Telechargé par yass bba

genes (1)

publicité
Prédiction des
gènes
Réalisé Par :
- Ben hamida yasser
- Medjaaf abbes)
- Alloune moustapha
Disposition de titre et de contenu avec liste
• Introduction
• Définition de prédiction des gènes
• Problématique
• Définition d'une gène
• Prédiction de gènes à partir d’une plateforme informatique
• Approches existantes en bio-informatique pour la détection de gènes.
• Cadre de lecture ouvert
• Exemple.
• Utilisation possible.
• Conclusion.
introduction:
• Le projet du génome humain ‘The Human Genome Project‘ (HGP) débutât
dans les années 1990, et consistait à déterminer la séquence complète du
code génétique (ADN) chez l’homme. La première carte génétique de
l’homme a été publiée par Schuler et coll. en 1996. Plus de 2000
scientifiques, et au-delà de 20 instituts provenant de six pays collaboraient
à la première ébauche du génome humain [L’achèvement du projet de
séquençage du génome humain a bénéficié de l’utilisation des installations
de séquençage ainsi que de ses ressources considérable afin d’effectuer des
projets encore plus ambitieux Un exemple d'un tel projet a pour objectif de
séquencer la totalité 2 des microbes du corps humain permettant une vue
de l’homme comme étant un super organisme.
Définition de prédiction des gènes:
• En bioinformatique , la prédiction de gènes consiste à identifier les zones de l'ADN qui
correspondent à des genes .
• la prédiction de gènes sont d’une importance considérable pour la santé humaine et la
médecine. Les gènes, qui ont une importance cruciale dans la fabrication des protéines, font
l’objet de nombreuses recherches pour différencier les régions codantes de celles non
codantes de l’ADN. Depuis le projet du génome humain, plusieurs chercheurs croient qu'il est
possible d'effectuer la prédiction de gènes à partir d'une plateforme informatique
Problématique:
• à quoi sert
• l’information contenue dans un gène?.
et
• A à quoi sert
La prediction des genes?
Définition d'une gène:
• Un gène, en génétique, est une unité de base d'hérédité qui en principe
prédétermine un trait précis de la forme d'un organisme vivant, tel que défini en
1909 par Wilhelm Johannsen. Au point de vue physique, un gène est un fragment
du locus déterminé d'une séquence d'ADN.
gène
Prédiction de gènes à partir d’une
plateforme informatique:
• La fin du 20e et le début du 21e siècle furent témoins
d’extraordinaires découvertes en sciences fondamentales et plus
particulièrement en biologie moléculaire et en informatique. Les
dérivés de l’informatique sont devenus des outils quotidiens. De nos
jours, plusieurs centres de recherche séquencent des génomes de
façon régulière. Cette masse d’information qui afflue sans cesse
justifie un besoin de développer des outils informatiques pour
l’analyse de ces séquences. Outre son intérêt dans la communauté
scientifique, la génomique et la prédiction de gènes sont d’une
importance considérable pour la santé humaine et la médecine. Les
gènes, qui ont une importance cruciale dans la fabrication des
protéines, font l’objet de nombreuses recherches pour différencier les
régions codantes de celles non codantes de l’ADN. Depuis le projet du
génome humain, plusieurs chercheurs croient qu'il est possible
d'effectuer la prédiction de gènes à partir d'une plateforme
informatique.
Approches existantes en bio-informatique pour la
détection de gènes:
• Prédiction par similitude: Les
méthodes par similitudes, aussi appelées
méthodes par homologie ou méthodes extrinsèques, consistent à utiliser
des informations extérieures au génome pour trouver les gènes. Plus
précisément, ces méthodes consistent à comparer la séquence étudiée
avec des séquences connues, rassemblées dans les bases de données. Par
exemple les séquences associées à des marqueurs de séquence
exprimée ou des ARN messagers sont utilisées.
• Prédiction Ab Initio: sont
des méthodes qui ne travaillent que sur la
séquence elle-même. De façon générale il y a deux propriétés qui
permettent de trouver un gène :
• les signaux, qui sont des séquences particulières caractéristiques des
gènes, par exemple les promoteurs et les codon-stop
Cadre de lecture :
• L’ARN messager est constitué d’une succession de nucléotides, dont
seule la lecture selon un cadre précis aboutit à la fabrication d’une
protéine.
Ce cadre de lecture consiste en :
• une lecture des nucléotides 3 par 3 (codon par codon) ;
• une séquence de 3 nucléotides (codon d'initiation) indique le point
de départ de la fabrication de la protéine ;
• un codon stop (une autre séquence de trois nucléotides) signifie
l’arrêt de la fabrication de la protéine.
Exemple:
• Recherche d’un triplet donné
TAG
ATT GCT TAC TAG AAT CGT ACG GGT ACG TAA ATC GTA TTC CGA
TAG
ATT GCT TAC TAG AAT CGT ACG GGT ACG TAA ATC GTA TTC CGA
Exemple:
La fonction NextStopCodon:
Utilisation possible:
• La manipulation génétique est utilisée dans plusieurs domaines:
• dans la médecine: Créer des médicaments,
• dans l’alimentation: Des fruits capables de se conserver plus longtemps
• dans l’élevage: Des vaches produisant plus de lait
Etc...
conclusion:
• Grâce au génie génétique et la prédiction des genes, nous sommes en
mesure de créer de nouveaux organismes en changeant un seul gène.
Par ce processus, nous pouvons produire des microbes modifiés.
Téléchargement
Explore flashcards