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Master-chimie-Pharmaceutique

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III - Programme détaillé par matière
Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : 1
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Chimie avancé I : Mécanismes réactionnels et grandes
réactions
Crédits : 5
Coefficients : 4
Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé conforter ou acquérir un complément de
connaissance en ce qui concerne la synthèse organique, les réactions de bases, leurs modes de
réactivité et leurs mécanismes.
Connaissances préalables recommandées :
Les enseignements de chimie organique de base.
Contenu de la matière :
Réactions de substitution radicalaire sur carbone saturé.
Réaction de substitution nucléophile sur carbone saturé.
Addition sur la double liaison C=C oléfinique
Elimination  (notions de et concepts concernant les réactions d’élimination, Elimination  de H/Hét,
Elimination b de Hét1/Hét2,)
Addition d’hétéronucléophiles sur les hétérocumulènes ainsi que sur les composés carbonylés et leurs
suites réactionnels
Additions ‘d’hydrures et d’organométalliques sur les composés carbonylés
Réaction de substitutions sur les composés aromatiques
Réaction de substitution nucléophile sur le carbone carboxylique C=O
Synthèse organique –Réactivité des composés carbonylés. Aldolisation-crotonisation : autocondensation
crroisée. Réaction de Knoevenagel. Réaction de Mannich. Condensation de Stobbe. Condensation de
Darzens. Réaction de Reformatsky. Réaction de Claisen. Réaction de Dickmann. Réaction de Michael et
aza-Michael. Annélation de Robinson.
Le travail personnel sera axé essentiellement sur des exposés relatifs aux cours dispensés
Mode d’évaluation: Evaluation continue et contrôle final
Références :
1. Mécanismes réactionnels en chimie organique Reinhard Brûckner DeBoeck Université
2. Traité de Chimie Organique. Vollhardt, Schore DeBoeck 3eme editon
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Outils spectroscopiques
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement cet enseignement vise la compréhension des méthodes spectroscopiques
usuelles sur le plan théorique et surtout pratique, qui peuvent s’avérer nécessaires pour élucider les
structures chimiques à partir de spectres (RMN, RMN à deux dimensions, SM et IR).
Connaissances préalables recommandées : Posséder les connaissances de base de la spectroscopie :
Résonance Magnétique Nucléaire, Infrarouge.
Contenu de la matière :
Techniques avancées de Résonance Magnétique Nucléaire multinoyaux. RMN bidimensionnelle.
Application à la détermination de la structure de molécules de synthèse et de composés naturels ;
application à la détermination de la structure de molécules biologiques. Aspects instrumentaux :
Aimants, sondes, techniques RMN HR-MAS, RMN multi-canaux, échantillons. Méthodologie
d'attribution spectrale, spectroscopie de corrélation multi-dimensionnelle homo et hétéronucléaire.
Interprétation en terme structuraux, analyses isotopiques, limites de sensibilité.
Equivalence magnétique (système rigide AMX, ABX et ABC avec trois constantes de couplage.
Spectrométrie RMN du carbone 13. Technique de découplage du 1H, effet Overhauser (NOE), couplage
de spin 13C-1H et DEPT.
Spectrométrie de Corrélation, RMN 2-D.
Théorie, Corrélation H-H COSY, HETCOR, HMBC et HSQC
Techniques avancées de Spectrométrie de Masse : Techniques d'ionisations moléculaires : EI,
CI, LSIMS, FAB, ESI, APCI, MALDI : Techniques instrumentales spécifiques à la spectroscopie de
masse moléculaire : Analyseurs (magnéto-électrostatiques, quadripolaires, trappes ioniques, TOF, ICR)
MS/MS et MSn. Sensibilité, résolution, limite de détection. Interprétation spectrales, fragmentations
moléculaires. Applications de la spectroscopie de masse à l'analyse moléculaire, la détection de trace,
la composition isotopique. Couplage GC/MS et LC/MS. Analyse quantitative en spectrométrie de masse.
Le travail personnel sera consacré à l’étude des spectres de composés complexes de synthèse
Mode d’évaluation: Evaluation continue et contrôle final
Références :
1. Identification spectrométrique de composés organiques : Silverstein. Deboeck Université.2007
2. Méthodes spectroscopiques pour la chimie organique Manfred Hess. Masson 1997
3. Spectrométrie de masse. De Hoffmann
Etablissement :
Année universitaire :
Dunod 2eme édition 1999.
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Chimie Thérapeutique I
Crédits : 5
Coefficients : 4
Objectifs de l’enseignement
Le cours de chimie thérapeutique a pour but de présenter une base cohérente à la reconnaissance et à
l’identification de la nature chimique des principes actifs de leur origine et des circonstances de leur
découverte.
Connaissances préalables recommandées : Connaissance suffisante de la chimie générale et organique,
notions de physiologie et de biologie cellulaire. Comprendre les démarches modernes de conception d'un
médicament et les phases liées à son développement.
-Intégrer l'apport de la chimie de synthèse à l'optimisation des propriétés d'une substance active.
Contenu de la matière :
Introduction à la Chimie Pharmaceutique : but de la chimie thérapeutique, rappel de quelques réactions
