IV – LES MODALITÉS D’APPARITION DES MUTATIONS Il existe 3 événements à l’origine des mutations : - Les erreurs de la réplication - La modification chimique des bases nucléiques - Les lésions de l’ADN IV-1- Les erreurs de la réplication Rappel du mécanisme de la réplication L’ADN est normalement dupliquée fidèlement par reproduction conforme = fidélité de la réplication Chaque brin de la molécule d’ADN sert de matrice pour la synthèse d’un nouveau brin complémentaire. Dans chaque molécule fille d’ADN, un brin provient de la molécule mère et l’autre est nouvellement synthétisé. Ainsi la réplication fournit 2 molécules d’ADN identiques entre elles et identiques à la molécule mère. La fidélité de la réplication est assurée par la règle de complémentarité des bases, la dynamique des liaisons hydrogènes et l’appariement des bases nucléotidiques par les ADN polymérases. Fidélité de la réplication de l’ADN molécules filles T – G – C – T – A brin parental A – C – G – A - T brin néosynthétisé Molécule mère T–G–C–T–A A–C–G –A–T T – G – C – T – A brin néosynthétisé A – C – G – A – T brin parental Malgré toutes les exigences qui entourent l’appariement des nucléotides, des erreurs peuvent se produire naturellement au cours de la réplication On distingue 2 types d’erreurs : - Les mésappariements - Le dérapage réplicatif IV-1-1- Les mésappariements C’est quand une base qui ne satisfait pas à la règle de complémentarité des bases est incorporée dans le brin d’ADN en formation au cours de la réplication Mésappariement et correction des épreuves Le dernier nucléotide incorporé ne satisfait pas à la règle de complémentarité des bases (= nucléotide illégitime). L’enzyme excise ce nucléotide et libère l’extrémité 3’-OH pour recevoir un nouveau nucléotide (c’est la dépolymérisation qui se fait dans le sens 3’ 5’) = correction des épreuves Bien que les principales ADN polymérase qui interviennent dans la réplication possèdent une activité de correction des épreuves, certains mésappariements échappent à cette correction. Des bases se trouvent donc incorrectement insérer dans le brin d’ADN en formation conduisant à une mutation (substitution) Exemple de mutation due à un mésappariement T-G-C-T-A-T-G-A Type A-C-G-A-T-A-C-T sauvage T-G-C-T-A-T-G-A A-C-G-A-C-A-C-T T-G-C-T-G-T-G-A Type A-C-G-A-C-A-C-T mutant T-G-C-T-A-T-G-A A-C-G-A-T-A-C-T erreur Type sauvage T-G-C-T-A-T-G-A A-C-G-A-T-A-C-T Type sauvage Première réplication Deuxième réplication IV-1-2- Le dérapage réplicatif Le dérapage réplicatif c’est le glissement pendant la réplication d’une séquence répétée sur l’autre formant une boucle. Elle concerne des séquence courtes de 1 base ou plus. Séquence répétée d’une base le brin néosynthétisé devient brin matrice et donne naissance à un brin portant une délétion le brin néosynthétisé devient brin matrice et donne naissance à un brin portant une insertion réalignement Réplication suivante Séquence répétée de 3 bases (CAG)6 réalignement I Insertion CAG : (CAG)7 Délétion CAG : (CAG)5 La correction d’un tel dérapage se fait par un réalignement de la boucle avant que la synthèse continue. En absence de correction il y a délétion ou insertion : - Si le brin matrice dérape et forme une boucle avec la séquence répétitive il entraine une délétion. - Si le brin complémentaire dérape et forme une boucle avec la séquence répétitive il entraine une insertion. IV-2- Les modifications chimiques des bases nucléiques 4 situations qui peuvent se produire spontanément ou sous l’action d’agents mutagènes a- La tautomérisation b- Les désaminations c- Les alkylations d- La dépurination a- La tautomérisation Toutes les bases qui composent la molécule d’ADN peuvent se présenter sous divers formes = formes tautomères : - La forme cétone qui est la forme habituelle de l’ADN - La forme imino (rare) -La forme énol (rare) La tautomérisation est le passage d’une forme à une autre forme La mutation par tautomérisation a pour origine le fait que les forme imino et énol n’établissent pas les mêmes associations préférentielles que les formes cétones (la règle de complémentarité des bases n’est pas respectée). Ainsi la forme imino de la cytosine s’apparie avec l’adénine et la forme énol de la thymine s’apparie avec la guanine. De même l’adénine sous forme imino s’apparie avec la cytosine et la guanine sous forme énol s’apparie avec la thymine. Ces mauvais appariements s’ils ne sont pas corrigées mènent à des mutations. Exemple de mutation par tautomérisation (a) Une guanine subit un changement tautomérique vers sa forme énol (rare) lors de la réplication. (b) Dans sa forme énol la guanine s’apparie avec la thymine. (c et d) Lors de la réplication suivante, la guanine revient à sa forme cétone plus stable. La thymine incorporée face à la forme énol de la guanine entraine l’incorporation d’une adénine (en face de la thymine) à la réplication suivante, que l’on voit en (d). Le résultat est une substitution de G-C en A-T. b- La désamination C’est la perte d’un groupement amine Désamination Adénine Cytosine Guanine