III - Programme détaillé par matière Master : Chimie Organique Pharmaceutique Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 1 Intitulé du Master : Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : 1 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Chimie avancé I : Mécanismes réactionnels et grandes réactions Crédits : 5 Coefficients : 4 Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé conforter ou acquérir un complément de connaissance en ce qui concerne la synthèse organique, les réactions de bases, leurs modes de réactivité et leurs mécanismes. Connaissances préalables recommandées : Les enseignements de chimie organique de base. Contenu de la matière : Réactions de substitution radicalaire sur carbone saturé. Réaction de substitution nucléophile sur carbone saturé. Addition sur la double liaison C=C oléfinique Elimination (notions de et concepts concernant les réactions d’élimination, Elimination de H/Hét, Elimination b de Hét1/Hét2,) Addition d’hétéronucléophiles sur les hétérocumulènes ainsi que sur les composés carbonylés et leurs suites réactionnels Additions ‘d’hydrures et d’organométalliques sur les composés carbonylés Réaction de substitutions sur les composés aromatiques Réaction de substitution nucléophile sur le carbone carboxylique C=O Synthèse organique –Réactivité des composés carbonylés. Aldolisation-crotonisation : autocondensation crroisée. Réaction de Knoevenagel. Réaction de Mannich. Condensation de Stobbe. Condensation de Darzens. Réaction de Reformatsky. Réaction de Claisen. Réaction de Dickmann. Réaction de Michael et aza-Michael. Annélation de Robinson. Le travail personnel sera axé essentiellement sur des exposés relatifs aux cours dispensés Mode d’évaluation: Evaluation continue et contrôle final Références : 1. Mécanismes réactionnels en chimie organique Reinhard Brûckner DeBoeck Université 2. Traité de Chimie Organique. Vollhardt, Schore DeBoeck 3eme editon Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 2 Intitulé du Master : Chimie Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Outils spectroscopiques Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement cet enseignement vise la compréhension des méthodes spectroscopiques usuelles sur le plan théorique et surtout pratique, qui peuvent s’avérer nécessaires pour élucider les structures chimiques à partir de spectres (RMN, RMN à deux dimensions, SM et IR). Connaissances préalables recommandées : Posséder les connaissances de base de la spectroscopie : Résonance Magnétique Nucléaire, Infrarouge. Contenu de la matière : Techniques avancées de Résonance Magnétique Nucléaire multinoyaux. RMN bidimensionnelle. Application à la détermination de la structure de molécules de synthèse et de composés naturels ; application à la détermination de la structure de molécules biologiques. Aspects instrumentaux : Aimants, sondes, techniques RMN HR-MAS, RMN multi-canaux, échantillons. Méthodologie d'attribution spectrale, spectroscopie de corrélation multi-dimensionnelle homo et hétéronucléaire. Interprétation en terme structuraux, analyses isotopiques, limites de sensibilité. Equivalence magnétique (système rigide AMX, ABX et ABC avec trois constantes de couplage. Spectrométrie RMN du carbone 13. Technique de découplage du 1H, effet Overhauser (NOE), couplage de spin 13C-1H et DEPT. Spectrométrie de Corrélation, RMN 2-D. Théorie, Corrélation H-H COSY, HETCOR, HMBC et HSQC Techniques avancées de Spectrométrie de Masse : Techniques d'ionisations moléculaires : EI, CI, LSIMS, FAB, ESI, APCI, MALDI : Techniques instrumentales spécifiques à la spectroscopie de masse moléculaire : Analyseurs (magnéto-électrostatiques, quadripolaires, trappes ioniques, TOF, ICR) MS/MS et MSn. Sensibilité, résolution, limite de détection. Interprétation spectrales, fragmentations moléculaires. Applications de la spectroscopie de masse à l'analyse moléculaire, la détection de trace, la composition isotopique. Couplage GC/MS et LC/MS. Analyse quantitative en spectrométrie de masse. Le travail personnel sera consacré à l’étude des spectres de composés complexes de synthèse Mode d’évaluation: Evaluation continue et contrôle final Références : 1. Identification spectrométrique de composés organiques : Silverstein. Deboeck Université.2007 2. Méthodes spectroscopiques pour la chimie organique Manfred Hess. Masson 1997 3. Spectrométrie de masse. De Hoffmann Etablissement : Année universitaire : Dunod 2eme édition 1999. Intitulé du master : Page 3 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Chimie Thérapeutique I Crédits : 5 Coefficients : 4 Objectifs de l’enseignement Le cours de chimie thérapeutique a pour but de présenter une base cohérente à la reconnaissance et à l’identification de la nature chimique des principes actifs de leur origine et des circonstances de leur découverte. Connaissances préalables recommandées : Connaissance suffisante de la chimie générale et organique, notions de physiologie et de biologie cellulaire. Comprendre les démarches modernes de conception d'un médicament et les phases liées à son développement. -Intégrer l'apport de la chimie de synthèse à l'optimisation des propriétés d'une substance active. Contenu de la matière : Introduction à la Chimie Pharmaceutique : but de la chimie thérapeutique, rappel de quelques réactions importantes en synthèse organique, principes fondamentaux guidant la conception des médicaments, abrégé des règles de nomenclature de l'I.U.P.A.C. Systématique . Chimie