importantes en synthèse organique, principes fondamentaux guidant la conception des médicaments,
abrégé des règles de nomenclature de l'I.U.P.A.C. Systématique .
Chimie pharmaceutique et découverte médicamenteuse
*Voies de découverte et optimisation médicamenteuse - Elaboration d’un composé médicinale
*Méthodes qualitatives d’études des relations structure-activité
Synthèse d’analogues structuraux- Préparation d’homologues et de vinylogues- Autres
méthodes physicichimiques- Homologation et Vinylogation
Isostérie- Bioisostérie- Récepteurs et médicaments- Enzymes et médicaments
Canaux ioniques et médicaments- Stéréo-isomérie et médicaments- Modélisation moléculaire
III. Relations quantitatives entre la structure et l’activité biologique : Méthodes de Hansch- Méthode
de Topliss
IV. Caractéristiques pharmacocinétique : Absorption, Distribution, Métabolisme, Elimination (ADME).
V. Nouveaux développement et perspectives thérapeutiques et les essais cliniques.
VII. Plan général d’études des médicaments : Définition- Préparation- Essai- Emploi
Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu
Le travail personnel sera consacré aux l’études des médicaments de synthèse sous forme d’une
présentation orale
Références : chimie pharmaceutique Graham-L Patrick.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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1- Société de chimie thérapeutique(1992). Traité de chimie thérapeutique; volume 2: médicaments
antibiotiques.
Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Cristallographie
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé acquérir des connaissances en ce qui concerne la
cristallographie, les structures atomiques et les réseaux cristallins.
Connaissances préalables recommandées : Les enseignements de chimie organique de base.
Contenu de la matière :
1. Les trois états de l’ordre de la matière : Introduction, les structures désordonnés Les
structures ordonnées : les matériaux dans un état intermédiaires
2. Structure atomique du cristal : Introduction, caractéristiques macroscopiques du cristal,
symétrie, Classification en sept systèmes cristallins introduction à la détermination des
structures cristallines
3. Maille primitive et maille multiple : Introduction, maille primitive, maille mutiple, les 14
réseaux de Bravaix, motif et unité asymétrique, composantes atomiques
4. Réseau Direct/Réseau Réciproque : introduction, direction rangée, famille de plans
réticulaires, réseau réciproque, indices de Miller, règles d’existence des indices
5. Calculs cristallographiques : introduction, calculs géométriques dans l’espace direct, calculs
géométriques dans l’espace réciproque, familles de plans directs et réciproques, densité
réticulaire, plans atomiques.
6. Opération de symétrie des structures cristallines : Introduction, symétrie des polyèdres
cristallins, symétrie des structures périodiques (symétrie de position)
7. Groupes de symétrie tables internationales de cristallographie
Le travail personnel sera dédié à l’étude des travaux de critallographie sur publication
Mode d’évaluation : … Evaluation et contrôle final ……………
Références
1. Cours de cristallographie, P. Perio, laboratoire de cristallographie Univ-Orsay-Sud
2. La structure de la matière du ciel bleu à la matière plastique. A. Guinier Hachette
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Intitulé de la matière : Pharmacologie Générale
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement La pharmacologie a pour finalité la découverte des médicaments et
l’étude de leurs propriétés et de leurs effets sur les organismes vivants, en particulier l’Homme dans la
perspective de leur administration thérapeutique en limitant leurs effets indésirables. Elle est
étroitement liée à la physiologie normale et pathologique
Connaissances préalables recommandées : connaissances générale de chimie pharmaceutique et
biologie cellulaire
Contenu de la matière :
Introduction à la pharmacologie
Les voies d’administration
L’absorption des médicaments
La distribution des médicaments
Le métabolisme des médicaments
L’excrétion des médicaments
Les paramètres pharmacocinétiques
Biodisponibilité et bioéquivalences
Mécanismes d’action des médicaments
Variabilité de l’effet des médicaments
Les différentes manifestations de la réponse pharmacologiques
Les effets indésirables
Le médicament et les fonctions rénale et hépatique
Le médicament en pédiatrique et en gérontologie
La femme et le médicament
Le travail personnel sera consacré aux effets secondaires des médicaments
Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final.
Références :
Pharmacologie B.P. : classes pharmacologiques (4ème édition), denis stora, édition porphyre
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Intitulé de la matière : Modélisation Moléculaire I
Crédits : 3
Coefficients : 2
Intitulé de la matière :
Objectifs de l’enseignement : Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme compétences
après le succès à cette matière.
Connaissances préalables recommandées : Notion de base de modélisation et de chimie quantique
Contenu de la matière :
I.
II.
III.
Modélisation moléculaire (Rappel) : La mécanique moléculaire. La Chimie quantique. La
Dynamique moléculaire. Spectroscopie.
Etude de la réactivité :

