MASTER 2 RECHERCHE GENETIQUE, BIOLOGIE CELLULAIRE ET PATHOLOGIES (GBCP) ANNEE 2015-16 Titre du sujet de stage Etude comparative de la mort cellulaire induite par l’infection par les alphavirus chez le mammifère et l’insecte. Nom, adresse de l’Unité d’accueil / Nom du responsable de l’Unité: UMR754 INRA-UCBL 50 Avenue Tony Garnier, 69007 Lyon Directeur d’Unité : JF Mornex Nom, adresse de l’Equipe d’accueil/ Nom, tel, adresse e-mail du responsable d’Equipe à contacter: « Infection et Évolution des Génomes Viraux », UMR754 Responsable d’équipe : Christophe Terzian, Co-PI : Dimitri Lavillette “Arbovirus interspecies transmission and therapeutics research” Institut Pasteur Shanghai, Chinese Academy of Sciences 200031 Shanghai http://english.shanghaipasteur.cas.cn/ Personne à contacter : Carine Maisse-Paradisi (UMR754), Tel : 04 37 28 74 55, [email protected] Sujet de stage Les arbovirus (arthropod-borne viruses) sont les agents responsables de plusieurs maladies infectieuses émergentes, entrainant d’importants problèmes de santé publique ainsi que vétérinaires. Parmi ces virus, le genre des alphavirus comprend plus de 40 membres dans la famille des Togaviridae. Ils sont capables d’infecter divers vertébrés tels que l’Homme, les chevaux, les rongeurs, les poissons et les oiseaux ainsi que des invertébrés. Les récentes épidémies du virus Chikungunya (CHIKV) sont d’une ampleur inégalée, avec des millions de personnes affectées sur tous les continents et des symptômes plus sévères conduisant à la mort. Par ailleurs, les virus de l’encéphalite équine vénézuélienne (VEEV), de l’ouest (WEEV), de l’est (EEEV) peuvent provoquer une encéphalite mortelle chez les chevaux et les humains, principalement en Amérique. Bien qu’imparfait, des vaccins pour EEEV, VEEV et WEEV sont administrés aux chevaux mais il n’existe aucun vaccin contre les alphavirus à usage humain et aucun traitement spécifique. Les alphavirus sont maintenus dans les cycles naturels par la transmission entre les vecteurs arthropodes suceurs de sang et les hôtes vertébrés. Dans les moustiques vecteurs, les alphavirus causent une infection persistante à vie avec un effet minimal sur les fonctions biologiques tandis que l’infection chez les mammifères est aigüe, souvent associée à une maladie et produit un niveau de virémie nécessaire à l’infection des arthopodes lors de leur repas de sang. Cette relation se traduit in vitro par le fait que dans les cellules mammifères en culture, l’infection affecte la physiologie de la cellule causant notamment le développement d’un effet cytopathique (CPE), alors que les cellules d’insectes peuvent être infectées de manière chronique. Cette différence de pathogénicité n’est pas clairement expliquée. Certains travaux récents décrivent toutefois une mort cellulaire « contrôlée » induite par l’infection chez l’insecte et évoquent même un rôle positif de l’apoptose dans la propagation virale. Il est intéressant de noter que durant ces 3 dernières années, des récepteurs et des complexesrécepteurs ont été identifiés chez les mammifères comme facilitant l’entrée de divers virus enveloppés (ex: TIM-1, TAM...). Ce groupe de récepteurs partage la capacité de se lier aux phosphatidyl sérine (PtdSer) présentes à la surface, soit des cellules apoptotiques, soit de l’enveloppe virale. L’exposition en surface de PtdSer « déguise » les virus en corps apoptotiques. Ce mécanisme est nommé mimétisme apoptotique. Certaines données récentes montrent que les membres de la famille de récepteurs TIM servent de récepteur de liaison aux alphavirus chez l’humain indépendamment des glycoprotéines d’enveloppe virale. Ces études ont été menées dans des cellules mammifères et l’utilisation de la mort cellulaire comme mécanisme de propagation virale chez l’insecte reste inconnu. En comparant l’insecte et le mammifère, notre projet vise à avoir une meilleure connaissance de la réponse de l’hôte à l’infection par différents alphavirus, en nous focalisant sur la mort cellulaire. Nous cherchons à définir clairement suite à l’infection virale, d’une part, les acteurs de la voie apoptotique activés dans les cellules de mammifère et d’autre part à quelle(s) étape(s) cette même voie est potentiellement régulée chez l’insecte. Afin de comprendre quelle peut être l’importance relative des vésicules apoptotiques dans la propagation virale chez l’insecte et le mammifère, nous étendrons cette étude aux phases tardives de l’apoptose, à savoir la formation des corps apoptotiques. Technologies utilisées Le projet permettra de se familiariser avec les techniques de culture cellulaire (cytométrie en flux, immunostaining, établissement de lignées stables inductibles), de virologie (infection, purification de virus, travail en BSL3), de biochimie (western blot, spectrofluorimétrie), et de biologie moléculaire (clonage de protéines virales). Mots clés Alphavirus, insecte, mammifère, mort cellulaire, vésicules. Publications d’intérêt 1.Griffin, D.E. and J.M. Hardwick, Regulators of apoptosis on the road to persistent alphavirus infection. Annu Rev Microbiol, 1997. 51: p. 565-92. 2.Li, M.L. and V. Stollar, Alphaviruses and apoptosis. Int Rev Immunol, 2004. 23(1-2): p. 7-24. 3.Weaver, S.C., L.H. Lorenz, and T.W. Scott, Pathologic changes in the midgut of Culex tarsalis following infection with Western equine encephalomyelitis virus. Am J Trop Med Hyg, 1992. 47(5): p. 691-701. 4.Krejbich-Trotot, P., et al., Chikungunya virus mobilizes the apoptotic machinery to invade host cell defenses. FASEB J. 25(1): p. 314-25. 5.Wang, H., et al., Effects of manipulating apoptosis on Sindbis virus infection of Aedes aegypti mosquitoes. J Virol. 86(12): p. 6546-54. 6.Jemielity, S., et al., TIM-family proteins promote infection of multiple enveloped viruses through virion-associated phosphatidylserine. PLoS Pathog. 9(3): p. e1003232. 7.Maisse C, et al., Netrin-1 up-regulation in inflammatory bowel diseases is required for colorectal cancer progression. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Oct 6;106(40):17146-51. 8.Douam F, Dao Thi VL, Maurin G., Fresquet J., Mompelat D., Cosset FL and Lavillette D. A critical interaction between E1 and E2 glycoproteins determines binding and fusion properties of hepatitisC virus during cell entry. Hepatology. 2014 Mar;59(3):776-88