pharmaceutique et découverte médicamenteuse *Voies de découverte et optimisation médicamenteuse - Elaboration d’un composé médicinale *Méthodes qualitatives d’études des relations structure-activité Synthèse d’analogues structuraux- Préparation d’homologues et de vinylogues- Autres méthodes physicichimiques- Homologation et Vinylogation Isostérie- Bioisostérie- Récepteurs et médicaments- Enzymes et médicaments Canaux ioniques et médicaments- Stéréo-isomérie et médicaments- Modélisation moléculaire III. Relations quantitatives entre la structure et l’activité biologique : Méthodes de Hansch- Méthode de Topliss IV. Caractéristiques pharmacocinétique : Absorption, Distribution, Métabolisme, Elimination (ADME). V. Nouveaux développement et perspectives thérapeutiques et les essais cliniques. VII. Plan général d’études des médicaments : Définition- Préparation- Essai- Emploi Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu Le travail personnel sera consacré aux l’études des médicaments de synthèse sous forme d’une présentation orale Références : chimie pharmaceutique Graham-L Patrick. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 4 1- Société de chimie thérapeutique(1992). Traité de chimie thérapeutique; volume 2: médicaments antibiotiques. Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Cristallographie Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé acquérir des connaissances en ce qui concerne la cristallographie, les structures atomiques et les réseaux cristallins. Connaissances préalables recommandées : Les enseignements de chimie organique de base. Contenu de la matière : 1. Les trois états de l’ordre de la matière : Introduction, les structures désordonnés Les structures ordonnées : les matériaux dans un état intermédiaires 2. Structure atomique du cristal : Introduction, caractéristiques macroscopiques du cristal, symétrie, Classification en sept systèmes cristallins introduction à la détermination des structures cristallines 3. Maille primitive et maille multiple : Introduction, maille primitive, maille mutiple, les 14 réseaux de Bravaix, motif et unité asymétrique, composantes atomiques 4. Réseau Direct/Réseau Réciproque : introduction, direction rangée, famille de plans réticulaires, réseau réciproque, indices de Miller, règles d’existence des indices 5. Calculs cristallographiques : introduction, calculs géométriques dans l’espace direct, calculs géométriques dans l’espace réciproque, familles de plans directs et réciproques, densité réticulaire, plans atomiques. 6. Opération de symétrie des structures cristallines : Introduction, symétrie des polyèdres cristallins, symétrie des structures périodiques (symétrie de position) 7. Groupes de symétrie tables internationales de cristallographie Le travail personnel sera dédié à l’étude des travaux de critallographie sur publication Mode d’évaluation : … Evaluation et contrôle final …………… Références 1. Cours de cristallographie, P. Perio, laboratoire de cristallographie Univ-Orsay-Sud 2. La structure de la matière du ciel bleu à la matière plastique. A. Guinier Hachette Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 5 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Méthodologie Intitulé de la matière : Pharmacologie Générale Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement La pharmacologie a pour finalité la découverte des médicaments et l’étude de leurs propriétés et de leurs effets sur les organismes vivants, en particulier l’Homme dans la perspective de leur administration thérapeutique en limitant leurs effets indésirables. Elle est étroitement liée à la physiologie normale et pathologique Connaissances préalables recommandées : connaissances générale de chimie pharmaceutique et biologie cellulaire Contenu de la matière : Introduction à la pharmacologie Les voies d’administration L’absorption des médicaments La distribution des médicaments Le métabolisme des médicaments L’excrétion des médicaments Les paramètres pharmacocinétiques Biodisponibilité et bioéquivalences Mécanismes d’action des médicaments Variabilité de l’effet des médicaments Les différentes manifestations de la réponse pharmacologiques Les effets indésirables Le médicament et les fonctions rénale et hépatique Le médicament en pédiatrique et en gérontologie La femme et le médicament Le travail personnel sera consacré aux effets secondaires des médicaments Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final. Références : Pharmacologie B.P. : classes pharmacologiques (4ème édition), denis stora, édition porphyre Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 6 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Méthodologie Intitulé de la matière : Modélisation Moléculaire I Crédits : 3 Coefficients : 2 Intitulé de la matière : Objectifs de l’enseignement : Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences après le succès à cette matière. Connaissances préalables recommandées : Notion de base de modélisation et de chimie quantique Contenu de la matière : I. II. III. Modélisation moléculaire (Rappel) : La mécanique moléculaire. La Chimie quantique. La Dynamique moléculaire. Spectroscopie. Etude de la réactivité : Etude d’une réaction SN2 Etude d’une réaction d’addition. Les indices de fukui : descripteurs globaux et locaux. Etude de la Relation structure activité et Recherche de la conformation. QSAR et Structure Activité : les Descripteurs 1D, 2D Analyse de données Analyse qualitative Régression multiple linéaire Le modèle non linéaire Réseaux de neurones Analyse combinatoire Algorithmes génétiques Interactions intramoléculaires (Liaisons hydrogéne..) Lipophilie. Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire Réceptorologie Interactions intermoléculaires (Docking) : Les Descripteurs 3D Modélisation des proteines: spécificité des champs de force Interactions Protéine-Protéine Interactions Drogue-Récepteur Comparaison et Superposition : Modélisation des proteines: spécificité des champs de force Interactions Protéine-Protéine Interactions Drogue-Récepteur Le travail personnel sera dédié à la familiarisation des étudiants aux logiciels de modélisation Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 7 Références: La modélisation moléculaire à la découverte des composés bioactifs. Dragos Horvath éditions universitaires européennes - P.A. Cox, « Introduction to quantum theory and atomic structure” , Oxford academic press, London, 1996 . - Castejon, H.; Wiberg, K. B.. J Comput Chem, 25:461-467,2004. Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Méthodologie Intitulé de la matière : Synthèse Asymétrique Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement La Synthèse asymétrique est permet l’accès aux molécules énantiomériquement enrichies. Cette finalité est d’autant plus justifié que les molécules naturelles sont, pour la plus part, chirales. Ce cours est consacré à la synthèse asymétrique et ses applications. Il décrit Les applications des auxilliaires, des réactifs et des catalyseurs chiraux en synthèse asymétrique. Connaissances préalables recommandées : Synthèse organique - Stéréochimie Contenu de la matière : Généralités : (Théorie de l’état de transition à l’induction asymétrique, effets conformationnels, influence des ligands chiraux Induction asymétrique : Réactions diastéréosélectives, Mécanismes, création de la liaisin C-C. Utilisation de copules chirales et réactifs chiraux (dérivés d’alcools, d’amines, d’amino-alcools et de sulfoxydes) Réactifs chiraux Déprotonations et protonations asymétriques Addition s aux groupes C=O et C=N Catalyse asymétrique : (catalyseurs chiraux et ligands chiraux). Application en synthèse. Analyses et séparations de molécules chirales. RMN, diffraction de rayons X, chromatographie HPLC. Dédoublements chimique et enzymatiqie Le travail personnel portera sur l’étude de l’importance des composés chiraux en pharmacologie Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final. Références : Synthèse et catalyse asymétrique, Jacqueline Seyden-Penne CNRS Editions Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 8 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Transversale Intitulé de la matière : Chémoinformatique Crédits : 2 Coefficients : 1 Objectifs de l’enseignement : Elle a pour objectif de fournir des outils et des méthodes pour l'analyse et le traitement des données issues des différents domaines de la chimie. Elle est notamment utilisée en pharmacologie pour la découverte de nouvelles molécules actives et la prédiction de propriétés à partir de structures moléculaires. Connaissances préalables recommandées : informatique de base Contenu de la matière : gestion de bases de données de molécules et de réactions ; prédiction de propriétés physiques, chimiques ou biologiques ; aide pour la conception de nouveaux médicaments ; résolution de structures moléculaires ; prédiction de réactions chimiques conception de protocoles de synthèse chimique. Le travail personnel consiste en l’élaboration des plans d’expérience Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final. Références : 1.Lahana R. 1996, similitude moléculaire et activité biologique pour Pour la sciences 212, 45-60 2.Villoutreix et al., Drug Discovery Today, 18:1081-9, 2013) Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 9 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S1 Intitulé de l’UE : Découverte Intitulé de la matière : Anglais Scientifique Crédits : 1 Coefficients : 1 Objectifs de l’enseignement : faire découvrir à l’étudiant l’anglais scientifique Contenu de la matière : Compréhension d’articles scientifiques et rédaction d’abstract Atteindre le niveau 2 Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 10 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Chimie Organique Avancée II Crédits : 5 Coefficients : 4 Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé conforter ou acquérir un complément de connaissance en ce qui concerne la synthèse organique, les réactions de bases, leurs modes de réactivité et leurs mécanismes. Connaissances préalables recommandées : Les enseignements de chimie organique de base. Contenu de la matière : 1. Composés organiques polyfonctionnels : diènes, polènes, composés di et polyhalogénés, diols, polyols, composés polycarbonylés, diacides, composés carbonylés insaturés, hydroxyacides, lactones, phénol, oxazolidinones, oxazaphosphospholidinones, quinones, oxiranes, polymères. 2. Chimie des hétérocycles Cycles à 6 chaînons saturés et non saturés (pyridines, sels de pyridinium et de thiopyridinum, quinoléines, isoquinoleines, sels de benzopyrylium, acridines, phenanthridines, pyrimidines et purines Méthode de synthèse et mécanisme Réactivité, Oxydation et Réduction L’importance des hétérocycles dans le domaine médical. 3. Les macromolécules (7 chaînons ou plus) Les méthodes de synthèse Propriétés chimiques et étude de complexes (ligands, catalyseurs) 4. Rôle des solvants en chimie organique (solubilité, effet de polarité, propriétés, constante diélectrique). 