Etude d’une réaction SN2

Etude d’une réaction d’addition.

Les indices de fukui : descripteurs globaux et locaux.
Etude de la Relation structure activité et Recherche de la conformation.

QSAR et Structure Activité : les Descripteurs 1D, 2D

Analyse de données

Analyse qualitative Régression multiple linéaire Le modèle non linéaire

Réseaux de neurones

Analyse combinatoire

Algorithmes génétiques
Interactions intramoléculaires (Liaisons hydrogéne..)



Lipophilie.
Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula
Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire
Réceptorologie
Interactions intermoléculaires (Docking) : Les Descripteurs 3D

Modélisation des proteines: spécificité des champs de force

Interactions Protéine-Protéine

Interactions Drogue-Récepteur

Comparaison et Superposition :

Modélisation des proteines: spécificité des champs de force

Interactions Protéine-Protéine

Interactions Drogue-Récepteur
Le travail personnel sera dédié à la familiarisation des étudiants aux logiciels de modélisation
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Références:
La modélisation moléculaire à la découverte des composés bioactifs. Dragos Horvath éditions universitaires européennes
- P.A. Cox, « Introduction to quantum theory and atomic structure” , Oxford academic press, London, 1996 . - Castejon, H.;
Wiberg, K. B.. J Comput Chem, 25:461-467,2004.
Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Intitulé de la matière : Synthèse Asymétrique
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
La Synthèse asymétrique est permet l’accès aux molécules énantiomériquement enrichies. Cette
finalité est d’autant plus justifié que les molécules naturelles sont, pour la plus part, chirales.
Ce cours est consacré à la synthèse asymétrique et ses applications. Il décrit Les applications des
auxilliaires, des réactifs et des catalyseurs chiraux en synthèse asymétrique.
Connaissances préalables recommandées : Synthèse organique - Stéréochimie
Contenu de la matière :
Généralités : (Théorie de l’état de transition à l’induction asymétrique, effets conformationnels,
influence des ligands chiraux
Induction asymétrique : Réactions diastéréosélectives, Mécanismes, création de la liaisin C-C.
Utilisation de copules chirales et réactifs chiraux (dérivés d’alcools, d’amines, d’amino-alcools
et de sulfoxydes)
Réactifs chiraux
Déprotonations et protonations asymétriques
Addition s aux groupes C=O et C=N
Catalyse asymétrique : (catalyseurs chiraux et ligands chiraux).
Application en synthèse.
Analyses et séparations de molécules chirales.
RMN, diffraction de rayons X, chromatographie HPLC. Dédoublements chimique et enzymatiqie
Le travail personnel portera sur l’étude de l’importance des composés chiraux en pharmacologie
Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final.
Références :
Synthèse et catalyse asymétrique, Jacqueline Seyden-Penne CNRS Editions
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Transversale
Intitulé de la matière : Chémoinformatique
Crédits : 2
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement :
Elle a pour objectif de fournir des outils et des méthodes pour l'analyse et le traitement des données
issues des différents domaines de la chimie. Elle est notamment utilisée en pharmacologie pour la
découverte de nouvelles molécules actives et la prédiction de propriétés à partir de structures
moléculaires.
Connaissances préalables recommandées : informatique de base
Contenu de la matière :

gestion de bases de données de molécules et de réactions ;

prédiction de propriétés physiques, chimiques ou biologiques ;

aide pour la conception de nouveaux médicaments ;

résolution de structures moléculaires ;

prédiction de réactions chimiques

conception de protocoles de synthèse chimique.
Le travail personnel consiste en l’élaboration des plans d’expérience

