Lactobacillus gasseri THT 031301 LMG 26661

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Lactobacillus gasseri
THT 031301
LMG 26661
Dernière mise à jour : juillet 2012

Lactobacillus gasseri THT 031301 2
Table des matières
1. Lieux de présence / Origine __________________________________________ 3
2. Classification ________________________________________________________ 3
3. Morphologie _________________________________________________________ 3
4. Identification ________________________________________________________ 4
a. Identification génétique _____________________________________________________ 4
i. Séquençage de l'ADNr 16S __________________________________________________ 4
ii. Séquençage par la méthode AFLP ____________________________________________ 5
5. Résistance à l’acidité _________________________________________________ 6
6. Résistance aux sels biliaires (Oxgall) _________________________________ 7
7. Effets probiotiques ___________________________________________________ 8
8. Sécurité et tolérance _________________________________________________ 9

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1. Lieux de présence / Origine
Le genre Lactobacillus représente le groupe des bactéries lactiques, le plus ubiquitaire. En
effet, ceux-ci colonisent tous les habitats contenant des glucides fermentescibles, des produits
d’hydrolyse des protéines, des vitamines, des facteurs de croissance et une basse teneur en
oxygène.
Plus particulièrement, l’espèce Lactobacillus gasseri est naturellement présente dans
l’appareil digestif de l’homme et des animaux.
La souche Lactobacillus gasseri THT 031301 a, quant à elle, été isolée d’un intestin humain.
2. Classification
Domaine : Bacteria
Embranchement : Firmicute
Classe : Bacilli
Ordre : Lactobacillales
Famille : Lactobacillaceae
Genre : Lactobacillus
Espèce : gasseri
Souche : THT 031301
3. Morphologie
Lactobacillus gasseri est une bactérie de type Gram positif. Elle se présente habituellement
sous forme de bâtonnets (0,6-0,8 µm x 3,0-5,0 µm). Ceux-ci peuvent être isolés ou réunis en
courtes chaînes.

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4. Identification
a. Identification génétique
i. Séquençage de l'ADNr 16S
La littérature considère que la détermination du pourcentage d'homologie entre les ADNr 16S
de plusieurs souches est une méthode suffisamment discriminante pour permettre
l'identification bactérienne.
Protocole
Les fragments de l’ADNr 16S de la souche THT 031301 (de 1148 paires de bases), obtenus
après amplification des ADN totaux, sont séquencés.
A partir de cette séquence, un pourcentage d'homologie est calculé par comparaison avec
d’autres séquences. Deux souches bactériennes sont considérées comme appartenant à la
même espèce si le pourcentage d'homologie entre les 2 ADNr 16S est supérieur ou égal à 97
%.
Résultats
Les taux d'homologie entre la séquence d’ADNr 16S de la souche Lb. gasseri THT 031301
avec d’autres séquences de souches appartenant au genre Lactobacillus sont repris dans le
Tableau 1.
Tableau 1. Pourcentage d'homologie obtenu par comparaison des séquences 16S de certaines souches de
Lactobacillus avec la séquence du gène codant pour l’ADNr 16S de la souche THT 031301.
Pourcentage d’homologie (%)
Lactobacillus gasseri LMG 9203
96,1
Lactobacillus johnsonii LMG 9436
95,6
Lactobacillus delbrueckii subsp delbrueckii LMG 6412
87,7
Lactobacillus acidophilus LMG 9433
89,0

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La séquence d’ADNr 16S montre un pourcentage d’homologie le plus élevé pour la souche
type Lactobacillus gasseri LMG 9203. Ce taux étant toutefois en dessous de 97 %, ce test ne
permet pas possible de déterminer avec exactitude l’appartenance de cette souche à l’espèce
Lactobacillus gasseri.
ii. Séquençage par la méthode AFLP
La méthode AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) est une technique PCR
permettant l’obtention d’empreinte ADN du génome entier par une amplification sélective de
fragments de restriction. Cette empreinte ADN avec deux combinaisons de primer permet
l’identification de l’espèce et la caractérisation du niveau intra-espèce.
L’identification de la souche THT 031301 par cette technique a été réalisée par le laboratoire
BCCM/LMG (Bacteria Collection Laboratorium voor Microbiologie Universiteit Gent).
Résultats
L’analyse par segment des empreintes ADN AFLP de la souche THT 031301 avec les
empreintes ADN AFLP des taxa de bactéries lactiques (incluant les Bifidobacterium) identifie
la souche THT 031301 comme un Lactobacillus gasseri.