5. Procédés et Techniques de synthèse pour une chimie économe et éco-compatible (notion de chimie verte). Le travail personnel sera consacré aux réactions les plus cités dans la littérature sur des thèmes qui seront définis en relation avec le cours. Mode d’évaluation : … Evaluation et contrôle final …………… Références Chimie Organique II, David M.Klein Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 11 Chimie Organique 7ème édition, John E. Mc Murry Chimie Organique Methodes et Modèles . PierreVogel DeBoeck Université Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière: Chimie Thérapeutique II Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement : Au terme de cet apprentissage, l’apprenant doit connaître les principales familles de médicaments (de leurs structures, synthèses à leur pharmacologie), et proposer en se basant sur les RSA et s’inspirant des développements des recherches, la synthèse de nouvelles molécules. Connaissances préalables recommandées La chimie organique est indispensable à la compréhension des mécanismes de synthèse des médicaments. L’étudiant doit aussi avoir des notions de base en pharmacologie et en galénique. Contenu de la matière : 1. Enseignements théoriques Recherche thérapeutique: état des lieux et prospectives Les grandes voies d'obtention des médicaments. Application des relations Structure-Activité. Les médicaments du système cardiovasculaires Les antalgiques Les anesthésiques Les catécholamines Atropines et dérivés Éphédrine et dérivés Les anti-sécrétoires Les normolipémiants Les anticancéreux Mode d’évaluation : QRC et QCM Références 1. Association française des enseignements de chimie thérapeutique(2003). Traité de chimie thérapeutique; volume 6: médicaments anti tumoraux et perspectives dans le traitement des cancers. 2. Goodman et Gilman (1998). Les bases pharmacologiques de l’utilisation des médicaments. 3. S.Kirkiacharian (1996) : Guide de chimie thérapeutique 4. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 1 5. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 2 6. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 3 Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 12 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre: S2 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Chimie Analytique approfondie Crédits : 5 Coefficients : 4 Enseignant responsable de la matière : Pr. LOUHI Achour Objectifs de l’enseignement : approfondir et compléter les notions de chimie analytique acquises au parcours de Licence chimie organique pharmaceutique. Maîtriser les techniques de dosages par spectrophotométrie Uv/Vis afin d’étudier les spectres d’absorption, les dosages des substances organiques ou des médicaments ainsi que leurs dégradation. La spectrométrie d’émission et d’absorption atomique par flamme et plasma ainsi que la Spectrométrie de fluorescence X pour la détection des minéraux. Connaissances préalables recommandées : Chimie Analytique (Partie ; Spectrométrie élémentaire). Contenu de la matière : Spectrophotométrie Uv/Vis : Spectre d’absorption moléculaire. Loi de Beer-Lambert. Cœfficient d’extinction molaire. Lois de déplacement d’équilibres. Application aux dosages. Spectrométrie d’émission atomique : Principe, intensité d’émission, applications analytiques. Emission de plasma par courant direct (DCP-AES), couplé par induction (ICP-AES) : notion de plasma, principe, dispositif d’excitation, système dispersifs et raies spectrales, paramètres optimaux, appareils simultanés et séquentiels, emploi analytique. Spectroscopie d’absorption atomique : Principe, effet de la température sur un élément –loi de répartition de Maxwell Boltzmann, Coefficient d’absorption, absorption intégrée, Instrumentation de base, générateurs d’atomes, raies de résonance, brûleurs, atomiseurs sans flamme (électrothermie), Perturbations physiques et chimiques. Effets de matrice (interférences). Applications analytiques : Dosages indirects : compléxation, extraction liquide-liquide, résine échangeuse d’ions. - Spectrométrie de fluorescence X : Principe de base. Etude des spectres. Effet photoélectrique. Loi globale (Bragg, Moseley et Bragg-Pierre). Rendement de fluorescence. Mode d’excitation des éléments : tubes scellés, sources radio-isotopiques. Appareillage. Préparation des échantillons. Densimétrie. Application analytique. Le travail personnel sera axé des études de comparaison des différentes méthodes Références : [1] F. ROUESSAC., A. ROUESSAC. -Analyse chimique. Méthodes et techniques instrumentales modernes. Cours et exercices corrigés. 1er Cycle/Licence Pharmacie. 6ème édition. DUNOD, Paris 2004. [2] D.A. SKOOG., D.M. WEST., F.J. HOLLER. -Fundamental of Analytical Chemistry (7 th Int. Ed), Saunders College Publishing, 1996. [3] T.R SREEKRISHAN, T.R. TYAGI.-Heavy metal leaching from sewage sludge’s: A Techno-Economic Evaluation of the Process options 2005. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 13 [4] J.VANDEGANS., A-M. KERSABIEC., M. HOENIG.-Technique de l’ingénieur. Traité d'analyse et caractérisation. P2825 .p1-27. 2006. [5] P.GALEZ. -Mesures physiques Techniques spectrométriques et nucléaires, Absorption atomique et émission de flamme. 