Mode d’évaluation : …● contrôle + examen final.
Références :
1.Lahana R. 1996, similitude moléculaire et activité biologique pour Pour la sciences 212, 45-60
2.Villoutreix et al., Drug Discovery Today, 18:1081-9, 2013)
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Découverte
Intitulé de la matière : Anglais Scientifique
Crédits : 1
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement : faire découvrir à l’étudiant l’anglais scientifique
Contenu de la matière :
Compréhension d’articles scientifiques et rédaction d’abstract
Atteindre le niveau 2
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Chimie Organique Avancée II
Crédits : 5
Coefficients : 4
Objectifs de l’enseignement : l’étudiant est censé conforter ou acquérir un complément de
connaissance en ce qui concerne la synthèse organique, les réactions de bases, leurs modes de
réactivité et leurs mécanismes.
Connaissances préalables recommandées :
Les enseignements de chimie organique de base.
Contenu de la matière :
1. Composés organiques polyfonctionnels : diènes, polènes, composés di et polyhalogénés, diols,
polyols, composés polycarbonylés, diacides, composés carbonylés insaturés, hydroxyacides,
lactones, phénol, oxazolidinones, oxazaphosphospholidinones, quinones, oxiranes, polymères.
2. Chimie des hétérocycles
Cycles à 6 chaînons saturés et non saturés (pyridines, sels de pyridinium et de thiopyridinum,
quinoléines, isoquinoleines, sels de benzopyrylium, acridines, phenanthridines, pyrimidines et
purines
Méthode de synthèse et mécanisme
Réactivité, Oxydation et Réduction
L’importance des hétérocycles dans le domaine médical.
3. Les macromolécules (7 chaînons ou plus)
Les méthodes de synthèse
Propriétés chimiques et étude de complexes (ligands, catalyseurs)
4. Rôle des solvants en chimie organique (solubilité, effet de polarité, propriétés, constante
diélectrique).
5. Procédés et Techniques de synthèse pour une chimie économe et éco-compatible (notion de
chimie verte).
Le travail personnel sera consacré aux réactions les plus cités dans la littérature sur des thèmes qui
seront définis en relation avec le cours.
Mode d’évaluation : … Evaluation et contrôle final ……………
Références
Chimie Organique II, David M.Klein
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Chimie Organique 7ème édition, John E. Mc Murry
Chimie Organique Methodes et Modèles . PierreVogel DeBoeck Université
Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière: Chimie Thérapeutique II
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement : Au terme de cet apprentissage, l’apprenant doit connaître les
principales familles de médicaments (de leurs structures, synthèses à leur pharmacologie), et proposer
en se basant sur les RSA et s’inspirant des développements des recherches, la synthèse de nouvelles
molécules.
Connaissances préalables recommandées
La chimie organique est indispensable à la compréhension des mécanismes de synthèse des
médicaments. L’étudiant doit aussi avoir des notions de base en pharmacologie et en galénique.
Contenu de la matière :
1.
Enseignements théoriques
Recherche thérapeutique: état des lieux et prospectives
Les grandes voies d'obtention des médicaments.
Application des relations Structure-Activité.
Les médicaments du système cardiovasculaires
Les antalgiques
Les anesthésiques
Les catécholamines
Atropines et dérivés
Éphédrine et dérivés
Les anti-sécrétoires
Les normolipémiants
Les anticancéreux
Mode d’évaluation :
QRC et QCM
Références
1.
Association française des enseignements de chimie thérapeutique(2003). Traité de chimie
thérapeutique; volume 6: médicaments anti tumoraux et perspectives dans le traitement des
cancers.
2. Goodman et Gilman (1998). Les bases pharmacologiques de l’utilisation des médicaments.
3. S.Kirkiacharian (1996) : Guide de chimie thérapeutique
4. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 1
5. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 2
6. A.Lespagnol (1974) : chimie des médicaments ; tome 3
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre: S2
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Chimie Analytique approfondie
Crédits : 5
Coefficients : 4
Enseignant responsable de la matière : Pr. LOUHI Achour
Objectifs de l’enseignement : approfondir et compléter les notions de chimie analytique
acquises au parcours de Licence chimie organique pharmaceutique. Maîtriser les techniques de
dosages par spectrophotométrie Uv/Vis afin d’étudier les spectres d’absorption, les dosages
des substances organiques ou des médicaments ainsi que leurs dégradation. La spectrométrie
d’émission et d’absorption atomique par flamme et plasma ainsi que la Spectrométrie de
fluorescence X pour la détection des minéraux.
Connaissances préalables recommandées : Chimie Analytique (Partie ; Spectrométrie
élémentaire).
Contenu de la matière :
Spectrophotométrie Uv/Vis : Spectre d’absorption moléculaire. Loi de Beer-Lambert. Cœfficient
d’extinction molaire. Lois de déplacement d’équilibres. Application aux dosages.
Spectrométrie d’émission atomique : Principe, intensité d’émission, applications analytiques. Emission de
plasma par courant direct (DCP-AES), couplé par induction (ICP-AES) : notion de plasma, principe,
dispositif d’excitation, système dispersifs et raies spectrales, paramètres optimaux, appareils
simultanés et séquentiels, emploi analytique.
Spectroscopie d’absorption atomique : Principe, effet de la température sur un élément –loi de
répartition de Maxwell Boltzmann, Coefficient d’absorption, absorption intégrée, Instrumentation de
base, générateurs d’atomes, raies de résonance, brûleurs, atomiseurs sans flamme (électrothermie),
Perturbations physiques et chimiques. Effets de matrice (interférences). Applications analytiques :
Dosages indirects : compléxation, extraction liquide-liquide, résine échangeuse d’ions.
- Spectrométrie de fluorescence X : Principe de base. Etude des spectres. Effet photoélectrique. Loi
globale (Bragg, Moseley et Bragg-Pierre). Rendement de fluorescence. Mode d’excitation des éléments :
tubes scellés, sources radio-isotopiques. Appareillage. Préparation des échantillons. Densimétrie.
Application analytique.
Le travail personnel sera axé des études de comparaison des différentes méthodes
Références :
[1] F. ROUESSAC., A. ROUESSAC. -Analyse chimique. Méthodes et techniques instrumentales modernes.
Cours et exercices corrigés. 1er Cycle/Licence Pharmacie. 6ème édition. DUNOD, Paris 2004.
[2] D.A. SKOOG., D.M. WEST., F.J. HOLLER. -Fundamental of Analytical Chemistry (7 th Int. Ed),
Saunders College Publishing, 1996.
[3] T.R SREEKRISHAN, T.R. TYAGI.-Heavy metal leaching from sewage sludge’s: A Techno-Economic
