La virologie

Propriétés générales des virus :
a- La taille des virus
b- Réplication des virus
c- acide nucléique des particules virales
d- Réplication des virus à partir de leurs composants
e- Dépendance des virus du métabolisme d'une cellule
f- Spécificité des virus vis-à-vis des cellules et des organismes
Courbe de croissance d’un bactériophage après infection de bactéries
Une suspension de bacteriophages λ est mélangée à des bactéries dans un rapport
de 10/1. Durant l’infection, on observe d’abord une phase au cours de laquelle aucun
virus infectieux ne peut être récupéré de la cellule infectée : en effet, lors de
l’infection, le génome a été libéré de la capside (décapsidation). Il n’y a donc plus de
virion complet, infectieux. Cette phase est appelée « phase d’éclipse ».
Ensuite, le génome viral est transcrit et fournit les protéines codées par le virus. Le
génome est également répliqué pour donner lieu à de nouvelles copies du génome
viral. Ces génomes qui ont été répliqués s’associent avec les protéines structurales
du virus (assemblage) pour former de nouveaux virions infectieux. Au cours de cette
phase, appelée « phase de maturation », de nouvelles particules virales
infectieuses sont donc assemblées dans la cellule, à partir de leurs composants.
Ceci contraste avec le cycle de réplication d’une cellule ou d’une bactérie au cours
duquel la cellule fille n’est pas formée, par un processus d’assemblage de
composants de la cellule mère. Mais est formée par scission de celle-ci. L’ensemble
des phases d’éclipse et de maturation s’appelle « phase de latence ».
1) Phase d’éclipse (pas de virus
infeceux décelable)
2) Phase de maturaon (assemblage
intracellulaire de virus)
3) Phase de latence (pas de virus
décelable dans le milieu).

f- Spécicité des virus vis-à-vis des cellules et des organismes :
Tous les organismes vivants sont suscepbles d'être infectés par des virus, mais ce ne sont
pas les mêmes virus qui infectent les diérents organismes. Ainsi, les virus des plantes.
n'infecteront généralement pas les animaux, et les virus d'une espèce de plante n'infecteront
pas nécessairement d'autres espèces de plantes. Cee barrière d'espèce n'est pas absolue et
on voit que par exemple certains animaux peuvent partager des virus avec les humains et
entre eux. A l'intérieur d'un organisme, les virus seront sélecfs de certains types de cellules.
Cee spécicité est due en grande pare aux récepteurs spéciques de surface des cellules
qui permeent la xaon et l'entrée des virus.
Reconnaissance spécifique de cellules par les virus : interaction virus-
récepteur.
Cycle virale :

Figure 4: cycle viral: attachement, la pénétration, la décapsidation, assemblage et
sortie du virus
Classification par type de génome:
Virus à ADN
Groupe I-Virus à ADN à double brin
Groupe II - Virus à ADN à simple brin
Virus à ARN
Groupe III-Virus à ARN à double brin
Groupe IV - virus á ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)
Groupe V-virus à ARN simple brin à polarité négative (-)
virus à polarité négative non-segmentés
Exemples virus de la rougeole
Exemples virus de la Rage
Virus à polarité négative segmentés Exemples virus de l'influenza A. B. et C (virus de
la grippe)
Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse
Groupe VI - rétrovirus à ARN simple brin
Exemples VIH I
Groupe VII - rétrovirus à ADN double brin
Exemple virus de l'Hépatite Exemple virus de la mosaïque du chou-fleur

Principaux éléments de la synthèse de l’ARN viral.
a.1- Les enzymes :
l’ARN polymérase- ARN dépendante est l’élément constant et majeur de la synthèse
de l’ARN viral génomique (réplication et transcription). L’amorçage de la réaction a
lieu à proximité de l’extrémité 3’ du brin d’ARN modèle. Il peut s’agir d’un amorçage
de novo (sans amorce) ou à l’aide d’une protéine virale liée au génome utilisée
comme amorce.
Les enzymes accessoires vitales participent à cette activité en dirigeant PARN
polymérase vers le site intracellulaire adéquat (noyau, membrane, vésicule.) ou sur
les sites spécifiques de la matrice ARN sites en 5 pour l’initiation et en 3 pour la
terminaison)
Des protéines d’origine cellulaires peuvent être associées à la réplication
transcription des virus, c’est le cas par exemple des protéines du cytosquelette.
a.2- L’ARN matrice :
_Les génomes ARN (-) sont liés aux protéines de la nucléocapside qui jouent un rôle
important dans le maintien de la conformation de la molécule d’ARN et le bon
fonctionnement de l’ARN polymérase. Au contraire, les génomes ARN (+) ne sont
pas liés à la nucléocapside, ils codent souvent une hélicase jouant un rôle dans
l’activité de la polymérase
_Les extrémités 5’ non-codantes des génomes ARN prennent une conformation en
tige, boucle. Ces motifs, ayant parfois une arborescence complexe, jouent un rôle
important pour la reconnaissance des sites d’initiation et de terminaison des
synthèses ARN et protéiques. Des modifications génétiques à ce niveau (par
exemple par mutation) peuvent avoir des conséquences sur la virulence du virus.
_L’amorçage de la réplication- transcription en 5 : La plupart des ARN polymérase
ARN dépendante peuvent initier la synthèse de l’ARN sans amorce.

L’enveloppe est le support pour les déterminants de la reconnaissance virus-cellule
hôte chez les virus enveloppés. Ces glycoprotéines (spicules) permettent au virus de
reconnaître la cellule-cible, par l’entremise d’un récepteur cellulaire et sont dès lors
parfois appelés anti-récepteurs. On connaît maintenant de mieux en mieux les
récepteurs cellulaires et leur anti-récepteur viral.
Schéma montrant l’enveloppe, l’anti-récepteur viral et les récepteurs
cellulaires correspondants
Stratégies De réplication des virus à ARN monocaténaire messager
Les gènes viraux s’expriment différemment selon les stades de l’infection grâce à
différentes stratégies de régulation. Ces stratégies comportent :
 la répartition des gènes sur plusieurs fragments d’ARN génomique (virus à
génome multipartite).
 Le clivage d’une poly protéine.
 Des mécanismes de translecture (conduisant un codon de fin de lecture et à
ne pas mettre fin à la synthèse de la protéine et exprimant de la sorte deux
cadres de lecture),
 Le décalage du cadre de lecture (glissement du ribosome avant le codon de
terminaison) aboutissant à la synthèse d’une protéine fusionnant deux ORF.