibilité.
M2. Le contenu d’enseignement au cours de l’année M2 sera le même pour l’ensemble des
étudiants. Il comportera un module d’Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule (3 CE) et
un suivant axé les méthodes d’investigation des fonctions cellulaires en imagerie (Histologie
fonctionnelle, 3 crédits), deux séries de conférences portant sur des Questions d’actualité en
Biologie Cellulaire (3 CE) et en Physiopathologie (9 CE). Les 12 autres crédits d’enseignement à
valider au 3ème semestre seront partagés entre divers enseignements concernant la sécurité en
laboratoire, la qualité, la propriété intellectuelle, les profils de carrière et la gestion des projets
scientifiques, mais aussi la préparation du stage du semestre 4. Le stage du 4ème semestre est
consacré à la recherche dans une équipe d’accueil et à la préparation d’un rapport de stage. La
préparation d’un séminaire par l’étudiant pourra lui être demandé.

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Débouchés
Les débouchés concernent les carrières de chercheurs à part entière et aussi celles
d’enseignants-chercheurs universitaires et hospitalo-universitaires, et de praticiens
hospitaliers, qui doivent également passer des concours sur dossier pour accéder aux postes. Les
carrières dans les départements Recherche et Développement du secteur industriel sont aussi des
débouchés à ce type de formation dès M2 ou à l’issue d’un Doctorat. La possibilité d’une
spécialisation polyvalente pour les étudiants parait constituer un atout important pour une
insertion future dans le monde professionnel.
Un Cancéropôle a été mis en place à Strasbourg à partir de l’été 2003, et il sera pérennisé par
l’Institut National du Cancer durant l’année 2004. . De plus un projet ambitieux est sur le point de
naître sur le campus médical Strasbourgeois. Il s’agit de l’IRBS (Institut de Recherche Biomédical
de Strasbourg) qui fédérera à terme (2007) sur un même emplacement géographique (Campus
Médecine : Faculté de Médecine et Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg) la majorité de la recherche
biomédicale Strasbourgeoise. Ceci est clairement acté dans le Plan Quadriennal 2005-2008 et dans
les CPER (Contrat Plan Etat-Région) actuel et futur. L’IRBS sera centré sur les thèmatiques
suivantes : l’infection, l’immunologie et la génétique humaine, les maladies inflammatoires, cancer et
neurosciences. Une fraction importante des laboratoires constitutifs de l’IRBS supportera la présente
spécialité.
Il s’agit d’une formation à la recherche tant fondamentale qu’appliquée, ayant une double visée
diagnostique et thérapeutique dans de nombreux domaines de la Santé. Elle pourrait être attractive
sur le Grand Est français, d’ores et déjà deux universités européennes acceptent d’être partenaires.
Enfin, avec la formation M1, les étudiants pourront acquérir des bases solides en biologie
cellulaire – biochimie, en microbiologie, et quelques éléments de physiologie. Ainsi, cette spécialité
peut aussi constituer un tremplin intéressant vers la préparation aux concours CAPET – Agrégation
des Professeurs de Biotechnologies.
Admission de droit à l’inscription aux 60 premiers crédits de master pour les étudiants
titulaires des diplômes suivants obtenus à l’ULP* :
Plusieurs catégories d’étudiants pourront s’inscrire en M1 dans cette spécialité de Master :
les étudiants en Sciences de la Vie pourront s’inscrire après avoir validé une :
Licence de Biochimie ou
Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire et Physiologie à l’Université Louis Pasteur
(ancien système)
Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie ou une
Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire. (LMD – ULP)
ou Licence jugée équivalente dans une autre université par la Commission Pédagogique*.
Les étudiants en Médecine pourront s’inscrire après avoir totalement validé leur année de
PCEM2 et pourront valider cette année M1 sur trois années, soit jusqu’au DCEM4 inclus.
Les étudiants en Odontologie pourront s’inscrire après avoir totalement validé leur première
année de spécialisation vers la formation en Chirurgie Dentaire (PCEO2) et pourront valider cette
année M1 sur trois années.
Les étudiants en Pharmacie pourront s’inscrire après avoir validé leur seconde année d’étude
en Pharmacie et pourront valider cette année M1 sur deux ou trois années.*
* Pour les autres étudiants, l’admission se fera sur examen du dossier par la commission pédagogique
Pré-requis (connaissances et compétences) recommandées pour l’admission en master. Précisez les pré-
requis pour chaque année de master :
La spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire requiert des connaissances
sérieuses en Biologie. La Biologie Moléculaire et la Biologie Cellulaire représentent des
éléments fondamentaux de cette filière. Des notions de biochimie, physiologie et un intérêt en
pathologie sont également importants. En fonction d’une expérience préalable et/ou d’affinités