Evaluation of the Process options 2005.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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[4] J.VANDEGANS., A-M. KERSABIEC., M. HOENIG.-Technique de l’ingénieur. Traité d'analyse et
caractérisation. P2825 .p1-27. 2006.
[5] P.GALEZ. -Mesures physiques Techniques spectrométriques et nucléaires, Absorption atomique et
émission de flamme. 2006.
Intitulé du master : Chimie Pharmaceutique
Semestre : S 2
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière: Techniques Pharmaceutiques Industrielles
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit :
-maîtriser les méthodes, les techniques et les paramètres clés de l’ensemble des opérations
pharmaceutiques intervenant dans la formulation des différentes formes galéniques.
-connaître les exigences réglementaires en matière d’assurance qualité pharmaceutique
-acquérir les éléments nécessaires pour travailler dans une zone à atmosphère contrôlée
Connaissances préalables recommandées
Maîtrise du vocabulaire pharmaceutique, avoir acquis des connaissances fondamentales en pharmacie
galénique.
Contenu de la matière :
OPERATIONS PHARMACEUTIQUES:
Pulvérisation-Mélange des poudres-Procédés de séchage-Granulation -Filtration -Stérilisation
MELANGE DES LIQUIDES
Dissolution- Dispersion : émulsions et suspensions
ASSURANCE QUALITE ET REGLEMENTATION PHARMACEUTIQUE
TRAVAIL EN ZONES A ATMOSPHERE CONTROLEE
Mode d’évaluation :
Le contrôle des connaissances acquises est assuré par :
• Des travaux dirigés : préparation et présentation orale d’un exposé (travail personnel).
• Deux épreuves théoriques : évaluation et contrôle final
•
Références
Y. ROSSETO et collaborateurs. Pharmacotechnie Industrielle π41. 1.M.Y. édition. Vendôme 1998. P. WEHRLE.
PHARMACIE GALENIQUE, Formulation et technologie pharmaceutique. Edition MALOINE 2007. C. JEANNIN, A.
MANGEOT, A. VERAIN. GALENICA 3. Génie pharmaceutique. Transposition d’échelle. LE HIR. Abrégé de
Pharmacie Galénique. Les Bonnes Pratiques de Fabrication des médicaments. 9 ème édition. MASSON. 2009.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du master : Chimie Pharmaceutique
Semestre : S 2
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Intitulé de la matière: Techniques expérimentales
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement :
Etant donné la spécificité de ce master, les travaux pratiques
sont très importants . Cet
enseignement vise la consolidation de la l’apprentissage et de la manipulation des produits
chimiques, synthèse, purification de produits et analyse
Connaissances préalables recommandées
La chimie organique est indispensable à la compréhension des mécanismes de synthèse des
médicaments. L’étudiant doit aussi avoir des notions de base de chimie expérimentale.
Contenu de la matière :
Synthèse d’un sulfamide modifié
Synthèse d’un analogue d’un anticancéreux, un chloroéthynitrosouré.
Contrôle de la qualité d’un médicament.
Synthèse malonique du Dicarrboxy-1,1 cyclopropane
Synthèse d’un médicament : La benzocaine
Synthèse d’un nucléoside à partir d’un ribose convenablement protégé et d’une base disponible
Ces synthèses seront suivies par ccm. et l’identification se fera à partir des spectres Infrarouge et la
mise à contribution de l’analyse élémentaire disponible au sein de notre laboratoire.
Travail personnel : Elaboration de compte rendu pour TP.
NB. Ces TP peuvent être remplacés par des TP similaires en fonction des disponibilités
Mode d’évaluation : … Compte rendu des TP réalisés et contrôle final ……………
Références
Chimie Organique expérimentale. Mireille Blancherd-Desce Hermann
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Intitulé de la matière: Les substances Naturelles
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement : Acquisition de connaissances en chimie des produits naturels.
Connaissances préalables recommandées : chimie organique de base
Contenu de la matière :
1ère partie : Synthèse asymétrique de produits naturels :
Généralités et définitions :
Substances naturelles, plantes médicinales, médecine traditionnelle, phytothérapie, pharmacognosie,
pharmacologie, ethnopharmacologie, phytochimie, phytothérapie.
Classification, etude structurale, propriétés biologiques et voies d’accès des :
Alcaloides
Flavonoides
Terpénoides
Saponosides
Méthodes d’extraction et de séparation de substances naturelles
Travaux pratiques :
Extraction de l’eugénol des clous de girofle
Extraction de la cafeine
Travail personnel : Etude d’une plante médicinale régionale (exposé)
Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu
Références:
1.Harbone, J.B. et Williams, C.A (2001) Avancés dans la reacherche Flafonoides depuis 1992. Phytochimie 2001.
Abbrégé de matière médicale, Pharmacognosie, Tome 1.82, Paris H et Hurrabielle, M. 1981.
3. Hess, M. Alkaloids Nature’s Curse of blessing VHCA Zurich 2002.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE. Méthodologie
Intitulé de la matière : Chimie Organométallique
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement
L’objectif de ce cours est de présenter les principales familles de complexes organométalliques, les
mécanismes de certaines réactions et quelques exemples d’application en catalyse.
Connaissances préalables recommandées
Bases élémentaires de chimie organique- Structure moléculaire des composés organiques.
Contenu de la matière :
I-Introduction
II-Structure des complexes organométalliques
-Généralités
-Ligands
-Caractéristiques des complexes organométalliques
-Règle des 18 électrons
-Hapticité des ligands
III-Liaison Métal-Ligand
IV-Réactions des complexes organométalliques
-Addition oxydante
-Elimination réductrice
-Substitution (échange de ligands)
-Insertion
V-Principales familles de complexes organométalliques
-Carbonyles
-Alkyles
-Hydrures
-Métallocènes
VI-Application de la catalyse organométallique
-Hydrogénation
-Transformation d’oléfines (polymérisation)
-Oxydation des hydrocarbures
-Carbonylation
Mode d’évaluation : …Examen terminal écrit
Références
-Didier Astruc, Chimie Organométallique. EDP Sciences, 2000.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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-Site internet : http ;//chemistry.lsu.edu/stanley/Chem4571-stanley.htm
Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : Transversale
Intitulé de la matière : Chimie Verte
Crédits : 2
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement
L’objectif de ce cours est de présenter les principes de la chimie verte et leurs intérêts en synthèse
organique
Connaissances préalables recommandées
Bases élémentaires de chimie organique- Structure moléculaire des composés organiques.
Contenu de la matière :
*.Généralités : chimie verte et développement durable
Les 12 principes de la chimie verte
*Comment évaluer le caractère éco-compatible d’une réaction