2006. Intitulé du master : Chimie Pharmaceutique Semestre : S 2 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière: Techniques Pharmaceutiques Industrielles Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit : -maîtriser les méthodes, les techniques et les paramètres clés de l’ensemble des opérations pharmaceutiques intervenant dans la formulation des différentes formes galéniques. -connaître les exigences réglementaires en matière d’assurance qualité pharmaceutique -acquérir les éléments nécessaires pour travailler dans une zone à atmosphère contrôlée Connaissances préalables recommandées Maîtrise du vocabulaire pharmaceutique, avoir acquis des connaissances fondamentales en pharmacie galénique. Contenu de la matière : OPERATIONS PHARMACEUTIQUES: Pulvérisation-Mélange des poudres-Procédés de séchage-Granulation -Filtration -Stérilisation MELANGE DES LIQUIDES Dissolution- Dispersion : émulsions et suspensions ASSURANCE QUALITE ET REGLEMENTATION PHARMACEUTIQUE TRAVAIL EN ZONES A ATMOSPHERE CONTROLEE Mode d’évaluation : Le contrôle des connaissances acquises est assuré par : • Des travaux dirigés : préparation et présentation orale d’un exposé (travail personnel). • Deux épreuves théoriques : évaluation et contrôle final • Références Y. ROSSETO et collaborateurs. Pharmacotechnie Industrielle π41. 1.M.Y. édition. Vendôme 1998. P. WEHRLE. PHARMACIE GALENIQUE, Formulation et technologie pharmaceutique. Edition MALOINE 2007. C. JEANNIN, A. MANGEOT, A. VERAIN. GALENICA 3. Génie pharmaceutique. Transposition d’échelle. LE HIR. Abrégé de Pharmacie Galénique. Les Bonnes Pratiques de Fabrication des médicaments. 9 ème édition. MASSON. 2009. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 14 Intitulé du master : Chimie Pharmaceutique Semestre : S 2 Intitulé de l’UE : Méthodologie Intitulé de la matière: Techniques expérimentales Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement : Etant donné la spécificité de ce master, les travaux pratiques sont très importants . Cet enseignement vise la consolidation de la l’apprentissage et de la manipulation des produits chimiques, synthèse, purification de produits et analyse Connaissances préalables recommandées La chimie organique est indispensable à la compréhension des mécanismes de synthèse des médicaments. L’étudiant doit aussi avoir des notions de base de chimie expérimentale. Contenu de la matière : Synthèse d’un sulfamide modifié Synthèse d’un analogue d’un anticancéreux, un chloroéthynitrosouré. Contrôle de la qualité d’un médicament. Synthèse malonique du Dicarrboxy-1,1 cyclopropane Synthèse d’un médicament : La benzocaine Synthèse d’un nucléoside à partir d’un ribose convenablement protégé et d’une base disponible Ces synthèses seront suivies par ccm. et l’identification se fera à partir des spectres Infrarouge et la mise à contribution de l’analyse élémentaire disponible au sein de notre laboratoire. Travail personnel : Elaboration de compte rendu pour TP. NB. Ces TP peuvent être remplacés par des TP similaires en fonction des disponibilités Mode d’évaluation : … Compte rendu des TP réalisés et contrôle final …………… Références Chimie Organique expérimentale. Mireille Blancherd-Desce Hermann Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 15 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE : Méthodologie Intitulé de la matière: Les substances Naturelles Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement : Acquisition de connaissances en chimie des produits naturels. Connaissances préalables recommandées : chimie organique de base Contenu de la matière : 1ère partie : Synthèse asymétrique de produits naturels : Généralités et définitions : Substances naturelles, plantes médicinales, médecine traditionnelle, phytothérapie, pharmacognosie, pharmacologie, ethnopharmacologie, phytochimie, phytothérapie. Classification, etude structurale, propriétés biologiques et voies d’accès des : Alcaloides Flavonoides Terpénoides Saponosides Méthodes d’extraction et de séparation de substances naturelles Travaux pratiques : Extraction de l’eugénol des clous de girofle Extraction de la cafeine Travail personnel : Etude d’une plante médicinale régionale (exposé) Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu Références: 1.Harbone, J.B. et Williams, C.A (2001) Avancés dans la reacherche Flafonoides depuis 1992. Phytochimie 2001. Abbrégé de matière médicale, Pharmacognosie, Tome 1.82, Paris H et Hurrabielle, M. 1981. 3. Hess, M. Alkaloids Nature’s Curse of blessing VHCA Zurich 2002. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 16 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE. Méthodologie Intitulé de la matière : Chimie Organométallique Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement L’objectif de ce cours est de présenter les principales familles de complexes organométalliques, les mécanismes de certaines réactions et quelques exemples d’application en catalyse. Connaissances préalables recommandées Bases élémentaires de chimie organique- Structure moléculaire des composés organiques. Contenu de la matière : I-Introduction II-Structure des complexes organométalliques -Généralités -Ligands -Caractéristiques des complexes organométalliques -Règle des 18 électrons -Hapticité des ligands III-Liaison Métal-Ligand IV-Réactions des complexes organométalliques -Addition oxydante -Elimination réductrice -Substitution (échange de ligands) -Insertion V-Principales familles de complexes organométalliques -Carbonyles -Alkyles -Hydrures -Métallocènes VI-Application de la catalyse organométallique -Hydrogénation -Transformation d’oléfines (polymérisation) -Oxydation des hydrocarbures -Carbonylation Mode d’évaluation : …Examen terminal écrit Références -Didier Astruc, Chimie Organométallique. EDP Sciences, 2000. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 17 -Site internet : http ;//chemistry.lsu.edu/stanley/Chem4571-stanley.htm Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE : Transversale Intitulé de la matière : Chimie Verte Crédits : 2 Coefficients : 1 Objectifs de l’enseignement L’objectif de ce cours est de présenter les principes de la chimie verte et leurs intérêts en synthèse organique Connaissances préalables recommandées Bases élémentaires de chimie organique- Structure moléculaire des composés organiques. Contenu de la matière : *.Généralités : chimie verte et développement durable Les 12 principes de la chimie verte *Comment évaluer le caractère éco-compatible d’une réaction Catalyse (homogène, hétérogène et d’oxydation) Biocatalyse (utilisation des enzymes en synthèse organique), Organocatalyse Milieux non usuels (chimie dans l’eau et fluides supercritiques) Matières premières renouvelables (hémisynthèse fine) Economie d’atomes (principes et exemples Mode d’évaluation : …Examen terminal écrit Références/ P.T Anastaz, et G. Warner, Green chemistry theorie and Practice 1998 Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 18 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S2 Intitulé de l’UE : Découverte Intitulé de la matière : Anglais scientifique Crédits : 1 Coefficients : 1 Objectifs de l’enseignement : faire découvrir à l’étudiant l’anglais scientifique Contenu de la matière : Compréhension d’articles scientifiques et rédaction d’abstract Atteindre le niveau B2 Ecrit : compréhension d’article scientifique, et rédaction de lettre Oral : pouvoir s’exprimer avec spontanéité Communication : participation active à des congrès. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 19 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S3 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Rétrosynthèse et stratégie en synthèse Crédits : 5 Coefficients : 4 Objectifs de l’enseignement : maîtrise des protocoles de synthèse des molécules organiques. Connaissances préalables recommandées : Toutes les matières de synthèse organique Contenu de la matière : Cette unité permet l’apprentissage des stratégies aisées et performantes servant à établir un plan de synthèse de molécules cibles, le choix d’une stratégie de synthèse étant fonction d’impératifs structuraux, de la présence de fonctionnalités et aussi d’exigences économiques Différentes stratégies basées sur les grandes réactions stéréosélectives seront étudiées. Quelques rappels en synthèse organique. Stratégie de synthèse : rétrosynthèse (analyse). Notion de dislocation. Synthons logiques…Vocabulaire utilisé en rétrosynthèse. Dislocation d’un groupe C-C. Dislocation des acides carboxyliques. Analyse des composés dioxygénés : 1-2, 1-3, 1-4, 1-5, et 1-6 Analyse rétrosynthétique, convergence, synthons et équivalents synthétiques; Interconversion de groupements foctionnels ; Stratégie de synthèse ; Activation par addition de groupements fonctionnels ; Contrôle de la sélectivité ; Chimie des groupement protectecteurs ; Protection :déprotection de fonctions; Exemples de synthèses totales remarquables Les radicaux libres en synthèse organique : Mécanismes réactionnels, Méthodologies, Contrôle de la stéréochimie, Travail personnel sera dédié à l’élaboration de stratégie simple éco-comptible Mode d’évaluation : …… Examen terminal écrit et contrôle continu Références -Chimie organique t.2 : hétéroéléments et stratégies de synthèse Nicolas Rabasso Editeur : DEBOECK - Stratégie : Synthèse de cours & exercices corrigés Alain Desreumaux (Auteur), Xavier Lecocq (Auteur), Vanessa Warnier (Auteur) Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 20 Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S3 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : les biomolécules Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement : former des étudiants capables de concevoir et de synthétiser selon de nouvelles méthodologies des molécules organiques à visée thérapeutique potentielle, en maîtrisant la compréhension des relations structure- activités ou structure –propriétés. Connaissances préalables recommandées Synthèse organique approfondie Contenu de la matière : Généralités : Acide amines, peptides proteines et sucres Stratégies de synthèse de longs peptides récurrente et par fragments ; nouveaux réactifs de couplage. Synthèse en solution versus synthèse sur support. Nouveaux supports solides utilisables pour la synthèse de longs peptides. Chimie des groupements protecteurs (Boc, Fmoc, Z, CBz, Alloc) Nouveaux groupements protecteurs utilisables dans la synthèse de peptides longs. Stratégies de synthèse de ponts di-sulfures. Réactifs supportés utilisés en synthèse peptidique. Synthèse de protéines par ligation. Méthodes de cyclisation de peptides et pseudopeptides. Méthodes de caractérisation de peptides longs et mini-protéines. Notions d’analyse structurale. Exemples de structure/activité de peptides hormones. Chimie de nucléosides : Généralités : Propriétés biologiques des nucléosides, rôle des nucléosides dans l’ADN. Les pseudonucléosides utilisés en clinique, étude des structures et de l’activité antivirale. Les différentes méthodes d’accès aux nucléosides, étude structurale Etude de publications récentes (mois de 3 ans) dédiées aux nouveaux protocoles de synthèse de nucléosides et nucléotides. Préparation et assemblage de ribonucléosides et polynucléotides. Les différents principes