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UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
ED N°2a
Diagnostic bactériologique des
infections urinaires
ECBU
Mise à jour le:
Objectif et prérequis
Objectif
•Savoir interpréter les résultats d'un examen
cytobactériologique des urines
Prérequis
•Cours 4 et 5, le monde bactérien
•Cours 28, antibiotiques: mécanisme d’action, mécanisme
de résistance
•Polycopié des TP page 28: les principales familles
d’antibiotiques
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Mme D., 32 ans, consulte pour des
brûlures mictionnelles
•
•
•
•
•
Pas d’antécédent médico-chirurgical
Pas de traitement en cours
Apparition brutale de brûlures mictionnelles la veille
Pas de fièvre
Pas de douleur lombaire
Quel diagnostic évoquez-vous?
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Cystite aiguë
• Infection uniquement vésicale
•
≠ Pyélonéphrite aiguë
• Atteinte du parenchyme rénal
• Clinique: fièvre ± frissons, douleur de la fosse lombaire irradiant
vers le pubis
Quel est le mécanisme physiopathologique habituel des
infections urinaires communautaires?
Quelles sont les bactéries habituellement responsables?
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Physiopathologie des IU
•
Colonisation ascendante des voies
urinaires par des bactéries possédant
des facteurs de virulence spécifiques:
(adhésines, sidérophores )
•
Femme : la longueur réduite de l’urètre
favorise l’infection
•
Femme enceinte : facteurs favorisants
supplémentaires (diminution des défenses
immunitaires, compression de l’urètre par l’utérus,
imprégnation progestative)
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Espèces bactériennes responsables
d’infections urinaires
Examen direct
(coloration de Gram)
Bacilles Gram négatif
Famille
Entérobactéries
Pseudomonadaceae
Cocci Gram positif
en chainettes
Streptococcaceae
Cocci Gram positif en
Micrococcaceae
amas
Espèce
%
Escherichia coli
68
Proteus mirabilis
8
Klebsiella sp
5
Autres entérobactéries
3
Pseudomonas aeruginosa
1
Enterococcus
5
(E. faecium, E. faecalis)
Streptocoques B
(Streptococcus agalactiae)
3
Staphylococcus aureus
3
S. saprophyticus
3
Autres bactéries
1
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
84%
Quel examen pour confirmer le
diagnostic?
• Examen Cyto-Bactériologique des Urines (ECBU)
• Il permet de mettre en évidence:
• Une réaction inflammatoire (cytologie : leucocytes)
• Des bactéries dans l’urine vésicale (physiologiquement stérile)
• Pyélonéphrites aiguës: hémocultures + ECBU
Comment bien réaliser un ECBU?
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
ECBU – Conditions de recueil
• Conditions standardisées pour :
•
Eviter une contamination de l’échantillon (bactéries commensales de
l’urètre et du périnée)
• Eviter une multiplication ou une destruction des bactéries
• Permettre une conservation des leucocytes
• 1ères urines du matin de préférence (concentrées)
• Toilette soigneuse du méat urinaire (femme +++)
• Urine de milieu de jet
• Avant tout traitement antibiotique
• Transport rapide au labo
(conservation 2h à T° ambiante, <24h à +4°C)
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
ECBU – Conditions de recueil
• Situations modifiant les critères d’interprétation
(conditions de recueil différentes) :
– Poche stérile adhésive chez le jeune enfant
– Doit être laissée en place moins de 30 min
– Fort risque de contamination
– Seule une urine négative est facilement interprétable, tout urine
positive prélevée ainsi, devrait être contrôlée++
– Recueil sur sonde urinaire (réanimation, incontinence, …)
– Leucocyturie ininterprétable
– Possible contamination de la sonde sans infection
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Analyse d’un ECBU – J0
1. Cytologie quantitative
- Leucocytes
- Hématies
Par mm3 ou ml attention aux unités!!!!
2. Frottis →Coloration de Gram →Examen au microscope
- Présence de germes
- Morphologie et coloration
3. Ensemencement quantitatif++ sur milieu chromogène
- 10 µL (öse calibrée)
- Incubation 24h à 37°C
- Permet la culture des Gram+ et des Gram-
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Analyse d’un ECBU – J0
Interprétation à J0
Les normes : leuco <104/ml et abs de germe
•exemples
∙ 105 leucocytes/ml ET nombreux bacilles Gram négatif
→ Infection probable
∙Traitement antibiotique probabiliste
∙ 104 leucocytes/ml et plusieurs types de germes au Gram
∙Souillure probable
→ Refaire ECBU
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Analyse d’un ECBU – J1
• Numération des bactéries sur les cultures
• 1 colonie = 102 bactéries/mL
• Identification bactérienne
• Orientation si identification par les caractères biochimiques (galerie
API) grâce aux milieux chromogènes
• Identification définitive si identification par
spectrométrie de masse (Maldi-Tof)
• Réalisation d’un antibiogramme
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Analyse d’un ECBU – J1
• Interprétation à J1
Interpretation
Leucocyturie/mL Bactéries/mL
< 104
< 104
Pas d'infection
≥ 104
≥ 105
Infection urinaire
Bactériurie sans leucocyte
<
104
104
–
105
∙ Contamination du prélèvement surtout si plusieurs espèces
∙ Infection débutante
∙ Infection sur terrain particulier : femme enceinte, nourrisson, diabétique ou
aplasique, immunodéprimé
Un nouveau prélèvement est nécessaire
Leucocyturie sans germe
≥ 104
< 104
∙ Infection décapitée par traitement antibiotique
∙ Sécrétions génitales
∙ Tuberculose urinaire : bactéries ne cultivent pas sur les milieux usuels (Cf. cours
sur les mycobactéries).