Changement d’appariement A-T H-C Uracile C-G U-A Xanthine G-C X-C Hypoxanthine H-C H-C A-T GC H-T A-T A-T A-T transition c- L’alkylation Addition de groupements alkyl à des bases de l’ADN d- La dépurination C’est la perte de bases puriques à la suite de la rupture de la liaison Glycosidique entre la base et le désoxyribose Un nucléotide avec une base (A) est incorporé en face du site apurique dans le brin néosynthétisé A la réplication suivante, le brin néosynthétisé devient matrice et conduit à une mutation Un nucléotide est incorporé en face du site apurique dans le brin néosynthétisé IV-3- Les lésions de l’ADN L’interaction d’agents physiques ou chimiques (voir plus loin) avec le matériel génétique conduit à des lésions de l’ADN, qui si elles ne sont pas réparées fidèlement entrainent l’apparition de mutations. Les dimères de pyrimidine constitue les principales lésions sur l’ADN par les rayons UV. Les dimères de pyrimidine sont le résultat d’une liaison covalente entre 2 pyrimidines sur un même brin. Forte courbure de l’ADN avec des répercussions sur la transcription et la réplication V- LES FACTEURS DE VARIATION DES TAUX DE MUTATIONS 2 types de facteurs Facteurs extrinsèques Facteurs intrinsèques V-1- Les facteurs extrinsèques Ce sont des facteurs environnementaux qui peuvent avoir pour effet de diminuer ou d’augmenter le taux de mutations. Il existe peu de produits capable de diminuer le taux de mutations. On sait que certains antioxydants limitent la fréquence des mutations en particulier au niveau de l’ADN mitochondriale. En revanche beaucoup de produits peuvent augmenter le taux de mutations. On les appelle des mutagènes ou des agents mutagènes. On distingue deux grandes catégories : - Les mutagènes chimiques - Les radiations Par définition un mutagène ou un agent mutagène est un agent naturel ou résultant de l’activité humaine, physique ou chimique, qui peut altérer la structure de l’ADN. La plupart des phénomènes à l’origine des mutations (alkylation, tautomérisation, désamination…) peuvent se produire spontanément, mais peuvent aussi être provoqués par l’action d’agents mutagènes. Ces agents mutagènes augmentent globalement le nombre de mutations. En effet malgré l’existence de mécanismes de réparation, le nombre de changements qui apparaissent dans la séquence d’ADN est très élevé et de ce fait toutes les erreurs ne sont pas réparées. V-1-1- Les mutagènes chimiques a- les analogues de bases b- les agents intercalants c- les agents alkylants (methylmethane sulfonate ) d- les agents désaminants (acide nitrique) etc. …………………………. a- Les analogues de bases Ce sont des composés dont la structure chimique rappelle les purines et le pyrimidines et qui peuvent être incorporé à leur place dans la molécule d’ADN lors de la réplication et entrainer une mutation. Exemple : le 5-bromouracile (5-BU ou BU) Forme cétone du 5BU analogue à la thymine et s’apparie à l’adénine Forme énol du 5-BU analogue à la cytosine et s’apparie à la guanine Mécanisme de création de mutations par le 5-BU : le 5-Bu provoque des mutations lorsqu’il est incorporé sous une forme et change ensuite de forme. Forme cétone A-BU A-T G-BU A-T Forme énol A-T A-T G-C G-C G-C G-C A-T Forme cétone G-C A-T A-T A-BU G-C G-C Transition A-BU A-T A-T A-T Forme énol G-BU A-T A-T G-C A-BU G-C G-C G-C G-C Transition Dans son état cétone le Bu s’apparie à l’adénine et forme ensuite dans son état énol un appariement avec la guanine, provoquant une transition A-T -> G-C Dans son état énol le Bu s’apparie à la guanine puis dans son état cétone à l’adénine, provoquant une transition G-C -> A-T b- Les agents intercalants Ce sont des composés qui vont s’insérer dans un endroit de la chaine d’ADN et provoquer l’insertion ou la délétion d’une paire ou de plusieurs paires de bases; Exemple : Provaline, acridine….. Si l’agent intercalant s’insère durant la réplication entre 2 bases du brin matriciel, il permet l’insertion dans le brin en formation d’une base supplémentaire (qui n’était pas prévue). Une seconde réplication à partir du brin modifié transforme définitivement l’ADN par insertion d’une paire de nucléotides. Empêche l’insertion de la base A Si l’agent intercalant s’insère dans un brin en formation, il empêche l’insertion d’une base. Ce qui lors de la réplication suivante donne une molécule d’ADN modifiée par délétion définitive d’une paire de nucléotide. V-1-2- Les radiations Ce sont le principal agent mutagène. Les rayons ultraviolets U.V. : provoque des lésions de l’ADN souvent létales et des mutations chromosomiques. Les rayons ionisantes : X et gamma, peuvent provoquer des cassures simple brin ou double brin de l’ADN, des pertes de bases…, des altérations chromosomiques (translocation, inversions…) V-2- Les facteurs intrinsèques V-2-1- Les gènes mutateurs Il existe des gènes dont la fonction est de corriger les erreurs de la réplication de l’ADN. Une mutation dans ces gènes va donc diminuer le taux de correction des erreurs et donc augmenter le taux de mutation, ces gènes sont dits gènes mutateurs.