d'assemblage : biosynthèse ribosomale de protèines, synthèse chimioenzymatique d'oligopeptides, synthèse chimique d'oligopeptides en solution et sur support solide, sont présentés et comparés. De même pour la polymérisation enzymatique de nucléoside-triphosphates, synthèse chimique par la méthode de couplage de nucléosidyl-phosphoramidites. Les acides nucléiques (bases puriques et pyrimidiques). Les analogues synthétiques de biomolécules et de médicaments commerciaux) Travail personnel (Etude d’articles récents) Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu Références. THE ORGANIC CHEMISTRY OF DRUG SYNTHESIS DANIEL LEDNICER,Wiley 2007, Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 21 Green et al. Protective Groups in organic Synthesis 4th edition Wiley 2007 Intitulé de l’UE : Fondamentale Semestre : S3 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière : Conception et synthèse de molécules d'intérêt pharmaceutique Crédits : 5 Coefficients : 4 Objectifs de l’enseignement : l’objectif est de former en des chimistes en conception (drug design) et synthèse de molécules bioactives avec une ouverture sur les nouvelles technologies de synthèse Cette matière permet à l’étudiant d’acquérir des compétences solides en conception de molécules analogues aux médicaments commerciaux. Connaissances préalables recommandées: Synthèse : organique approfondie Contenu de la matière : o chimie hétéroaromatique : hétérocycles aromatiques : synthèse et réactivité des hétérocycles azotés « simples » type pyridine, indole...jusqu’aux bases puriques et autres polyhétérocycles-mécanisme d’action de la mitomycine o Réactivité des bases puriques et pyrimidiques (construction de biomolécules dérivés de ces bases) o Intérêt de la chiralité dans l’activité biologique : Exemples et analyse o chimie combinatoire : généralités ; potentiel combinatoire ; criblage ; découverte d’une tête de série ; stratégie de synthèse et d’identification structurale ; méthodologies en phase solide-exemples des peptides, pseudo-peptides et peptidomimétiques o Nature chimique des substances actives et natures chimique et interaction avec la cible. o Génèse des substances actives o Hemisynthèse : hemisynthèse de composés d’intérêt biologique : exemples portant sur la synthèse de produits biologiquement actifs de structure complexe o Notions sur les différentes activités biologiques .(molécules de références et dose thérapeutique). o Travail personnel : Elaboration d’un structure potentiellement active à partir de réactifs commerciaux et bons marché. Mode d’évaluation : Examen terminal écrit et contrôle continu Références Initiation À La Chimie Médicinale - Les Voies De La Découverte Du Médicaments, Marc ADENOT Guide de chimie médicinale et médicaments conception, structure, synthèse, pharmacochimie, mode d'action et activité des médicaments, Auteur : Serge Kirkiacharian. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 22 t Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique Semestre : S3 Intitulé de l’UE : Fondamentale Intitulé de la matière: Chimie pharmaceutique Crédits : 4 Coefficients : 3 Objectifs de l’enseignement: le développement en synthèse, chimie pharmaceutique et produits naturels est de fournir aux étudiants une formation approfondie en chimie organique pharmaceutique. Connaissances préalables recommandées: Chimie pharmaceutique de base et découverte médicamenteuse Contenu de la matière : I-Découverte d’une molécule bioactive: 1- Criblage de substances naturelles -Recherche d’activité. - Synthèse. 2- Approche combinatoire - Synthèse automatique et rapide des molécules. -Criblage expérimental à haut débit (Hight Throughput Screening). - Analyse des informations, tri et évaluation de la diversité moléculaire. 3Conception rationnelle II)- Identification d'une tète de série. 1- Criblage au hasard. 2- Etudes du métabolisme des drogues. 3- Observations cliniques. 3-Conception rationnelle (Rational Drug Design). III)- Développement d’une molécule bioactive: 1- Modification d’une tête de Série. Identification des pharmacophores. -Simplification du Squelette de Base. -Elaboration du Squelette de Base. 2- Modifications de Groupes Fonctionnels. 3- Amélioration de l’efficacité thérapeutique et de l'indice thérapeutique. IV)- Interactions (molécule-Récepteur): 1- Constante de Dissociation. 2- Affinité. 3- Ionisation. 4)- Chiralité. V)- Enzymes, Récepteurs Catalytiques. VI)- Inhibition d’enzymes: 1)- Inhibition Réversible.- Conception Rationnelle à partir du Mécanisme Enzymatique.. Conception d’isostères de l’état de transition correspondant 2- Inhibition Irréversible. Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu Références. Chimie pharmaceutique Graham-L Patrick, S.Kirkiacharian (1996) : Guide de chimie thérapeutique Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 23 Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique Semestre : 3 Intitulé de l’UE : Méthodologie Matière : Développements pharmaceutiques Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit : maîtriser les différentes étapes de mise au point et développement d’un médicament (Princeps, médicament générique) connaître le protocole expérimental de formulation et de fabrication des différentes formes galéniques. Connaissances préalables recommandées: Les étudiants doivent avoir acquis précédemment les éléments fondamentaux des différentes opérations pharmaceutiques. Contenu de la matière : 1. Conception et développement d’un médicament : Princeps, médicament générique 2. Formes orales solides : comprimés, gélules, capsules molles 3. Préparations parentérales 4. Formes à appliquer sur la peau 5. Formes galéniques à libération modifiée 6. Nanoparticules 7. Mode d’évaluation : Le contrôle des connaissances acquises est assuré par : Des travaux dirigés : préparation et présentation orale d’un exposé. Deux épreuves théoriques : évaluation et contrôle final Références 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Y. ROSSETO et collaborateurs. Pharmacotechnie Industriel π41. 