Catalyse (homogène, hétérogène et d’oxydation)
Biocatalyse (utilisation des enzymes en synthèse organique),
Organocatalyse
Milieux non usuels (chimie dans l’eau et fluides supercritiques)
Matières premières renouvelables (hémisynthèse fine)
Economie d’atomes (principes et exemples
Mode d’évaluation : …Examen terminal écrit
Références/
P.T Anastaz, et G. Warner, Green chemistry theorie and Practice 1998
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S2
Intitulé de l’UE : Découverte
Intitulé de la matière : Anglais scientifique
Crédits : 1
Coefficients : 1
Objectifs de l’enseignement : faire découvrir à l’étudiant l’anglais scientifique
Contenu de la matière :
Compréhension d’articles scientifiques et rédaction d’abstract
Atteindre le niveau B2
Ecrit : compréhension d’article scientifique, et rédaction de lettre
Oral : pouvoir s’exprimer avec spontanéité
Communication : participation active à des congrès.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Rétrosynthèse et stratégie en synthèse
Crédits : 5
Coefficients : 4
Objectifs de l’enseignement : maîtrise des protocoles de synthèse des molécules organiques.
Connaissances préalables recommandées : Toutes les matières de synthèse organique
Contenu de la matière :
Cette unité permet l’apprentissage des stratégies aisées et performantes servant à établir un plan de
synthèse de molécules cibles, le choix d’une stratégie de synthèse étant fonction d’impératifs
structuraux, de la présence de fonctionnalités et aussi d’exigences économiques
Différentes stratégies basées sur les grandes réactions stéréosélectives seront étudiées.
Quelques rappels en synthèse organique. Stratégie de synthèse : rétrosynthèse (analyse). Notion de
dislocation. Synthons logiques…Vocabulaire utilisé en rétrosynthèse. Dislocation d’un groupe C-C.
Dislocation des acides carboxyliques. Analyse des composés dioxygénés : 1-2, 1-3, 1-4, 1-5, et 1-6
Analyse rétrosynthétique, convergence, synthons et équivalents synthétiques; Interconversion de
groupements foctionnels ; Stratégie de synthèse ; Activation par addition de groupements fonctionnels
; Contrôle de la sélectivité ;
Chimie des groupement protectecteurs ; Protection :déprotection de fonctions; Exemples de synthèses
totales remarquables
Les radicaux libres en synthèse organique : Mécanismes réactionnels, Méthodologies, Contrôle de la
stéréochimie,
Travail personnel sera dédié à l’élaboration de stratégie simple éco-comptible
Mode d’évaluation : …… Examen terminal écrit et contrôle continu
Références
-Chimie organique t.2 : hétéroéléments et stratégies de synthèse Nicolas Rabasso Editeur : DEBOECK
- Stratégie : Synthèse de cours & exercices corrigés Alain Desreumaux (Auteur), Xavier Lecocq (Auteur), Vanessa
Warnier (Auteur)
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : les biomolécules
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement : former des étudiants capables de concevoir et de synthétiser selon de
nouvelles méthodologies des molécules organiques à visée thérapeutique potentielle, en maîtrisant la
compréhension des relations structure- activités ou structure –propriétés.
Connaissances préalables recommandées Synthèse organique approfondie
Contenu de la matière :
Généralités : Acide amines, peptides proteines et sucres
Stratégies de synthèse de longs peptides récurrente et par fragments ; nouveaux réactifs de couplage.
Synthèse en solution versus synthèse sur support. Nouveaux supports solides utilisables pour la
synthèse de longs peptides.
Chimie des groupements protecteurs (Boc, Fmoc, Z, CBz, Alloc) Nouveaux groupements protecteurs
utilisables dans la synthèse de peptides longs.
Stratégies de synthèse de ponts di-sulfures. Réactifs supportés utilisés en synthèse peptidique.
Synthèse de protéines par ligation. Méthodes de cyclisation de peptides et pseudopeptides. Méthodes
de caractérisation de peptides longs et mini-protéines. Notions d’analyse structurale. Exemples de
structure/activité de peptides hormones.
Chimie de nucléosides :
Généralités : Propriétés biologiques des nucléosides, rôle des nucléosides dans l’ADN.
Les pseudonucléosides utilisés en clinique, étude des structures et de l’activité antivirale.
Les différentes méthodes d’accès aux nucléosides, étude structurale
Etude de publications récentes (mois de 3 ans) dédiées aux nouveaux protocoles de synthèse de
nucléosides et nucléotides.
Préparation et assemblage de ribonucléosides et polynucléotides. Les différents principes
d'assemblage : biosynthèse ribosomale de protèines, synthèse chimioenzymatique d'oligopeptides,
synthèse chimique d'oligopeptides en solution et sur support solide, sont présentés et comparés. De
même pour la polymérisation enzymatique de nucléoside-triphosphates, synthèse chimique par la
méthode de couplage de nucléosidyl-phosphoramidites. Les acides nucléiques (bases puriques et
pyrimidiques). Les analogues synthétiques de biomolécules et de médicaments commerciaux)
Travail personnel (Etude d’articles récents)
Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu
Références.
THE ORGANIC CHEMISTRY OF DRUG SYNTHESIS DANIEL LEDNICER,Wiley 2007,
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Green et al. Protective Groups in organic Synthesis 4th edition Wiley 2007
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Conception et synthèse de molécules d'intérêt pharmaceutique
Crédits : 5
Coefficients : 4
Objectifs de l’enseignement : l’objectif est de former en des chimistes en conception (drug design)
et synthèse de molécules bioactives avec une ouverture sur les nouvelles technologies de synthèse
Cette matière permet à l’étudiant d’acquérir
des compétences solides en conception de molécules
analogues aux médicaments commerciaux.
Connaissances préalables recommandées: Synthèse : organique approfondie
Contenu de la matière :
o
chimie hétéroaromatique : hétérocycles aromatiques : synthèse et réactivité des
hétérocycles azotés « simples » type pyridine, indole...jusqu’aux bases puriques et
autres polyhétérocycles-mécanisme d’action de la mitomycine
o
Réactivité des bases puriques et pyrimidiques (construction de biomolécules dérivés
de ces bases)
o
Intérêt de la chiralité dans l’activité biologique : Exemples et analyse
o
chimie combinatoire : généralités ; potentiel combinatoire ; criblage ; découverte d’une
tête de série ; stratégie de synthèse et d’identification structurale ; méthodologies en
phase solide-exemples des peptides, pseudo-peptides et peptidomimétiques
o
Nature chimique des substances actives et natures chimique et interaction avec la
cible.
o
Génèse des substances actives
o
Hemisynthèse : hemisynthèse de composés d’intérêt biologique : exemples portant sur
la synthèse de produits biologiquement actifs de structure complexe
o
Notions sur les différentes activités biologiques .(molécules de références et dose
thérapeutique).
o
Travail personnel : Elaboration d’un structure potentiellement active à partir de
réactifs commerciaux et bons marché.
Mode d’évaluation : Examen terminal écrit et contrôle continu
Références
Initiation À La Chimie Médicinale - Les Voies De La Découverte Du Médicaments, Marc ADENOT
Guide de chimie médicinale et médicaments
conception, structure, synthèse, pharmacochimie, mode d'action et activité des médicaments, Auteur : Serge
Kirkiacharian.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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t
Intitulé du Master : Chimie Organique Pharmaceutique
Semestre : S3
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière: Chimie pharmaceutique
Crédits : 4
Coefficients : 3
Objectifs de l’enseignement: le développement en synthèse, chimie pharmaceutique et produits
naturels est de fournir aux étudiants une formation approfondie en chimie organique pharmaceutique.
Connaissances
préalables
recommandées:
Chimie
pharmaceutique
de
base
et
découverte
médicamenteuse
Contenu de la matière :
I-Découverte d’une molécule bioactive:
1- Criblage de substances naturelles -Recherche d’activité. - Synthèse. 2- Approche combinatoire
- Synthèse automatique et rapide des molécules. -Criblage expérimental à haut débit (Hight
Throughput Screening). - Analyse des informations, tri et évaluation de la diversité moléculaire. 3Conception rationnelle
II)- Identification d'une tète de série. 1- Criblage au hasard. 2- Etudes du métabolisme des
drogues. 3- Observations cliniques. 3-Conception rationnelle (Rational Drug Design).
III)- Développement d’une molécule bioactive: 1- Modification d’une tête de Série. Identification des pharmacophores. -Simplification du Squelette de Base. -Elaboration du
Squelette de Base. 2- Modifications de Groupes Fonctionnels. 3- Amélioration de l’efficacité
thérapeutique et de l'indice thérapeutique.
IV)- Interactions (molécule-Récepteur): 1- Constante de Dissociation. 2- Affinité. 3- Ionisation.
4)- Chiralité.
V)- Enzymes, Récepteurs Catalytiques.
VI)- Inhibition d’enzymes: 1)- Inhibition Réversible.- Conception Rationnelle à partir du Mécanisme
Enzymatique.. Conception d’isostères de l’état de transition correspondant
2- Inhibition
Irréversible.
Mode d’évaluation : … Examen terminal écrit et contrôle continu
Références.
Chimie pharmaceutique Graham-L Patrick,
S.Kirkiacharian (1996) : Guide de chimie thérapeutique
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique
Semestre : 3
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Matière :
Développements pharmaceutiques
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit :
 maîtriser les différentes étapes de mise au point et développement d’un médicament (Princeps,
médicament générique)