∙ Urétrite (Chlamydiae, mycoplasme), donnant signes de cystite chez la femme
∙ Réaction inflammatoire d'origine non infectieuse (traumatisme ou tumeur)
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Analyse d’un ECBU – J2
• Identification bactérienne complète
E. coli
• Antibiogramme
50 % des E. coli : producteurs de pénicillinase
résistance à l ’ampicilline
Vérifier la sensibilité du germe à l’antibiotique
initialement prescrit +++
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
ECBU – Indications
• L’ECBU est indiqué pour le diagnostic initial
•
•
•
•
Des cystites aigues compliquées
Des cystites récidivantes
Des pyélonéphrites aigues simples et compliquées
Des prostatites
• Diagnostic initial des cystites aigues simples
• L’ECBU n’est PAS indiqué pour le diagnostic
• Le seul examen complémentaire recommandé est le test par la
bandelette urinaire (BU)
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Place des bandelettes urinaires
•
Détection
• Leucocyte estérase produite par les PNN
» Négatifs: infection débutante, neutropénie
» Faux négatifs: urine diluée, Vitamine C
» Faux positifs: urétrites, inflammation non infectieuses (sonde urinaire +++)
• Nitrites produits par les bactéries (nitrate réductase)
» Négatifs: germes en faible nombre ou non producteur de nitrate reductase
(Enterococcus, S. saprophyticus, Pseudomonas, Acinetobacter, Candida)
» Faux négatifs: Régime végétarien, Vitamine C, pH urinaire < 6
» Faux positifs: mauvaise conservation de l’échantillon
•Si les 2 tests sont négatifs: pas d’ECBU (VPN = 95% )
• Si 1 des 2 tests est positif : faire un ECBU
• Exception : ECBU d’emblée, sans BU préalable :
- Chez les patients à risque de complications (femmes enceintes, diabétiques,
neutropéniques)
- En cas de sondage urinaire
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Traitement
•
Entérobactéries (BGN)
• β-lactamines (pénicillines et céphalosporines)
– Résistance naturelle aux Pénicillines G et M (imperméabilité)
– E. coli : 50% de résistance acquise à l’ampicilline/amoxicilline
• Autres antibiotiques
– fluoroquinolones, fosfomycine, bactrim, aminosides
Traitement de la cystite aiguë
• 1re intention : Fosfomycine
•
Traitement de la pyélonéphrite aiguë
• 2ième intention: Fluoroquinolone ou
Nitrofurantoïne
• Céphalosporine de 3e génération
injectable ou fluoroquinolone per os
•Traitement minute possible pour la
fosfomycine et les fluoroquinolones si
femme jeune non-enceinte sans facteurs de
risques
• + aminoside si sepsis grave
Entérocoques (Cocci à Gram + en chainette)
• Résistance naturelle aux céphalosporines+++, bactrim et quinolones
• Traitement par amoxicilline
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
Traitement
•
Règles hygiéno-diététiques
• Mictions fréquentes
• Diurèse abondante
• Traitement d’une constipation
•
Contrôle de l’ECBU
• Non recommandé dans les cystites aiguës et les pyélonéphrites aiguës simples
• Sauf en cas de persistance des symptômes 72h après le début du traitement
• Recommandé dans les pyélonéphrites aiguës compliquées (48h à 72h après le début
du traitement et 4 à 6 semaines après la fin du traitement)
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
A retenir
• L’ECBU est un examen simple et peu coûteux
• Il peut donner une première indication dès le 1er jour
• Les bactéries les plus fréquemment rencontrées sont des
Entérobactéries (E. coli +++)
• L’infection urinaire est très fréquente, généralement peu
grave... sauf chez certains patients à risque.
UE: Agents infectieux – Hygiène – Aspects généraux
L’ECBU
dans ses différentes étapes
Urines de milieu de jet
J0
Examen cytologique
Examen bactériologique
Quantitatif
Leucocyturie
Qualitatif
Germes
Ensemencement
(Öse calibrée 10 µL)
J1 à 2
Dénombrement,
différenciation et
identification des
colonies
J2 à 3
Antibiogramme(s)
éventuel(s)
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