1.M.Y. édition. Vendôme 1998. P. WEHRLE. PHARMACIE GALENIQUE, Formulation et technologie pharmaceutique. Edition MALOINE 2007. C. JEANNIN, A. MANGEOT, A. VERAIN. GALENICA 3. Génie pharmaceutique. Transposition d’échelle. LE HIR. Abrégé de Pharmacie Galénique. Les Bonnes Pratiques de Fabrication des médicaments. 9ème édition. MASSON. 2009. A.AICHE, J.G. BESNER, P. BURI, PP Le BLANC. Traité de biopharmacie et pharmacocinétique. 1985. A.M. AICHE. GALÉNICA. Biopharmacie. Lavoisier technique et documentation. 2ème édition. 1982. Assurance de la qualité des produits pharmaceutiques. Volume 1. Recueil de directives et autres documents. OMS. Genève 1998. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 24 Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique Semestre : 3 Intitulé de l’UE : Méthodologie Matière Biologie cellulaire Crédits : 3 Coefficients : 2 Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit : maîtriser les différentes étapes et développement d’un médicament (Princeps, médicament générique) connaître le protocole expérimental de formulation et de fabrication des différentes formes galéniques. Connaissances préalables recommandées: Les étudiants doivent avoir acquis des notions de base de biologie cellulaire Contenu de la matière : Chapitre 1 : Cellules Procaryotes et cellules encaryotes I) Les cellules procaryotes II) Les cellules eucaryotes IIILes caractères distinctifs entre procaryote et eucaryote Chapitre 2 : Méthodes d’études Cellulaires 1) Les méthodes d’observation 2) Les méthodes de fractionnement subcellulaire 3) Diversités des protéines membranaires Chapitre 3 : la membrane cellulaire I) Composition des membranes II) Propriétés des membranes III) Différenciation de la membrane plasmique Chapitre 4:Adhérence cellulaire 1) Les matrices extracellulaires 2) Molécules d’adhérences et jonctions intercellulaires Mode d’évaluation contrôle continue Références : Campbell N.A. Biologie. De Boeck Université 1995 Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 25 Albert Johnson, Lewis, Raff. Biologie moleculaire de la cellule 4eme edition medecine, Flamarion 2004 Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique Semestre : 3 Intitulé de l’UE : Méthodologie Matière modélisation moléculaire II Crédits : 3 Coefficients : 2 1.Modélisation moléculaire (Rappel) La mécanique moléculaire. La Chimie quantique. La Dynamique moléculaire. Spectroscopie. 2. Etude de la réactivité : Etude d’une réaction SN2 Etude d’une réaction d’addition. Les indices de fukui : descripteurs globaux et locaux. 3.Etude de la Relation structure activité et Recherche de la conformation. 1. QSAR et Structure Activité : les Descripteurs 1D, 2D 2. Analyse de données 3. Analyse qualitative Régression multiple linéaire Le modèle non linéaire 4. Réseaux de neurones 5. Analyse combinatoire 6. Algorithmes génétiques Interactions intramoléculaires (Liaisons hydrogéne.) 2. 1. Lipophilie. Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire Réceptorologie Interactions intermoléculaires (Docking) : Les Descripteurs 3D 7. Modélisation des proteines: spécificité des champs de force 8. Interactions Protéine-Protéine 9. Interactions Drogue-Récepteur 10. Comparaison et Superposition : 11. Modélisation des proteines: spécificité des champs de force 12. Interactions Protéine-Protéine 13. Interactions Drogue-Récepteur Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 26 Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique Semestre : 3 Intitulé de l’UE : CONNAISSANCE DU MILIEU PROFESSIONNEL ET INSERTION Matière : modélisation moléculaire II Crédits : 2 Coefficients : 1 L’objectif de cette UE est de mettre les étudiants en situation pour qu’ils perçoivent et contribuent à l’activité de professionnels ayant une formation équivalente au M2 Cette UE est donc majoritairement constituée par un stage obligatoire d’une semaine soit en entreprise soit dans un laboratoire de recherche. Compte tenu des objectifs de la formation, le responsable de l’UE à la charge de valider ou non le stage. La recherche de stage par chaque étudiant est une étape importante de la formation. Chaque étudiant est l’objet d’un suivi personnalité par le responsable de l’UE. avec des conseils pour la rédaction de son CV et de sa lettre de motivation Pour leur recherche de stage, les étudiants ont à leur disposition, comme point de départ, une liste des entreprises ayant par et quelque laboratoires. Avant de partir en stage, les étudiants recevront une formation (environ 4 h) sur la recherche documentaire pour leur permettre de connaitre tre les outils nécessaires à la recherche de l’information. Le stage donnera lieu à une présentation orale de 15 min (avec tout support permis), suivie de questions par les membres du jury constitué par trois enseignants du M2 et du maître de stage. Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 27 Etablissement : Année universitaire : Intitulé du master : Page 28