connaître le protocole expérimental de formulation et de fabrication des différentes formes
galéniques.
Connaissances préalables recommandées: Les étudiants doivent avoir acquis précédemment les
éléments fondamentaux des différentes opérations pharmaceutiques.
Contenu de la matière :
1. Conception et développement d’un médicament : Princeps, médicament générique
2. Formes orales solides : comprimés, gélules, capsules molles
3. Préparations parentérales
4. Formes à appliquer sur la peau
5. Formes galéniques à libération modifiée
6. Nanoparticules
7.
Mode d’évaluation : Le contrôle des connaissances acquises est assuré par :
 Des travaux dirigés : préparation et présentation orale d’un exposé.
 Deux épreuves théoriques : évaluation et contrôle final
Références
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Y. ROSSETO et collaborateurs. Pharmacotechnie Industriel π41. 1.M.Y. édition. Vendôme
1998.
P. WEHRLE. PHARMACIE GALENIQUE, Formulation et technologie pharmaceutique. Edition
MALOINE 2007.
C. JEANNIN, A. MANGEOT, A. VERAIN. GALENICA 3. Génie pharmaceutique. Transposition
d’échelle.
LE HIR. Abrégé de Pharmacie Galénique. Les Bonnes Pratiques de Fabrication des
médicaments. 9ème édition. MASSON. 2009.
A.AICHE, J.G. BESNER, P. BURI, PP Le BLANC. Traité de biopharmacie et pharmacocinétique.
1985.
A.M. AICHE. GALÉNICA. Biopharmacie. Lavoisier technique et documentation. 2ème édition.
1982.
Assurance de la qualité des produits pharmaceutiques. Volume 1. Recueil de directives et
autres documents. OMS. Genève 1998.
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique
Semestre : 3
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Matière Biologie cellulaire
Crédits : 3
Coefficients : 2
Objectifs de l’enseignement : A L’issu de la formation, l’étudiant doit :
 maîtriser les différentes étapes et développement d’un médicament (Princeps, médicament
générique)

connaître le protocole expérimental de formulation et de fabrication des différentes formes
galéniques.
Connaissances préalables recommandées: Les étudiants doivent avoir acquis des notions de base de
biologie cellulaire
Contenu de la matière :
Chapitre 1 : Cellules Procaryotes et cellules encaryotes
 I) Les cellules procaryotes



II) Les cellules eucaryotes
IIILes caractères distinctifs entre procaryote et eucaryote
Chapitre 2 : Méthodes d’études Cellulaires

1) Les méthodes d’observation
2) Les méthodes de fractionnement subcellulaire
3) Diversités des protéines membranaires
Chapitre 3 : la membrane cellulaire



I) Composition des membranes
II) Propriétés des membranes
III) Différenciation de la membrane plasmique
Chapitre 4:Adhérence cellulaire
1) Les matrices extracellulaires
2) Molécules d’adhérences et jonctions intercellulaires
Mode d’évaluation contrôle continue
Références :
Campbell N.A. Biologie. De Boeck Université 1995
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
Page 25
Albert Johnson, Lewis, Raff. Biologie moleculaire de la cellule 4eme edition medecine, Flamarion 2004
Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique
Semestre : 3
Intitulé de l’UE : Méthodologie
Matière modélisation moléculaire II
Crédits : 3
Coefficients : 2
1.Modélisation moléculaire (Rappel)

La mécanique moléculaire.

La Chimie quantique.

La Dynamique moléculaire.

Spectroscopie.
2. Etude de la réactivité :

Etude d’une réaction SN2

Etude d’une réaction d’addition.

Les indices de fukui : descripteurs globaux et locaux.
3.Etude de la Relation structure activité et Recherche de la conformation.
1.
QSAR et Structure Activité : les Descripteurs 1D, 2D
2. Analyse de données
3. Analyse qualitative Régression multiple linéaire Le modèle non linéaire
4. Réseaux de neurones
5. Analyse combinatoire
6. Algorithmes génétiques
Interactions intramoléculaires (Liaisons hydrogéne.)
2.



1.
Lipophilie.
Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula
Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire
Réceptorologie
Interactions intermoléculaires (Docking) : Les Descripteurs 3D
7. Modélisation des proteines: spécificité des champs de force
8. Interactions Protéine-Protéine
9. Interactions Drogue-Récepteur
10. Comparaison et Superposition :
11. Modélisation des proteines: spécificité des champs de force
12. Interactions Protéine-Protéine
13. Interactions Drogue-Récepteur
Etablissement :
Année universitaire :
Intitulé du master :
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Intitulé du master : Chimie organique pharmaceutique
Semestre : 3
Intitulé de l’UE : CONNAISSANCE DU MILIEU PROFESSIONNEL ET INSERTION
Matière : modélisation moléculaire II
Crédits : 2
Coefficients : 1
L’objectif de cette UE est de mettre les étudiants en situation pour qu’ils perçoivent et contribuent à
l’activité de professionnels ayant une formation équivalente au M2
Cette UE est donc majoritairement constituée par un stage obligatoire d’une semaine soit en
entreprise soit dans un laboratoire de recherche.
Compte tenu des objectifs de la formation, le responsable de l’UE à la charge de valider ou non le
stage.
La recherche de stage par chaque étudiant est une étape importante de la formation. Chaque étudiant
est l’objet d’un suivi personnalité par le responsable de l’UE. avec des conseils pour la rédaction de son
CV et de sa lettre de motivation
Pour leur recherche de stage, les étudiants ont à leur disposition, comme point de départ, une liste des
entreprises ayant par et quelque laboratoires.
Avant de partir en stage, les étudiants recevront une formation (environ 4 h) sur la recherche
documentaire pour leur permettre de connaitre tre les outils nécessaires à la recherche de
l’information.
Le stage donnera lieu à une présentation orale de 15 min (avec tout support permis), suivie de
questions par les membres du jury constitué par trois enseignants du M2 et du maître de stage.
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